[R-br] Extraindo formula do preditor linear GEE
Pedro Emmanuel Alvarenga Americano do Brasil
emmanuel.brasil em gmail.com
Sex Jun 18 19:58:08 -03 2021
Amigos de R,
Venho procurar uma luz. Tenho certeza que é alguma coisa ridícula que não
consigo ver. Eu gostaria de adicionar num relatório a fórmula do preditor
linear de um modelo GEE. No pacote Hmisc há uma função Formula que faz
isso, mas não funciona para objetos geeglm. Além disso, a formula possui um
termo spline e depois de um tempo fuçando por ai eu não consegui fazer a
formula funcionar.
fitar1_11 <- geeglm(outcome ~ v1 + v2 + v4_recoded + v5_trunc + bs(weeks,
df = 3), family = binomial(), data = M2, id = f1p0, corstr = "ar1")
fitar1_11
geeglm(formula = outcome ~ v1 + v2 + v4_recoded + v5_trunc +
bs(weeks, df = 3), family = binomial(), data = M2, id = f1p0,
corstr = "ar1")
Coefficients:
(Intercept)
v1
-1.586386e+00
8.363458e-02
v2 v4_recodedNET, NGT, JF, OET, GF or
TPN
-3.763166e-02
4.503599e+15
v5_trunc bs(weeks, df =
3)1
7.261799e-02
3.469451e-03
bs(weeks, df = 3)2 bs(weeks, df =
3)3
3.756985e-01
4.542696e+00
Degrees of Freedom: 472 Total (i.e. Null); 464 Residual
> nd # newdata to predict at
v1 v2 v4_recoded v5_trunc weeks
1 8 3 No catheter 36 2
> predict(fitar1_11, type = "response", newdata = nd) # prediction from the
model
1
0.8345324
# Not working prediction from the hand made formula
> plogis(-1.586386 + 0.08363458*nd$v1 + -0.03763166*nd$v2 +
4503599142291968*0 + 0.07261799*nd$v5_trunc + 0.003469451*nd$weeks +
0.3756985*pmax(nd$weeks-1,0)^3 + 4.542696*pmax(nd$weeks-8,0)^3)
[1] 0.8772541
Alguem consegue me dar uma luz o que está errado para eu acertar esta
previsão? Se puder indicar uma leitura que resolva eu gostaria também.
Abraço forte e que a força esteja com voces,
Pedro Brasil
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