[R-br] Duvidas Análise de Componentes Principais

[Fernando Souza]

Olá pessoal tudo bem

Estou realizando uma análise de componentes principais, com o objetivo de
selecionar as melhores variáveis para uma análise multivariada.

Gostaria de uma orientação sobre a  interpretação. Eu interpretei de forma
correta? Variáveis que possuem alta correlação com um CP também estão
correlacionadas entre si. Isso significa que posso utilizar somente uma das
principais variáveis do CP1 (por exemplo) para incluir no modelo
multivariado? No caso a variável que apresentar significado para o trabalho.

Os círculos de correlação, screem plot e corrplot geradas pelo Pca estão
disponíveis no link
https://drive.google.com/open?id=1jS5tCX-2-qHo2Gbej00DkFQBpLztwXks

A interpretação que fiz foi a seguinte:

Considerei as variáveis PC,IC e Prod leite (Azul no gráfico) como variável
suplementar quantitativa.  Baseado no ScreenPlot selecionei somente 5 CP
para avaliação que explicaram 67,80% da variancia total. Pela minha
interpretação cheguei as seguintes conclusões

Principais variáveis para cada componente:

Consumos (CP1): CMS,CMO,CPB,CEE,CCNF,CFDNcp,CFDA,CNDT,CEB,CED,CEM,CEL

Energia (CP2) : EB,ED,EM,EL

Peso (CP3): PV,PCJ,PCVZ,PCVZ075

Composição do Leite(CP4) : Solido e DCNF

Variaveis sanguíneas (CP5): PT e ALBUMINA



Segue uma descrição do trabalho para compreensão. Aceito sugestões sobre a
melhor forma trabalhar esses dados

O banco de dados é oriundo  dois estudos realizados pelo mesmo grupo de
pesquisa nas mesmas condições experimentais
(animais,instalação,dieta,manejo) e avaliaram 48 variáveis.
Os fatores experimentais foram:
*Raça*: Estudo 1 avaliou 12 animais (6 raça1 e 6 da raça 2). O estudo 2
avaliou 13 animais (6 raça 1 e 7 raça 2)
*Plano nutricional:*  O estudo 1 avaliou os níveis (0,15,30) o estudo 2
avaliou os níveis (0,5,10,20)
*Dias em lactação-DEL* (medidas repetidas no tempo):  Estudo 1, dias
dispersos entre os períodos de 30 a 120 dias. No estudo 2 os DEL foram
avaliados em dias entre 150 a 250 dias.


Eu realizei uma análise gráfica e não há indicações de haver diferenças
entre estudos, o que era de certo modo esperado. Raça e DEL parecem ser os
fatores que afetam as variáveis respostas.



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Fernando Souza
Zootecnista, DSc. Produção e Alimentação Animal
Celular: (31)99796-8781 (Vivo)
E-mail:nandodesouza em gmail.com <e-mail%3Anandodesouza em gmail.com>
Lattes: http://lattes.cnpq.br/6519538815038307
Blog: https://producaoanimalcomr.wordpress.com/
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