[R-br] Instalação do pacote brms

Andre Oliveira andreolsouza em yahoo.com.br
Quarta Março 14 07:53:24 -03 2018


boa dia,estou a procura de um pacote para estimar componentes de variâncias via Bayesiana. Já testes alguns outros recomendados por professores, mas,  me falaram da brms. Acontece que são tantos erros que não consegui instalar no Ubuntu. A rstan é uma dependência que não instala por nada.  Alguém tem algumas sugestões? 


R version 3.4.3 (2017-11-30) -- "Kite-Eating Tree"
Copyright (C) 2017 The R Foundation for Statistical Computing
Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)

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[Workspace loaded from ~/.RData]

> install.packages("rstan")
Installing package into ‘/home/andre/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.4’
(as ‘lib’ is unspecified)
tentando a URL 'https://cran-r.c3sl.ufpr.br/src/contrib/rstan_2.17.3.tar.gz'
Content type 'application/x-gzip' length 747202 bytes (729 KB)
==================================================
downloaded 729 KB

* installing *source* package ‘rstan’ ...
** package ‘rstan’ successfully unpacked and MD5 sums checked
** libs
g++  -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I"../inst/include" -I"../inst/include/boost_not_in_BH" -I"`"/usr/lib/R/bin/Rscript" --vanilla -e "cat(system.file('include', 'src', package = 'StanHeaders'))"`" -DBOOST_RESULT_OF_USE_TR1 -DBOOST_NO_DECLTYPE -DBOOST_DISABLE_ASSERTS -DFUSION_MAX_VECTOR_SIZE=12 -DBOOST_PHOENIX_NO_VARIADIC_EXPRESSION -I"/home/andre/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.4/Rcpp/include" -I"/home/andre/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.4/RcppEigen/include" -I"/home/andre/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.4/BH/include" -I"/home/andre/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.4/StanHeaders/include"    -fpic  -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g  -c chains.cpp -o chains.o
.....In file included from /home/andre/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.4/BH/include/boost/spirit/include/phoenix_limits.hpp:11:0,
                 from /home/andre/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.4/BH/include/boost/spirit/home/support/meta_compiler.hpp:16,
                 from /home/andre/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.4/BH/include/boost/spirit/home/qi/meta_compiler.hpp:14,
                 from /home/andre/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.4/BH/include/boost/spirit/home/qi/action/action.hpp:14,
                 from /home/andre/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.4/BH/include/boost/spirit/home/qi/action.hpp:14,
                 from /home/andre/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.4/BH/include/boost/spirit/home/qi.hpp:14,
                 from /home/andre/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.4/BH/include/boost/spirit/include/qi.hpp:16,
                 from /home/andre/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.4/StanHeaders/include/src/stan/lang/grammars/bare_type_grammar_def.hpp:4,
                 from /home/andre/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.4/StanHeaders/include/src/stan/lang/grammars/bare_type_grammar_inst.cpp:1,
                 from lang__grammars__bare_type_grammar_inst.cpp:18:
/home/andre/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.4/BH/include/boost/phoenix/core/limits.hpp:44:0: warning: "BOOST_PHOENIX_NO_VARIADIC_EXPRESSION" redefined [enabled by default]
 # define BOOST_PHOENIX_NO_VARIADIC_EXPRESSION
 ^
<command-line>:0:0: note: this is the location of the previous definition 

Não passa deste ponto ! 




# Em allguns momentos da este aviso. 
installed.packages("rstan")
Package LibPath Version Priority Depends Imports LinkingTo Suggests Enhances License
License_is_FOSS License_restricts_use OS_type Archs MD5sum NeedsCompilation Built


# Aqui estão dependências complicadas! 
installed.packages("rstan")
install.packages("shinystan")
installed.packages("brms")
Grato! 

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