[R-br] Erro de memória importando objeto pequeno de SQL

[Cesar Rabak]

Pedro,

Calloc é uma chamada "primitiva" para o R, uma função da biblioteca C e é
uma função feita para "alocar" (reservar) memória e zerá-la.

O estranho, para mim, é a tentativa do aplicativo de reservar *tanta* memória
assim na chamada da função do R.

Essa função sqlQuery() pode ser testada fazendo:

> example(sqlQuery)

?

Se o exemplo do próprio pacote funcionar, aí teremos que fazer uma busca
para ver de onde vem esse comportamento.

HTH
--
Cesar Rabak




2017-07-28 17:12 GMT-03:00 Pedro Emmanuel Alvarenga Americano do Brasil <
emmanuel.brasil em gmail.com>:

> Ei Cesar,
>
> Eu tenho pouco familiaridade com SQL, e o amigo da TI que tem e faz
> manutenção do servidor diz que o erro é na minha estação com R. Eu acho que
> não, mas não tenho certeza porque eu não sei ao certo o que quer dizer esse
> erro. O que seria essa "Calloc"? É uma coisa natural do R?
>
> Abraço,
>
> Pedro Brasil
>
> Em 28 de julho de 2017 16:59, Cesar Rabak <cesar.rabak em gmail.com>
> escreveu:
>
>> Pedro,
>>
>> Mesmo sem poder fazer uma tentativa, me parece que o erro é estranho
>> demais para não ser notado: a chamada à primitiva da ling. C "calloc" está
>> pedindo 200 Gbytes, que falha e me parece algo grande demais para um
>> "default" da chamada a sqlQuery().
>>
>> HTH
>>
>>
>> 2017-07-28 9:42 GMT-03:00 Pedro Emmanuel Alvarenga Americano do Brasil
>> via R-br <r-br em listas.c3sl.ufpr.br>:
>>
>>> Amigos de R,
>>>
>>> Estou envolvido numa tarefa que importo um banco SQL de um servidor,
>>> faço uma modelagem, salvo o modelo no SQL através de uma seriliazação, e
>>> depois carrego esse modelo do SQL para fazer previsões em novos dados.
>>>
>>> Estou seguindo um exemplo disponível nessa página:
>>> https://docs.microsoft.com/pt-br/sql/advanced-analytics/tuto
>>> rials/walkthrough-deploy-and-use-the-model
>>>
>>> Sei que esse exemplo não é reproduzível porque depende da conexão com o
>>> servidor e credenciais que não posso divulgar. Mas se alguem já passou por
>>> esse problema poderia pelo menos indicar aonde está o problema que não
>>> estou sabendo identificar? Acho que muito provavelmente seria uma
>>> configuração do SQL no servidor...
>>>
>>> library(RODBC)
>>>
>>> # define database connection string
>>> dbconn <- 'Driver={SQL Server};Server=BLABLABLA;Datab
>>> ase=BLABLABLA;Trusted_Connection=yes;'
>>>
>>> # define a connection
>>> conn <- odbcDriverConnect(connection = dbconn)
>>>
>>> # Estou fazendo o exemplo com o objeto LETTERS só pra ter certeza que é
>>> um objeto pequeno e que não deveria ser um problema de memória do R.
>>> > LETTERS
>>>  [1] "A" "B" "C" "D" "E" "F" "G" "H" "I" "J" "K" "L" "M" "N" "O" "P" "Q"
>>> "R" "S" "T" "U" "V" "W" "X"
>>> [25] "Y" "Z"
>>> > teste_pequeno <- serialize(LETTERS, connection = NULL)
>>> > teste_pequeno <- paste(teste_pequeno, collapse = "")
>>>
>>> # o EXEC PersistModel faz
>>> # insert into [tempo_permanencia_models] (model, [description]) values
>>> (convert(varbinary(max), em m,2), @description)
>>> # insere o modelo e uma descricao
>>>
>>> > p <- paste("EXEC PersistModel @m='", teste_pequeno,"', @description =
>>> 'Teste de serialização objeto pequeno'", sep = "")
>>> > sqlQuery(conn, p)
>>> character(0)
>>> > rm(teste_pequeno)
>>> > p <- "SELECT model FROM [tempo_permanencia_models] WHERE id_model =
>>> 1022"
>>> > mod.teste.peq <- sqlQuery(conn, p)
>>> Error in odbcQuery(channel, query, rows_at_time) :
>>>   'Calloc' could not allocate memory (214748364800 of 1 bytes)
>>> > p <- paste0("SELECT id_model, description FROM
>>> [tempo_permanencia_models] WHERE id_model = 1022")
>>> > sqlQuery(conn, p) #
>>>    id_model                                              description
>>> 1      1022                     Teste de serialização objeto pequeno
>>>
>>> Reparem que o objeto está salvo no servidor. Foi salvo a partir do R,
>>> mas não retorna para o R por conta do erro de memoria. Eu não estou sabendo
>>> nem por onde começar.
>>>
>>> Que a força esteja sempre com vocês e abraço forte.
>>>
>>> Pedro Brasil
>>>
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