[R-br] "Append" arquivos csv de diversos subdiretórios

[Éder Comunello]

Boa tarde, pessoal.

Dependendo da situação poderá utilizar também o argumento full.names=T.

list.files("DADOS", recursive=T)
# [1] "CSV1/Text1.csv" "CSV1/Text2.csv" "CSV2/Text3.csv"

list.files("DADOS", recursive=T, full=T)
# [1] "DADOS/CSV1/Text1.csv" "DADOS/CSV1/Text2.csv" "DADOS/CSV2/Text3.csv"

dir("DADOS", recursive=T, full=T)
# [1] "DADOS/CSV1/Text1.csv" "DADOS/CSV1/Text2.csv" "DADOS/CSV2/Text3.csv"


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Éder Comunello
Researcher at Brazilian Agricultural Research Corporation (Embrapa)
DSc in Agricultural Systems Engineering (USP/Esalq)
MSc in Environ. Sciences (UEM), Agronomist (UEM)
---
Embrapa Agropecuária Oeste, Dourados, MS, Brazil |<O>|
================================================
GEO, -22.2752, -54.8182, 408m
UTC-04:00 / DST: UTC-03:00




2016-09-22 11:38 GMT-04:00 Thiago V. dos Santos via R-br <
r-br em listas.c3sl.ufpr.br>:

> Alexandre,
>
> Basta usar o argumento "recursive" no seu comando list.files:
>
> filenames <- list.files (".", recursive=T)
>
> Greetings,
>  -- Thiago V. dos Santos
>
> PhD student
> Land and Atmospheric Science
> University of Minnesota
>
>
> On Thursday, September 22, 2016 6:58 AM, Alexandre Loures via R-br <
> r-br em listas.c3sl.ufpr.br> wrote:
>
>
>
> Bom dia!
>
> Tenho um diretório com 50 subdiretórios sendo que cada um possui 11
> arquivos csv. O que preciso é "empilhar" esses arquivos (em um único
> arquivo) e para isso estou fazendo o seguinte:
>
>
> filenames <- list.files ()
> mydata <- do.call ("rbind", lapply (filenames, read.csv, header = TRUE))
>
>
> Entretanto, gostaria de "automatizar" esse script, ou seja, o próprio
> comando fosse em cada subdiretório e fizesse o "append" (dos 550 arquivos
> csv) dando o resultado final.
>
> Alguém poderia me ajudar?
>
>
> Desde já muito obrigado!
>
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> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br
> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forne� c�igo
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