[R-br] como fazer plot de componentes principais em cores?

Jackson Rodrigues jacksonmrodrigues em gmail.com
Terça Maio 24 11:42:52 BRT 2016


Oi pessoal,

Eu preciso fazer um PCA que varie as cores em função dos anos. O mais
antigo em vermelho e a medida que chega as datas mais recentes vai ficando
roxo (uma escala de cor).

eu tenho esse exemplo hipotético.

mat5 <- matrix(rnorm(2000), ,4) # minha matriz
mat5
ages<-seq(1, 50000, by = 100) #idades
ages

library(plotrix)
agecol<-color.scale(ages,extremes=c("purple","red")) # encaixando a escala
de cor nas idades

rownames(mat5) <- c(seq ) # fazendo as idades os nomes da linhas da matriz

library("vegan")
test.pca<-rda(mat5) # calculando componentes principais
plot(test.pca,display="sites", cex=1, type="p",scaling=-3) # plotando
componentes princiapais.

O problema é: Como fazer os pontos do gráfico ficarem coloridos como
estabelecido  em " agecol<-color.scale(ages,extremes=c("purple","red")) "

Agradeço desde já a ajuda

Abraços
Jackson
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