[R-br] RES: [R-br Teste de diferça entre proporções via loop

[Cesar Rabak]

Mauro,

Sua importação de dados gerou uma quinta linha com nº de experimentos menor
que os "acertos" para os testes de proporção.

Veja os seus resultados versus os meus e verás que o valor de N na quinta
linha deve ser 30500 e não 305 como você importou. . .

HTH
--
Cesar Rabak


2016-03-26 17:24 GMT-03:00 Mauro Sznelwar <sznelwar em uol.com.br>:

> Por que não estou conseguindo rodar?
>
>
>
> > dados <- read.table("data_test.txt", header=T, sep= "\t")
>
> > dados$p_valor <- apply(dados[,2:4], 1, function(linha)
> prop.test(x=c(linha[1],linha[2]),n=c(linha[3],linha[3]), correct=F)$p.value)
>
> Error in prop.test(x = c(linha[1], linha[2]), n = c(linha[3], linha[3]),
> :
>
>   elements of 'x' must not be greater than those of 'n'
>
> > dados
>
>   AREA   X1   X2     N
>
> 1    1 1982 9416 11398
>
> 2    2 6546 4084 10630
>
> 3    3 3418  667  4085
>
> 4    4 1503 4408  5911
>
> 5    5  966  339   305
>
> >
>
>
>
>
>
>
>
>
>
> Como sugestão para um código mais enxuto, o objetivo poderia ser atingido
> com a aplicação da função apply:
>
>
>
> > dados <- read.table("data_test.txt", header=T, sep= "\t")
>
> > dados$p_valor <- apply(dados[,2:4], 1, function(linha)
> prop.test(x=c(linha[1],linha[2]),n=c(linha[3],linha[3]), correct=F)$p.value)
>
> > dados
>
>   AREA   X1   X2     N       p_valor
>
> 1    1 1982 9416 11398  0,000000e+00
>
> 2    2 6546 4084 10630 5,362948e-250
>
> 3    3 3418  667 40850  0,000000e+00
>
> 4    4 1503 4408 59110  0,000000e+00
>
> 5    5  966  339 30500  6,472911e-69
>
>
>
> Ademais, se o OP tiver que resolver problemas dessa natureza com
> frequência, pode ser que valha a pena examinar alguns pacotes que têm
> funções para facilitar esse tipo de resumos, como, por exemplo, os pacotes
> *descr* e *reporttools*.
>
>
>
> HTH
>
> --
>
> Cesar Rabak
>
>
>
>
>
> On Wed, Mar 23, 2016 at 1:46 PM, Daniel Tiezzi <dtiezzi em usp.br> wrote:
>
> Boa tarde Wagner
>
>
>
> Supondo que seus dados esteja uma tabela data_test (em anexo)
>
>
>
> acho que você pode resolver assim
>
>
>
>
>
> data<- read.table(“data_test.txt”, header=T, sep= “\t”)
>
>
>
> data_df <- as.data.frame(data)
>
>
>
> res<- list()
>
>
>
> for (i in 1:nrow(data)) {
>
>   y<- prop.test(x = c(data$X1[i], data$X2[i]), n = c(data$N[i],
> data$N[i]), correct = FALSE)
>
>   x= y$p.value
>
>   res[[paste0(i)]] <- x
>
> }
>
>
>
> result <- t(as.data.frame(res))
>
>
>
> data_df1 <- cbind(data_df, result)
>
>
>
> data_df1
>
>
>
>
>
> Espero que funcione
>
>
>
>
>
> daniel
>
>
>
>
>
>
>
> Daniel Tiezzi, MD, PhD
>
> Professor Associado
>
> Departamento de Ginecologia e Obstetrícia
>
> Setor de Mastologia e Oncologia Ginecológica
>
> Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto - USP
>
> Tel.: 16 3602-2488
>
> e-mail: dtiezzi em fmrp.usp.br
>
>
>
>
>
>
>
>
>
> On Mar 23, 2016, at 3:50 PM, Wagner Tassinari <wtassinari em gmail.com>
> wrote:
>
>
>
> AREA    X1      X2       N       p_valor
> 1        1982    9416    11398      ?
> 2        6546    4084    10630      ?
> 3        3418    667       4085       ?
> 4        1503    4408      5911       ?
> 5        966        339       305       ?
>
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