[R-br] Loop script
Jose Wellingthon Dos Santos
jose-wellingthon.santos em embrapa.br
Quarta Dezembro 7 11:31:21 BRST 2016
Caro Fernado,
O loop é muito simples. Segue um script em que analisei 11 variáveis de uma só vez e ainda apliquei dois testes de comparações de medias. As duas primeiras colunas sao respectivamente
Trat e Repetiçoes, as demais são as variavies.
Att
dados<-read.table("e:/adalgisa/magna.txt", header=TRUE)
dados
TRAT<-as.factor(dados[,1])
REP<-as.factor(dados[,2])
require(laercio)
colin<-3
for(i in colin:ncol(dados))
{
modelo<-aov(dados[,i]~TRAT+REP)
print(summary(modelo))
LTukey(modelo,"TRAT",conf.level=0.95)
LScottKnott(modelo,"TRAT",conf.level=0.95)
}
Att
--
José Wellingthon dos Santos
Pesquisador - Métodos Quantitativos
Embrapa Algodão
Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa)
Campina Grande, PB
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----- Mensagem original -----
De: "Jose Claudio Faria via R-br" <r-br em listas.c3sl.ufpr.br>
Para: "Fernando Rodrigo Bortolozo" <fernandobortolozo em gmail.com>, "a lista Brasileira oficial de discussão do programa R." <r-br em listas.c3sl.ufpr.br>
Enviadas: Terça-feira, 6 de dezembro de 2016 16:44:16
Assunto: Re: [R-br] Loop script
Fernando,
Você poderia pensar em fazer uma manova e em seguida uma aov do objeto que armazena a manova.
Por exemplo, no código fonte da documentação da manova você pode fazer uma aov do objeto npk2.aov
npk2 <- within(npk, foo <- rnorm(24))
(npk2.aov <- manova(cbind(yield, foo) ~ block + N*P*K, npk2))
summary(aov(npk2.aov))
HTH,
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Jose Claudio Faria
Estatistica
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joseclaudio.faria at gmail.com
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2016-12-06 16:29 GMT-03:00 Fernando Rodrigo Bortolozo via R-br < r-br em listas.c3sl.ufpr.br > :
Eu estou fazendo anova e com posterior teste de médias de um experimento com muitas variáveis. Então eu tenho que repetir o script muitas vezes o mesmo script para cada variável.
Os colegas sabem me dizer se existe alguma maneira de fazer um Loop para um script, ou mesmo criar um elemento com todas variáveis para analisar de uma só vez?
Aqui vai uma pequena parte das variáveis que vou analisar, tenho 7 tratamentos, 4 repetições.
pasted1
Aqui esta o script (Agricolae Package)
dados <- read.csv("~/Documents/R/Data306090DAPv2.csv", header = TRUE)
head(dados)
model<-aov(Cas30 ~Trat, data=dados)
out <- HSD.test(model,"Trat", group=TRUE,console=TRUE, main="Calcio")
par(mfrow=c(1,2))
out$means
par (mar = c (3,3,2,0),cex=0.9)
bar.group(out$groups,ylim=c(0, 360),density=50,border="blue", col="blue", las=1)
bar.err(out$means,variation="SE",horiz=FALSE, ylim = c(0, 360), col=colors()[15],space=0.3,bar=TRUE, las=1)
out<-HSD.test(model,"Trat", group=FALSE)
means<-out$means
df<-df.residual(model)
MSerror<-deviance(model)/df
with(dados,HSD.test(Cas30,Trat,df,MSerror, group=TRUE,console=TRUE, main="Cálcio"))
Muito obrigado desde já.
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