[R-br] RES: Markdown

Terça Agosto 9 19:19:03 BRT 2016

André, 

Pela mensagem, é erro do pandoc, não do R. Ele não está achando onde o markdown gerou a figura. Pode ser problema de configuração de seu PATH ou até um erro do R que passou batido (Acho difícil ser isto, pois, segundo você, o html é gerado).

Eu, particularmente, instalei o pandoc direto, não utilizo o do R

Leonard

De: Andre Oliveira [mailto:andreolsouza em yahoo.com.br] 
Enviada em: terça-feira, 9 de agosto de 2016 16:33
Para: Leonard Assis <assis.leonard em gmail.com>
Assunto: Re: [R-br] Markdown

Este é o erro ....

output file: análise.knit.md

! Package pdftex.def Error: File `an�lise_files/figure-latex/unnamed-chunk-17-1
.pdf' not found.

See the pdftex.def package documentation for explanation.
Type  H <return>  for immediate help.
 ...                                              

l.767 ...iles/figure-latex/unnamed-chunk-17-1.pdf}

pandoc: Error producing PDF from TeX source
Erro: pandoc document conversion failed with error 43
Execução interrompida

André Oliveira Souza. Graduação em Matemática, mestrado em estatística aplicada.Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia do Espirito Santo.  IFES

Em Terça-feira, 9 de Agosto de 2016 14:10, Leonard Assis <assis.leonard em gmail.com <mailto:assis.leonard em gmail.com> > escreveu:

Eu tive um.problema deste uma vez. Era problema do pacote, que não era muito compatível com o markdown. Agora não lembro ao certo qual figura era, suponho que seja alguma representação de rede neural.

Leonard

Em 9 de ago de 2016 14:06, "Andre Oliveira via R-br" <r-br em listas.c3sl.ufpr.br <mailto:r-br em listas.c3sl.ufpr.br> > escreveu:

Boa tarde, deu tudo certo. Obrigado pela dicas! 

Ao rodar para gerar o HTML está tudo certo,  mas para rodar para obter o  .pdf não insere as figuras! Alguma dica de como contornar este ponto? 

obg

Estrutura ...

---
title: "Material R"
author: "André Oliveira Souza"
date: "3 de maio de 2016"
output: pdf_document
number_sections: yes
---

```{r,fig=T}
Dados<-scale(dad)
hc<-hclust(dist(dad),method=" ward.D")
par(las=2) # Gira título do eixo 
plot(as.dendrogram(hc),horiz = F,main = "Agrupamentos dos Tratamentos") 
abline(h=6,lty=3, col="red")
```

André Oliveira Souza. Graduação em Matemática, mestrado em estatística aplicada.Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia do Espirito Santo.  IFES

Em Domingo, 7 de Agosto de 2016 20:36, Andre Oliveira via R-br <r-br em listas.c3sl.ufpr.br <mailto:r-br em listas.c3sl.ufpr.br> > escreveu:

obrigado! 

André Oliveira Souza. Graduação em Matemática, mestrado em estatística aplicada.Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia do Espirito Santo.  IFES

Em Domingo, 7 de Agosto de 2016 13:36, Marcos Silva via R-br <r-br em listas.c3sl.ufpr.br <mailto:r-br em listas.c3sl.ufpr.br> > escreveu:

Tente
supressMessages()

Em 7 de ago de 2016 11:21 AM, "Felipe via R-br" <r-br em listas.c3sl.ufpr.br <mailto:r-br em listas.c3sl.ufpr.br> > escreveu:

Tentou assim:

```{r,message=FALSE}

require(gdata)
```

Em 07-08-2016 11:04, Andre Oliveira via R-br escreveu:

boa dia,
como esconder estes avisos no R Markdown? Já pesquisei e não consegui resolver, quando carrego a gdata,  ficam estes estes avisos no texto.  Minhas configurações no documento são: 

```{r,include=F}
# Configuração global 
require(knitr)
opts_chunk$set(echo = F,comment="",message=" ")
```

```{r}

require(gdata, quietly = TRUE)
gdata: read.xls support for 'XLS' (Excel 97-2004) files ENABLED.
gdata: read.xls support for 'XLSX' (Excel 2007+) files ENABLED.
Attaching package: ‘gdata’
The following object is masked from ‘package:stats’:
nobs
The following object is masked from ‘package:utils’:
object.size
The following object is masked from ‘package:base’:
startsWith

```

Obrigado!

André Oliveira Souza. Graduação em Matemática, mestrado em estatística aplicada.Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia do Espirito Santo.  IFES

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