[R-br] Exrpotar formula de modelo para planilha

Leonardo Ferreira Fontenelle leonardof em leonardof.med.br
Terça Abril 26 16:24:15 BRT 2016


Estou sem o R no momento. Talvez isto funcione:
 
[...]
f <- cph(S ~ rcs(age,4) + sex, x=TRUE, y=TRUE)
df <- data.frame(coef = coef(f), row.names = names(coef(f)))
write.csv(df, "meuarquivo.csv")
 
Espero ter ajudado!
 
Leonardo Ferreira Fontenelle[1]
 
 
Em Qua 20 abr. 2016, às 17:36, Pedro Emmanuel Alvarenga Americano do
Brasil escreveu:
> Amigos de R,
>
> Ajustei um modelo de sobrevivencia e gostaria de exportar o modelo uma
> planilha xlsx ou csv, de tal forma que os coeficientes fiquem numa
> coluna e na coluna ao lado fique pelo o que o coeficiente está
> multiplicando. Já quebrei a cabeça aqui e não consegui. A pegadinha é
> que o modelo possui algumas transformações por splines e por isso
> preciso dos valores dos nós pra cada variável contínua. Achei uma
> função chamada Function que faz isso. Mas depois disso eu não avancei.
> Eu gostaria de pegar da saída função Function o que está entre as
> chaves, quebrar nos "+" e nos "-" pra separar os termos e depois
> quebrar nos "*" pra separar as colunas. Organizar em formato de
> planilha e exportar.
>
> library(rms)
> n <- 1000
> age <- 50 + 12*rnorm(n)
> label(age) <- "Age"
> sex <- factor(sample(c('Male','Female'), n,
> rep=TRUE, prob=c(.6, .4)))
> cens <- 15*runif(n)
> h <- .02*exp(.04*(age-50)+.8*(sex=='Female'))
> dt <- -log(runif(n))/h
> label(dt) <- 'Follow-up Time'
> e <- ifelse(dt <= cens,1,0)
> dt <- pmin(dt, cens)
> units(dt) <- "Year"
> dd <- datadist(age, sex)
> options(datadist='dd')
> S <- Surv(dt,e)
> f <- cph(S ~ rcs(age,4) + sex, x=TRUE, y=TRUE)
> >Function(f)
>
> >function(age = 48.800654,sex = "Male") {0.28612987-0.017321951* age+0.00012586581*pmax(age-29.600456,0)^3-0.00046285671*pmax(age-
> >44.273198,0)^3+0.00042111763*pmax(age-53.769262,0)^3-8.4126731e-
> >05*pmax(age-69.855597,0)^3-0.64448916*(sex=="Male") }
> <environment: 0x0000000015fa7378>
>
> Pra ficar mais ou menos assim
> +0.28612987
> -0.017321951    age
> +0.00012586581  pmax(age-29.600456,0)^3
> -0.00046285671  pmax(age-44.273198,0)^3
> +0.00042111763  pmax(age-53.769262,0)^3
> -8.4126731e-05  pmax(age-69.855597,0)^3
> -0.64448916     (sex=="Male")
>
> Alguma luz?
>
>
> Abraço forte,
>
> Pedro Brasil
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