[R-br] Plotar perfil de umidade no solo ao longo do ano

[Benilton Carvalho]

mude

brewer.pal(9,"Blues")

para

rev(brewer.pal(9,"RdBu"))

b

Em 18 de setembro de 2014 12:00, Thiago V. dos Santos <
thi_veloso em yahoo.com.br> escreveu:

> Caro Wenceslau,
>
> Também estou buscando mudar a escala de cores para algo mais didático, mas
> ainda não acertei totalmente as configurações. Por enquanto, o que estou
> fazendo é:
>
> # criar uma escala de azul usando o RColorBrewer.
> # digite display.brewer.all() para ver as paletas disponíveis
> cols <- colorRampPalette(brewer.pal(9,"Blues"))(200)
>
> # plotar o perfil especificando a paleta no argumento "cols"
> plot <- filled.contour(x= date,
>                        y= sort(-(as.numeric(names(depths)))),
>                        z= t(soil_data[11:1,]),
>                        zlim= c(0,1),
>                        ylab= expression(theta(m^3~~m^-3)),
>                        col=cols,
>                        nlevels= 100)
>
> Ainda não é o ideal, mas pelo menos uma escala azul torna mais fácil a
> interpretação de diferentes quantidades de umidade no solo.
>
> Saudações,
> --
> Thiago V. dos Santos
> PhD student
> Land and Atmospheric Science
> University of Minnesota
>
> http://www.laas.umn.edu/CurrentStudents/MeettheStudents/ThiagodosSantos/index.htm
> Phone: (612) 323 9898
>
>
>   On Thursday, September 18, 2014 9:46 AM, Wenceslau Teixeira <
> wgt007 em gmail.com> wrote:
>
>
> Caros colegas do R,
>
> muito bacana o script disponibilizado para traçar os perfis de umidade do
> solo.
> Será útil para nós. Só gostaria de trocar as cores, com valores mais alto
> (umido) para azul e valores mais baixos (solo seco)
> para vermelho, assim o gráfico fica mais cognitivo.
> Alguém sabe como mudar as cores ?
>
> Cordialmente,
>
> Wenceslau Teixeira
> Embrapa Solos
>
>
>
> library(repmis) # reads text data directly from dropbox - no need to
> download any file
> # read data
> url <- 'https://dl.dropboxusercontent.com/u/27700634/precip.txt'
> tmp <- repmis::source_data(url, sep = '', header = TRUE)
>
> # convert julian day to date
> date <- as.Date(tmp$julian, origin='2011-12-31')
> data <- cbind(date, tmp)
> head(data)
> # define vector with depth of soil layers
> depths <- c(0.05,0.10,0.20,0.30,
>                  0.40,0.60,0.80,1.00,
>                  1.50,2.00,2.50)
>
> # teste com lattice
> cols <- ncol(data):4
> levelplot(as.matrix(data[, cols]),
>           aspect = "fill", xlab = "date", ylab = "soil Moist.",
>           scales = list(x = list(at = which(date %in% pretty(date)),
>                                  labels = pretty(date)),
>                         y = list(at = length(cols):1, labels = depths)),
>           contour = T)
>
> # Plot soil moisture profile
>
> # como são profundidades (abaixo da superfície) use a convenção de z
> negativo
> # acrescentei a chuva, precisa ajustar ylabels, mtext() resolve
>
> x11()
> op <- par(mar = c(3,4,12,3))
> plot <- filled.contour(date, sort(-depths), as.matrix(data[, cols]), ylab
> = expression(theta(m^3~~m^-3)))
> par(new=T,mar=c(23,4,1,8))
> with(data,
>       plot(date, precip, type = "h", xaxt = "n", xpd = T, xaxs="i", ylab =
> "Precip (mm)", xlab = ""))
> par(op)
>
>
> --
>
> Wenceslau Teixeira
>
> wgt007 em gmail.com
> skype: wgt007
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