[R-br] Plotar perfil de umidade no solo ao longo do ano

[Wenceslau Teixeira]

Caros colegas do R,

muito bacana o script disponibilizado para traçar os perfis de umidade do
solo.
Será útil para nós. Só gostaria de trocar as cores, com valores mais alto
(umido) para azul e valores mais baixos (solo seco)
para vermelho, assim o gráfico fica mais cognitivo.
Alguém sabe como mudar as cores ?

Cordialmente,

Wenceslau Teixeira
Embrapa Solos



library(repmis) # reads text data directly from dropbox - no need to
download any file
# read data
url <- 'https://dl.dropboxusercontent.com/u/27700634/precip.txt'
tmp <- repmis::source_data(url, sep = '', header = TRUE)

# convert julian day to date
date <- as.Date(tmp$julian, origin='2011-12-31')
data <- cbind(date, tmp)
head(data)
# define vector with depth of soil layers
depths <- c(0.05,0.10,0.20,0.30,
                 0.40,0.60,0.80,1.00,
                 1.50,2.00,2.50)

# teste com lattice
cols <- ncol(data):4
levelplot(as.matrix(data[, cols]),
          aspect = "fill", xlab = "date", ylab = "soil Moist.",
          scales = list(x = list(at = which(date %in% pretty(date)),
                                 labels = pretty(date)),
                        y = list(at = length(cols):1, labels = depths)),
          contour = T)

# Plot soil moisture profile

# como são profundidades (abaixo da superfície) use a convenção de z
negativo
# acrescentei a chuva, precisa ajustar ylabels, mtext() resolve

x11()
op <- par(mar = c(3,4,12,3))
plot <- filled.contour(date, sort(-depths), as.matrix(data[, cols]), ylab =
expression(theta(m^3~~m^-3)))
par(new=T,mar=c(23,4,1,8))
with(data,
      plot(date, precip, type = "h", xaxt = "n", xpd = T, xaxs="i", ylab =
"Precip (mm)", xlab = ""))
par(op)


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Wenceslau Teixeira

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