[R-br] função de interpolação

Fernando Souza nandodesouza em gmail.com
Quarta Outubro 1 16:16:07 BRT 2014


Muito obrigado Benilton! Era exatamente isso que queria.
Estava seguindo por caminhos tão complicados.
Obrigado por tudo
On 01-10-2014 15:50, Benilton Carvalho wrote:
> Oi Fernando,
>
> alguns comentarios antes.... Quando vc diz de interpolar, vc quer 
> "peso" como sendo sua variavel "Y" e "dia/data/etc" como eixo "X"... 
> correto?
>
> Se for este o caso, a sua chamada de 'approx' esta' incorreta... o "X" 
> e' o primeiro argumento... e o "Y" e' o segundo.
>
> Alem disso, no codigo abaixo, colocarei a interpolacao para funcionar 
> direto das datas... se isso vai fazer sentido (ou nao), deixo pra vc 
> "descobrir" (a dica e' que o R vai achar uma representacao numerica 
> para data e converte-la antes do ajuste... experimente um pouco e veja 
> se e' conveniente para o seu caso. Se nao for, crie a variavel 
> adequada a priori).
>
> Usando o seu conjunto de dados de exemplo (colado abaixo apenas para 
> conveniencia):
>
> set.seed(20)
> dados<-data.frame(ANIMAL=factor(rep(1:5,each=4)),
>                   Peso=rnorm(20,30,4),
> data=sample(seq(as.Date("01/04/2009",'%d/%m/%Y'),
> as.Date("30/04/2009",'%d/%m/%Y'),length.out=30), 20),
>                   day=1:20)
>
> Tudo o que vc precisa e' criar uma funcao que funcione num data.frame 
> de mesma estrutura que este acima.... Veja o codigo abaixo:
>
> myf <- function(mydf)
>     with(mydf, approx(data, Peso))
>
> Tudo o que a funcao 'myf' faz e' a interpolacao Peso x data num 
> data.frame generico chamado 'mydf'... Note que a funcao e' burra o 
> suficiente pra nao saber que existem animais diferentes... mas se vc 
> tivesse um data.frame para cada animal, isso funcionaria...
>
> Entao agora e' dividir os data.frames por animal e ter os 
> resultados... Para isso, eu gosto de usar o pacote 'plyr'... Como a 
> entrada de dados e' a partir de um data.frame (d) e a saida eu quero 
> que seja numa lista (l), entao vc usa o comando 'dlply'...
>
> library(plyr)
> res <- dlply(dados, .(ANIMAL), myf)
>
> Por fim, o que isso faz e': pegar o seu data.frame completo, quebrar 
> em data.frames menores usando a variavel 'ANIMAL' e, em cada 
> data.frame menor, aplicar a funcao 'myf'.... Seu resultado 'res', e' 
> uma lista... cada elemento da lista e' um resultado do approx para 
> cada animal...
>
> b
>
>
> set.seed(20)
> dados<-data.frame(ANIMAL=factor(rep(1:5,each=4)),
>                   Peso=rnorm(20,30,4),
> data=sample(seq(as.Date("01/04/2009",'%d/%m/%Y'),
> as.Date("30/04/2009",'%d/%m/%Y'),length.out=30), 20),
>                   day=1:20)
> myf <- function(mydf)
>     with(mydf, approx(data, Peso))
> library(plyr)
> res <- dlply(dados, .(ANIMAL), myf)
>
>
>
> Em 1 de outubro de 2014 14:16, Fernando Souza <nandodesouza em gmail.com 
> <mailto:nandodesouza em gmail.com>> escreveu:
>
>     Caros amigos
>
>     Estou necessitando faze a interpolação de algumas pesagens tomadas
>     em diferentes animais. Eu preciso da interpolação feita para cada
>     animal separadamente e o intervalo entre medidas não é fixo. Eu
>     estou utilizando a função approx() no entanto devido ao número de
>     animais utilizados fica muito dispendioso fazer fazer esta
>     interpolação uma a uma.  Por isso gostaria de uma função onde um
>     pudesse automatizar este procedimento.
>
>     set.seed(20)
>     dados<-data.frame(ANIMAL=factor(rep(1:5,each=4)),Peso=rnorm(20,30,4),
>     data=sample(seq(as.Date("01/04/2009",'%d/%m/%Y'),
>     as.Date("30/04/2009",'%d/%m/%Y'),length.out=30),20),day=1:20)
>
>     Estou tentando fazer uma função que estime os pontos da
>     interpolação agrupados por Animal . Entretanto tenho pouco
>     conhecimento em programação para fazer isso. Tenho tentado fazer
>     isso, sem muito sucesso.
>     Alguém poderia me ajudar? Abraços
>
>     aprendendo<-function(dados){
>          niveis<-levels(dados$ANIMAL)
>          dia<-diff(dados$data)
>          for(i in min(niveis):max(niveis)){
>
>             b<-
>     approx(dados[dados$ANIMAL==as.numeric(i),]$Peso,dados[dados$ANIMAL==as.numeric(i),]$data),n=15)
>                }
>            return(b)
>                  }
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