[R-br] Função likfitBGCCM e predict
Paulo Justiniano
paulojus em leg.ufpr.br
Terça Novembro 4 11:32:59 BRST 2014
veja
help(predict.BGCCM)
## S3 method for class 'BGCCM'
predict(object, locations, borders,
variable.to.predict = 1, ...)
variable.to.predict: scalar with options for values or 2 indicating
which variable is to be predicted.
On Mon, 3 Nov 2014, Jacqueline Cantú wrote:
> Caros,
> Usando os comando que seguem (os quais estão disponíveis
> em: http://www.leg.ufpr.br/geoR/tutorials/CCM.R)
> Gostaria de saber como proceder para obter a predição espacial para a
> segunda variável (y2), uma vez que essa rotina me fornece apenas os valores da
> predição da primeira variável (y1).
>
> require(geoR)
> set.seed(30)
> all.coords <- round(cbind(runif(200), runif(200)), dig=3)
> set.seed(111); ind1 <- sample(1:200, 120)
> coords1 <- all.coords[ind1,]
> set.seed(222); ind2 <- sample(1:200, 80)
> coords2 <- all.coords[ind2,]
>
> ## Model parameters:
> mu1 <- 10; mu2 <- 50
> sigma01 <- 2; sigma1 <- 1.5; sigma02 <- 8; sigma2 <- 6
> phi0 <- 0.2; phi1 <- 0.15; phi2 <- 0.25
>
> ## Model parameters (reparametrised)
> sigma <- sigma01
> nu1 <- sigma1/sigma
> eta <- sigma02/sigma; nu2 <- sigma2/sigma
>
> ## Simulating model components
> S0 <- grf(grid=all.coords, cov.pars=c(sigma, phi0))$data
> S1 <- grf(grid=coords1, cov.pars=c(sigma1, phi1))$data
> S2 <- grf(grid=coords2, cov.pars=c(sigma2, phi2))$data
>
> ## Y1 and Y2 data
> y1 <- as.geodata(cbind(coords1,10+S0[ind1]+S1))
> y2 <- as.geodata(cbind(coords2,50+S0[ind2]+S2))
>
> ## maximum likelihood estimation
> fit12 <- likfitBGCCM(y1, y2, ini.s=c(2,1.5,8,6), ini.phi=c(.2,.15,.25),
> control=list(trace=T))
> fit12
>
> ## Prediction
> locs <- cbind(c(0.2, 0.5, 0.7, 0.2), c(0.3, 0.5, 0.2, 0.8))
> pred12 <- predict(fit12, loc=locs)
>
>
> Att, Jacqueline.
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