[R-br] RES: extracao da Longitude correta para dados de SST

[Mauro Sznelwar]

Como eu baixo este pacote ncdf4, quando eu tento baixá-lo diz que não está disponível na versão R 3.1

 

 

 

Humberto,

 

Obrigado pelo exemplo completamente reprodutível.

 

O pacote ncdf não é mais atualizado pelo David Pierce e muito em breve o seu codigo pode nao mais funcionar. Use o ncdf4, que é mantido e regularmente atualizado. Ao fazer isso você terá de reformular o código, por exemplo 'open.ncdf' vira 'nc_open', mas dessa forma você garante que o seu codigo continue funcionando pelos próximos anos.

 

A solucao ideal para o seu problema seria usar a funcao 'rotate' do pacote raster mas isso não é possível porque a grade do seu arquivo não é regular. Dessa forma a minha sugestão para reprojetar a longitude 'na marra' é:

 

new_lon = ((lon + 180) %% 360) - 180

 

A diferença de 0.5 grau entre o que eu recomendo e o que você espera se deve à implementação de cada software: em alguns a coordenada é do canto da grade, enquanto em outros a coordenada é do centro da grade. Ajuste o resultado conforme a sua necessidade (i.e. new_lon <- new_lon + 0.5).

 

Por último, note também que o seu vetor de datas está incorreto porque está sendo criado de uma origem diferente da origem embebida no netcdf (ano 1900 ao invés de 1800). Uma solucao que resgata os valores de data diretamente do arquivo é a seguinte (note que as funções já são do ncdf4):

 

# get time dimension

t <- ncvar_get(nc,"time")

tunits <- ncatt_get(nc,"time","units")

 

# show "real" times

tustr <- strsplit(tunits$value, " ") 

tdstr <- strsplit(unlist(tustr)[3], "-")

tmonth <- as.integer(unlist(tdstr)[2])

tday <- as.integer(unlist(tdstr)[3])

tyear <- as.integer(unlist(tdstr)[1])

ndate <- as.Date(chron(t, out.format='year-month-day', origin=c(tmonth, tday, tyear)))

 

O vetor ndate serve para visualização das datas em um formato "humano", mas se você vai recriar o arquivo, provavelmente você montará a dimensao de tempo usando o vetor "t".

 

Saudações,
--
Thiago V. dos Santos
PhD student
Land and Atmospheric Science
University of Minnesota
http://www.laas.umn.edu/CurrentStudents/MeettheStudents/ThiagodosSantos/index.htm
Phone: (612) 323 9898

 

On Thursday, December 4, 2014 8:56 PM, Humberto <hghazin em hotmail.com> wrote:

 

Boa noite pessoal,

 

Estou extraindo de um arquivo ncdf os valores de latitude (lat) longitude( lon)  e temperatura da superfície da agua do mar( SST), entretanto a longitude (lon) ela está na projeção 0 a 360 graus. Minha pergunta é como faço para converter ela para -180 a 180 graus? Segue o script que estou utilizando juntamente com o link dos dados.

Desde já agradeço a ajuda 

Humberto 

 


          lon

             lat

     data

          sst

	               Lon como deveria ser


299.5

10.5

11/30/1981

27.85

 

-60.000


300.5

10.5

11/30/1981

27.96

 

-59.500


301.5

10.5

11/30/1981

28.02

 

-58.500


302.5

10.5

11/30/1981

28.02

 

-57.500


303.5

10.5

11/30/1981

27.97

 

-56.500


304.5

10.5

11/30/1981

27.84

 

-55.500


305.5

10.5

11/30/1981

27.81

 

-54.500


306.5

10.5

11/30/1981

27.78

 

-53.500


307.5

10.5

11/30/1981

27.75

 

-52.500

 

 

Link para acesso dos dados https://www.dropbox.com/s/xnab2g365mduykx/SST_81_14.nc?dl=0

 

Script:

require(ncdf) #'ncdf' versao 1.6.6

require(reshape)

require(chron)

 

###sst

nc <- open.ncdf("SST_81_14.nc")

nc

 

lat <- get.var.ncdf(nc, "lat")

lon <- get.var.ncdf(nc, "lon")

tunits <- att.get.ncdf(nc,"time","units")

 

# print tunits

tunits$value

 

# criar tempo "real" Times

time<- get.var.ncdf(nc,"time")

Time<-chron(time,origin=c(month=1, day=1, year=1900))

 

## array da variavel sst

wm <- get.var.ncdf(nc, "sst")

str(wm)

 

## atribuindo dimnames conforme lon, lat e tempo

dimnames(wm)[[1]] <- as.character(lon)

dimnames(wm)[[2]] <- as.character(lat)

dimnames(wm)[[3]] <- as.character(Time)

str(wm)

 

## melt para reestruturação dos dados

mwm <- melt(wm)

head(mwm)







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