[R-br] Problema para instalar R.2.15.2.tar.gz no ubuntu 12.04 64bits [RESOLVIDO]
ASANTOS
alexandresantosbr em yahoo.com.br
Domingo Setembro 22 11:35:58 BRT 2013
Fernando funcionou,
Apenas não consegui instalar no terminal:
sudo apt-get install gdal-bin libgdal-dev libgdal1 libgdal1-dev libproj0
libproj-dev
Apenas instalei:
sudo apt-get install gdal-bin libgdal-dev
E funcionou perfeitamente, não sei se é algum problema de distro,
Obrigado,
Alexandre
Em 18/09/2013 15:03, Fernando Mayer escreveu:
> O rgdal precisa do GDAL e do PROJ.4, que são programas externos ao R
> (isso está na página do pacote no CRAN
> http://cran.r-project.org/web/packages/rgdal/index.html). Você precisa
> instalar os pacotes necessários antes
>
> sudo apt-get install gdal-bin libgdal-dev libgdal1 libgdal1-dev
> libproj0 libproj-dev
>
> Quanto aos pacotes duplicados vc pode deletar um ou mais diretórios
> que vc acha que nao sao necessarios, e definir uma (ou mais)
> biblioteca pessoal com a variavel de ambiente R_LIBS dento do
> ~/.Renviron, por exemplo a minha é
>
> R_LIBS=~/R_environment/my_library
>
> e reinstale os pacotes. Veja ?.libPaths e ?packageStatus
>
>
>
>
> ---
> Fernando de Pol Mayer
> Doutorando em Estatística e Experimentação Agronômica
> Escola Superior de Agricultura "Luiz de Queiroz" - ESALQ
> Universidade de São Paulo - USP
> URL: http://fernandomayer.github.io <http://fernandomayer.github.com>
> e-mail: fernando.mayer [@] {gmail.com <http://gmail.com>, usp.br
> <http://usp.br>}
>
>
> 2013/9/18 ASANTOS <alexandresantosbr em yahoo.com.br
> <mailto:alexandresantosbr em yahoo.com.br>>
>
> Fernando funcionou o Rstudio, porém,
>
> Solicitou que eu criasse uma library pessoal e criei,
> mas vários pacote ficaram duplicados quando fiz:
>
> update.packages(checkBuilt = TRUE, ask = FALSE)
>
> E não consigo instalar o rgdal, apresenta o seguinte erro:
>
> ERROR: configuration failed for package 'rgdal'
> * removing '/home/santos-a/R/i686-pc-linux-gnu-library/2.15/rgdal'
> Warning in install.packages :
> installation of package 'rgdal' had non-zero exit status
>
> Tem mais alguma coisa que eu poderia fazer?
>
> Obrigado,
>
> Alexandre
>
>
> Em 17/09/2013 14:05, Fernando Mayer escreveu:
>> Tem que configurar o R como uma shared library para ter o libR.so.
>>
>> Desinstale e faça novamente com
>>
>> ./configure --enable-R-shlib
>> make
>> sudo make install
>>
>>
>>
>>
>> ---
>> Fernando de Pol Mayer
>> Doutorando em Estatística e Experimentação Agronômica
>> Escola Superior de Agricultura "Luiz de Queiroz" - ESALQ
>> Universidade de São Paulo - USP
>> URL: http://fernandomayer.github.io <http://fernandomayer.github.com>
>> e-mail: fernando.mayer [@] {gmail.com <http://gmail.com>, usp.br
>> <http://usp.br>}
>>
>>
>> 2013/9/17 ASANTOS <alexandresantosbr em yahoo.com.br
>> <mailto:alexandresantosbr em yahoo.com.br>>
>>
>> Obrigado Fernando,
>>
>> A instalação funcionou, porém como fiz:
>>
>>
>> ./configure
>> make
>> sudo make install
>>
>> No diretório: santos-a em santosa-K43E:~/Documentos$ R-2.15.2
>>
>> No terminal o R funcionou OK, mas quando instalei o Rstudio
>> após ele não funciona e acusa a seguinte mensagem:
>>
>> R Not Found
>>
>> R shared library (/usr/local/lib/R/lib/libR.so) not find. If
>> this is a custom build of R, was it build with the enable
>> --R-shlib option
>>
>>
>> Eu teria que ter instalado a pasta em outro local?
>>
>> Obrigado,
>>
>>
>> Alexandre
>>
>> Em 06/09/2013 13:53, Fernando Mayer escreveu:
>>> 1) Vc precisa conferir se os pacotes que vc diz serem
>>> incompativeis com o R 3.0.1 são realmente incompativeis, ou
>>> se falta alguma configuração (ou pacote) no seu sistema.
>>> Acredito que a grande maioria dos pacotes seja compatível
>>> pois esse versão já foi lançada há alguns meses.
>>>
>>> 2) Caso você veja que é realmente necessário instalar (e
>>> _compilar_) a versão anterior (2.15.2), vc precisa antes ter
>>> todas as ferramentas necessárias para a compilação (que
>>> aparentemente não estão instaladas). Faça:
>>>
>>> sudo apt-get install build-essential
>>> sudo apt-get buil-dep r-base
>>>
>>> E depois
>>>
>>> ./configure
>>> make
>>> sudo make install
>>>
>>>
>>>
>>>
>>>
>>>
>>> ---
>>> Fernando de Pol Mayer
>>> Doutorando em Estatística e Experimentação Agronômica
>>> Escola Superior de Agricultura "Luiz de Queiroz" - ESALQ
>>> Universidade de São Paulo - USP
>>> URL: http://fernandomayer.github.io
>>> <http://fernandomayer.github.com>
>>> e-mail: fernando.mayer [@] {gmail.com <http://gmail.com>,
>>> usp.br <http://usp.br>}
>>>
>>>
>>> 2013/9/6 Teodoro Calvo <teocalvo2 em gmail.com
>>> <mailto:teocalvo2 em gmail.com>>
>>>
>>> Olá, bom dia ! Tudo bem ?
>>>
>>> O senhor já tentou instala-lo pelo central de
>>> aplicativos Ubuntu ? Ao invés de baixa-lo em formato
>>> .tar.gz ?
>>>
>>> Acredito que seja uma boa saída.
>>>
>>> Tenho utilizado o RKWard, que utiliza o R 2.15. como
>>> base. Este também esta disponível no Central de
>>> Aplicativos Ubuntu.
>>>
>>> Caso não goste de usa um GUI para o R, também há
>>> possibilidade de utilização diretamente no terminal.
>>>
>>> Ctrl + Alt + t
>>>
>>> depois simplesmente digitando : R
>>>
>>> Espero que dê certo e tenha ajudado de alguma forma.
>>>
>>> Caso dê erro, possivelmente deve-se verificar se o R 3.0
>>> foi totalmente removido.
>>>
>>> Boa sorte.
>>>
>>> Att Téo Calvo.
>>>
>>>
>>>
>>> Em 06-09-2013 10:59, ASANTOS escreveu:
>>>> Bom dia pessoal,
>>>>
>>>>
>>>> Precisei reinstalar meu ubuntu 12.04 64bits e
>>>> abaixei o R.2.15.2.tar.gz, pois vários pacotes são
>>>> incompatíveis com o R.3.0, ou tenho que ficar buscando
>>>> soluções para cada pacote devido, error zero status na
>>>> instalação, portanto descompactei o R.2.15.2.tar.gz na
>>>> área de trabalho e quando faço ./ configure
>>>> LIBnn=libmake , recebo o seguinte erro:
>>>>
>>>> santos-a em santosa-K43E:~/Área de Trabalho/R-2.15.2$
>>>> ./configure LIBnn=libmake
>>>>
>>>> checking build system type... i686-pc-linux-gnu
>>>>
>>>> checking host system type... i686-pc-linux-gnu
>>>>
>>>> loading site script './config.site'
>>>>
>>>> loading build-specific script './config.site'
>>>>
>>>> checking for pwd... /bin/pwd
>>>>
>>>> checking whether builddir is srcdir... yes
>>>>
>>>> checking for working aclocal... missing
>>>>
>>>> checking for working autoconf... missing
>>>>
>>>> checking for working automake... missing
>>>>
>>>> checking for working autoheader... missing
>>>>
>>>> checking for gawk... no
>>>>
>>>> checking for mawk... mawk
>>>>
>>>> checking whether ln -s works... yes
>>>>
>>>> checking for bison... no
>>>>
>>>> checking for byacc... no
>>>>
>>>> checking for ar... ar
>>>>
>>>> checking for a BSD-compatible install...
>>>> /usr/bin/install -c
>>>>
>>>> checking for sed... /bin/sed
>>>>
>>>> checking for which... /usr/bin/which
>>>>
>>>> checking for less... /usr/bin/less
>>>>
>>>> checking for gtar... no
>>>>
>>>> checking for gnutar... no
>>>>
>>>> checking for tar... /bin/tar
>>>>
>>>> checking for tex... no
>>>>
>>>> checking for pdftex... no
>>>>
>>>> configure: WARNING: you cannot build PDF versions of
>>>> the R manuals
>>>>
>>>> checking for pdflatex... no
>>>>
>>>> configure: WARNING: you cannot build PDF versions of
>>>> vignettes and help pages
>>>>
>>>> checking for makeindex... no
>>>>
>>>> checking for makeinfo... no
>>>>
>>>> configure: WARNING: you cannot build info or HTML
>>>> versions of the R manuals
>>>>
>>>> checking for texi2dvi... no
>>>>
>>>> checking for kpsewhich... no
>>>>
>>>> checking for unzip... /usr/bin/unzip
>>>>
>>>> checking for zip... /usr/bin/zip
>>>>
>>>> checking for gzip... /bin/gzip
>>>>
>>>> checking for bzip2... /bin/bzip2
>>>>
>>>> checking for firefox... /usr/bin/firefox
>>>>
>>>> using default browser ... /usr/bin/firefox
>>>>
>>>> checking for acroread... no
>>>>
>>>> checking for acroread4... no
>>>>
>>>> checking for xdg-open... /usr/bin/xdg-open
>>>>
>>>> checking for notangle... false
>>>>
>>>> checking for pkg-config... /usr/bin/pkg-config
>>>>
>>>> checking for gcc... gcc
>>>>
>>>> checking whether the C compiler works... yes
>>>>
>>>> checking for C compiler default output file name... a.out
>>>>
>>>> checking for suffix of executables...
>>>>
>>>> checking whether we are cross compiling... no
>>>>
>>>> checking for suffix of object files... o
>>>>
>>>> checking whether we are using the GNU C compiler... yes
>>>>
>>>> checking whether gcc accepts -g... yes
>>>>
>>>> checking for gcc option to accept ISO C89... none needed
>>>>
>>>> checking how to run the C preprocessor... gcc -E
>>>>
>>>> checking for grep that handles long lines and -e...
>>>> /bin/grep
>>>>
>>>> checking for egrep... /bin/grep -E
>>>>
>>>> checking whether gcc needs -traditional... no
>>>>
>>>> checking how to run the C preprocessor... gcc -E
>>>>
>>>> checking for gfortran... no
>>>>
>>>> checking for f95... no
>>>>
>>>> checking for fort... no
>>>>
>>>> checking for xlf95... no
>>>>
>>>> checking for ifort... no
>>>>
>>>> checking for ifc... no
>>>>
>>>> checking for efc... no
>>>>
>>>> checking for pgf95... no
>>>>
>>>> checking for lf95... no
>>>>
>>>> checking for gfortran... no
>>>>
>>>> checking for ftn... no
>>>>
>>>> checking for g95... no
>>>>
>>>> checking for f90... no
>>>>
>>>> checking for xlf90... no
>>>>
>>>> checking for pgf90... no
>>>>
>>>> checking for pghpf... no
>>>>
>>>> checking for epcf90... no
>>>>
>>>> checking for g77... no
>>>>
>>>> checking for f77... no
>>>>
>>>> checking for xlf... no
>>>>
>>>> checking for frt... no
>>>>
>>>> checking for pgf77... no
>>>>
>>>> checking for cf77... no
>>>>
>>>> checking for fort77... no
>>>>
>>>> checking for fl32... no
>>>>
>>>> checking for af77... no
>>>>
>>>> checking for fc... no
>>>>
>>>>
>>>>
>>>> Alguém poderia me ajudar a selecionar o problema, tudo
>>>> que tentei no R help Simple compilation não funcionou,
>>>>
>>>> Obrigado,
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