[R-br] Problema para instalar R.2.15.2.tar.gz no ubuntu 12.04 64bits
ASANTOS
alexandresantosbr em yahoo.com.br
Quarta Setembro 18 15:03:18 BRT 2013
Fernando funcionou o Rstudio, porém,
Solicitou que eu criasse uma library pessoal e criei, mas
vários pacote ficaram duplicados quando fiz:
update.packages(checkBuilt = TRUE, ask = FALSE)
E não consigo instalar o rgdal, apresenta o seguinte erro:
ERROR: configuration failed for package 'rgdal'
* removing '/home/santos-a/R/i686-pc-linux-gnu-library/2.15/rgdal'
Warning in install.packages :
installation of package 'rgdal' had non-zero exit status
Tem mais alguma coisa que eu poderia fazer?
Obrigado,
Alexandre
Em 17/09/2013 14:05, Fernando Mayer escreveu:
> Tem que configurar o R como uma shared library para ter o libR.so.
>
> Desinstale e faça novamente com
>
> ./configure --enable-R-shlib
> make
> sudo make install
>
>
>
>
> ---
> Fernando de Pol Mayer
> Doutorando em Estatística e Experimentação Agronômica
> Escola Superior de Agricultura "Luiz de Queiroz" - ESALQ
> Universidade de São Paulo - USP
> URL: http://fernandomayer.github.io <http://fernandomayer.github.com>
> e-mail: fernando.mayer [@] {gmail.com <http://gmail.com>, usp.br
> <http://usp.br>}
>
>
> 2013/9/17 ASANTOS <alexandresantosbr em yahoo.com.br
> <mailto:alexandresantosbr em yahoo.com.br>>
>
> Obrigado Fernando,
>
> A instalação funcionou, porém como fiz:
>
>
> ./configure
> make
> sudo make install
>
> No diretório: santos-a em santosa-K43E:~/Documentos$ R-2.15.2
>
> No terminal o R funcionou OK, mas quando instalei o Rstudio após
> ele não funciona e acusa a seguinte mensagem:
>
> R Not Found
>
> R shared library (/usr/local/lib/R/lib/libR.so) not find. If this
> is a custom build of R, was it build with the enable --R-shlib option
>
>
> Eu teria que ter instalado a pasta em outro local?
>
> Obrigado,
>
>
> Alexandre
>
> Em 06/09/2013 13:53, Fernando Mayer escreveu:
>> 1) Vc precisa conferir se os pacotes que vc diz serem
>> incompativeis com o R 3.0.1 são realmente incompativeis, ou se
>> falta alguma configuração (ou pacote) no seu sistema. Acredito
>> que a grande maioria dos pacotes seja compatível pois esse versão
>> já foi lançada há alguns meses.
>>
>> 2) Caso você veja que é realmente necessário instalar (e
>> _compilar_) a versão anterior (2.15.2), vc precisa antes ter
>> todas as ferramentas necessárias para a compilação (que
>> aparentemente não estão instaladas). Faça:
>>
>> sudo apt-get install build-essential
>> sudo apt-get buil-dep r-base
>>
>> E depois
>>
>> ./configure
>> make
>> sudo make install
>>
>>
>>
>>
>>
>>
>> ---
>> Fernando de Pol Mayer
>> Doutorando em Estatística e Experimentação Agronômica
>> Escola Superior de Agricultura "Luiz de Queiroz" - ESALQ
>> Universidade de São Paulo - USP
>> URL: http://fernandomayer.github.io <http://fernandomayer.github.com>
>> e-mail: fernando.mayer [@] {gmail.com <http://gmail.com>, usp.br
>> <http://usp.br>}
>>
>>
>> 2013/9/6 Teodoro Calvo <teocalvo2 em gmail.com
>> <mailto:teocalvo2 em gmail.com>>
>>
>> Olá, bom dia ! Tudo bem ?
>>
>> O senhor já tentou instala-lo pelo central de aplicativos
>> Ubuntu ? Ao invés de baixa-lo em formato .tar.gz ?
>>
>> Acredito que seja uma boa saída.
>>
>> Tenho utilizado o RKWard, que utiliza o R 2.15. como base.
>> Este também esta disponível no Central de Aplicativos Ubuntu.
>>
>> Caso não goste de usa um GUI para o R, também há
>> possibilidade de utilização diretamente no terminal.
>>
>> Ctrl + Alt + t
>>
>> depois simplesmente digitando : R
>>
>> Espero que dê certo e tenha ajudado de alguma forma.
>>
>> Caso dê erro, possivelmente deve-se verificar se o R 3.0 foi
>> totalmente removido.
>>
>> Boa sorte.
>>
>> Att Téo Calvo.
>>
>>
>>
>> Em 06-09-2013 10:59, ASANTOS escreveu:
>>> Bom dia pessoal,
>>>
>>>
>>> Precisei reinstalar meu ubuntu 12.04 64bits e abaixei o
>>> R.2.15.2.tar.gz, pois vários pacotes são incompatíveis com o
>>> R.3.0, ou tenho que ficar buscando soluções para cada pacote
>>> devido, error zero status na instalação, portanto
>>> descompactei o R.2.15.2.tar.gz na área de trabalho e quando
>>> faço ./ configure LIBnn=libmake , recebo o seguinte erro:
>>>
>>> santos-a em santosa-K43E:~/Área de Trabalho/R-2.15.2$
>>> ./configure LIBnn=libmake
>>>
>>> checking build system type... i686-pc-linux-gnu
>>>
>>> checking host system type... i686-pc-linux-gnu
>>>
>>> loading site script './config.site'
>>>
>>> loading build-specific script './config.site'
>>>
>>> checking for pwd... /bin/pwd
>>>
>>> checking whether builddir is srcdir... yes
>>>
>>> checking for working aclocal... missing
>>>
>>> checking for working autoconf... missing
>>>
>>> checking for working automake... missing
>>>
>>> checking for working autoheader... missing
>>>
>>> checking for gawk... no
>>>
>>> checking for mawk... mawk
>>>
>>> checking whether ln -s works... yes
>>>
>>> checking for bison... no
>>>
>>> checking for byacc... no
>>>
>>> checking for ar... ar
>>>
>>> checking for a BSD-compatible install... /usr/bin/install -c
>>>
>>> checking for sed... /bin/sed
>>>
>>> checking for which... /usr/bin/which
>>>
>>> checking for less... /usr/bin/less
>>>
>>> checking for gtar... no
>>>
>>> checking for gnutar... no
>>>
>>> checking for tar... /bin/tar
>>>
>>> checking for tex... no
>>>
>>> checking for pdftex... no
>>>
>>> configure: WARNING: you cannot build PDF versions of the R
>>> manuals
>>>
>>> checking for pdflatex... no
>>>
>>> configure: WARNING: you cannot build PDF versions of
>>> vignettes and help pages
>>>
>>> checking for makeindex... no
>>>
>>> checking for makeinfo... no
>>>
>>> configure: WARNING: you cannot build info or HTML versions
>>> of the R manuals
>>>
>>> checking for texi2dvi... no
>>>
>>> checking for kpsewhich... no
>>>
>>> checking for unzip... /usr/bin/unzip
>>>
>>> checking for zip... /usr/bin/zip
>>>
>>> checking for gzip... /bin/gzip
>>>
>>> checking for bzip2... /bin/bzip2
>>>
>>> checking for firefox... /usr/bin/firefox
>>>
>>> using default browser ... /usr/bin/firefox
>>>
>>> checking for acroread... no
>>>
>>> checking for acroread4... no
>>>
>>> checking for xdg-open... /usr/bin/xdg-open
>>>
>>> checking for notangle... false
>>>
>>> checking for pkg-config... /usr/bin/pkg-config
>>>
>>> checking for gcc... gcc
>>>
>>> checking whether the C compiler works... yes
>>>
>>> checking for C compiler default output file name... a.out
>>>
>>> checking for suffix of executables...
>>>
>>> checking whether we are cross compiling... no
>>>
>>> checking for suffix of object files... o
>>>
>>> checking whether we are using the GNU C compiler... yes
>>>
>>> checking whether gcc accepts -g... yes
>>>
>>> checking for gcc option to accept ISO C89... none needed
>>>
>>> checking how to run the C preprocessor... gcc -E
>>>
>>> checking for grep that handles long lines and -e... /bin/grep
>>>
>>> checking for egrep... /bin/grep -E
>>>
>>> checking whether gcc needs -traditional... no
>>>
>>> checking how to run the C preprocessor... gcc -E
>>>
>>> checking for gfortran... no
>>>
>>> checking for f95... no
>>>
>>> checking for fort... no
>>>
>>> checking for xlf95... no
>>>
>>> checking for ifort... no
>>>
>>> checking for ifc... no
>>>
>>> checking for efc... no
>>>
>>> checking for pgf95... no
>>>
>>> checking for lf95... no
>>>
>>> checking for gfortran... no
>>>
>>> checking for ftn... no
>>>
>>> checking for g95... no
>>>
>>> checking for f90... no
>>>
>>> checking for xlf90... no
>>>
>>> checking for pgf90... no
>>>
>>> checking for pghpf... no
>>>
>>> checking for epcf90... no
>>>
>>> checking for g77... no
>>>
>>> checking for f77... no
>>>
>>> checking for xlf... no
>>>
>>> checking for frt... no
>>>
>>> checking for pgf77... no
>>>
>>> checking for cf77... no
>>>
>>> checking for fort77... no
>>>
>>> checking for fl32... no
>>>
>>> checking for af77... no
>>>
>>> checking for fc... no
>>>
>>>
>>>
>>> Alguém poderia me ajudar a selecionar o problema, tudo que
>>> tentei no R help Simple compilation não funcionou,
>>>
>>> Obrigado,
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