[R-br] Inserção de EIXOS (vetores) em NMDS

Sábado Março 16 01:39:02 BRT 2013

tente algo parecido com isso:
http://www.r-bloggers.com/customising-vegan%E2%80%99s-ordination-plots/

Em 15 de março de 2013 20:06, Márcio Mendonça <mwmendonca em yahoo.com.br>escreveu:

> Prezados,
> como faço para inserir os eixos(tipo vetores) em um gráfico de ordenação,
> por exemplo em nmds? existe algum pacote?
>  ATT
> Márcio
>
>
>
>
>
>    *De:* Márcio Mendonça <mwmendonca em yahoo.com.br>
> *Para:* "r-br em listas.c3sl.ufpr.br" <r-br em listas.c3sl.ufpr.br>
> *Enviadas:* Sexta-feira, 15 de Março de 2013 20:04
> *Assunto:* Re: Digest R-br, volume 25, assunto 23
>
> Prezados,
> como faço para inserir os eixos(tipo vetores) em um gráfico de ordenação,
> por exemplo em nmds? existe algum pacote?
>
> ATT
> Márcio
>
>
>
>
>
> ----- Mensagem original -----
> De: "r-br-request em listas.c3sl.ufpr.br" <r-br-request em listas.c3sl.ufpr.br>
> Para: r-br em listas.c3sl.ufpr.br
> Cc:
> Enviadas: Sexta-feira, 15 de Março de 2013 12:00
> Assunto: Digest R-br, volume 25, assunto 23
>
> Enviar submissões para a lista de discussão R-br para
>     r-br em listas.c3sl.ufpr.br
>
> Para se cadastrar ou descadastrar via WWW, visite o endereço
>     https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br
> ou, via email, envie uma mensagem com a palavra 'help' no assunto ou
> corpo da mensagem para
>     r-br-request em listas.c3sl.ufpr.br
>
> Você poderá entrar em contato com a pessoa que gerencia a lista pelo
> endereço
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>
> Quando responder, por favor edite sua linha Assunto assim ela será
> mais específica que "Re: Contents of R-br digest..."
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>   1. Re: Eliminar Vetores Repetidos.... (Benilton Carvalho)
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>
> Message: 1
> Date: Thu, 14 Mar 2013 23:35:35 -0300
> From: Benilton Carvalho <beniltoncarvalho em gmail.com>
> To: r-br em listas.c3sl.ufpr.br
> Subject: Re: [R-br] Eliminar Vetores Repetidos....
> Message-ID:
>     <CAO-arWOhcFpUORJqsfobJvOm-W1fw-a7rH-+MpY4pqJSvWfqtQ em mail.gmail.com>
> Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1"
>
> As linhas 1 e 5 só são iguais depois de ordenar. Correto? Seu objeto final
> pode ter as linhas ordenadas?
> On Mar 14, 2013 11:19 PM, <andrebvs em bol.com.br> wrote:
>
> > Olá colegas!
> >
> > Gostaria de saber como posso eliminar de uma matrix vetores repetidos, no
> > exemplo abaixo, a linha1 e a linha5 são iguais, gostaria que houvesse uma
> > outra matrix ou dataframe com apenas as linhas não repetidas.
> >
> > Seja a matrix 6x4:
> >
> > linha1 <- 1,2,4,5
> > linha2 <- 7,2,1,5
> >  linha3 <- 9,3,1,5
> > linha4 <- 6,2,1,5
> >  linha5 <- 5,2,1,4
> > linha6 <- 9,2,1,5
> >
> > desde já agradeço!
> >
> > *Att.*
> > *André*
> >
> > _______________________________________________
> > R-br mailing list
> > R-br em listas.c3sl.ufpr.br
> > https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br
> > Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça
> > código mínimo reproduzível.
> >
> -------------- Próxima Parte ----------
> Um anexo em HTML foi limpo...
> URL: <
> http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20130314/8c6945e1/attachment-0001.html
> >
>
> ------------------------------
>
> Message: 2
> Date: Thu, 14 Mar 2013 23:36:46 -0300
> From: andrebvs em bol.com.br
> To: r-br em listas.c3sl.ufpr.br
> Subject: Re: [R-br] Eliminar Vetores Repetidos....
> Message-ID: <5142893ea22da_53997e1447815f em a4-winter14.tmail>
> Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1"
>
> Um anexo em HTML foi limpo...
> URL: <
> http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20130314/bde11ea4/attachment-0001.html
> >
>
> ------------------------------
>
> Message: 3
> Date: Thu, 14 Mar 2013 23:46:45 -0300
> From: Benilton Carvalho <beniltoncarvalho em gmail.com>
> To: r-br em listas.c3sl.ufpr.br
> Subject: Re: [R-br] Eliminar Vetores Repetidos....
> Message-ID:
>     <CAO-arWMAE3Sbbys83y-S=8jfQ7s6DQJz9upKJp-OzxfwdSTR+Q em mail.gmail.com>
> Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1"
>
> unique(t(apply(x, 1, sort)))
> On Mar 14, 2013 11:36 PM, <andrebvs em bol.com.br> wrote:
>
> > Olá Benilton!
> >
> > No resultado final, tanto faz, ter linha ordenada ou não.
> >
> > ------------------------------
> > Em 14/03/2013 23:35, *Benilton Carvalho < beniltoncarvalho em gmail.com>*escreveu:
> >
> > As linhas 1 e 5 só são iguais depois de ordenar. Correto? Seu objeto
> final
> > pode ter as linhas ordenadas?
> > On Mar 14, 2013 11:19 PM, <andrebvs em bol.com.br<
> http://../undefined/compose?to=andrebvs@bol.com.br>>
> > wrote:
> >
> >> Olá colegas!
> >>
> >> Gostaria de saber como posso eliminar de uma matrix vetores repetidos,
> no
> >> exemplo abaixo, a linha1 e a linha5 são iguais, gostaria que houvesse
> uma
> >> outra matrix ou dataframe com apenas as linhas não repetidas.
> >>
> >> Seja a matrix 6x4:
> >>
> >> linha1
> >> linha2
> >> linha3linha4
> >> linha5linha6
> >>
> >> desde já agradeço!
> >>
> >> *Att.*
> >> *André*
> >>
> >> _______________________________________________
> >> R-br mailing list
> >> R-br em listas.c3sl.ufpr.br<
> http://../undefined/compose?to=R-br@listas.c3sl.ufpr.br>
> >> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br
> >> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça
> >> código mínimo reproduzível.
> >>
> >
> >
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> > https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br
> > Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça
> > código mínimo reproduzível.
> >
> -------------- Próxima Parte ----------
> Um anexo em HTML foi limpo...
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> http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20130314/5236f633/attachment-0001.html
> >
>
> ------------------------------
>
> Message: 4
> Date: Thu, 14 Mar 2013 23:50:45 -0300
> From: andrebvs em bol.com.br
> To: r-br em listas.c3sl.ufpr.br
> Subject: Re: [R-br] Eliminar Vetores Repetidos....
> Message-ID: <51428c8569331_5355d95547c1029 em a4-winter11.tmail>
> Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1"
>
> Um anexo em HTML foi limpo...
> URL: <
> http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20130314/ac92d8b3/attachment-0001.html
> >
>
> ------------------------------
>
> Message: 5
> Date: Fri, 15 Mar 2013 00:00:57 -0300
> From: Benilton Carvalho <beniltoncarvalho em gmail.com>
> To: r-br em listas.c3sl.ufpr.br
> Subject: Re: [R-br] Eliminar Vetores Repetidos....
> Message-ID:
>     <CAO-arWMEHpC353V+3+EUG=uzfwi=iYY1opvEiFvwfLnsp0GsCQ em mail.gmail.com>
> Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1"
>
> duplicated(t(apply(x, 1, sort)), fromLast=FALSE) | duplicated(t(apply(x, 1,
> sort)), fromLast=TRUE)
> On Mar 14, 2013 11:50 PM, <andrebvs em bol.com.br> wrote:
>
> > Obrigado benilton, tinha acabado de utilizar esse simples comando mesmo:
> >
> > L1 <- c(1,2,4,5)
> > L2 <- c(7,2,1,5)
> > L3 <- c(9,3,1,5)
> > L4 <- c(6,2,1,5)
> > L5 <- c(5,2,1,4)
> > L6 <- c(9,2,1,5)
> >
> > M = matrix(c(L1,L2,L3,L4,L5,L6),,4,byrow=T)
> >
> > unique(t(apply(M,1,sort)))
> >
> > Agora, teria como verificar, por exemplo, quais linhas foram repetidas na
> > matrix M?
> >
> > *Att.*
> > *André*
> >
> > ------------------------------
> > Em 14/03/2013 23:46, *Benilton Carvalho < beniltoncarvalho em gmail.com>*escreveu:
> >
> > unique(t(apply(x, 1, sort)))
> > On Mar 14, 2013 11:36 PM, <andrebvs em bol.com.br<
> http://../undefined/compose?to=andrebvs@bol.com.br>>
> > wrote:
> >
> >> Olá Benilton!
> >>
> >> No resultado final, tanto faz, ter linha ordenada ou não.
> >>
> >> ------------------------------
> >> Em 14/03/2013 23:35, *Benilton Carvalho < beniltoncarvalho em gmail.com<
> http://../undefined/compose?to=beniltoncarvalho@gmail.com>>
> >> * escreveu:
> >>
> >> As linhas 1 e 5 só são iguais depois de ordenar. Correto? Seu objeto
> >> final pode ter as linhas ordenadas?
> >> On Mar 14, 2013 11:19 PM, <andrebvs em bol.com.br<
> http://../undefined/compose?to=andrebvs@bol.com.br>>
> >> wrote:
> >>
> >>> Olá colegas!
> >>>
> >>> Gostaria de saber como posso eliminar de uma matrix vetores repetidos,
> >>> no exemplo abaixo, a linha1 e a linha5 são iguais, gostaria que
> houvesse
> >>> uma outra matrix ou dataframe com apenas as linhas não repetidas.
> >>>
> >>> Seja a matrix 6x4:
> >>>
> >>> linha1
> >>> linha2
> >>> linha3linha4
> >>> linha5linha6
> >>>
> >>> desde já agradeço!
> >>>
> >>> *Att.*
> >>> *André*
> >>>
> >>> _______________________________________________
> >>> R-br mailing list
> >>> R-br em listas.c3sl.ufpr.br<
> http://../undefined/compose?to=R-br@listas.c3sl.ufpr.br>
> >>> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br
> >>> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça
> >>> código mínimo reproduzível.
> >>>
> >>
> >>
> >> _______________________________________________
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> http://../undefined/compose?to=R-br@listas.c3sl.ufpr.br>
> >> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br
> >> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça
> >> código mínimo reproduzível.
> >
> >
> >
> > _______________________________________________
> > R-br mailing list
> > R-br em listas.c3sl.ufpr.br
> > https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br
> > Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça
> > código mínimo reproduzível.
> >
> -------------- Próxima Parte ----------
> Um anexo em HTML foi limpo...
> URL: <
> http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20130315/068a9c48/attachment-0001.html
> >
>
> ------------------------------
>
> Message: 6
> Date: Fri, 15 Mar 2013 00:01:20 -0300
> From: Benilton Carvalho <beniltoncarvalho em gmail.com>
> To: r-br em listas.c3sl.ufpr.br
> Subject: Re: [R-br] Eliminar Vetores Repetidos....
> Message-ID:
>     <CAO-arWMuYJhu+kN58urRXLVxY1e1AgDHyGcy-E-i8fUtBT9B2g em mail.gmail.com>
> Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1"
>
> Tudo em uma linha só
> On Mar 15, 2013 12:00 AM, "Benilton Carvalho" <beniltoncarvalho em gmail.com>
> wrote:
>
> > duplicated(t(apply(x, 1, sort)), fromLast=FALSE) | duplicated(t(apply(x,
> > 1, sort)), fromLast=TRUE)
> > On Mar 14, 2013 11:50 PM, <andrebvs em bol.com.br> wrote:
> >
> >> Obrigado benilton, tinha acabado de utilizar esse simples comando mesmo:
> >>
> >> L1 <- c(1,2,4,5)
> >> L2 <- c(7,2,1,5)
> >> L3 <- c(9,3,1,5)
> >> L4 <- c(6,2,1,5)
> >> L5 <- c(5,2,1,4)
> >> L6 <- c(9,2,1,5)
> >>
> >> M = matrix(c(L1,L2,L3,L4,L5,L6),,4,byrow=T)
> >>
> >> unique(t(apply(M,1,sort)))
> >>
> >> Agora, teria como verificar, por exemplo, quais linhas foram repetidas
> na
> >> matrix M?
> >>
> >> *Att.*
> >> *André*
> >>
> >> ------------------------------
> >> Em 14/03/2013 23:46, *Benilton Carvalho < beniltoncarvalho em gmail.com>*escreveu:
> >>
> >> unique(t(apply(x, 1, sort)))
> >> On Mar 14, 2013 11:36 PM, <andrebvs em bol.com.br<
> http://../undefined/compose?to=andrebvs@bol.com.br>>
> >> wrote:
> >>
> >>> Olá Benilton!
> >>>
> >>> No resultado final, tanto faz, ter linha ordenada ou não.
> >>>
> >>> ------------------------------
> >>> Em 14/03/2013 23:35, *Benilton Carvalho < beniltoncarvalho em gmail.com<
> http://../undefined/compose?to=beniltoncarvalho@gmail.com>>
> >>> * escreveu:
> >>>
> >>> As linhas 1 e 5 só são iguais depois de ordenar. Correto? Seu objeto
> >>> final pode ter as linhas ordenadas?
> >>> On Mar 14, 2013 11:19 PM, <andrebvs em bol.com.br<
> http://../undefined/compose?to=andrebvs@bol.com.br>>
> >>> wrote:
> >>>
> >>>> Olá colegas!
> >>>>
> >>>> Gostaria de saber como posso eliminar de uma matrix vetores repetidos,
> >>>> no exemplo abaixo, a linha1 e a linha5 são iguais, gostaria que
> houvesse
> >>>> uma outra matrix ou dataframe com apenas as linhas não repetidas.
> >>>>
> >>>> Seja a matrix 6x4:
> >>>>
> >>>> linha1
> >>>> linha2
> >>>> linha3linha4
> >>>> linha5linha6
> >>>>
> >>>> desde já agradeço!
> >>>>
> >>>> *Att.*
> >>>> *André*
> >>>>
> >>>> _______________________________________________
> >>>> R-br mailing list
> >>>> R-br em listas.c3sl.ufpr.br<
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> >>>> código mínimo reproduzível.
> >>>>
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> >>> código mínimo reproduzível.
> >>
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> >> R-br mailing list
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> >> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br
> >> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça
> >> código mínimo reproduzível.
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> Um anexo em HTML foi limpo...
> URL: <
> http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20130315/4352bc55/attachment-0001.html
> >
>
> ------------------------------
>
> Message: 7
> Date: Fri, 15 Mar 2013 00:06:01 -0300
> From: andrebvs em bol.com.br
> To: r-br em listas.c3sl.ufpr.br
> Subject: Re: [R-br] Eliminar Vetores Repetidos....
> Message-ID: <5142901979a1c_7a8c3ab6c6c1e1 em a4-winter18.tmail>
> Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1"
>
> Um anexo em HTML foi limpo...
> URL: <
> http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20130315/8e99627e/attachment-0001.html
> >
>
> ------------------------------
>
> Message: 8
> Date: Fri, 15 Mar 2013 11:21:03 +0100
> From: Elias Teixeira Krainski <eliaskrainski em yahoo.com.br>
> To: r-br em listas.c3sl.ufpr.br
> Subject: Re: [R-br] Eliminar Vetores Repetidos....
> Message-ID: <1363342863.2119.2.camel em eliasn2>
> Content-Type: text/plain; charset="UTF-8"
>
> Vc não enviou um CMR. Supondo x sua matriz, use
>   unique(x)
>
>
>
>
> ------------------------------
>
> Message: 9
> Date: Fri, 15 Mar 2013 09:57:40 -0300 (BRT)
> From: Paulo Justiniano <paulojus em leg.ufpr.br>
> To: r-br em listas.c3sl.ufpr.br
> Subject: Re: [R-br] Nome das linhas em um data frame
> Message-ID: <alpine.DEB.2.00.1303150955570.5400 em pataxo.est.ufpr.br>
> Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1"; Format="flowed"
>
> importe com
>
> dados<-read.csv("my_data.csv",h=T, row.names=1)
>
> uma vez gravado como texto nao há indicacao para o que é me de linha ou
> variavel
>
> se quiser preservar a estrutura do objeto xporte em outro formado em que
> tal estrutura seja preservada (dput, save, dump ou similar)
>
>
> On Thu, 14 Mar 2013, Luciano F. Sgarbi wrote:
>
> >
> > Prezados,
> > Estou com um pequeno problema em importar um conjunto de dados para o R.
> > Eu estou criando um conjunto de dados e salvando ele no formato ".csv"
> > Quando eu importo o conjunto de dados para o R, o nome das linhas se
> transforma em uma nova variável.
> > No entanto quando eu salvo o arquivo em formato ".txt" esse erro
> > não ocorre.
> > Acredito que a resolução deste problema seja muito simples, no entanto
> não estou conseguindo encontrar essa tal solução.
> >
> > Se puderem me ajudar ficarei muito grato!
> > O CMR segue abaixo:
> >
> > my.data<-data.frame(v1=c(letters[1:5]),v2=1:5,v3=100:104)
> > rownames(my.data)<-LETTERS[1:5]
> > my.data
> > write.csv(my.data,"my_data.csv")
> > dados<-read.csv("my_data.csv",h=T)
> > dados
> >
> >
> > Abraços,
> > Luciano
> >
> > --
> >
> > Luciano F. Sgarbi
> >
> > Mestrando em Ecologia e Evolução
> > Laboratório de Ecologia de Insetos (sl. 222)
> > Departamento de Ecologia
> > Instituto de Ciências Biológicas - ICB 1
> > Universidade Federal de Goiás, campus II
> > Goiânia-GO
> > 74001-970
> > Brazil
> >
> >
> >
> >
>
> ------------------------------
>
> _______________________________________________
> R-br mailing list
> R-br em listas.c3sl.ufpr.br
> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br
>
>
> Fim da Digest R-br, volume 25, assunto 23
> *****************************************
>
>
>
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> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça
> código mínimo reproduzível.
>

-- 

*Luciano F. Sgarbi*

Mestrando em Ecologia e Evolução
Laboratório de Ecologia de Insetos (sl. 222)
Departamento de Ecologia
Instituto de Ciências Biológicas - ICB 1
Universidade Federal de Goiás, campus II
Goiânia-GO
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