[R-br] Inserção de EIXOS (vetores) em NMDS

Márcio Mendonça mwmendonca em yahoo.com.br
Sexta Março 15 20:06:26 BRT 2013 

Prezados,
como faço para inserir os eixos(tipo vetores) em um gráfico de ordenação, por exemplo em nmds? existe algum pacote? 
ATT
Márcio  
 


 
 

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 De: Márcio Mendonça <mwmendonca em yahoo.com.br>
Para: "r-br em listas.c3sl.ufpr.br" <r-br em listas.c3sl.ufpr.br> 
Enviadas: Sexta-feira, 15 de Março de 2013 20:04
Assunto: Re: Digest R-br, volume 25, assunto 23
  

Prezados,
como faço para inserir os eixos(tipo vetores) em um gráfico de ordenação, por exemplo em nmds? existe algum pacote?
 
ATT
Márcio 
 


 


----- Mensagem original -----
De: "r-br-request em listas.c3sl.ufpr.br" <r-br-request em listas.c3sl.ufpr.br>
Para: r-br em listas.c3sl.ufpr.br
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Enviadas: Sexta-feira, 15 de Março de 2013 12:00
Assunto: Digest R-br, volume 25, assunto 23

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Message: 1
Date: Thu, 14 Mar 2013 23:35:35 -0300
From: Benilton
 Carvalho <beniltoncarvalho em gmail.com>
To: r-br em listas.c3sl.ufpr.br
Subject: Re: [R-br] Eliminar Vetores Repetidos....
Message-ID:
    <CAO-arWOhcFpUORJqsfobJvOm-W1fw-a7rH-+MpY4pqJSvWfqtQ em mail.gmail.com>
Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1"

As linhas 1 e 5 só são iguais depois de ordenar. Correto? Seu objeto final
pode ter as linhas ordenadas?
On Mar 14, 2013 11:19 PM, <andrebvs em bol.com.br> wrote:

> Olá colegas!
>
> Gostaria de saber como posso eliminar de uma matrix vetores repetidos, no
> exemplo
 abaixo, a linha1 e a linha5 são iguais, gostaria que houvesse uma
> outra matrix ou dataframe com apenas as linhas não repetidas.
>
> Seja a matrix 6x4:
>
> linha1 <- 1,2,4,5
> linha2 <- 7,2,1,5
>  linha3 <- 9,3,1,5
> linha4 <- 6,2,1,5
>  linha5 <- 5,2,1,4
> linha6 <- 9,2,1,5
>
> desde já agradeço!
>
> *Att.*
> *André*
>
> _______________________________________________
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> R-br em listas.c3sl.ufpr.br
> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br
> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça
> código
 mínimo reproduzível.
>
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Message: 2
Date: Thu, 14 Mar 2013 23:36:46 -0300
From: andrebvs em bol.com.br
To: r-br em listas.c3sl.ufpr.br
Subject: Re: [R-br] Eliminar Vetores Repetidos....
Message-ID: <5142893ea22da_53997e1447815f em a4-winter14.tmail>
Content-Type: text/plain;
 charset="iso-8859-1"

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URL: <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20130314/bde11ea4/attachment-0001.html>

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Message: 3
Date: Thu, 14 Mar 2013 23:46:45 -0300
From: Benilton Carvalho <beniltoncarvalho em gmail.com>
To: r-br em listas.c3sl.ufpr.br
Subject: Re: [R-br] Eliminar Vetores Repetidos....
Message-ID:
    <CAO-arWMAE3Sbbys83y-S=8jfQ7s6DQJz9upKJp-OzxfwdSTR+Q em mail.gmail.com>
Content-Type: text/plain;
 charset="iso-8859-1"

unique(t(apply(x, 1, sort)))
On Mar 14, 2013 11:36 PM, <andrebvs em bol.com.br> wrote:

> Olá Benilton!
>
> No resultado final, tanto faz, ter linha ordenada ou não.
>
> ------------------------------
> Em 14/03/2013 23:35, *Benilton Carvalho < beniltoncarvalho em gmail.com >*escreveu:
>
> As linhas 1 e 5 só são iguais depois de ordenar. Correto? Seu objeto final
> pode ter as linhas ordenadas?
> On Mar 14, 2013 11:19 PM, <andrebvs em bol.com.br<http://../undefined/compose?to=andrebvs@bol.com.br>>
>
 wrote:
>
>> Olá colegas!
>>
>> Gostaria de saber como posso eliminar de uma matrix vetores repetidos, no
>> exemplo abaixo, a linha1 e a linha5 são iguais, gostaria que houvesse uma
>> outra matrix ou dataframe com apenas as linhas não repetidas.
>>
>> Seja a matrix 6x4:
>>
>> linha1
>> linha2
>> linha3linha4
>> linha5linha6
>>
>> desde já agradeço!
>>
>> *Att.*
>> *André*
>>
>> _______________________________________________
>> R-br mailing list
>> R-br em listas.c3sl.ufpr.br<http://../undefined/compose?to=R-br@listas.c3sl.ufpr.br>
>> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br
>> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça
>> código mínimo reproduzível.
>>
>
>
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> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br
> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça
> código mínimo reproduzível.
>
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Message: 4
Date: Thu, 14 Mar 2013 23:50:45 -0300
From: andrebvs em bol.com.br
To: r-br em listas.c3sl.ufpr.br
Subject: Re: [R-br] Eliminar Vetores Repetidos....
Message-ID: <51428c8569331_5355d95547c1029 em a4-winter11.tmail>
Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1"

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Message: 5
Date: Fri, 15 Mar 2013 00:00:57 -0300
From: Benilton Carvalho <beniltoncarvalho em gmail.com>
To: r-br em listas.c3sl.ufpr.br
Subject: Re: [R-br] Eliminar Vetores Repetidos....
Message-ID:
    <CAO-arWMEHpC353V+3+EUG=uzfwi=iYY1opvEiFvwfLnsp0GsCQ em mail.gmail.com>
Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1"

duplicated(t(apply(x, 1, sort)),
 fromLast=FALSE) | duplicated(t(apply(x, 1,
sort)), fromLast=TRUE)
On Mar 14, 2013 11:50 PM, <andrebvs em bol.com.br> wrote:

> Obrigado benilton, tinha acabado de utilizar esse simples comando mesmo:
>
> L1 <- c(1,2,4,5)
> L2 <- c(7,2,1,5)
> L3 <- c(9,3,1,5)
> L4 <- c(6,2,1,5)
> L5 <- c(5,2,1,4)
> L6 <- c(9,2,1,5)
>
> M = matrix(c(L1,L2,L3,L4,L5,L6),,4,byrow=T)
>
> unique(t(apply(M,1,sort)))
>
> Agora, teria como verificar, por exemplo, quais linhas foram repetidas na
> matrix M?
>
> *Att.*
> *André*
>
> ------------------------------
> Em 14/03/2013 23:46, *Benilton Carvalho < beniltoncarvalho em gmail.com >*escreveu:
>
> unique(t(apply(x, 1, sort)))
> On Mar 14, 2013 11:36 PM, <andrebvs em bol.com.br<http://../undefined/compose?to=andrebvs@bol.com.br>>
> wrote:
>
>> Olá Benilton!
>>
>> No resultado final, tanto faz, ter linha ordenada ou não.
>>
>> ------------------------------
>> Em 14/03/2013 23:35, *Benilton Carvalho < beniltoncarvalho em gmail.com<http://../undefined/compose?to=beniltoncarvalho@gmail.com>>
>> * escreveu:
>>
>> As linhas 1 e 5 só são iguais depois de ordenar. Correto?
 Seu objeto
>> final pode ter as linhas ordenadas?
>> On Mar 14, 2013 11:19 PM, <andrebvs em bol.com.br<http://../undefined/compose?to=andrebvs@bol.com.br>>
>> wrote:
>>
>>> Olá colegas!
>>>
>>> Gostaria de saber como posso eliminar de uma matrix vetores repetidos,
>>> no exemplo abaixo, a linha1 e a linha5 são iguais, gostaria que houvesse
>>> uma outra matrix ou dataframe com apenas as linhas não repetidas.
>>>
>>> Seja a matrix 6x4:
>>>
>>> linha1
>>> linha2
>>> linha3linha4
>>> linha5linha6
>>>
>>> desde já agradeço!
>>>
>>> *Att.*
>>>
 *André*
>>>
>>> _______________________________________________
>>> R-br mailing list
>>> R-br em listas.c3sl.ufpr.br<http://../undefined/compose?to=R-br@listas.c3sl.ufpr.br>
>>> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br
>>> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça
>>> código mínimo reproduzível.
>>>
>>
>>
>> _______________________________________________
>> R-br mailing list
>> R-br em listas.c3sl.ufpr.br<http://../undefined/compose?to=R-br@listas.c3sl.ufpr.br>
>> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br
>> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça
>> código mínimo reproduzível.
>
>
>
> _______________________________________________
> R-br mailing list
> R-br em listas.c3sl.ufpr.br
> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br
> Leia o guia de
 postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça
> código mínimo reproduzível.
>
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Message: 6
Date: Fri, 15 Mar 2013 00:01:20 -0300
From: Benilton Carvalho <beniltoncarvalho em gmail.com>
To: r-br em listas.c3sl.ufpr.br
Subject: Re: [R-br] Eliminar Vetores Repetidos....
Message-ID:
    <CAO-arWMuYJhu+kN58urRXLVxY1e1AgDHyGcy-E-i8fUtBT9B2g em mail.gmail.com>
Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1"

Tudo em uma linha só
On Mar 15, 2013 12:00 AM, "Benilton Carvalho" <beniltoncarvalho em gmail.com>
wrote:

> duplicated(t(apply(x, 1, sort)), fromLast=FALSE) | duplicated(t(apply(x,
> 1, sort)), fromLast=TRUE)
> On Mar 14, 2013 11:50 PM, <andrebvs em bol.com.br> wrote:
>
>> Obrigado benilton, tinha acabado de utilizar esse simples comando mesmo:
>>
>> L1 <- c(1,2,4,5)
>> L2 <- c(7,2,1,5)
>> L3 <- c(9,3,1,5)
>> L4 <-
 c(6,2,1,5)
>> L5 <- c(5,2,1,4)
>> L6 <- c(9,2,1,5)
>>
>> M = matrix(c(L1,L2,L3,L4,L5,L6),,4,byrow=T)
>>
>> unique(t(apply(M,1,sort)))
>>
>> Agora, teria como verificar, por exemplo, quais linhas foram repetidas na
>> matrix M?
>>
>> *Att.*
>> *André*
>>
>> ------------------------------
>> Em 14/03/2013 23:46, *Benilton Carvalho < beniltoncarvalho em gmail.com >*escreveu:
>>
>> unique(t(apply(x, 1, sort)))
>> On Mar 14, 2013 11:36 PM, <andrebvs em bol.com.br<http://../undefined/compose?to=andrebvs@bol.com.br>>
>>
 wrote:
>>
>>> Olá Benilton!
>>>
>>> No resultado final, tanto faz, ter linha ordenada ou não.
>>>
>>> ------------------------------
>>> Em 14/03/2013 23:35, *Benilton Carvalho < beniltoncarvalho em gmail.com<http://../undefined/compose?to=beniltoncarvalho@gmail.com>>
>>> * escreveu:
>>>
>>> As linhas 1 e 5 só são iguais depois de ordenar. Correto? Seu objeto
>>> final pode ter as linhas ordenadas?
>>> On Mar 14, 2013 11:19 PM, <andrebvs em bol.com.br<http://../undefined/compose?to=andrebvs@bol.com.br>>
>>> wrote:
>>>
>>>> Olá colegas!
>>>>
>>>> Gostaria de saber como posso eliminar de uma matrix vetores repetidos,
>>>> no exemplo abaixo, a linha1 e a linha5 são iguais, gostaria que houvesse
>>>> uma outra matrix ou dataframe com apenas as linhas não repetidas.
>>>>
>>>> Seja a matrix 6x4:
>>>>
>>>> linha1
>>>> linha2
>>>> linha3linha4
>>>> linha5linha6
>>>>
>>>> desde já agradeço!
>>>>
>>>> *Att.*
>>>> *André*
>>>>
>>>> _______________________________________________
>>>> R-br mailing list
>>>> R-br em listas.c3sl.ufpr.br<http://../undefined/compose?to=R-br@listas.c3sl.ufpr.br>
>>>> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br
>>>> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça
>>>> código mínimo reproduzível.
>>>>
>>>
>>>
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>>> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br
>>> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça
>>> código mínimo reproduzível.
>>
>>
>>
>> _______________________________________________
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>> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br
>> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça
>> código mínimo reproduzível.
>>
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Message: 7
Date: Fri, 15 Mar 2013 00:06:01 -0300
From: andrebvs em bol.com.br
To: r-br em listas.c3sl.ufpr.br
Subject: Re: [R-br] Eliminar Vetores Repetidos....
Message-ID: <5142901979a1c_7a8c3ab6c6c1e1 em a4-winter18.tmail>
Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1"

Um anexo em HTML foi limpo...
URL: <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20130315/8e99627e/attachment-0001.html>

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Message: 8
Date: Fri, 15 Mar 2013 11:21:03 +0100
From: Elias Teixeira Krainski <eliaskrainski em yahoo.com.br>
To: r-br em listas.c3sl.ufpr.br
Subject: Re: [R-br] Eliminar Vetores Repetidos....
Message-ID: <1363342863.2119.2.camel em eliasn2>
Content-Type: text/plain;
 charset="UTF-8"

Vc não enviou um CMR. Supondo x sua matriz, use 
  unique(x)




------------------------------

Message: 9
Date: Fri, 15 Mar 2013 09:57:40 -0300 (BRT)
From: Paulo Justiniano <paulojus em leg.ufpr.br>
To: r-br em listas.c3sl.ufpr.br
Subject: Re: [R-br] Nome das linhas em um data frame
Message-ID: <alpine.DEB.2.00.1303150955570.5400 em pataxo.est.ufpr.br>
Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1"; Format="flowed"

importe com

dados<-read.csv("my_data.csv",h=T, row.names=1)

uma vez gravado como texto nao há indicacao para o que é me de linha ou 
variavel

se quiser preservar a estrutura do objeto xporte em outro formado em que 
tal estrutura seja preservada (dput, save, dump ou similar)


On Thu, 14 Mar 2013, Luciano F. Sgarbi wrote:

> 
> Prezados,
> Estou com um pequeno problema em importar um conjunto de dados para o R.
> Eu estou criando um conjunto de dados e salvando ele no formato ".csv"
> Quando eu importo o conjunto de dados para o R, o nome das linhas se transforma em uma nova variável.
> No entanto quando eu salvo o arquivo em formato ".txt" esse erro
> não ocorre.
> Acredito que a resolução deste problema seja muito simples, no entanto não estou conseguindo encontrar essa tal solução.
> 
> Se puderem me ajudar ficarei muito grato!
> O CMR segue abaixo:
> 
> my.data<-data.frame(v1=c(letters[1:5]),v2=1:5,v3=100:104)
> rownames(my.data)<-LETTERS[1:5]
>
 my.data
> write.csv(my.data,"my_data.csv")
> dados<-read.csv("my_data.csv",h=T)
> dados
> 
> 
> Abraços,
> Luciano
> 
> --
> 
> Luciano F. Sgarbi
> 
> Mestrando em Ecologia e Evolução
> Laboratório de Ecologia de Insetos (sl. 222)
> Departamento de Ecologia
> Instituto de Ciências Biológicas - ICB 1
> Universidade Federal de Goiás, campus II
> Goiânia-GO
> 74001-970
> Brazil
> 
> 
> 
>

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