[R-br] Sugestao de pacote

[Marcelo Laia]

Benilton,

Ce tem certeza que o snpStats do Bioconductor pode ser considerado?
Estive lendo sobre ele e vi tratar-se de SNPs.

Por favor, não vi como rodar meus dados nele.

Nesse meio tempo vi alguns pacotes: drc, eha e survival. No entanto,
eles analisam do lado do inseto. Eu quero analisar do lado da
planta. O pacote drc faz algo interessante, mas, considera
dosagens. Eu modifiquei o exemplo desse pacote e troquei doses para
tempo e herbicidas para genótipos. Ele fez o gráfico [1], mas, não sei
se a estatística por de trás está correta a essa questão.

1. https://dl.dropboxusercontent.com/u/34009642/Rplots.pdf

Alguma outra sugestão?

Laia

On 07/07/13 at 11:55pm, Benilton Carvalho wrote:
> snpStats é um pacote a considerar
> On 7 Jul 2013 18:50, "Marcelo Laia" <marcelolaia em gmail.com> wrote:
> 
> > Preciso realizar uma análise sobre a resistência de dado genótipo a
> > uma praga. O experimento foi o seguinte:
> >
> > genotipo   T0            T1  T2
> > 1          10            8   3
> > 2          10            10  10
> > 3          10            2   0
> > 4          10            1   0
> > 5          10            10  10
> > (...)
> > n          10            8   2
> >
> > Em cada genótipo foram adicionados 10 insetos no tempo zero e
> > passou-se a contar o número de sobreviventes a cada dia. Genótipos
> > onde os insetos morreram de início são mais resistentes que aqueles em
> > que os insetos sobreviveram mais tempo.
> >
> > Há repetição desse mesmo experimento ao longo do tempo. Foi observado
> > que em determinada época do ano a mortalidade varia.
> >
> > Poderia sugerir um pacote que auxilia nesse tipo de análise? Ou
> > sugerir material bibliográfico? Funções, etc...?
> >
> > Obrigado
> >
> >

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