[R-br] Método de Agrupamento Ward (bruno vidigal)

Leonard de Assis assis.leonard em gmail.com
Segunda Janeiro 28 11:01:26 BRST 2013


Bruno

Como minimizar a distância sem calcular a mesma?

pense nisso.

Em 27/01/2013 20:01, bruno vidigal escreveu:
> Oi Marcos,
>
> Concordo com o que vc falou sobre o Ward, mas continuo sem entender o 
> que o R faz.
> Veja bem meu raciocínio:
>
> Segundo Mingoti (2005) o método de Ward faz o seguinte:
>
> 1 - Calcula a soma de quadrados dentro de cada conglomerado;
>
> 2 - Calcula a soma de quadrados entre dois conglomerados;
>
> 3 - Os dois conglomerados que minimizam a distância calculada no item 
> 2 são combinados.
>
> Então, ao meu ver, não precisaria de uma matriz de distância como o R 
> pede já que o próprio método de Ward já utiliza a soma de quadrados 
> para agrupar os indivíduos mais homogêneos.
>
> Vou ler o material sugerido,
>
> abraço
>
>
> Em 27 de janeiro de 2013 19:04, Marcos Vital <marcosvital em gmail.com 
> <mailto:marcosvital em gmail.com>> escreveu:
>
>     Bruno, na verdade o método de Ward precisa sim da matriz de
>     distância como os outros métodos de clsuter; o que muda é a forma
>     como ele cria o dendograma.
>
>     Ele calcula a soma dos quadrados das distâncias entre os objetos,
>     dividida pelo número de objetos, buscando minimizá-la. Então é
>     necessária uma matriz de distância como nos outros casos, e o que
>     muda na função hclust é o argumento method="ward".
>
>     Se tiver acesso, veja o excelente *Numerical Ecology with R*
>     (Bocard, Gillet & Legendre, 2011), que é uma excelente fonte para
>     estudar métodos multivariados no R (o foco é em Ecologia, mas com
>     certeza pode ser útil em outros casos).
>
>     Abraços
>
>     Marcos
>
>     -- 
>     Marcos Vinícius Carneiro Vital
>     Universidade Federal de Alagoas
>     Instituto de Ciências Biológicas e da Saúde
>     Setor de Biodiversidade e Ecologia
>
>     _______________________________________________
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>     Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e
>     forneça código mínimo reproduzível.
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> -- 
> Bruno C. Vidigal
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