[R-br] Método de Agrupamento Ward (bruno vidigal)

bruno vidigal caetano.vidigal em gmail.com
Domingo Janeiro 27 20:01:41 BRST 2013


Oi Marcos,

Concordo com o que vc falou sobre o Ward, mas continuo sem entender o que o
R faz.
Veja bem meu raciocínio:

Segundo Mingoti (2005) o método de Ward faz o seguinte:

1 - Calcula a soma de quadrados dentro de cada conglomerado;

2 - Calcula a soma de quadrados entre dois conglomerados;

3 - Os dois conglomerados que minimizam a distância calculada no item 2 são
combinados.

Então, ao meu ver, não precisaria de uma matriz de distância como o R pede
já que o próprio método de Ward já utiliza a soma de quadrados para agrupar
os indivíduos mais homogêneos.

Vou ler o material sugerido,

abraço


Em 27 de janeiro de 2013 19:04, Marcos Vital <marcosvital em gmail.com>escreveu:

> Bruno, na verdade o método de Ward precisa sim da matriz de distância como
> os outros métodos de clsuter; o que muda é a forma como ele cria o
> dendograma.
>
> Ele calcula a soma dos quadrados das distâncias entre os objetos, dividida
> pelo número de objetos, buscando minimizá-la. Então é necessária uma matriz
> de distância como nos outros casos, e o que muda na função hclust é o
> argumento method="ward".
>
> Se tiver acesso, veja o excelente *Numerical Ecology with R* (Bocard,
> Gillet & Legendre, 2011), que é uma excelente fonte para estudar métodos
> multivariados no R (o foco é em Ecologia, mas com certeza pode ser útil em
> outros casos).
>
> Abraços
>
> Marcos
>
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> Marcos Vinícius Carneiro Vital
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> Instituto de Ciências Biológicas e da Saúde
> Setor de Biodiversidade e Ecologia
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