[R-br] INLA Geoestatística

[Taynãna César Simões]

Muito obrigada, Elias.
Abraços


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 De: Elias T. Krainski <eliaskrainski em yahoo.com.br>
Para: "r-br em listas.c3sl.ufpr.br" <r-br em listas.c3sl.ufpr.br> 
Enviadas: Quarta-feira, 21 de Novembro de 2012 14:07
Assunto: Re: [R-br] INLA Geoestatística
 
Oi Taynãna, 

DIC negativo pode ocorrer com distribuições contínuas sem problemas. 
O mesmo vale para log-Verossimilhança. 
Veja sobre DIC em 
http://www.mrc-bsu.cam.ac.uk/bugs/winbugs/dicpage.shtml

### exemplo de log-verossimilhança negativa 
 y1 <- rnorm(100, 0, 100)
### log-verossimilhança em 0, 100
 sum(dnorm(y1, 0, 100, log=TRUE))

### exemplo de log-verossimilhança positiva
 y2 <- rnorm(100, 0, 0.01)
### log-verossimilhança em 0, 0.01
sum(dnorm(y2, 0, 0.01, log=TRUE))



### para distribuições discretas, o 

### log-verossimilhança será sempre negativa
y3 <- rpois(100, 3)
### log lik
sum(dpois(y3, 3, log=TRUE))


att. 
Elias T. Krainski
>
>Ei, Elias.
>Agora sim, consegui rodar, mas o DIC está dando negativo, com qualquer das estratégias utilizadas (gaussiana, laplace ou laplace simplificada)...
>Percebeu isso?
> 
>Abraço, Taynãna
>
>
>Taynãna, fiz 
>   inla.upgrade(testing=TRUE)
>atualizou para a versao de 5 de novembro
>e consegui executar todo o script SwissRainfall.R sem problemas...
>
>
>
> Att.
>Elias T. Krainski
>
>>Oi, Elias.
>>
>>
>>O Havard Rue respondeu dizendo p tentar o comando inla.upgrade(testing=TRUE), mas não deu certo.
>>A versão que estou usando é de 5 de novembro.
>>
>>
>>Abraço, Taynãna
>>
>>Oi Taynãna, 
>>
>>qual a versão do seu INLA.
>>  inla.version()
>>Eu consegui executar sem problemas na versão de 18 de agosto
>>
>>
>>
>>Elias
T. Krainski
>>
>>>
>>>
>>>Pessoal,
>>>
>>>Estou tentando reproduzir um exemplo de modelagem espacial no INLA com dados de geoestatística, do artigo  
>>>
>>>de Blangiardo et al (2012). O código em R está disponível e o exemplo 3
(SwissRainfall.R).
>>>
>>>Ao rodar o modelo aparece a seguinte mensagem:
>>>
>>>> mod =   inla(formula,
>>>+              data=inla.stack.data(stack, spde=spde),family="gaussian",
>>>+              control.predictor=list(A=inla.stack.A(stack), compute=TRUE),
>>>+             
>>control.compute=list(cpo=TRUE, dic=TRUE),
>>>+              keep=FALSE, verbose=TRUE)
>>>Erro em .local(x, i, j, ..., value) : 
>>>  not-yet-implemented 'Matrix[<-' method
>>>Calls: inla -> inla.predictor.section -> [<- -> [<- -> .local
>>>
>>>Alguém tem idéia do quê possa estar
acontecendo?
>>>
>>>Att,
>>>Taynãna
>>>Pesquisadora em Saúde Pública - ENSP/FIOCRUZ 
>
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