[R-br] Cluster para r

Diogo Ferrari diogoferrari em gmail.com
Domingo Novembro 18 19:43:29 BRST 2012


Fabio,

vc usou esses pacotes que o Benilton mencionou?

abs


2012/11/18 Fabio Mathias Corrêa <fabio.ufla em yahoo.com.br>

> Eu já li arquivos .txt de 50Gb em meu laptop com 4 Gb de RAM e processador
> dual core.
>
> Faça um teste.
>
> Valeu!
>
>         Fábio Mathias Corrêa
>
>    Universidade Estadual de Santa Cruz
> Departamento de Ciências Exatas e da Terra - DCET
>
>
> Campus Soane Nazaré de Andrade, km 16 Rodovia Ilhéus-Itabuna
> CEP 45662-900. Ilhéus-Bahia
>
>
> Tel.: 73-3680-5076
>   ------------------------------
> *De:* Diogo Ferrari <diogoferrari em gmail.com>
> *Para:* r-br em listas.c3sl.ufpr.br; Fabio Mathias Corrêa <
> fabio.ufla em yahoo.com.br>
> *Enviadas:* Domingo, 18 de Novembro de 2012 13:20
>
> *Assunto:* Re: [R-br] Cluster para r
>
> Legal, não conhecia esse pacote. Mas no caso de bancos de 20 GB, a memória
> não basta....
>
>
> 2012/11/18 Fabio Mathias Corrêa <fabio.ufla em yahoo.com.br>
>
> O pacote bigmemory permite trabalhar com grandes bancos de dados sem
> sobrecarregar a memória.
>
>
>
>         Fábio Mathias Corrêa
>
>    Universidade Estadual de Santa Cruz
> Departamento de Ciências Exatas e da Terra - DCET
>
>
> Campus Soane Nazaré de Andrade, km 16 Rodovia Ilhéus-Itabuna
> CEP 45662-900. Ilhéus-Bahia
>
>
> Tel.: 73-3680-5076
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> *De:* Diogo Ferrari <diogoferrari em gmail.com>
> *Para:* r-br em listas.c3sl.ufpr.br; regis barros <regisgbarros em yahoo.com.br>
>
> *Enviadas:* Domingo, 18 de Novembro de 2012 12:07
> *Assunto:* Re: [R-br] Cluster para r
>
> Ola Regis,
>
> Já trabalhei, ou melhor, tentei trabalhar, com R operando em servidor
> linux. O principal problema é a divisão do processamento. Não é possível
> dividir o processamento entre os nós. é possível apenas dividir dentro do
> próprio núcleo do processador. Eu trabalhei com bases na casa de 20x10^9. A
> melhor solução que encontrei foi o RevolutionR, fazer proc. paralelo local
> e converter os arquivos para .xdf (usado pelo revolution). Se o seu
> problema é computar sobre os dados, e não fazer simulações por exemplo, vc
> tem que encontrar uma solução que permita isso. É mais um problema de
> geranciamento e acesso aos dados do que capaciadade de processamento. O R
> tradicional carrega tudo na memória e, portanto, limita o uso de big data.
> O .xdf e o RevolutionR solucionam isso permitindo trabalhar com os dados
> sem carregá-los, além de dividir e indexar o banco, como se faz em SQL, por
> exemplo. Mas isso vai depender do que vc precisa fazer com os dados. As
> funções disponível para o RevolutionR são as mais simples.estão no pacote
> RevoscaleR.
>
> abs
>
>
> 2012/11/18 regis barros <regisgbarros em yahoo.com.br>
>
> Bom dia Pessoal
> Gostaria de saber de pessoas que trabalham com cluster para linux e usam o
> r para executar os cálculos e modelos que venho trabalhando. Li nos e-mails
> anteriores que pessoas que estavam usando uma base de dados de 1*10^9,
> todavia gostaria de trabalhar com mais do que isto alguém trabalha?
> Grato
> Regis Godoy Barros
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