[R-br] Fwd: Fwd: Re: Fwd: Re: Fwd: Re: [Dúvida] Criando pacotes para o R.

Domingo Novembro 18 17:00:47 BRST 2012

Benilton voltando ao esquema de versões de pacotes. Você disse que em seus
pacotes estável tem vida útil de 6 meses, ou seja, abril-outrubro-abril,
similar aos lançamento das versões do ubuntu. A versão instável (x.y.z), ou
seja quando y é ímpar, tem vida útil de quantos meses?  Exemplo:

Suponha um pacote em sua versão 1.8.x. Nessa versão estável apenas terá
correções de bugs mas nada de novo será implementado. Ao mesmo tempo você
tem em seu pc uma versão 1.9 que terá todas as correções feita na versão
1.8.x e mais novas funções. Depois de 6 meses sua versão irá se tornar a
1.9.0. Quanto tempo terá essa versão instável ou apenas as estáveis que
irão ser submetidas de 6 em 6 meses no CRAN?

[   ],
Pedro Rafael Diniz Marinho.

Em 18 de novembro de 2012 07:25, beniltoncarvalho [via R-br] <
ml-node+s2285057n4657112h49 em n4.nabble.com> escreveu:

> A resposta curta para sua pergunta e' "nao".
>
> A mais longa e':
> http://stackoverflow.com/questions/1689028/r-package-download-and-usage-statistics
>
> Se vc estivesse submetendo para o BioConductor, teria uma aproximacao (a
> gente tem um mecanismo de registro do numero de downloads de cada pacote).
>
>
> 2012/11/18 Pedro Rafael <[hidden email]<http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657112&i=0>
> >
>
>> Benilton muito obrigado pela pelas informações sobre as versões. Foi
>> muito útil para mim e acho que vou seguir essa ideia. Existe alguma forma
>> de fazer a estatística de quantas pessoas estão utilizando o pacote?
>>
>> [   ],
>> Pedro Rafael Diniz Marinho.
>>
>>
>> ---------- Mensagem encaminhada ----------
>> De: beniltoncarvalho [via R-br] <[hidden email]<http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657112&i=1>
>> >
>>
>> Data: 17 de novembro de 2012 18:18
>> Assunto: Re: [R-br] Fwd: Re: Fwd: Re: Fwd: Re: [Dúvida] Criando pacotes
>> para o R.
>>
>> Para: Pedro Rafael Diniz Marinho <[hidden email]<http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657112&i=2>
>> >
>>
>>
>> Existe uma padronizacao... pode ser
>>
>> x.y.z
>> x.y-z
>>
>> :-P
>>
>> Nos meus pacotes, eu uso x.y.z
>>
>> x - versao majoritaria
>> y - versao minoritaria (par para codigo estavel / impar para codigo em
>> desenvolvimento)
>> z - revisao
>>
>> Eu mantenho 2 arvores de codigo distintas:
>> - Estavel
>> - Desenvolvimento
>>
>> Na estavel, eu apenas faco bug-fixes e nao implemento nada novo.
>>
>> Na desenvolvimento, aplico os bug-fixes q aplico na estavel e faco a
>> implementacao de novos metodos/ferramentas.
>>
>> Cada versao estavel tem uma "vida" de 6 meses (Abril-Outubro-Abril).
>>
>> Por exemplo, o oligo esta' agora na versao 1.22.0... Se alguem encontrar
>> um bug, eu conserto e a versao muda para 1.22.1.
>>
>> Paralelamente, minha versao de desenvolvimento esta' em 1.23.0... Nessa
>> versao eu implemento as coisas novas e aplico as correcoes aplicadas na
>> estavel (1.22.x)... Qualquer alteracao na versao de desenvolvimento implica
>> na atualizacao da revisao de 1.23.0 para 1.23.1 / 1.23.2 / etc...
>>
>> Em abril, a minha versao de desenvolvimento e' "promovida" a versao
>> estavel... sai de 1.23.x para 1.24.0. No dia dessa "promocao", uma copia
>> identica da 1.24.0 e' copiada como 1.25.0.... A 1.24.0 fica entao como a
>> "nova" versao estavel... e a 1.25.0 como a "nova" de desenvolvimento....
>>
>> E, naturalmente, eu paro de dar suporte para qualquer versao inferior a
>> 1.24.x....
>>
>> b
>>
>>
>> 2012/11/17 Pedro Rafael <[hidden email]<http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657109&i=0>
>> >
>>
>>> Valeu Benilton. Vejo varios sistemas de numeraçoes de pacotes. Alguns
>>> começam como versao 1.0, outros com 0.1-0. Nao existe uma padronizacao?
>>> ---------- Mensagem encaminhada ----------
>>> De: "beniltoncarvalho [via R-br]" <[hidden email]<http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657109&i=1>
>>> >
>>>
>>> Data: 17/11/2012 14:58
>>> Assunto: Re: [R-br] Fwd: Re: Fwd: Re: [Dúvida] Criando pacotes para o R.
>>> Para: "Pedro Rafael Diniz Marinho" <[hidden email]<http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657109&i=2>
>>> >
>>>
>>>
>>> Qualquer mudanca, mesmo q seja uma virgulazinha numa das paginas do
>>> manual, significa uma nova versao.... b
>>>
>>>
>>> 2012/11/17 Pedro Rafael <[hidden email]<http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657106&i=0>
>>> >
>>>
>>>> Obrigado pela opinião Leonard Mendonça.
>>>>
>>>> [   ],
>>>> Pedro Rafael Diniz Marinho.
>>>>
>>>>
>>>> Em 17 de novembro de 2012 14:45, Pedro Rafael <[hidden email]<http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657106&i=1>
>>>> > escreveu:
>>>>
>>>>> Obrigado pela opinião Leonard Mendonça.
>>>>>
>>>>> [   ],
>>>>> Pedro Rafael Diniz Marinho.
>>>>>
>>>>>
>>>>> Em 17 de novembro de 2012 12:13, Leonard Mendonça de Assis [via R-br]
>>>>> <[hidden email] <http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657106&i=2>
>>>>> > escreveu:
>>>>>
>>>>>  No meu entendimento é uma nova versão
>>>>>>
>>>>>> []s
>>>>>> Leonard de Assishttp://about.me/ldeassis
>>>>>>
>>>>>> Em 17/11/2012 11:32, Pedro Rafael escreveu:
>>>>>>
>>>>>> Benilton voce poderia me tirar uma dúvida? Já li a documentacao do R
>>>>>> mas nao ficou claro para mim. Caso eu queira fazer uma nova versao do
>>>>>> pacote pelo que eu entendi eu devo fazer upload do novo arquivo tar.gz
>>>>>> informando a nova versao. Contudo, caso eu precise fazer pequenos ajustes,
>>>>>> por exemplo, ajustes na documentacao. Como fazer isso sem mudar a versao do
>>>>>> pacote? Isso pode ser feito?
>>>>>> ---------- Mensagem encaminhada ----------
>>>>>>
>>>>>> De: "beniltoncarvalho [via R-br]" <[hidden email]<http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657102&i=0>
>>>>>> >
>>>>>>  Data: 16/11/2012 17:50
>>>>>> Assunto: Re: [R-br] Fwd: Re: [Dúvida] Criando pacotes para o R.
>>>>>> Para: "Pedro Rafael Diniz Marinho" <[hidden email]<http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657102&i=1>
>>>>>> >
>>>>>>
>>>>>>
>>>>>> Aguarde 24-48h, é o tempo do ciclo dos "builds".
>>>>>>  On 16 Nov 2012 20:47, "Pedro Rafael" <[hidden email]<http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657087&i=0>>
>>>>>> wrote:
>>>>>>
>>>>>>>  Pessoal os binarios para windows e Mac sao gerados pelo CRAN? Vi
>>>>>>> em alguns pacotes que entraram nos espelhos hoje nao tem esses binarios.
>>>>>>> Existe uma mensagem do lado dizendo que os pacotes sao novos. Os binarios
>>>>>>> nao sao gerados logo quando o pacofe entra no CRAN?
>>>>>>>  ---------- Mensagem encaminhada ----------
>>>>>>> De: "beniltoncarvalho [via R-br]" <[hidden email]<http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657087&i=1>>
>>>>>>>
>>>>>>>
>>>>>>> Data: 16/11/2012 17:01
>>>>>>> Assunto: Re: [R-br] [Dúvida] Criando pacotes para o R.
>>>>>>>  Para: "Pedro Rafael Diniz Marinho" <[hidden email]<http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657087&i=2>>
>>>>>>>
>>>>>>>
>>>>>>>
>>>>>>> Se vc rodar
>>>>>>>
>>>>>>>   R CMD check pacote
>>>>>>>
>>>>>>>  ou seu equivalente para o windows... o que sao os erros e o
>>>>>>> conteudo dos logs?
>>>>>>>
>>>>>>>  2012/11/16 tiago souza marçal <[hidden email]<http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657081&i=0>
>>>>>>> >
>>>>>>>
>>>>>>>  O meu path esta configurado da seguinte forma:
>>>>>>>
>>>>>>>  C:\Perl\site\bin;C:\Perl\bin;C:\Rtools\bin;C:\MiKTeX2.9\miktex\bin;C:\R\R-2.15.2\bin\i386;C:\MinGW\bin;C:\HTMLHelpWorkshop;C:\Program
>>>>>>> Files\Common Files\Microsoft
>>>>>>> Shared\WindowsLive;%LINDOAPI_HOME%bin\win32;C:\Windows\system32;C:\Windows;C:\Windows\System32\Wbem;C:\Windows\System32\WindowsPowerShell\v1.0\;C:\Program
>>>>>>> Files\Windows Live\Shared;C:\Program Files\Internet Explorer
>>>>>>>
>>>>>>>  Você vê algum problema?
>>>>>>>
>>>>>>>  Att.
>>>>>>>
>>>>>>>  Tiago.
>>>>>>>
>>>>>>>  ------------------------------
>>>>>>> Date: Fri, 16 Nov 2012 13:58:58 -0200
>>>>>>>
>>>>>>> From: [hidden email]<http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657081&i=1>
>>>>>>> To: [hidden email]<http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657081&i=2>
>>>>>>> Subject: Re: [R-br] [Dúvida] Criando pacotes para o R.
>>>>>>>
>>>>>>> na minha vm windows, eu instalei primeiro o miktex, depois instalei
>>>>>>> o rtools. Deve ser alguma loucura do windows (Path faltando, por exemplo)
>>>>>>>
>>>>>>> []s
>>>>>>> Leonard de Assishttp://about.me/ldeassis
>>>>>>>
>>>>>>> Em 16/11/2012 13:11, tiago souza marçal escreveu:
>>>>>>>
>>>>>>>  O Rtools eu tenho o problema e quando eu peço para gerar o PDF ( R
>>>>>>> CMD Rd2pdf ) ele me retorna uma mensagem de erro falando do MikTex 1.9,
>>>>>>> entretanto, eu estou utilizando o MikTex 2.9.
>>>>>>>
>>>>>>>  Att.
>>>>>>>
>>>>>>>  Tiago.
>>>>>>>
>>>>>>>  ------------------------------
>>>>>>> Date: Thu, 15 Nov 2012 20:33:21 -0200
>>>>>>> From: [hidden email]<http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657081&i=3>
>>>>>>> To: [hidden email]<http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657081&i=4>
>>>>>>> Subject: Re: [R-br] [Dúvida] Criando pacotes para o R.
>>>>>>>
>>>>>>> RTools, errei o nome
>>>>>>>
>>>>>>> voce acha no CRAN
>>>>>>>
>>>>>>> []s
>>>>>>> Leonard de Assishttp://about.me/ldeassis
>>>>>>>
>>>>>>> Em 15/11/2012 09:42, tiago souza marçal escreveu:
>>>>>>>
>>>>>>>  Leonard onde eu consigo baixar esse rutil?
>>>>>>>
>>>>>>>  Att.
>>>>>>>
>>>>>>>  Tiago.
>>>>>>>
>>>>>>>  ------------------------------
>>>>>>> Date: Thu, 15 Nov 2012 09:28:46 -0200
>>>>>>> From: [hidden email]<http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657081&i=5>
>>>>>>> To: [hidden email]<http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657081&i=6>
>>>>>>> Subject: Re: [R-br] [Dúvida] Criando pacotes para o R.
>>>>>>>
>>>>>>> No Windows tem que instalar o rutil recomendado para a versão do R
>>>>>>> que estamos usando.
>>>>>>>
>>>>>>> Tenho uma VM windows 64 bits comigo e todos os problemas que
>>>>>>> encontrei quando fuçei com pacotes foram referentes ao R não localizar
>>>>>>> todos os 'bichinhos' do Rutil os quais precisava.
>>>>>>>
>>>>>>> []s
>>>>>>> Leonard de Assishttp://about.me/ldeassis
>>>>>>>
>>>>>>> Em 15/11/2012 08:06, tiago souza marçal escreveu:
>>>>>>>
>>>>>>>  Estou com um problema parecido com o seu, porém, no Windows . No
>>>>>>> meu caso o check do PDF está ok mas quando eu peço para ele ser gerado (R
>>>>>>> CMD Rd2pdf) uma mensagem de erro e retornada informando uma versão
>>>>>>> antiga do MikTex que eu não estou usando.
>>>>>>>
>>>>>>>  Mas no seu caso você observou mensagem de erro no processo de
>>>>>>> instalação do pacote (R CMD INSTALL) ? Caso isso tenha ocorrido
>>>>>>> este pode ter sido o problema, em função de algum erro na edição do
>>>>>>> arquivo.Rd. Observe que foi retornado pra você um  WARNING no check
>>>>>>> dos arquivos.Rd com algumas mensagens de erro.
>>>>>>>
>>>>>>>  Espero ter te ajudado.
>>>>>>>
>>>>>>>  Att.
>>>>>>>
>>>>>>>  Tiago.
>>>>>>>
>>>>>>>  ------------------------------
>>>>>>> Date: Wed, 14 Nov 2012 23:27:37 -0300
>>>>>>> From: [hidden email]<http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657081&i=7>
>>>>>>> To: [hidden email]<http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657081&i=8>
>>>>>>> Subject: Re: [R-br] [Dúvida] Criando pacotes para o R.
>>>>>>>
>>>>>>> Pessoal estou estudando como criar pacotes no R e tive o seguinte
>>>>>>> erro na hora de dar o check. Consigo gerar o arquivo tar.gz mas o pdf da
>>>>>>> documentação não é criado. Alguém saberia me informar onde estaria o erro?
>>>>>>>
>>>>>>> OBS: Estou em uma máquina Linux.
>>>>>>>
>>>>>>> * using log directory
>>>>>>> ‘/home/pedro/Documentos/Gama_Log_Logistica/FUNCAO_CODIGO/PRDM.Rcheck’
>>>>>>> * using R version 2.15.1 (2012-06-22)
>>>>>>> * using platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)
>>>>>>> * using session charset: UTF-8
>>>>>>> * checking for file ‘PRDM/DESCRIPTION’ ... OK
>>>>>>> * checking extension type ... Package
>>>>>>> * this is package ‘PRDM’ version ‘1.0’
>>>>>>> * checking package namespace information ... OK
>>>>>>> * checking package dependencies ... OK
>>>>>>> * checking if this is a source package ... OK
>>>>>>> * checking if there is a namespace ... OK
>>>>>>> * checking for executable files ... OK
>>>>>>> * checking whether package ‘PRDM’ can be installed ... OK
>>>>>>> * checking installed package size ... OK
>>>>>>> * checking package directory ... OK
>>>>>>> * checking for portable file names ... OK
>>>>>>> * checking for sufficient/correct file permissions ... OK
>>>>>>> * checking DESCRIPTION meta-information ... OK
>>>>>>> * checking top-level files ... OK
>>>>>>> * checking index information ... OK
>>>>>>> * checking package subdirectories ... OK
>>>>>>> * checking R files for non-ASCII characters ... OK
>>>>>>> * checking R files for syntax errors ... OK
>>>>>>> * checking whether the package can be loaded ... OK
>>>>>>> * checking whether the package can be loaded with stated
>>>>>>> dependencies ... OK
>>>>>>> * checking whether the package can be unloaded cleanly ... OK
>>>>>>> * checking whether the namespace can be loaded with stated
>>>>>>> dependencies ... OK
>>>>>>> * checking whether the namespace can be unloaded cleanly ... OK
>>>>>>> * checking for unstated dependencies in R code ... OK
>>>>>>> * checking S3 generic/method consistency ... OK
>>>>>>> * checking replacement functions ... OK
>>>>>>> * checking foreign function calls ... OK
>>>>>>> * checking R code for possible problems ... OK
>>>>>>> * checking Rd files ... WARNING
>>>>>>> prepare_Rd: PRDM-package.Rd:30: All text must be in a section
>>>>>>> prepare_Rd: PRDM-package.Rd:31: All text must be in a section
>>>>>>> prepare_Rd: prdm.Rd:36-42: Dropping empty section \value
>>>>>>> * checking Rd metadata ... OK
>>>>>>> * checking Rd cross-references ... OK
>>>>>>> * checking for missing documentation entries ... OK
>>>>>>> * checking for code/documentation mismatches ... OK
>>>>>>> * checking Rd \usage sections ... OK
>>>>>>> * checking Rd contents ... OK
>>>>>>> * checking for unstated dependencies in examples ... OK
>>>>>>> * checking examples ... OK
>>>>>>> * checking PDF version of manual ... ERROR
>>>>>>> Rd conversion errors:
>>>>>>> Warning: unknown option '-'
>>>>>>> Warning in file(con, "r") :
>>>>>>>   cannot open file '/home/pedro/Documentos/MESTRADO': No such file
>>>>>>> or directory
>>>>>>> Error in file(con, "r") : cannot open the connection
>>>>>>>
>>>>>>>
>>>>>>> [   ],
>>>>>>> Pedro Rafael Diniz Marinho.
>>>>>>>
>>>>>>>
>>>>>>> Em 14 de novembro de 2012 20:43, Pedro Rafael <[hidden email]<http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657081&i=9>
>>>>>>> > escreveu:
>>>>>>>
>>>>>>> Grande Paulo Justiniano, como vai? Muito obrigado pelas suas
>>>>>>> informações. Uso o Linux faz uns 6 anos mas nunca contribui ou publiquei
>>>>>>> meus códigos. Estava vendo que a linguagem Julia vem com a licença MIT  que
>>>>>>> eu não acho muito interessante porque quem quiser pode vender o código.
>>>>>>> Minha dúvida sobre a licença GPL ou GPL2  é se uma pessoa poderá desmanchar
>>>>>>> algum código que fiz ou mudar completamente o foco do pacote, retirar nome
>>>>>>> dos autores, etc. Existe um pacote hoje muito usado no R que foi feito por
>>>>>>> uma pessoa e depois de um tempo parou de ser mantido. Chegou um outro cara
>>>>>>> de fora  e reimplementou  o pacote e tirou o nome dos autores antigos e
>>>>>>> depois muita luta o nome dessas pessoas permaneceu  como "autores antigos".
>>>>>>> Isso ocorre com certa frequência? Existe alguma periodicidade de manutenção
>>>>>>> do pacote que deve ser respeitada?
>>>>>>>
>>>>>>> [   ],
>>>>>>> Pedro Rafael Diniz Marinho.
>>>>>>>
>>>>>>>
>>>>>>>  Em 14 de novembro de 2012 20:28, Paulo Justiniano [via R-br] <[hidden
>>>>>>> email] <http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657081&i=10>>escreveu:
>>>>>>>
>>>>>>>
>>>>>>>
>>>>>>> On Wed, 14 Nov 2012, Pedro Rafael wrote:
>>>>>>>
>>>>>>> > Pessoal, digamos que faço um pacote para o R. Como funciona o
>>>>>>> professo de submissão?
>>>>>>>
>>>>>>>  1. Leia atentamente o manual "Writing R extensions"  que descreve
>>>>>>> isto em
>>>>>>> detalhes.
>>>>>>>
>>>>>>> 2 certifique-se que voce testou o seu pacote :
>>>>>>>
>>>>>>> R CMD check SEU_PACOTE
>>>>>>>
>>>>>>> e corrija todos os eventuais problemas
>>>>>>>
>>>>>>> > Digamos que eu submeta um pacote "meu_pacote" e depois queira
>>>>>>> > fazer modificações no mesmo. Para acrescentar essas modificações
>>>>>>> eu tenho que submeter novamente o pacote com o mesmo nome para que as
>>>>>>> atualizações
>>>>>>> > fiquem disponíveis?
>>>>>>>
>>>>>>>  Sim. Para isto voce alter a numero da versao no arquivo DESCRIPTION
>>>>>>>
>>>>>>> >
>>>>>>> > Outra dúvida que tenho é sobre a segurança que tenho que meu
>>>>>>> pacote não seja modificado. Qualquer pessoa pode pegar esse pacote e
>>>>>>> alterar ele
>>>>>>> > completamente sem nenhuma permissão minha ou qualquer modificação
>>>>>>> tem que ser acompanhada por intermédio da pessoa que submeteu o pacote pela
>>>>>>> primeira
>>>>>>> > vez?
>>>>>>> >
>>>>>>>
>>>>>>>  Bem vindo ao Universo do Software livre
>>>>>>>
>>>>>>> Note que se voce quiser voce pode baixar os fontes do R e mudar o
>>>>>>> que
>>>>>>> quiser
>>>>>>>
>>>>>>> Falando mais seriamente no DESCRIPTION voce define a licenca.
>>>>>>> Leia sobre licxancas GPL e análogas
>>>>>>>
>>>>>>> Minha sugestao: internalize completamente o conceito de software
>>>>>>> livre e
>>>>>>> livre-se  destas preocupacoes
>>>>>>>
>>>>>>> >
>>>>>>> > São dúvidas bestas mas que nunca entendi direito.
>>>>>>>
>>>>>>>  Nao sao somente suas.
>>>>>>> Não é por acaso que há uma diversidade de tipos de licensas, não sem
>>>>>>> controvérsias!
>>>>>>>
>>>>>>> >
>>>>>>> > Obrigado à todos.
>>>>>>> > [   ],
>>>>>>> > Pedro Rafael Diniz Marinho.
>>>>>>> >
>>>>>>> >
>>>>>>> >
>>>>>>>  _______________________________________________
>>>>>>> R-br mailing list
>>>>>>> [hidden email]<http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657009&i=0>
>>>>>>> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br
>>>>>>> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e
>>>>>>> forneça código mínimo reproduzível.
>>>>>>>
>>>>>>> ------------------------------
>>>>>>>  If you reply to this email, your message will be added to the
>>>>>>> discussion below:
>>>>>>>
>>>>>>> http://r-br.2285057.n4.nabble.com/R-br-Duvida-Criando-pacotes-para-o-R-tp4657007p4657009.html
>>>>>>>  To unsubscribe from R-br, click here.
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>>>>>>>
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>>>>>>>
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