[R-br] Fwd: Fwd: Re: Fwd: Re: Fwd: Re: [Dúvida] Criando pacotes para o R.
Benilton Carvalho
beniltoncarvalho em gmail.com
Domingo Novembro 18 08:24:47 BRST 2012
A resposta curta para sua pergunta e' "nao".
A mais longa e':
http://stackoverflow.com/questions/1689028/r-package-download-and-usage-statistics
Se vc estivesse submetendo para o BioConductor, teria uma aproximacao (a
gente tem um mecanismo de registro do numero de downloads de cada pacote).
2012/11/18 Pedro Rafael <pedro.rafael.marinho em gmail.com>
> Benilton muito obrigado pela pelas informações sobre as versões. Foi muito
> útil para mim e acho que vou seguir essa ideia. Existe alguma forma de
> fazer a estatística de quantas pessoas estão utilizando o pacote?
>
> [ ],
> Pedro Rafael Diniz Marinho.
>
>
> ---------- Mensagem encaminhada ----------
> De: beniltoncarvalho [via R-br] <ml-node+s2285057n4657109h56 em n4.nabble.com
> >
> Data: 17 de novembro de 2012 18:18
> Assunto: Re: [R-br] Fwd: Re: Fwd: Re: Fwd: Re: [Dúvida] Criando pacotes
> para o R.
>
> Para: Pedro Rafael Diniz Marinho <pedro.rafael.marinho em gmail.com>
>
>
> Existe uma padronizacao... pode ser
>
> x.y.z
> x.y-z
>
> :-P
>
> Nos meus pacotes, eu uso x.y.z
>
> x - versao majoritaria
> y - versao minoritaria (par para codigo estavel / impar para codigo em
> desenvolvimento)
> z - revisao
>
> Eu mantenho 2 arvores de codigo distintas:
> - Estavel
> - Desenvolvimento
>
> Na estavel, eu apenas faco bug-fixes e nao implemento nada novo.
>
> Na desenvolvimento, aplico os bug-fixes q aplico na estavel e faco a
> implementacao de novos metodos/ferramentas.
>
> Cada versao estavel tem uma "vida" de 6 meses (Abril-Outubro-Abril).
>
> Por exemplo, o oligo esta' agora na versao 1.22.0... Se alguem encontrar
> um bug, eu conserto e a versao muda para 1.22.1.
>
> Paralelamente, minha versao de desenvolvimento esta' em 1.23.0... Nessa
> versao eu implemento as coisas novas e aplico as correcoes aplicadas na
> estavel (1.22.x)... Qualquer alteracao na versao de desenvolvimento implica
> na atualizacao da revisao de 1.23.0 para 1.23.1 / 1.23.2 / etc...
>
> Em abril, a minha versao de desenvolvimento e' "promovida" a versao
> estavel... sai de 1.23.x para 1.24.0. No dia dessa "promocao", uma copia
> identica da 1.24.0 e' copiada como 1.25.0.... A 1.24.0 fica entao como a
> "nova" versao estavel... e a 1.25.0 como a "nova" de desenvolvimento....
>
> E, naturalmente, eu paro de dar suporte para qualquer versao inferior a
> 1.24.x....
>
> b
>
>
> 2012/11/17 Pedro Rafael <[hidden email]<http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657109&i=0>
> >
>
>> Valeu Benilton. Vejo varios sistemas de numeraçoes de pacotes. Alguns
>> começam como versao 1.0, outros com 0.1-0. Nao existe uma padronizacao?
>> ---------- Mensagem encaminhada ----------
>> De: "beniltoncarvalho [via R-br]" <[hidden email]<http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657109&i=1>
>> >
>>
>> Data: 17/11/2012 14:58
>> Assunto: Re: [R-br] Fwd: Re: Fwd: Re: [Dúvida] Criando pacotes para o R.
>> Para: "Pedro Rafael Diniz Marinho" <[hidden email]<http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657109&i=2>
>> >
>>
>>
>> Qualquer mudanca, mesmo q seja uma virgulazinha numa das paginas do
>> manual, significa uma nova versao.... b
>>
>>
>> 2012/11/17 Pedro Rafael <[hidden email]<http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657106&i=0>
>> >
>>
>>> Obrigado pela opinião Leonard Mendonça.
>>>
>>> [ ],
>>> Pedro Rafael Diniz Marinho.
>>>
>>>
>>> Em 17 de novembro de 2012 14:45, Pedro Rafael <[hidden email]<http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657106&i=1>
>>> > escreveu:
>>>
>>>> Obrigado pela opinião Leonard Mendonça.
>>>>
>>>> [ ],
>>>> Pedro Rafael Diniz Marinho.
>>>>
>>>>
>>>> Em 17 de novembro de 2012 12:13, Leonard Mendonça de Assis [via R-br] <[hidden
>>>> email] <http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657106&i=2>>escreveu:
>>>>
>>>> No meu entendimento é uma nova versão
>>>>>
>>>>> []s
>>>>> Leonard de Assishttp://about.me/ldeassis
>>>>>
>>>>> Em 17/11/2012 11:32, Pedro Rafael escreveu:
>>>>>
>>>>> Benilton voce poderia me tirar uma dúvida? Já li a documentacao do R
>>>>> mas nao ficou claro para mim. Caso eu queira fazer uma nova versao do
>>>>> pacote pelo que eu entendi eu devo fazer upload do novo arquivo tar.gz
>>>>> informando a nova versao. Contudo, caso eu precise fazer pequenos ajustes,
>>>>> por exemplo, ajustes na documentacao. Como fazer isso sem mudar a versao do
>>>>> pacote? Isso pode ser feito?
>>>>> ---------- Mensagem encaminhada ----------
>>>>>
>>>>> De: "beniltoncarvalho [via R-br]" <[hidden email]<http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657102&i=0>
>>>>> >
>>>>> Data: 16/11/2012 17:50
>>>>> Assunto: Re: [R-br] Fwd: Re: [Dúvida] Criando pacotes para o R.
>>>>> Para: "Pedro Rafael Diniz Marinho" <[hidden email]<http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657102&i=1>
>>>>> >
>>>>>
>>>>>
>>>>> Aguarde 24-48h, é o tempo do ciclo dos "builds".
>>>>> On 16 Nov 2012 20:47, "Pedro Rafael" <[hidden email]<http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657087&i=0>>
>>>>> wrote:
>>>>>
>>>>>> Pessoal os binarios para windows e Mac sao gerados pelo CRAN? Vi em
>>>>>> alguns pacotes que entraram nos espelhos hoje nao tem esses binarios.
>>>>>> Existe uma mensagem do lado dizendo que os pacotes sao novos. Os binarios
>>>>>> nao sao gerados logo quando o pacofe entra no CRAN?
>>>>>> ---------- Mensagem encaminhada ----------
>>>>>> De: "beniltoncarvalho [via R-br]" <[hidden email]<http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657087&i=1>>
>>>>>>
>>>>>>
>>>>>> Data: 16/11/2012 17:01
>>>>>> Assunto: Re: [R-br] [Dúvida] Criando pacotes para o R.
>>>>>> Para: "Pedro Rafael Diniz Marinho" <[hidden email]<http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657087&i=2>>
>>>>>>
>>>>>>
>>>>>>
>>>>>> Se vc rodar
>>>>>>
>>>>>> R CMD check pacote
>>>>>>
>>>>>> ou seu equivalente para o windows... o que sao os erros e o
>>>>>> conteudo dos logs?
>>>>>>
>>>>>> 2012/11/16 tiago souza marçal <[hidden email]<http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657081&i=0>
>>>>>> >
>>>>>>
>>>>>> O meu path esta configurado da seguinte forma:
>>>>>>
>>>>>> C:\Perl\site\bin;C:\Perl\bin;C:\Rtools\bin;C:\MiKTeX2.9\miktex\bin;C:\R\R-2.15.2\bin\i386;C:\MinGW\bin;C:\HTMLHelpWorkshop;C:\Program
>>>>>> Files\Common Files\Microsoft
>>>>>> Shared\WindowsLive;%LINDOAPI_HOME%bin\win32;C:\Windows\system32;C:\Windows;C:\Windows\System32\Wbem;C:\Windows\System32\WindowsPowerShell\v1.0\;C:\Program
>>>>>> Files\Windows Live\Shared;C:\Program Files\Internet Explorer
>>>>>>
>>>>>> Você vê algum problema?
>>>>>>
>>>>>> Att.
>>>>>>
>>>>>> Tiago.
>>>>>>
>>>>>> ------------------------------
>>>>>> Date: Fri, 16 Nov 2012 13:58:58 -0200
>>>>>>
>>>>>> From: [hidden email]<http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657081&i=1>
>>>>>> To: [hidden email]<http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657081&i=2>
>>>>>> Subject: Re: [R-br] [Dúvida] Criando pacotes para o R.
>>>>>>
>>>>>> na minha vm windows, eu instalei primeiro o miktex, depois instalei o
>>>>>> rtools. Deve ser alguma loucura do windows (Path faltando, por exemplo)
>>>>>>
>>>>>> []s
>>>>>> Leonard de Assishttp://about.me/ldeassis
>>>>>>
>>>>>> Em 16/11/2012 13:11, tiago souza marçal escreveu:
>>>>>>
>>>>>> O Rtools eu tenho o problema e quando eu peço para gerar o PDF ( R
>>>>>> CMD Rd2pdf ) ele me retorna uma mensagem de erro falando do MikTex 1.9,
>>>>>> entretanto, eu estou utilizando o MikTex 2.9.
>>>>>>
>>>>>> Att.
>>>>>>
>>>>>> Tiago.
>>>>>>
>>>>>> ------------------------------
>>>>>> Date: Thu, 15 Nov 2012 20:33:21 -0200
>>>>>> From: [hidden email]<http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657081&i=3>
>>>>>> To: [hidden email]<http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657081&i=4>
>>>>>> Subject: Re: [R-br] [Dúvida] Criando pacotes para o R.
>>>>>>
>>>>>> RTools, errei o nome
>>>>>>
>>>>>> voce acha no CRAN
>>>>>>
>>>>>> []s
>>>>>> Leonard de Assishttp://about.me/ldeassis
>>>>>>
>>>>>> Em 15/11/2012 09:42, tiago souza marçal escreveu:
>>>>>>
>>>>>> Leonard onde eu consigo baixar esse rutil?
>>>>>>
>>>>>> Att.
>>>>>>
>>>>>> Tiago.
>>>>>>
>>>>>> ------------------------------
>>>>>> Date: Thu, 15 Nov 2012 09:28:46 -0200
>>>>>> From: [hidden email]<http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657081&i=5>
>>>>>> To: [hidden email]<http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657081&i=6>
>>>>>> Subject: Re: [R-br] [Dúvida] Criando pacotes para o R.
>>>>>>
>>>>>> No Windows tem que instalar o rutil recomendado para a versão do R
>>>>>> que estamos usando.
>>>>>>
>>>>>> Tenho uma VM windows 64 bits comigo e todos os problemas que
>>>>>> encontrei quando fuçei com pacotes foram referentes ao R não localizar
>>>>>> todos os 'bichinhos' do Rutil os quais precisava.
>>>>>>
>>>>>> []s
>>>>>> Leonard de Assishttp://about.me/ldeassis
>>>>>>
>>>>>> Em 15/11/2012 08:06, tiago souza marçal escreveu:
>>>>>>
>>>>>> Estou com um problema parecido com o seu, porém, no Windows . No meu
>>>>>> caso o check do PDF está ok mas quando eu peço para ele ser gerado (R
>>>>>> CMD Rd2pdf) uma mensagem de erro e retornada informando uma versão
>>>>>> antiga do MikTex que eu não estou usando.
>>>>>>
>>>>>> Mas no seu caso você observou mensagem de erro no processo de
>>>>>> instalação do pacote (R CMD INSTALL) ? Caso isso tenha ocorrido este
>>>>>> pode ter sido o problema, em função de algum erro na edição do arquivo.Rd.
>>>>>> Observe que foi retornado pra você um WARNING no check dos
>>>>>> arquivos.Rd com algumas mensagens de erro.
>>>>>>
>>>>>> Espero ter te ajudado.
>>>>>>
>>>>>> Att.
>>>>>>
>>>>>> Tiago.
>>>>>>
>>>>>> ------------------------------
>>>>>> Date: Wed, 14 Nov 2012 23:27:37 -0300
>>>>>> From: [hidden email]<http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657081&i=7>
>>>>>> To: [hidden email]<http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657081&i=8>
>>>>>> Subject: Re: [R-br] [Dúvida] Criando pacotes para o R.
>>>>>>
>>>>>> Pessoal estou estudando como criar pacotes no R e tive o seguinte
>>>>>> erro na hora de dar o check. Consigo gerar o arquivo tar.gz mas o pdf da
>>>>>> documentação não é criado. Alguém saberia me informar onde estaria o erro?
>>>>>>
>>>>>> OBS: Estou em uma máquina Linux.
>>>>>>
>>>>>> * using log directory
>>>>>> ‘/home/pedro/Documentos/Gama_Log_Logistica/FUNCAO_CODIGO/PRDM.Rcheck’
>>>>>> * using R version 2.15.1 (2012-06-22)
>>>>>> * using platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)
>>>>>> * using session charset: UTF-8
>>>>>> * checking for file ‘PRDM/DESCRIPTION’ ... OK
>>>>>> * checking extension type ... Package
>>>>>> * this is package ‘PRDM’ version ‘1.0’
>>>>>> * checking package namespace information ... OK
>>>>>> * checking package dependencies ... OK
>>>>>> * checking if this is a source package ... OK
>>>>>> * checking if there is a namespace ... OK
>>>>>> * checking for executable files ... OK
>>>>>> * checking whether package ‘PRDM’ can be installed ... OK
>>>>>> * checking installed package size ... OK
>>>>>> * checking package directory ... OK
>>>>>> * checking for portable file names ... OK
>>>>>> * checking for sufficient/correct file permissions ... OK
>>>>>> * checking DESCRIPTION meta-information ... OK
>>>>>> * checking top-level files ... OK
>>>>>> * checking index information ... OK
>>>>>> * checking package subdirectories ... OK
>>>>>> * checking R files for non-ASCII characters ... OK
>>>>>> * checking R files for syntax errors ... OK
>>>>>> * checking whether the package can be loaded ... OK
>>>>>> * checking whether the package can be loaded with stated dependencies
>>>>>> ... OK
>>>>>> * checking whether the package can be unloaded cleanly ... OK
>>>>>> * checking whether the namespace can be loaded with stated
>>>>>> dependencies ... OK
>>>>>> * checking whether the namespace can be unloaded cleanly ... OK
>>>>>> * checking for unstated dependencies in R code ... OK
>>>>>> * checking S3 generic/method consistency ... OK
>>>>>> * checking replacement functions ... OK
>>>>>> * checking foreign function calls ... OK
>>>>>> * checking R code for possible problems ... OK
>>>>>> * checking Rd files ... WARNING
>>>>>> prepare_Rd: PRDM-package.Rd:30: All text must be in a section
>>>>>> prepare_Rd: PRDM-package.Rd:31: All text must be in a section
>>>>>> prepare_Rd: prdm.Rd:36-42: Dropping empty section \value
>>>>>> * checking Rd metadata ... OK
>>>>>> * checking Rd cross-references ... OK
>>>>>> * checking for missing documentation entries ... OK
>>>>>> * checking for code/documentation mismatches ... OK
>>>>>> * checking Rd \usage sections ... OK
>>>>>> * checking Rd contents ... OK
>>>>>> * checking for unstated dependencies in examples ... OK
>>>>>> * checking examples ... OK
>>>>>> * checking PDF version of manual ... ERROR
>>>>>> Rd conversion errors:
>>>>>> Warning: unknown option '-'
>>>>>> Warning in file(con, "r") :
>>>>>> cannot open file '/home/pedro/Documentos/MESTRADO': No such file or
>>>>>> directory
>>>>>> Error in file(con, "r") : cannot open the connection
>>>>>>
>>>>>>
>>>>>> [ ],
>>>>>> Pedro Rafael Diniz Marinho.
>>>>>>
>>>>>>
>>>>>> Em 14 de novembro de 2012 20:43, Pedro Rafael <[hidden email]<http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657081&i=9>
>>>>>> > escreveu:
>>>>>>
>>>>>> Grande Paulo Justiniano, como vai? Muito obrigado pelas suas
>>>>>> informações. Uso o Linux faz uns 6 anos mas nunca contribui ou publiquei
>>>>>> meus códigos. Estava vendo que a linguagem Julia vem com a licença MIT que
>>>>>> eu não acho muito interessante porque quem quiser pode vender o código.
>>>>>> Minha dúvida sobre a licença GPL ou GPL2 é se uma pessoa poderá desmanchar
>>>>>> algum código que fiz ou mudar completamente o foco do pacote, retirar nome
>>>>>> dos autores, etc. Existe um pacote hoje muito usado no R que foi feito por
>>>>>> uma pessoa e depois de um tempo parou de ser mantido. Chegou um outro cara
>>>>>> de fora e reimplementou o pacote e tirou o nome dos autores antigos e
>>>>>> depois muita luta o nome dessas pessoas permaneceu como "autores antigos".
>>>>>> Isso ocorre com certa frequência? Existe alguma periodicidade de manutenção
>>>>>> do pacote que deve ser respeitada?
>>>>>>
>>>>>> [ ],
>>>>>> Pedro Rafael Diniz Marinho.
>>>>>>
>>>>>>
>>>>>> Em 14 de novembro de 2012 20:28, Paulo Justiniano [via R-br] <[hidden
>>>>>> email] <http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657081&i=10>>escreveu:
>>>>>>
>>>>>>
>>>>>>
>>>>>> On Wed, 14 Nov 2012, Pedro Rafael wrote:
>>>>>>
>>>>>> > Pessoal, digamos que faço um pacote para o R. Como funciona o
>>>>>> professo de submissão?
>>>>>>
>>>>>> 1. Leia atentamente o manual "Writing R extensions" que descreve
>>>>>> isto em
>>>>>> detalhes.
>>>>>>
>>>>>> 2 certifique-se que voce testou o seu pacote :
>>>>>>
>>>>>> R CMD check SEU_PACOTE
>>>>>>
>>>>>> e corrija todos os eventuais problemas
>>>>>>
>>>>>> > Digamos que eu submeta um pacote "meu_pacote" e depois queira
>>>>>> > fazer modificações no mesmo. Para acrescentar essas modificações eu
>>>>>> tenho que submeter novamente o pacote com o mesmo nome para que as
>>>>>> atualizações
>>>>>> > fiquem disponíveis?
>>>>>>
>>>>>> Sim. Para isto voce alter a numero da versao no arquivo DESCRIPTION
>>>>>>
>>>>>> >
>>>>>> > Outra dúvida que tenho é sobre a segurança que tenho que meu pacote
>>>>>> não seja modificado. Qualquer pessoa pode pegar esse pacote e alterar ele
>>>>>> > completamente sem nenhuma permissão minha ou qualquer modificação
>>>>>> tem que ser acompanhada por intermédio da pessoa que submeteu o pacote pela
>>>>>> primeira
>>>>>> > vez?
>>>>>> >
>>>>>>
>>>>>> Bem vindo ao Universo do Software livre
>>>>>>
>>>>>> Note que se voce quiser voce pode baixar os fontes do R e mudar o que
>>>>>> quiser
>>>>>>
>>>>>> Falando mais seriamente no DESCRIPTION voce define a licenca.
>>>>>> Leia sobre licxancas GPL e análogas
>>>>>>
>>>>>> Minha sugestao: internalize completamente o conceito de software
>>>>>> livre e
>>>>>> livre-se destas preocupacoes
>>>>>>
>>>>>> >
>>>>>> > São dúvidas bestas mas que nunca entendi direito.
>>>>>>
>>>>>> Nao sao somente suas.
>>>>>> Não é por acaso que há uma diversidade de tipos de licensas, não sem
>>>>>> controvérsias!
>>>>>>
>>>>>> >
>>>>>> > Obrigado à todos.
>>>>>> > [ ],
>>>>>> > Pedro Rafael Diniz Marinho.
>>>>>> >
>>>>>> >
>>>>>> >
>>>>>> _______________________________________________
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>>>>>> código mínimo reproduzível.
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>>>>>>
>>>>>>
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