[R-br] Fwd: Re: Fwd: Re: [Dúvida] Criando pacotes para o R.

Sábado Novembro 17 15:57:38 BRST 2012

Qualquer mudanca, mesmo q seja uma virgulazinha numa das paginas do manual,
significa uma nova versao.... b

2012/11/17 Pedro Rafael <pedro.rafael.marinho em gmail.com>

> Obrigado pela opinião Leonard Mendonça.
>
> [   ],
> Pedro Rafael Diniz Marinho.
>
>
> Em 17 de novembro de 2012 14:45, Pedro Rafael <
> pedro.rafael.marinho em gmail.com> escreveu:
>
>> Obrigado pela opinião Leonard Mendonça.
>>
>> [   ],
>> Pedro Rafael Diniz Marinho.
>>
>>
>> Em 17 de novembro de 2012 12:13, Leonard Mendonça de Assis [via R-br] <
>> ml-node+s2285057n4657102h39 em n4.nabble.com> escreveu:
>>
>>  No meu entendimento é uma nova versão
>>>
>>> []s
>>> Leonard de Assishttp://about.me/ldeassis
>>>
>>> Em 17/11/2012 11:32, Pedro Rafael escreveu:
>>>
>>> Benilton voce poderia me tirar uma dúvida? Já li a documentacao do R mas
>>> nao ficou claro para mim. Caso eu queira fazer uma nova versao do pacote
>>> pelo que eu entendi eu devo fazer upload do novo arquivo tar.gz informando
>>> a nova versao. Contudo, caso eu precise fazer pequenos ajustes, por
>>> exemplo, ajustes na documentacao. Como fazer isso sem mudar a versao do
>>> pacote? Isso pode ser feito?
>>> ---------- Mensagem encaminhada ----------
>>>
>>> De: "beniltoncarvalho [via R-br]" <[hidden email]<http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657102&i=0>
>>> >
>>>  Data: 16/11/2012 17:50
>>> Assunto: Re: [R-br] Fwd: Re: [Dúvida] Criando pacotes para o R.
>>> Para: "Pedro Rafael Diniz Marinho" <[hidden email]<http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657102&i=1>
>>> >
>>>
>>>
>>> Aguarde 24-48h, é o tempo do ciclo dos "builds".
>>>  On 16 Nov 2012 20:47, "Pedro Rafael" <[hidden email]<http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657087&i=0>>
>>> wrote:
>>>
>>>>  Pessoal os binarios para windows e Mac sao gerados pelo CRAN? Vi em
>>>> alguns pacotes que entraram nos espelhos hoje nao tem esses binarios.
>>>> Existe uma mensagem do lado dizendo que os pacotes sao novos. Os binarios
>>>> nao sao gerados logo quando o pacofe entra no CRAN?
>>>>  ---------- Mensagem encaminhada ----------
>>>> De: "beniltoncarvalho [via R-br]" <[hidden email]<http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657087&i=1>>
>>>>
>>>>
>>>> Data: 16/11/2012 17:01
>>>> Assunto: Re: [R-br] [Dúvida] Criando pacotes para o R.
>>>>  Para: "Pedro Rafael Diniz Marinho" <[hidden email]<http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657087&i=2>>
>>>>
>>>>
>>>>
>>>> Se vc rodar
>>>>
>>>>   R CMD check pacote
>>>>
>>>>  ou seu equivalente para o windows... o que sao os erros e o conteudo
>>>> dos logs?
>>>>
>>>>  2012/11/16 tiago souza marçal <[hidden email]<http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657081&i=0>
>>>> >
>>>>
>>>>  O meu path esta configurado da seguinte forma:
>>>>
>>>>  C:\Perl\site\bin;C:\Perl\bin;C:\Rtools\bin;C:\MiKTeX2.9\miktex\bin;C:\R\R-2.15.2\bin\i386;C:\MinGW\bin;C:\HTMLHelpWorkshop;C:\Program
>>>> Files\Common Files\Microsoft
>>>> Shared\WindowsLive;%LINDOAPI_HOME%bin\win32;C:\Windows\system32;C:\Windows;C:\Windows\System32\Wbem;C:\Windows\System32\WindowsPowerShell\v1.0\;C:\Program
>>>> Files\Windows Live\Shared;C:\Program Files\Internet Explorer
>>>>
>>>>  Você vê algum problema?
>>>>
>>>>  Att.
>>>>
>>>>  Tiago.
>>>>
>>>>  ------------------------------
>>>> Date: Fri, 16 Nov 2012 13:58:58 -0200
>>>>
>>>> From: [hidden email]<http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657081&i=1>
>>>> To: [hidden email]<http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657081&i=2>
>>>> Subject: Re: [R-br] [Dúvida] Criando pacotes para o R.
>>>>
>>>> na minha vm windows, eu instalei primeiro o miktex, depois instalei o
>>>> rtools. Deve ser alguma loucura do windows (Path faltando, por exemplo)
>>>>
>>>> []s
>>>> Leonard de Assishttp://about.me/ldeassis
>>>>
>>>> Em 16/11/2012 13:11, tiago souza marçal escreveu:
>>>>
>>>>  O Rtools eu tenho o problema e quando eu peço para gerar o PDF ( R CMD
>>>> Rd2pdf ) ele me retorna uma mensagem de erro falando do MikTex 1.9,
>>>> entretanto, eu estou utilizando o MikTex 2.9.
>>>>
>>>>  Att.
>>>>
>>>>  Tiago.
>>>>
>>>>  ------------------------------
>>>> Date: Thu, 15 Nov 2012 20:33:21 -0200
>>>> From: [hidden email]<http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657081&i=3>
>>>> To: [hidden email]<http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657081&i=4>
>>>> Subject: Re: [R-br] [Dúvida] Criando pacotes para o R.
>>>>
>>>> RTools, errei o nome
>>>>
>>>> voce acha no CRAN
>>>>
>>>> []s
>>>> Leonard de Assishttp://about.me/ldeassis
>>>>
>>>> Em 15/11/2012 09:42, tiago souza marçal escreveu:
>>>>
>>>>  Leonard onde eu consigo baixar esse rutil?
>>>>
>>>>  Att.
>>>>
>>>>  Tiago.
>>>>
>>>>  ------------------------------
>>>> Date: Thu, 15 Nov 2012 09:28:46 -0200
>>>> From: [hidden email]<http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657081&i=5>
>>>> To: [hidden email]<http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657081&i=6>
>>>> Subject: Re: [R-br] [Dúvida] Criando pacotes para o R.
>>>>
>>>> No Windows tem que instalar o rutil recomendado para a versão do R que
>>>> estamos usando.
>>>>
>>>> Tenho uma VM windows 64 bits comigo e todos os problemas que encontrei
>>>> quando fuçei com pacotes foram referentes ao R não localizar todos os
>>>> 'bichinhos' do Rutil os quais precisava.
>>>>
>>>> []s
>>>> Leonard de Assishttp://about.me/ldeassis
>>>>
>>>> Em 15/11/2012 08:06, tiago souza marçal escreveu:
>>>>
>>>>  Estou com um problema parecido com o seu, porém, no Windows . No meu
>>>> caso o check do PDF está ok mas quando eu peço para ele ser gerado (R
>>>> CMD Rd2pdf) uma mensagem de erro e retornada informando uma versão
>>>> antiga do MikTex que eu não estou usando.
>>>>
>>>>  Mas no seu caso você observou mensagem de erro no processo de
>>>> instalação do pacote (R CMD INSTALL) ? Caso isso tenha ocorrido este
>>>> pode ter sido o problema, em função de algum erro na edição do arquivo.Rd.
>>>> Observe que foi retornado pra você um  WARNING no check dos
>>>> arquivos.Rd com algumas mensagens de erro.
>>>>
>>>>  Espero ter te ajudado.
>>>>
>>>>  Att.
>>>>
>>>>  Tiago.
>>>>
>>>>  ------------------------------
>>>> Date: Wed, 14 Nov 2012 23:27:37 -0300
>>>> From: [hidden email]<http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657081&i=7>
>>>> To: [hidden email]<http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657081&i=8>
>>>> Subject: Re: [R-br] [Dúvida] Criando pacotes para o R.
>>>>
>>>> Pessoal estou estudando como criar pacotes no R e tive o seguinte erro
>>>> na hora de dar o check. Consigo gerar o arquivo tar.gz mas o pdf da
>>>> documentação não é criado. Alguém saberia me informar onde estaria o erro?
>>>>
>>>> OBS: Estou em uma máquina Linux.
>>>>
>>>> * using log directory
>>>> ‘/home/pedro/Documentos/Gama_Log_Logistica/FUNCAO_CODIGO/PRDM.Rcheck’
>>>> * using R version 2.15.1 (2012-06-22)
>>>> * using platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)
>>>> * using session charset: UTF-8
>>>> * checking for file ‘PRDM/DESCRIPTION’ ... OK
>>>> * checking extension type ... Package
>>>> * this is package ‘PRDM’ version ‘1.0’
>>>> * checking package namespace information ... OK
>>>> * checking package dependencies ... OK
>>>> * checking if this is a source package ... OK
>>>> * checking if there is a namespace ... OK
>>>> * checking for executable files ... OK
>>>> * checking whether package ‘PRDM’ can be installed ... OK
>>>> * checking installed package size ... OK
>>>> * checking package directory ... OK
>>>> * checking for portable file names ... OK
>>>> * checking for sufficient/correct file permissions ... OK
>>>> * checking DESCRIPTION meta-information ... OK
>>>> * checking top-level files ... OK
>>>> * checking index information ... OK
>>>> * checking package subdirectories ... OK
>>>> * checking R files for non-ASCII characters ... OK
>>>> * checking R files for syntax errors ... OK
>>>> * checking whether the package can be loaded ... OK
>>>> * checking whether the package can be loaded with stated dependencies
>>>> ... OK
>>>> * checking whether the package can be unloaded cleanly ... OK
>>>> * checking whether the namespace can be loaded with stated dependencies
>>>> ... OK
>>>> * checking whether the namespace can be unloaded cleanly ... OK
>>>> * checking for unstated dependencies in R code ... OK
>>>> * checking S3 generic/method consistency ... OK
>>>> * checking replacement functions ... OK
>>>> * checking foreign function calls ... OK
>>>> * checking R code for possible problems ... OK
>>>> * checking Rd files ... WARNING
>>>> prepare_Rd: PRDM-package.Rd:30: All text must be in a section
>>>> prepare_Rd: PRDM-package.Rd:31: All text must be in a section
>>>> prepare_Rd: prdm.Rd:36-42: Dropping empty section \value
>>>> * checking Rd metadata ... OK
>>>> * checking Rd cross-references ... OK
>>>> * checking for missing documentation entries ... OK
>>>> * checking for code/documentation mismatches ... OK
>>>> * checking Rd \usage sections ... OK
>>>> * checking Rd contents ... OK
>>>> * checking for unstated dependencies in examples ... OK
>>>> * checking examples ... OK
>>>> * checking PDF version of manual ... ERROR
>>>> Rd conversion errors:
>>>> Warning: unknown option '-'
>>>> Warning in file(con, "r") :
>>>>   cannot open file '/home/pedro/Documentos/MESTRADO': No such file or
>>>> directory
>>>> Error in file(con, "r") : cannot open the connection
>>>>
>>>>
>>>> [   ],
>>>> Pedro Rafael Diniz Marinho.
>>>>
>>>>
>>>> Em 14 de novembro de 2012 20:43, Pedro Rafael <[hidden email]<http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657081&i=9>
>>>> > escreveu:
>>>>
>>>> Grande Paulo Justiniano, como vai? Muito obrigado pelas suas
>>>> informações. Uso o Linux faz uns 6 anos mas nunca contribui ou publiquei
>>>> meus códigos. Estava vendo que a linguagem Julia vem com a licença MIT  que
>>>> eu não acho muito interessante porque quem quiser pode vender o código.
>>>> Minha dúvida sobre a licença GPL ou GPL2  é se uma pessoa poderá desmanchar
>>>> algum código que fiz ou mudar completamente o foco do pacote, retirar nome
>>>> dos autores, etc. Existe um pacote hoje muito usado no R que foi feito por
>>>> uma pessoa e depois de um tempo parou de ser mantido. Chegou um outro cara
>>>> de fora  e reimplementou  o pacote e tirou o nome dos autores antigos e
>>>> depois muita luta o nome dessas pessoas permaneceu  como "autores antigos".
>>>> Isso ocorre com certa frequência? Existe alguma periodicidade de manutenção
>>>> do pacote que deve ser respeitada?
>>>>
>>>> [   ],
>>>> Pedro Rafael Diniz Marinho.
>>>>
>>>>
>>>>  Em 14 de novembro de 2012 20:28, Paulo Justiniano [via R-br] <[hidden
>>>> email] <http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657081&i=10>>escreveu:
>>>>
>>>>
>>>>
>>>> On Wed, 14 Nov 2012, Pedro Rafael wrote:
>>>>
>>>> > Pessoal, digamos que faço um pacote para o R. Como funciona o
>>>> professo de submissão?
>>>>
>>>>  1. Leia atentamente o manual "Writing R extensions"  que descreve isto
>>>> em
>>>> detalhes.
>>>>
>>>> 2 certifique-se que voce testou o seu pacote :
>>>>
>>>> R CMD check SEU_PACOTE
>>>>
>>>> e corrija todos os eventuais problemas
>>>>
>>>> > Digamos que eu submeta um pacote "meu_pacote" e depois queira
>>>> > fazer modificações no mesmo. Para acrescentar essas modificações eu
>>>> tenho que submeter novamente o pacote com o mesmo nome para que as
>>>> atualizações
>>>> > fiquem disponíveis?
>>>>
>>>>  Sim. Para isto voce alter a numero da versao no arquivo DESCRIPTION
>>>>
>>>> >
>>>> > Outra dúvida que tenho é sobre a segurança que tenho que meu pacote
>>>> não seja modificado. Qualquer pessoa pode pegar esse pacote e alterar ele
>>>> > completamente sem nenhuma permissão minha ou qualquer modificação tem
>>>> que ser acompanhada por intermédio da pessoa que submeteu o pacote pela
>>>> primeira
>>>> > vez?
>>>> >
>>>>
>>>>  Bem vindo ao Universo do Software livre
>>>>
>>>> Note que se voce quiser voce pode baixar os fontes do R e mudar o que
>>>> quiser
>>>>
>>>> Falando mais seriamente no DESCRIPTION voce define a licenca.
>>>> Leia sobre licxancas GPL e análogas
>>>>
>>>> Minha sugestao: internalize completamente o conceito de software livre
>>>> e
>>>> livre-se  destas preocupacoes
>>>>
>>>> >
>>>> > São dúvidas bestas mas que nunca entendi direito.
>>>>
>>>>  Nao sao somente suas.
>>>> Não é por acaso que há uma diversidade de tipos de licensas, não sem
>>>> controvérsias!
>>>>
>>>> >
>>>> > Obrigado à todos.
>>>> > [   ],
>>>> > Pedro Rafael Diniz Marinho.
>>>> >
>>>> >
>>>> >
>>>>  _______________________________________________
>>>> R-br mailing list
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>>>> código mínimo reproduzível.
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>>>>
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>>
>>
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> código mínimo reproduzível.
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