[R-br] Fwd: Re: Fwd: Re: [Dúvida] Criando pacotes para o R.
Leonard Mendonça de Assis
assis.leonard em gmail.com
Sábado Novembro 17 13:13:06 BRST 2012
No meu entendimento é uma nova versão
[]s
Leonard de Assis
http://about.me/ldeassis
Em 17/11/2012 11:32, Pedro Rafael escreveu:
>
> Benilton voce poderia me tirar uma dúvida? Já li a documentacao do R
> mas nao ficou claro para mim. Caso eu queira fazer uma nova versao do
> pacote pelo que eu entendi eu devo fazer upload do novo arquivo tar.gz
> informando a nova versao. Contudo, caso eu precise fazer pequenos
> ajustes, por exemplo, ajustes na documentacao. Como fazer isso sem
> mudar a versao do pacote? Isso pode ser feito?
>
> ---------- Mensagem encaminhada ----------
> De: "beniltoncarvalho [via R-br]"
> <ml-node+s2285057n4657087h74 em n4.nabble.com
> <mailto:ml-node%2Bs2285057n4657087h74 em n4.nabble.com>>
> Data: 16/11/2012 17:50
> Assunto: Re: [R-br] Fwd: Re: [Dúvida] Criando pacotes para o R.
> Para: "Pedro Rafael Diniz Marinho" <pedro.rafael.marinho em gmail.com
> <mailto:pedro.rafael.marinho em gmail.com>>
>
> Aguarde 24-48h, é o tempo do ciclo dos "builds".
>
> On 16 Nov 2012 20:47, "Pedro Rafael" <[hidden email]
> <http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657087&i=0>> wrote:
>
> Pessoal os binarios para windows e Mac sao gerados pelo CRAN? Vi
> em alguns pacotes que entraram nos espelhos hoje nao tem esses
> binarios. Existe uma mensagem do lado dizendo que os pacotes sao
> novos. Os binarios nao sao gerados logo quando o pacofe entra no
> CRAN?
>
> ---------- Mensagem encaminhada ----------
> De: "beniltoncarvalho [via R-br]" <[hidden email]
> <http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657087&i=1>>
>
> Data: 16/11/2012 17:01
> Assunto: Re: [R-br] [Dúvida] Criando pacotes para o R.
> Para: "Pedro Rafael Diniz Marinho" <[hidden email]
> <http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657087&i=2>>
>
>
> Se vc rodar
>
> R CMD check pacote
>
> ou seu equivalente para o windows... o que sao os erros e o
> conteudo dos logs?
>
> 2012/11/16 tiago souza marçal <[hidden email]
> <http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657081&i=0>>
>
> O meu path esta configurado da seguinte forma:
>
> C:\Perl\site\bin;C:\Perl\bin;C:\Rtools\bin;C:\MiKTeX2.9\miktex\bin;C:\R\R-2.15.2\bin\i386;C:\MinGW\bin;C:\HTMLHelpWorkshop;C:\Program
> Files\Common Files\Microsoft
> Shared\WindowsLive;%LINDOAPI_HOME%bin\win32;C:\Windows\system32;C:\Windows;C:\Windows\System32\Wbem;C:\Windows\System32\WindowsPowerShell\v1.0\;C:\Program
> Files\Windows Live\Shared;C:\Program Files\Internet Explorer
>
> Você vê algum problema?
>
> Att.
>
> Tiago.
>
> ------------------------------------------------------------------------
> Date: Fri, 16 Nov 2012 13:58:58 -0200
>
> From: [hidden email]
> <http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657081&i=1>
> To: [hidden email]
> <http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657081&i=2>
> Subject: Re: [R-br] [Dúvida] Criando pacotes para o R.
>
> na minha vm windows, eu instalei primeiro o miktex, depois
> instalei o rtools. Deve ser alguma loucura do windows (Path
> faltando, por exemplo)
>
> []s
> Leonard de Assis
> http://about.me/ldeassis
>
> Em 16/11/2012 13:11, tiago souza marçal escreveu:
>
> O Rtools eu tenho o problema e quando eu peço para gerar o PDF
> ( R CMD Rd2pdf ) ele me retorna uma mensagem de erro falando
> do MikTex 1.9, entretanto, eu estou utilizando o MikTex 2.9.
>
> Att.
>
> Tiago.
>
> ------------------------------------------------------------------------
> Date: Thu, 15 Nov 2012 20:33:21 -0200
> From: [hidden email]
> <http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657081&i=3>
> To: [hidden email]
> <http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657081&i=4>
> Subject: Re: [R-br] [Dúvida] Criando pacotes para o R.
>
> RTools, errei o nome
>
> voce acha no CRAN
>
> []s
> Leonard de Assis
> http://about.me/ldeassis
>
> Em 15/11/2012 09:42, tiago souza marçal escreveu:
>
> Leonard onde eu consigo baixar esse rutil?
>
> Att.
>
> Tiago.
>
> ------------------------------------------------------------------------
> Date: Thu, 15 Nov 2012 09:28:46 -0200
> From: [hidden email]
> <http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657081&i=5>
> To: [hidden email]
> <http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657081&i=6>
> Subject: Re: [R-br] [Dúvida] Criando pacotes para o R.
>
> No Windows tem que instalar o rutil recomendado para a
> versão do R que estamos usando.
>
> Tenho uma VM windows 64 bits comigo e todos os problemas
> que encontrei quando fuçei com pacotes foram referentes ao
> R não localizar todos os 'bichinhos' do Rutil os quais
> precisava.
>
> []s
> Leonard de Assis
> http://about.me/ldeassis
>
> Em 15/11/2012 08:06, tiago souza marçal escreveu:
>
> Estou com um problema parecido com o seu, porém, no
> Windows . No meu caso o check do PDF está ok mas
> quando eu peço para ele ser gerado (R CMD Rd2pdf) uma
> mensagem de erro e retornada informando uma versão
> antiga do MikTex que eu não estou usando.
>
> Mas no seu caso você observou mensagem de erro no
> processo de instalação do pacote (R CMD INSTALL) ?
> Caso isso tenha ocorrido este pode ter sido o
> problema, em função de algum erro na edição do
> arquivo.Rd. Observe que foi retornado pra você um
> WARNING no check dos arquivos.Rd com algumas mensagens
> de erro.
>
> Espero ter te ajudado.
>
> Att.
>
> Tiago.
>
> ------------------------------------------------------------------------
> Date: Wed, 14 Nov 2012 23:27:37 -0300
> From: [hidden email]
> <http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657081&i=7>
> To: [hidden email]
> <http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657081&i=8>
> Subject: Re: [R-br] [Dúvida] Criando pacotes para o R.
>
> Pessoal estou estudando como criar pacotes no R e tive
> o seguinte erro na hora de dar o check. Consigo gerar
> o arquivo tar.gz mas o pdf da documentação não é
> criado. Alguém saberia me informar onde estaria o erro?
>
> OBS: Estou em uma máquina Linux.
>
> * using log directory
> '/home/pedro/Documentos/Gama_Log_Logistica/FUNCAO_CODIGO/PRDM.Rcheck'
> * using R version 2.15.1 (2012-06-22)
> * using platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)
> * using session charset: UTF-8
> * checking for file 'PRDM/DESCRIPTION' ... OK
> * checking extension type ... Package
> * this is package 'PRDM' version '1.0'
> * checking package namespace information ... OK
> * checking package dependencies ... OK
> * checking if this is a source package ... OK
> * checking if there is a namespace ... OK
> * checking for executable files ... OK
> * checking whether package 'PRDM' can be installed ... OK
> * checking installed package size ... OK
> * checking package directory ... OK
> * checking for portable file names ... OK
> * checking for sufficient/correct file permissions ... OK
> * checking DESCRIPTION meta-information ... OK
> * checking top-level files ... OK
> * checking index information ... OK
> * checking package subdirectories ... OK
> * checking R files for non-ASCII characters ... OK
> * checking R files for syntax errors ... OK
> * checking whether the package can be loaded ... OK
> * checking whether the package can be loaded with
> stated dependencies ... OK
> * checking whether the package can be unloaded cleanly
> ... OK
> * checking whether the namespace can be loaded with
> stated dependencies ... OK
> * checking whether the namespace can be unloaded
> cleanly ... OK
> * checking for unstated dependencies in R code ... OK
> * checking S3 generic/method consistency ... OK
> * checking replacement functions ... OK
> * checking foreign function calls ... OK
> * checking R code for possible problems ... OK
> * checking Rd files ... WARNING
> prepare_Rd: PRDM-package.Rd:30: All text must be in a
> section
> prepare_Rd: PRDM-package.Rd:31: All text must be in a
> section
> prepare_Rd: prdm.Rd:36-42: Dropping empty section \value
> * checking Rd metadata ... OK
> * checking Rd cross-references ... OK
> * checking for missing documentation entries ... OK
> * checking for code/documentation mismatches ... OK
> * checking Rd \usage sections ... OK
> * checking Rd contents ... OK
> * checking for unstated dependencies in examples ... OK
> * checking examples ... OK
> * checking PDF version of manual ... ERROR
> Rd conversion errors:
> Warning: unknown option '-'
> Warning in file(con, "r") :
> cannot open file '/home/pedro/Documentos/MESTRADO':
> No such file or directory
> Error in file(con, "r") : cannot open the connection
>
>
> [ ],
> Pedro Rafael Diniz Marinho.
>
>
> Em 14 de novembro de 2012 20:43, Pedro Rafael <[hidden
> email]
> <http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657081&i=9>> escreveu:
>
> Grande Paulo Justiniano, como vai? Muito obrigado
> pelas suas informações. Uso o Linux faz uns 6 anos
> mas nunca contribui ou publiquei meus códigos.
> Estava vendo que a linguagem Julia vem com a
> licença MIT que eu não acho muito interessante
> porque quem quiser pode vender o código. Minha
> dúvida sobre a licença GPL ou GPL2 é se uma
> pessoa poderá desmanchar algum código que fiz ou
> mudar completamente o foco do pacote, retirar nome
> dos autores, etc. Existe um pacote hoje muito
> usado no R que foi feito por uma pessoa e depois
> de um tempo parou de ser mantido. Chegou um outro
> cara de fora e reimplementou o pacote e tirou o
> nome dos autores antigos e depois muita luta o
> nome dessas pessoas permaneceu como "autores
> antigos". Isso ocorre com certa frequência? Existe
> alguma periodicidade de manutenção do pacote que
> deve ser respeitada?
>
> [ ],
> Pedro Rafael Diniz Marinho.
>
>
> Em 14 de novembro de 2012 20:28, Paulo Justiniano
> [via R-br] <[hidden email]
> <http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657081&i=10>>
> escreveu:
>
>
>
> On Wed, 14 Nov 2012, Pedro Rafael wrote:
>
> > Pessoal, digamos que faço um pacote para o
> R. Como funciona o professo de submissão?
>
> 1. Leia atentamente o manual "Writing R
> extensions" que descreve isto em
> detalhes.
>
> 2 certifique-se que voce testou o seu pacote :
>
> R CMD check SEU_PACOTE
>
> e corrija todos os eventuais problemas
>
> > Digamos que eu submeta um pacote
> "meu_pacote" e depois queira
> > fazer modificações no mesmo. Para
> acrescentar essas modificações eu tenho que
> submeter novamente o pacote com o mesmo nome
> para que as atualizações
> > fiquem disponíveis?
>
> Sim. Para isto voce alter a numero da versao
> no arquivo DESCRIPTION
>
> >
> > Outra dúvida que tenho é sobre a segurança
> que tenho que meu pacote não seja modificado.
> Qualquer pessoa pode pegar esse pacote e
> alterar ele
> > completamente sem nenhuma permissão minha ou
> qualquer modificação tem que ser acompanhada
> por intermédio da pessoa que submeteu o pacote
> pela primeira
> > vez?
> >
>
> Bem vindo ao Universo do Software livre
>
> Note que se voce quiser voce pode baixar os
> fontes do R e mudar o que
> quiser
>
> Falando mais seriamente no DESCRIPTION voce
> define a licenca.
> Leia sobre licxancas GPL e análogas
>
> Minha sugestao: internalize completamente o
> conceito de software livre e
> livre-se destas preocupacoes
>
> >
> > São dúvidas bestas mas que nunca entendi
> direito.
>
> Nao sao somente suas.
> Não é por acaso que há uma diversidade de
> tipos de licensas, não sem
> controvérsias!
>
> >
> > Obrigado à todos.
> > [ ],
> > Pedro Rafael Diniz Marinho.
> >
> >
> >
> _______________________________________________
> R-br mailing list
> [hidden email]
> <http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657009&i=0>
>
> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br
> Leia o guia de postagem
> (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça
> código mínimo reproduzível.
>
> ------------------------------------------------------------------------
> If you reply to this email, your message will
> be added to the discussion below:
> http://r-br.2285057.n4.nabble.com/R-br-Duvida-Criando-pacotes-para-o-R-tp4657007p4657009.html
>
> To unsubscribe from R-br, click here.
> NAML
> <http://r-br.2285057.n4.nabble.com/template/NamlServlet.jtp?macro=macro_viewer&id=instant_html%21nabble:email.naml&base=nabble.naml.namespaces.BasicNamespace-nabble.view.web.template.NabbleNamespace-nabble.view.web.template.NodeNamespace&breadcrumbs=notify_subscribers%21nabble:email.naml-instant_emails%21nabble:email.naml-send_instant_email%21nabble:email.naml>
>
>
>
>
>
> _______________________________________________ R-br
> mailing list [hidden email]
> <http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657081&i=11> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br
> Leia o guia de postagem
> (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forne?a c?digo
> m?nimo reproduz?vel.
>
>
> _______________________________________________
> R-br mailing list
> [hidden email] <http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657081&i=12>
> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br
> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível.
>
>
>
> _______________________________________________ R-br
> mailing list [hidden email]
> <http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657081&i=13>
> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br
> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia)
> e forne?a c?digo m?nimo reproduz?vel.
>
>
> _______________________________________________
> R-br mailing list
> [hidden email] <http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657081&i=14>
> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br
> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível.
>
>
>
> _______________________________________________ R-br mailing
> list [hidden email]
> <http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657081&i=15>
> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia
> o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e
> forne?a c?digo m?nimo reproduz?vel.
>
>
> _______________________________________________
> R-br mailing list
> [hidden email] <http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657081&i=16>
> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br
> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível.
>
>
>
> _______________________________________________ R-br mailing list
> [hidden email]
> <http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657081&i=17>
> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o
> guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forne?a
> c?digo m?nimo reproduz?vel.
>
> _______________________________________________
> R-br mailing list
> [hidden email] <http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657081&i=18>
> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br
> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e
> forneça código mínimo reproduzível.
>
>
>
> _______________________________________________
> R-br mailing list
> [hidden email] <http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657081&i=19>
> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br
> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça
> código mínimo reproduzível.
>
> ------------------------------------------------------------------------
> If you reply to this email, your message will be added to the
> discussion below:
> http://r-br.2285057.n4.nabble.com/R-br-Duvida-Criando-pacotes-para-o-R-tp4657007p4657081.html
>
> To unsubscribe from R-br, click here.
> NAML
> <http://r-br.2285057.n4.nabble.com/template/NamlServlet.jtp?macro=macro_viewer&id=instant_html%21nabble%3Aemail.naml&base=nabble.naml.namespaces.BasicNamespace-nabble.view.web.template.NabbleNamespace-nabble.view.web.template.NodeNamespace&breadcrumbs=notify_subscribers%21nabble%3Aemail.naml-instant_emails%21nabble%3Aemail.naml-send_instant_email%21nabble%3Aemail.naml>
>
>
> _______________________________________________
> R-br mailing list
> [hidden email] <http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657087&i=3>
> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br
> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça
> código mínimo reproduzível.
>
> _______________________________________________
> R-br mailing list
> [hidden email] <http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657087&i=4>
> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br
> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça
> código mínimo reproduzível.
>
> ------------------------------------------------------------------------
> If you reply to this email, your message will be added to the
> discussion below:
> http://r-br.2285057.n4.nabble.com/R-br-Duvida-Criando-pacotes-para-o-R-tp4657007p4657087.html
>
> To unsubscribe from R-br, click here
> <http://r-br.2285057.n4.nabble.com/template/NamlServlet.jtp?macro=unsubscribe_by_code&node=3357982&code=cGVkcm8ucmFmYWVsLm1hcmluaG9AZ21haWwuY29tfDMzNTc5ODJ8NTAyMjI0MDYw>.
> NAML
> <http://r-br.2285057.n4.nabble.com/template/NamlServlet.jtp?macro=macro_viewer&id=instant_html%21nabble%3Aemail.naml&base=nabble.naml.namespaces.BasicNamespace-nabble.view.web.template.NabbleNamespace-nabble.view.web.template.NodeNamespace&breadcrumbs=notify_subscribers%21nabble%3Aemail.naml-instant_emails%21nabble%3Aemail.naml-send_instant_email%21nabble%3Aemail.naml>
>
>
>
> _______________________________________________
> R-br mailing list
> R-br em listas.c3sl.ufpr.br
> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br
> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível.
-------------- Próxima Parte ----------
Um anexo em HTML foi limpo...
URL: <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20121117/abab19f5/attachment.html>
Mais detalhes sobre a lista de discussão R-br