[R-br] [Dúvida] Criando pacotes para o R.
Leonard Mendonça de Assis
assis.leonard em gmail.com
Sexta Novembro 16 13:58:58 BRST 2012
na minha vm windows, eu instalei primeiro o miktex, depois instalei o
rtools. Deve ser alguma loucura do windows (Path faltando, por exemplo)
[]s
Leonard de Assis
http://about.me/ldeassis
Em 16/11/2012 13:11, tiago souza marçal escreveu:
> O Rtools eu tenho o problema e quando eu peço para gerar o PDF ( R CMD
> Rd2pdf ) ele me retorna uma mensagem de erro falando do MikTex 1.9,
> entretanto, eu estou utilizando o MikTex 2.9.
>
> Att.
>
> Tiago.
>
> ------------------------------------------------------------------------
> Date: Thu, 15 Nov 2012 20:33:21 -0200
> From: assis.leonard em gmail.com
> To: r-br em listas.c3sl.ufpr.br
> Subject: Re: [R-br] [Dúvida] Criando pacotes para o R.
>
> RTools, errei o nome
>
> voce acha no CRAN
> []s
> Leonard de Assis
> http://about.me/ldeassis
> Em 15/11/2012 09:42, tiago souza marçal escreveu:
>
> Leonard onde eu consigo baixar esse rutil?
>
> Att.
>
> Tiago.
>
> ------------------------------------------------------------------------
> Date: Thu, 15 Nov 2012 09:28:46 -0200
> From: assis.leonard em gmail.com <mailto:assis.leonard em gmail.com>
> To: r-br em listas.c3sl.ufpr.br <mailto:r-br em listas.c3sl.ufpr.br>
> Subject: Re: [R-br] [Dúvida] Criando pacotes para o R.
>
> No Windows tem que instalar o rutil recomendado para a versão do R
> que estamos usando.
>
> Tenho uma VM windows 64 bits comigo e todos os problemas que
> encontrei quando fuçei com pacotes foram referentes ao R não
> localizar todos os 'bichinhos' do Rutil os quais precisava.
>
> []s
> Leonard de Assis
> http://about.me/ldeassis
>
> Em 15/11/2012 08:06, tiago souza marçal escreveu:
>
> Estou com um problema parecido com o seu, porém, no Windows .
> No meu caso o check do PDF está ok mas quando eu peço para ele
> ser gerado (R CMD Rd2pdf) uma mensagem de erro e retornada
> informando uma versão antiga do MikTex que eu não estou usando.
>
> Mas no seu caso você observou mensagem de erro no processo de
> instalação do pacote (R CMD INSTALL) ? Caso isso tenha
> ocorrido este pode ter sido o problema, em função de algum
> erro na edição do arquivo.Rd. Observe que foi retornado pra
> você um WARNING no check dos arquivos.Rd com algumas mensagens
> de erro.
>
> Espero ter te ajudado.
>
> Att.
>
> Tiago.
>
> ------------------------------------------------------------------------
> Date: Wed, 14 Nov 2012 23:27:37 -0300
> From: pedro.rafael.marinho em gmail.com
> <mailto:pedro.rafael.marinho em gmail.com>
> To: r-br em listas.c3sl.ufpr.br <mailto:r-br em listas.c3sl.ufpr.br>
> Subject: Re: [R-br] [Dúvida] Criando pacotes para o R.
>
> Pessoal estou estudando como criar pacotes no R e tive o
> seguinte erro na hora de dar o check. Consigo gerar o arquivo
> tar.gz mas o pdf da documentação não é criado. Alguém saberia
> me informar onde estaria o erro?
>
> OBS: Estou em uma máquina Linux.
>
> * using log directory
> '/home/pedro/Documentos/Gama_Log_Logistica/FUNCAO_CODIGO/PRDM.Rcheck'
> * using R version 2.15.1 (2012-06-22)
> * using platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)
> * using session charset: UTF-8
> * checking for file 'PRDM/DESCRIPTION' ... OK
> * checking extension type ... Package
> * this is package 'PRDM' version '1.0'
> * checking package namespace information ... OK
> * checking package dependencies ... OK
> * checking if this is a source package ... OK
> * checking if there is a namespace ... OK
> * checking for executable files ... OK
> * checking whether package 'PRDM' can be installed ... OK
> * checking installed package size ... OK
> * checking package directory ... OK
> * checking for portable file names ... OK
> * checking for sufficient/correct file permissions ... OK
> * checking DESCRIPTION meta-information ... OK
> * checking top-level files ... OK
> * checking index information ... OK
> * checking package subdirectories ... OK
> * checking R files for non-ASCII characters ... OK
> * checking R files for syntax errors ... OK
> * checking whether the package can be loaded ... OK
> * checking whether the package can be loaded with stated
> dependencies ... OK
> * checking whether the package can be unloaded cleanly ... OK
> * checking whether the namespace can be loaded with stated
> dependencies ... OK
> * checking whether the namespace can be unloaded cleanly ... OK
> * checking for unstated dependencies in R code ... OK
> * checking S3 generic/method consistency ... OK
> * checking replacement functions ... OK
> * checking foreign function calls ... OK
> * checking R code for possible problems ... OK
> * checking Rd files ... WARNING
> prepare_Rd: PRDM-package.Rd:30: All text must be in a section
> prepare_Rd: PRDM-package.Rd:31: All text must be in a section
> prepare_Rd: prdm.Rd:36-42: Dropping empty section \value
> * checking Rd metadata ... OK
> * checking Rd cross-references ... OK
> * checking for missing documentation entries ... OK
> * checking for code/documentation mismatches ... OK
> * checking Rd \usage sections ... OK
> * checking Rd contents ... OK
> * checking for unstated dependencies in examples ... OK
> * checking examples ... OK
> * checking PDF version of manual ... ERROR
> Rd conversion errors:
> Warning: unknown option '-'
> Warning in file(con, "r") :
> cannot open file '/home/pedro/Documentos/MESTRADO': No such
> file or directory
> Error in file(con, "r") : cannot open the connection
>
>
> [ ],
> Pedro Rafael Diniz Marinho.
>
>
> Em 14 de novembro de 2012 20:43, Pedro Rafael
> <pedro.rafael.marinho em gmail.com
> <mailto:pedro.rafael.marinho em gmail.com>> escreveu:
>
> Grande Paulo Justiniano, como vai? Muito obrigado pelas
> suas informações. Uso o Linux faz uns 6 anos mas nunca
> contribui ou publiquei meus códigos. Estava vendo que a
> linguagem Julia vem com a licença MIT que eu não acho
> muito interessante porque quem quiser pode vender o
> código. Minha dúvida sobre a licença GPL ou GPL2 é se uma
> pessoa poderá desmanchar algum código que fiz ou mudar
> completamente o foco do pacote, retirar nome dos autores,
> etc. Existe um pacote hoje muito usado no R que foi feito
> por uma pessoa e depois de um tempo parou de ser mantido.
> Chegou um outro cara de fora e reimplementou o pacote e
> tirou o nome dos autores antigos e depois muita luta o
> nome dessas pessoas permaneceu como "autores antigos".
> Isso ocorre com certa frequência? Existe alguma
> periodicidade de manutenção do pacote que deve ser
> respeitada?
>
> [ ],
> Pedro Rafael Diniz Marinho.
>
>
> Em 14 de novembro de 2012 20:28, Paulo Justiniano [via
> R-br] <ml-node+s2285057n4657009h56 em n4.nabble.com
> <mailto:ml-node+s2285057n4657009h56 em n4.nabble.com>> escreveu:
>
>
>
> On Wed, 14 Nov 2012, Pedro Rafael wrote:
>
> > Pessoal, digamos que faço um pacote para o R. Como
> funciona o professo de submissão?
>
> 1. Leia atentamente o manual "Writing R extensions"
> que descreve isto em
> detalhes.
>
> 2 certifique-se que voce testou o seu pacote :
>
> R CMD check SEU_PACOTE
>
> e corrija todos os eventuais problemas
>
> > Digamos que eu submeta um pacote "meu_pacote" e
> depois queira
> > fazer modificações no mesmo. Para acrescentar essas
> modificações eu tenho que submeter novamente o pacote
> com o mesmo nome para que as atualizações
> > fiquem disponíveis?
>
> Sim. Para isto voce alter a numero da versao no
> arquivo DESCRIPTION
>
> >
> > Outra dúvida que tenho é sobre a segurança que tenho
> que meu pacote não seja modificado. Qualquer pessoa
> pode pegar esse pacote e alterar ele
> > completamente sem nenhuma permissão minha ou
> qualquer modificação tem que ser acompanhada por
> intermédio da pessoa que submeteu o pacote pela primeira
> > vez?
> >
>
> Bem vindo ao Universo do Software livre
>
> Note que se voce quiser voce pode baixar os fontes do
> R e mudar o que
> quiser
>
> Falando mais seriamente no DESCRIPTION voce define a
> licenca.
> Leia sobre licxancas GPL e análogas
>
> Minha sugestao: internalize completamente o conceito
> de software livre e
> livre-se destas preocupacoes
>
> >
> > São dúvidas bestas mas que nunca entendi direito.
>
> Nao sao somente suas.
> Não é por acaso que há uma diversidade de tipos de
> licensas, não sem
> controvérsias!
>
> >
> > Obrigado à todos.
> > [ ],
> > Pedro Rafael Diniz Marinho.
> >
> >
> >
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