[R-br] Ler .xls no Rcmdr no Ubuntu

Domingo Novembro 11 18:43:16 BRST 2012

Daniel,
obrigado pela colaboração você foi preciso em suas palavras. Muito obrigado.
Resolvido assim.

sudo apt-get build-dep r-cran-rjava
sudo apt-get build-dep r-cran-rgl

install.packages("Rcmdr", dep=T)
install.packages("XLConnect", dep=T)
install.packages("rJava", dep=T)

obrigado 

André Oliveira Souza

________________________________
 De: Daniel C Bezerra <danielcbezerra em gmail.com>
Para: r-br em listas.c3sl.ufpr.br; Andre Oliveira <andreolsouza em yahoo.com.br> 
Enviadas: Domingo, 11 de Novembro de 2012 17:04
Assunto: Re: [R-br] Ler .xls no Rcmdr no Ubuntu

Provavelmente vc não deve ter o jdk instalado. Tente rodar no terminal:

sudo apt-get build-dep r-cran-rjava

e depois entre no R tente instalar o rJava novamente. 

Abs,

D

On Sun, Nov 11, 2012 at 4:31 PM, Andre Oliveira <andreolsouza em yahoo.com.br> wrote:

Eu tentei vários servidores.....e agora descobri este outro  erro também..
>
>
>
>
> install.packages("rJava", dep=T)
>
>Installing package(s) into ‘/home/andre/R/i686-pc-linux-gnu-library/2.15’
>(as ‘lib’ is unspecified)
>--- Please select a CRAN mirror for use in this session
 ---
>Carregando a interface Tcl/Tk ... pronto
>tentando a URL 'http://cran-r.c3sl.ufpr.br/src/contrib/rJava_0.9-3.tar.gz'
>
>Content type 'application/x-gzip' length 537153 bytes (524 Kb)
>URL aberta
>==================================================
>downloaded 524 Kb
>
>
>* installing *source* package ‘rJava’ ...
>** package ‘rJava’ successfully unpacked and MD5 sums checked
>checking for gcc... gcc -std=gnu99
>checking for C compiler default output file name... a.out
>checking whether the C compiler works... yes
>checking whether we are cross compiling... no
>checking for suffix of executables... 
>checking for suffix of object files... o
>checking whether we are using the GNU C compiler... yes
>checking whether gcc -std=gnu99 accepts -g... yes
>checking for gcc -std=gnu99 option to accept ISO C89... none needed
>checking how to run the C preprocessor... gcc -std=gnu99 -E
>checking for grep that handles
 long lines and -e... /bin/grep
>checking for egrep... /bin/grep -E
>checking for ANSI C header files... yes
>checking for sys/wait.h that is POSIX.1 compatible... yes
>checking for sys/types.h... yes
>checking for sys/stat.h... yes
>checking for stdlib.h... yes
>checking for string.h... yes
>checking for memory.h... yes
>checking for strings.h... yes
>checking for inttypes.h... yes
>checking for stdint.h... yes
>checking for unistd.h... yes
>checking for string.h... (cached) yes
>checking sys/time.h usability... yes
>checking sys/time.h presence... yes
>checking for sys/time.h... yes
>checking for unistd.h... (cached) yes
>checking for an ANSI C-conforming const... yes
>checking whether time.h and sys/time.h may both be included... yes
>configure: checking whether gcc -std=gnu99 supports static inline...
>yes
>checking whether setjmp.h is POSIX.1 compatible... yes
>checking whether sigsetjmp is declared...
 yes
>checking whether siglongjmp is declared... yes
>checking Java support in R... present:
>interpreter : '/usr/bin/java'
>archiver    : '/usr/bin/jar'
>compiler    : '/usr/bin/javac'
>header prep.: '/usr/bin/javah'
>cpp flags   : '-I/usr/lib/jvm/java-6-openjdk-i386/jre/../include'
>java libs   : '-L/usr/lib/jvm/java-6-openjdk-i386/jre/lib/i386/server -L/usr/lib/jvm/java-6-openjdk-i386/jre/lib/i386 -L/usr/lib/jvm/java-6-openjdk-i386/jre/../lib/i386 -L/usr/java/packages/lib/i386 -L/usr/lib/i386-linux-gnu/jni -L/lib/i386-linux-gnu -L/usr/lib/i386-linux-gnu -L/usr/lib/jni -L/lib -L/usr/lib -ljvm'
>checking whether JNI programs can be compiled... configure: error: Cannot compile a simple JNI program. See config.log for details.
>
>Make sure you have Java Development Kit installed and correctly registered in R.
>If in doubt, re-run "R CMD javareconf" as root.
>
>ERROR:
 configuration failed for package ‘rJava’
>* removing ‘/home/andre/R/i686-pc-linux-gnu-library/2.15/rJava’
>
>
>The downloaded source packages are in
>    ‘/tmp/RtmpuZLRQJ/downloaded_packages’
>Mensagens de aviso perdidas:
>In install.packages("rJava", dep = T) :
>
>  installation of package ‘rJava’ had non-zero exit status
>
>
>
>
>
>
>
>
>
>
>
>
>
>
>
> 
>André Oliveira Souza
>
>
>________________________________
> De: Andre Oliveira <andreolsouza em yahoo.com.br>
>Para: "r-br em listas.c3sl.ufpr.br" <r-br em listas.c3sl.ufpr.br> 
>Enviadas: Domingo, 11 de Novembro de 2012 16:03
>
>Assunto: Re: [R-br] Ler .xls no Rcmdr no Ubuntu
> 
>
>
>obrigado. Penso que deve ser algum pacote que devo instalar só não sei qual é. Tentei aqui sua dica: Mas deu este erro.
>
>
>
>
>> install.packages("XLConnect", dep=T)
>Installing package(s) into ‘/home/andre/R/i686-pc-linux-gnu-library/2.15’
>(as ‘lib’ is unspecified)
>--- Please select a CRAN mirror for use in this session ---
>Carregando a interface Tcl/Tk ... pronto
>also installing the dependencies ‘XLConnectJars’, ‘rJava’
>
>tentando a URL 'http://www.vps.fmvz.usp.br/CRAN/src/contrib/XLConnectJars_0.2-0.tar.gz'
>Content type 'application/x-gzip' length 16488318 bytes (15.7 Mb)
>URL aberta
>==================================================
>downloaded 15.7 Mb
>
>tentando a URL 'http://www.vps.fmvz.usp.br/CRAN/src/contrib/rJava_0.9-3.tar.gz'
>Content type 'application/x-gzip' length 537153 bytes (524 Kb)
>URL aberta
>==================================================
>downloaded 524 Kb
>
>tentando a URL 'http://www.vps.fmvz.usp.br/CRAN/src/contrib/XLConnect_0.2-3.tar.gz'
>Content type 'application/x-gzip' length 1667765 bytes (1.6 Mb)
>URL
 aberta
>==================================================
>downloaded 1.6 Mb
>
>* installing *source* package ‘rJava’ ...
>** package ‘rJava’ successfully unpacked and MD5 sums checked
>checking for gcc... gcc -std=gnu99
>checking for C compiler default output file name... a.out
>checking whether the C compiler works... yes
>checking whether we are cross compiling... no
>checking for suffix of executables... 
>checking for suffix of object files... o
>checking whether we are using the GNU C compiler... yes
>checking whether gcc -std=gnu99 accepts -g... yes
>checking for gcc -std=gnu99 option to accept ISO C89... none needed
>checking how to run the C preprocessor... gcc -std=gnu99 -E
>checking for grep that handles long lines and -e... /bin/grep
>checking for egrep... /bin/grep -E
>checking for ANSI C header files... yes
>checking for sys/wait.h that is POSIX.1 compatible... yes
>checking for
 sys/types.h... yes
>checking for sys/stat.h... yes
>checking for stdlib.h... yes
>checking for string.h... yes
>checking for memory.h... yes
>checking for strings.h... yes
>checking for inttypes.h... yes
>checking for stdint.h... yes
>checking for unistd.h... yes
>checking for string.h... (cached) yes
>checking sys/time.h usability... yes
>checking sys/time.h presence... yes
>checking for sys/time.h... yes
>checking for unistd.h... (cached) yes
>checking for an ANSI C-conforming const... yes
>checking whether time.h and sys/time.h may both be included... yes
>configure: checking whether gcc -std=gnu99 supports static inline...
>yes
>checking whether setjmp.h is POSIX.1 compatible... yes
>checking whether sigsetjmp is declared... yes
>checking whether siglongjmp is declared... yes
>checking Java support in R... present:
>interpreter : '/usr/bin/java'
>archiver    :
 '/usr/bin/jar'
>compiler    : '/usr/bin/javac'
>header prep.: '/usr/bin/javah'
>cpp flags   : '-I/usr/lib/jvm/java-6-openjdk-i386/jre/../include'
>java libs   : '-L/usr/lib/jvm/java-6-openjdk-i386/jre/lib/i386/server -L/usr/lib/jvm/java-6-openjdk-i386/jre/lib/i386 -L/usr/lib/jvm/java-6-openjdk-i386/jre/../lib/i386 -L/usr/java/packages/lib/i386 -L/usr/lib/i386-linux-gnu/jni -L/lib/i386-linux-gnu -L/usr/lib/i386-linux-gnu -L/usr/lib/jni -L/lib -L/usr/lib -ljvm'
>checking whether JNI programs can be compiled... configure: error: Cannot compile a simple JNI program. See config.log for details.
>
>Make sure you have Java Development Kit installed and correctly registered in R.
>If in doubt, re-run "R CMD javareconf" as root.
>
>ERROR: configuration failed for package ‘rJava’
>* removing ‘/home/andre/R/i686-pc-linux-gnu-library/2.15/rJava’
>ERROR: dependency ‘rJava’ is not available for
 package ‘XLConnectJars’
>* removing ‘/home/andre/R/i686-pc-linux-gnu-library/2.15/XLConnectJars’
>ERROR: dependencies ‘XLConnectJars’, ‘rJava’ are not available for package ‘XLConnect’
>* removing ‘/home/andre/R/i686-pc-linux-gnu-library/2.15/XLConnect’
>
>The downloaded source packages are in
>    ‘/tmp/Rtmpp7HwvH/downloaded_packages’
>Mensagens de aviso perdidas:
>1: In install.packages("XLConnect", dep = T) :
>  installation of package ‘rJava’ had non-zero exit status
>2: In install.packages("XLConnect", dep = T) :
>  installation of package ‘XLConnectJars’ had non-zero exit status
>3: In install.packages("XLConnect", dep = T) :
>  installation of package ‘XLConnect’ had non-zero exit status
>
>
>
>Tem alguma pendencia com o ‘rJava’ que não  sei qual é. Alguma dica?
>
>
>obrigado 
>
>
>
>
>
>
>
> 
>André Oliveira Souza
>
>
>________________________________
> De: Daniel C Bezerra <danielcbezerra em gmail.com>
>Para: r-br em listas.c3sl.ufpr.br 
>Enviadas: Domingo, 11 de Novembro de 2012 12:18
>Assunto: Re: [R-br] Ler .xls no Rcmdr no Ubuntu
> 
>
>Tente instalar os pacotes "XLConnect" e "XLConnectJars" e depois rode o Rcmdr novamente (não precisa carregar os pacotes após a reinicialização). 
>
>Dê uma olhada se a opção de importar arquivos do excel aparece no menu. 
>
>Abs,
>
>D
>
>
>2012/11/11 Edson Lira <edinhoestat em yahoo.com.br>
>
>Por que não converte para .csv? É uma alternativa,
>>
>>
>>[. ]'s.Edson Lira
>>Estatístico
>>Ma-Am
>>
>>Em 10/11/2012, às 14:35, Andre Oliveira <andreolsouza em yahoo.com.br> escreveu:
>>
>>
>>É uma solução,
>>>testei aqui. O Rcmdr está na central de programas do ubuntu 12.04  e quando instalada cria um menu na barra de ferramentas. Na verdade eu gostaria  de usar menos linhas de comando possível com os alunos. Eu sempre uso linha de camando acho melhor.
>>>
>>>
>>>
>>> 
>>>André Oliveira Souza
>>>
>>>
>>>________________________________
>>> De: Sérgio Henrique <sergio.edfisica em gmail.com>
>>>Para: "r-br em listas.c3sl.ufpr.br" <r-br em listas.c3sl.ufpr.br>; Andre Oliveira <andreolsouza em yahoo.com.br> 
>>>Enviadas: Sábado, 10 de Novembro de 2012 16:11
>>>Assunto: Re: [R-br] Ler .xls no Rcmdr no Ubuntu
>>> 
>>>
>>>Você usar a linha de comando do Rcmdr.
>>>Use
>>>require(gdata)
>>>read.xls
>>>
>>>
>>>Obs: não testei pra saber se roda.
>>>
>>>
>>>Abraços
>>>
>>>Enviado via iPad
>>>
>>>Em Nov 10, 2012, às 4:08 PM, Andre Oliveira <andreolsouza em yahoo.com.br> escreveu:
>>>
>>>
>>>Boa tarde,
>>>>alguns dias atrás tive aqui com mesmo assunto na lista e não consegui resolver  a questão. Pesquisei muito e não encontrei como carregar um .xls pelo menu (importar arquivos)  do Rcmdr o que é possivel pelo Win$$.  Atualmente estou trabalhando no curso de administração e gostaria de trabalhar com Ubuntu+R+Rcmdr. Na escola tem ubuntu em todas máquinas este o motivo de voltar ao assunto. Agora estou com dúvidas será que esta é uma tarefa impossível para Ubuntu+R+Rcmdr?  
>>>>
>>>> 
>>>>
>>>>
>>>_______________________________________________
>>>>R-br mailing list
>>>>R-br em listas.c3sl.ufpr.br
>>>>https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br
>>>>Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível.
>>>
>>>
>>_______________________________________________
>>>R-br mailing list
>>>R-br em listas.c3sl.ufpr.br
>>>https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br
>>>Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível.
>>_______________________________________________
>>R-br mailing list
>>R-br em listas.c3sl.ufpr.br
>>https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br
>>Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível.
>>
>
>_______________________________________________
>R-br mailing list
>R-br em listas.c3sl.ufpr.br
>https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br
>Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível.
>
>
>_______________________________________________
>R-br mailing list
>R-br em listas.c3sl.ufpr.br
>https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br
>Leia o guia de
 postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível.
>
>
>_______________________________________________
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>R-br em listas.c3sl.ufpr.br
>https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br
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