[R-br] Ler .xls no Rcmdr no Ubuntu

Andre Oliveira andreolsouza em yahoo.com.br
Domingo Novembro 11 16:31:13 BRST 2012 

Eu tentei vários servidores.....e agora descobri este outro  erro também..


 install.packages("rJava", dep=T)
Installing package(s) into ‘/home/andre/R/i686-pc-linux-gnu-library/2.15’
(as ‘lib’ is unspecified)
--- Please select a CRAN mirror for use in this session ---
Carregando a interface Tcl/Tk ... pronto
tentando a URL 'http://cran-r.c3sl.ufpr.br/src/contrib/rJava_0.9-3.tar.gz'
Content type 'application/x-gzip' length 537153 bytes (524 Kb)
URL aberta
==================================================
downloaded 524 Kb

* installing *source* package ‘rJava’ ...
** package ‘rJava’ successfully unpacked and MD5 sums checked
checking for gcc... gcc -std=gnu99
checking for C compiler default output file name... a.out
checking whether the C compiler works... yes
checking whether we are cross compiling... no
checking for suffix of executables... 
checking for suffix of object files... o
checking whether we are using the GNU C compiler... yes
checking whether gcc -std=gnu99 accepts -g... yes
checking for gcc -std=gnu99 option to accept ISO C89... none needed
checking how to run the C preprocessor... gcc -std=gnu99 -E
checking for grep that handles long lines and -e... /bin/grep
checking for egrep... /bin/grep -E
checking for ANSI C header files... yes
checking for sys/wait.h that is POSIX.1 compatible... yes
checking for sys/types.h... yes
checking for sys/stat.h... yes
checking for stdlib.h... yes
checking for string.h... yes
checking for memory.h... yes
checking for strings.h... yes
checking for inttypes.h... yes
checking for stdint.h... yes
checking for unistd.h... yes
checking for string.h... (cached) yes
checking sys/time.h usability... yes
checking sys/time.h presence... yes
checking for sys/time.h... yes
checking for unistd.h... (cached) yes
checking for an ANSI C-conforming const... yes
checking whether time.h and sys/time.h may both be included... yes
configure: checking whether gcc -std=gnu99 supports static inline...
yes
checking whether setjmp.h is POSIX.1 compatible... yes
checking whether sigsetjmp is declared... yes
checking whether siglongjmp is declared... yes
checking Java support in R... present:
interpreter : '/usr/bin/java'
archiver    : '/usr/bin/jar'
compiler    : '/usr/bin/javac'
header prep.: '/usr/bin/javah'
cpp flags   : '-I/usr/lib/jvm/java-6-openjdk-i386/jre/../include'
java libs   : '-L/usr/lib/jvm/java-6-openjdk-i386/jre/lib/i386/server -L/usr/lib/jvm/java-6-openjdk-i386/jre/lib/i386 -L/usr/lib/jvm/java-6-openjdk-i386/jre/../lib/i386 -L/usr/java/packages/lib/i386 -L/usr/lib/i386-linux-gnu/jni -L/lib/i386-linux-gnu -L/usr/lib/i386-linux-gnu -L/usr/lib/jni -L/lib -L/usr/lib -ljvm'
checking whether JNI programs can be compiled... configure: error: Cannot compile a simple JNI program. See config.log for details.

Make sure you have Java Development Kit installed and correctly registered in R.
If in doubt, re-run "R CMD javareconf" as root.

ERROR: configuration failed for package ‘rJava’
* removing ‘/home/andre/R/i686-pc-linux-gnu-library/2.15/rJava’

The downloaded source packages are in
    ‘/tmp/RtmpuZLRQJ/downloaded_packages’
Mensagens de aviso perdidas:
In install.packages("rJava", dep = T) :
  installation of package ‘rJava’ had non-zero exit status








 
André Oliveira Souza


________________________________
 De: Andre Oliveira <andreolsouza em yahoo.com.br>
Para: "r-br em listas.c3sl.ufpr.br" <r-br em listas.c3sl.ufpr.br> 
Enviadas: Domingo, 11 de Novembro de 2012 16:03
Assunto: Re: [R-br] Ler .xls no Rcmdr no Ubuntu
 

obrigado. Penso que deve ser algum pacote que devo instalar só não sei qual é. Tentei aqui sua dica: Mas deu este erro.


> install.packages("XLConnect", dep=T)
Installing package(s) into ‘/home/andre/R/i686-pc-linux-gnu-library/2.15’
(as ‘lib’ is unspecified)
--- Please select a CRAN mirror for use in this session ---
Carregando a interface Tcl/Tk ... pronto
also installing the dependencies ‘XLConnectJars’, ‘rJava’

tentando a URL 'http://www.vps.fmvz.usp.br/CRAN/src/contrib/XLConnectJars_0.2-0.tar.gz'
Content type 'application/x-gzip' length 16488318 bytes (15.7 Mb)
URL aberta
==================================================
downloaded 15.7 Mb

tentando a URL 'http://www.vps.fmvz.usp.br/CRAN/src/contrib/rJava_0.9-3.tar.gz'
Content type 'application/x-gzip' length 537153 bytes (524 Kb)
URL aberta
==================================================
downloaded 524 Kb

tentando a URL 'http://www.vps.fmvz.usp.br/CRAN/src/contrib/XLConnect_0.2-3.tar.gz'
Content type 'application/x-gzip' length 1667765 bytes (1.6 Mb)
URL
 aberta
==================================================
downloaded 1.6 Mb

* installing *source* package ‘rJava’ ...
** package ‘rJava’ successfully unpacked and MD5 sums checked
checking for gcc... gcc -std=gnu99
checking for C compiler default output file name... a.out
checking whether the C compiler works... yes
checking whether we are cross compiling... no
checking for suffix of executables... 
checking for suffix of object files... o
checking whether we are using the GNU C compiler... yes
checking whether gcc -std=gnu99 accepts -g... yes
checking for gcc -std=gnu99 option to accept ISO C89... none needed
checking how to run the C preprocessor... gcc -std=gnu99 -E
checking for grep that handles long lines and -e... /bin/grep
checking for egrep... /bin/grep -E
checking for ANSI C header files... yes
checking for sys/wait.h that is POSIX.1 compatible... yes
checking for
 sys/types.h... yes
checking for sys/stat.h... yes
checking for stdlib.h... yes
checking for string.h... yes
checking for memory.h... yes
checking for strings.h... yes
checking for inttypes.h... yes
checking for stdint.h... yes
checking for unistd.h... yes
checking for string.h... (cached) yes
checking sys/time.h usability... yes
checking sys/time.h presence... yes
checking for sys/time.h... yes
checking for unistd.h... (cached) yes
checking for an ANSI C-conforming const... yes
checking whether time.h and sys/time.h may both be included... yes
configure: checking whether gcc -std=gnu99 supports static inline...
yes
checking whether setjmp.h is POSIX.1 compatible... yes
checking whether sigsetjmp is declared... yes
checking whether siglongjmp is declared... yes
checking Java support in R... present:
interpreter : '/usr/bin/java'
archiver    :
 '/usr/bin/jar'
compiler    : '/usr/bin/javac'
header prep.: '/usr/bin/javah'
cpp flags   : '-I/usr/lib/jvm/java-6-openjdk-i386/jre/../include'
java libs   : '-L/usr/lib/jvm/java-6-openjdk-i386/jre/lib/i386/server -L/usr/lib/jvm/java-6-openjdk-i386/jre/lib/i386 -L/usr/lib/jvm/java-6-openjdk-i386/jre/../lib/i386 -L/usr/java/packages/lib/i386 -L/usr/lib/i386-linux-gnu/jni -L/lib/i386-linux-gnu -L/usr/lib/i386-linux-gnu -L/usr/lib/jni -L/lib -L/usr/lib -ljvm'
checking whether JNI programs can be compiled... configure: error: Cannot compile a simple JNI program. See config.log for details.

Make sure you have Java Development Kit installed and correctly registered in R.
If in doubt, re-run "R CMD javareconf" as root.

ERROR: configuration failed for package ‘rJava’
* removing ‘/home/andre/R/i686-pc-linux-gnu-library/2.15/rJava’
ERROR: dependency ‘rJava’ is not available for
 package ‘XLConnectJars’
* removing ‘/home/andre/R/i686-pc-linux-gnu-library/2.15/XLConnectJars’
ERROR: dependencies ‘XLConnectJars’, ‘rJava’ are not available for package ‘XLConnect’
* removing ‘/home/andre/R/i686-pc-linux-gnu-library/2.15/XLConnect’

The downloaded source packages are in
    ‘/tmp/Rtmpp7HwvH/downloaded_packages’
Mensagens de aviso perdidas:
1: In install.packages("XLConnect", dep = T) :
  installation of package ‘rJava’ had non-zero exit status
2: In install.packages("XLConnect", dep = T) :
  installation of package ‘XLConnectJars’ had non-zero exit status
3: In install.packages("XLConnect", dep = T) :
  installation of package ‘XLConnect’ had non-zero exit status


Tem alguma pendencia com o ‘rJava’ que não  sei qual é. Alguma dica?

obrigado 




 
André Oliveira Souza


________________________________
 De: Daniel C Bezerra <danielcbezerra em gmail.com>
Para: r-br em listas.c3sl.ufpr.br 
Enviadas: Domingo, 11 de Novembro de 2012 12:18
Assunto: Re: [R-br] Ler .xls no Rcmdr no Ubuntu
 

Tente instalar os pacotes "XLConnect" e "XLConnectJars" e depois rode o Rcmdr novamente (não precisa carregar os pacotes após a reinicialização). 

Dê uma olhada se a opção de importar arquivos do excel aparece no menu. 

Abs,

D


2012/11/11 Edson Lira <edinhoestat em yahoo.com.br>

Por que não converte para .csv? É uma alternativa,
>
>
>[. ]'s.Edson Lira
>Estatístico
>Ma-Am
>
>Em 10/11/2012, às 14:35, Andre Oliveira <andreolsouza em yahoo.com.br> escreveu:
>
>
>É uma solução,
>>testei aqui. O Rcmdr está na central de programas do ubuntu 12.04  e quando instalada cria um menu na barra de ferramentas. Na verdade eu gostaria  de usar menos linhas de comando possível com os alunos. Eu sempre uso linha de camando acho melhor.
>>
>>
>>
>> 
>>André Oliveira Souza
>>
>>
>>________________________________
>> De: Sérgio Henrique <sergio.edfisica em gmail.com>
>>Para: "r-br em listas.c3sl.ufpr.br" <r-br em listas.c3sl.ufpr.br>; Andre Oliveira <andreolsouza em yahoo.com.br> 
>>Enviadas: Sábado, 10 de Novembro de 2012 16:11
>>Assunto: Re: [R-br] Ler .xls no Rcmdr no Ubuntu
>> 
>>
>>Você usar a linha de comando do Rcmdr.
>>Use
>>require(gdata)
>>read.xls
>>
>>
>>Obs: não testei pra saber se roda.
>>
>>
>>Abraços
>>
>>Enviado via iPad
>>
>>Em Nov 10, 2012, às 4:08 PM, Andre Oliveira <andreolsouza em yahoo.com.br> escreveu:
>>
>>
>>Boa tarde,
>>>alguns dias atrás tive aqui com mesmo assunto na lista e não consegui resolver  a questão. Pesquisei muito e não encontrei como carregar um .xls pelo menu (importar arquivos)  do Rcmdr o que é possivel pelo Win$$.  Atualmente estou trabalhando no curso de administração e gostaria de trabalhar com Ubuntu+R+Rcmdr. Na escola tem ubuntu em todas máquinas este o motivo de voltar ao assunto. Agora estou com dúvidas será que esta é uma tarefa impossível para Ubuntu+R+Rcmdr?  
>>>
>>> 
>>>
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