[R-br] função image( ) - plotar valores selecionados

[Vitor Aguiar]

Só pra complementar,

preciso usar a função image com log, assim:

image(log(xmat))




Vitor


On May 31, 2012, at 12:06 PM, Vitor Aguiar wrote:

> Boa tarde,
> 
> alguém poderia me ajudar com a função image( )? Me desculpe por abusar do tempo de vocês, o texto abaixo é grande porém simples.
> 
> Tenho uma matrix de valores com que estou fazendo um heatmap usando a função image( ). Gostaria de plotar não apenas os valores observados na matrix, mas também valores que seriam possíveis mas não são observados. 
> 
> Isso significa o seguinte: 
> Tenho uma matrix 16x16. Valores possíveis, mas não observados, correspondem a "0" (zeros) onde a soma (índice da linha + índice da coluna) são iguais ou menores que 15.
> 
> Exemplo: Se eu tenho um valor "0" na posição [14, 3], eu NÃO quero plotar, pois 14 + 3 = 17.
> Se eu tenho um valor "0" na posição [11, 3], eu quero plotar, pois 11 + 3 = 14.
> 
> Eu queria que esses valores fossem plotados em cor diferente do meu heatmap, por exemplo, em azul.
> 
> Matrix:
> x = c(3045, 893, 692, 830, 617, 155, 246, 657, 105, 60, 18, 7, 7, 4, 2, 11234, 2985, 2242, 2471, 1575, 366, 503, 1283, 170, 79, 32, 6, 4, 1, 3, 19475, 4756, 3233, 3251, 1810, 409, 575, 1210, 139, 41, 11, 4, 2, 0, 0, 20830, 4739, 2990, 2531, 1346, 298, 325, 612, 60, 17, 1, 0, 1, 0, 0, 15304, 3196, 1885, 1440, 610, 117, 115, 185, 14, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 8026, 1535, 806, 539, 223, 33, 37, 39, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3300, 562, 286, 141, 45, 14, 5, 12, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1067, 160, 65, 40, 14, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 277, 47, 6, 2, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 72, 6, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 11, 5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0)
> 
> xmat = matrix(x, ncol = 12)
> 
> row15 = rep(0,16)
> col12 = rep(0,15)
> col13 = rep(0,15)
> col14 = rep(0,15)
> col15 = rep(0,15)
> xmat = cbind(xmat, col12, col13, col14, col15)
> xmat = rbind(xmat, row15)
> dimnames(xmat) = list(0:15, 0:15)
> xmat
> 
> # minha matrix original é a primeira xmat (15x12), mas estou criando essa outra com linhas e colunas de zeros pois, por exemplo, 0 + 15 = 15, e preciso plotar esse valor também. Mas se alguém tiver solução mais simples...
> 
> Desde já agradeço,
> 
> Vitor
> 
> 
> 
> Vitor Rezende da Costa Aguiar
> ---------------------------------------------------
> PhD candidate in biotechnology
> Rede Nordeste de Biotecnologia
> UFES, Brazil
> ---------------------------------------------------
> Current Adress: 
> Department of Integrative Biology
> University of California, Berkeley
> 2033 Valley Life Sciences Building #4134
> Berkeley, CA 94720
> Phone: 1 (510) 473-2070
> 




-------------- Próxima Parte ----------
Um anexo em HTML foi limpo...
URL: <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20120531/9942af0d/attachment.html>