[R-br] identificação de grupos em um cluster

[Humberto Hazin]

Olá Antonio,

A melhor solução que encontrei para resolver esse problema foi (deve 
haver outra forma melhor, mais funcionou):
library(vegan)
data(dune)
dis <- vegdist(dune)
cluc <- hclust(dis, "complete")
plot(cluc)
rect.hclust(cluc, 3)
grp <- cutree(cluc, 3)
grp

namesI<-c("I")
namesII<-c("II")
namesIII<-c("III")
legend(0.4,0.98,namesIII,cex=1.5,bty="n",bg ="white",col="white")
legend(5.2,0.98,namesI,cex=1.5,bty="n",bg ='white')
legend(14.2,0.98,namesII,cex=1.5,bty="n",bg ='white')

Um abraço

Humberto Hazin



Em 3/2/2012 8:02 AM, Antonio Silva escreveu:
> Olá
>
> Gostaria de saber se há como indicar no dendrograma, na altura do 
> corte, o número referente ao grupo, como indicado em cutree.
>
> Observei que em alguns dendrogramas que os grupos selecionados de 
> acordo com um dado o nível de corte não seguem necessariamente uma 
> ordem ascendente (grupo 3 pode não ser o terceiro da esquerda para 
> direita).
>
> Seria algo semelhante ao da figura 
> https://www.crops.org/images/publications/cs/42/5/1584f4.jpeg
>
> Por exemplo exemplo:
>
> library(vegan)
> data(dune)
> dis <- vegdist(dune)
> cluc <- hclust(dis, "complete")
> plot(cluc)
> rect.hclust(cluc, 3)
> grp <- cutree(cluc, 3)
> grp
>
> Notem que o grupo com os objetos 17, 19, 11 e 18, posicionado a 
> esquerda no dedrograma é o grupo de número 3, e o grupo com os objetos 
> 1,2, ..., 7, representado no meio do dendrograma é o de número 1.
>
> Eu gostaria que, no nível de corte, aparecesse no dendrograma, ao lado 
> das barras verticais de cada cluster, a indicação 3, 1, 2.
>
> Agradeço qualquer dica. Abraços
>
> Antônio
>
> -- 
> Antônio Olinto Ávila da Silva
> Biólogo / Oceanógrafo
> Instituto de Pesca
> São Paulo, Brasil
>
>
>
> _______________________________________________
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