[R-br] Frequência dentro de parcelas selecionadas com table()

Paulo Justiniano paulojus em leg.ufpr.br
Segunda Novembro 21 10:54:45 BRST 2011


Alexandre

em meus testes aqui su consegui selecionar o SpatialGridDataFrame
(e nao o SpatialGrid)
deve ter como mas como solucao temporaria:

## o seguinte funciona
ap <- SpatialGridDataFrame(grid, data=data.frame(clip))
ap1 <- ap[!is.na(clip),]




On Sat, 19 Nov 2011, ASANTOS wrote:

>
> Boa dia pessoal,
>
>      Então fiz as recomendações que o Prof. Paulo me recomendou, porém
> quando utilizo a função overlay() ou over(), para sobrescrever um novo
> grid (objeto sel.grid), somente com as parcelas do grid contidas no
> limite da área, obtenho o seguinte erro: Erro em grid[!is.na(clip), ] :
> (subscript) subscrito lógico muito longo, já verifiquei todos os objetos
> espaciais envolvidos e me parece estar tudo Ok não sei o que pode estar
> dando errado, segue o script:
>
> require(splancs)
> require(sp)
> set.seed(12)
> #Geração dos pontos aleatórios
> x<- runif(n=500,min=0, max=20)
> y<- runif(n=500,min=0, max=20)
> xy<-cbind(x,y)
> plot(x=x,y=y,axes=F, xlab="", ylab="",
>     xlim=c(-1,20),ylim=c(0,21))##Plota os pontos
> ##Divide em parcelas
> segments(x0=rep(0,20),y0=0:20,
>         x1=rep(20,20),y1=0:20, col="gray", lty=2)
> segments(x0=0:20,y0=rep(0,20),
>         x1=0:20,y1=rep(20,20),col="gray", lty=2)
> pt0<- c(0.5,0.5)##Define o centro da primeira parcela
> N_S=seq(pt0[1], by=1, length.out=20)##Define o centro das parcelas
> L_O=seq(pt0[2],by=1, length.out=20)
> grid0<- expand.grid(N_S=seq(pt0[1], by=1, length.out=20),
> L_O=seq(pt0[2],by=1, length.out=20))
> ##Cria o limite da área
> limx<-c(2.5,2.5,18,18,2.5)
> limy<-c(2.5,18,18,2.5,2.5)
> lim=cbind(limx,limy)
> lim<-as.matrix(lim)
> ##Passando para objetos da classe Spatial
> #Pontos
> pontos<- SpatialPoints(cbind(x,y))
> pontos<- SpatialPoints(list(x,y))
> pontos<- SpatialPoints(data.frame(x,y))
> #Grid
> grid0= GridTopology(c(0.5,0.5), c(1,1), c(20,20))
> grid<-SpatialGrid(grid = grid0)
> ##Limite da área
> limite=SpatialPolygons(list(Polygons(list(Polygon(lim)),"lim")))
> ##Plotando
> plot(limite)#Limite
> points(pontos,col='red')#Pontos
> points(grid,col='blue')#Malha
> clip<-overlay(grid,limite)##Jogando o limite sobre a malha
> sel.grid<-grid[!is.na(clip),]##Retirando os NA's que correspondem a
> parte do grid fora do limite
>
>
> Obrigado,
>
> -- 
> Alexandre DOS SANTOS
> Engenheiro Florestal, Msc.
> Laboratório de Entomologia Florestal
> Departamento de Entomologia
> Universidade Federal de Lavras
> Caixa Postal 3037
> 37200-000 - Lavras - Minas Gerais - Brasil
> Tel: +55 35 92230304
>
>
>
>
>
>
> Em 16-11-2011 15:25, Paulo Justiniano escreveu:
>>  Alexandre
>>
>>  sem fornecer codigo especifico aqui vao algums ideias de por ojnde eu
>>  comecaria
>>
>>  algumas alternativas caso nao queira programar isto:
>>
>>  1. represetnar os dados no formato sp. Um como SpatialPoints
>>  --  Alexandre DOS SANTOS
>>  Engenheiro Florestal, Msc.
>>  Laboratório de Entomologia Florestal
>>  Departamento de Entomologia
>>  Universidade Federal de Lavras
>>  Caixa Postal 3037
>>  37200-000 - Lavras - Minas Gerais - Brasil
>>  Tel: +55 35 92230304
>>  e outro como SpatialGrid
>>  Depois a operaçõa de overlay (over() ) com tabloe vai te fornecer as
>>  contagens
>>
>>  2.
>>  este problema é o mesmo do chamado "quadrat counts"
>>  que é tratado em pacotes como spatstat (oficial)
>>  ou Rcitrus (nao oficial)
>>
>>  aqui vai um exemplinho usando o 1o
>>
>>  require(spatstat)
>>  ## Carregando um conjunto de dados
>>  data(swedishpines)
>>  X<- swedishpines
>>  plot(X)
>>  summary(X)
>>  ## Contagem de Quadrats
>>  Q<- quadratcount(X, nx = 4, ny = 3)
>>  Q
>>  plot(X)
>>  plot(Q, add = TRUE, cex = 2)
>> 
>> 
>> 
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