[R-br] Frequência dentro de parcelas selecionadas com table()

ASANTOS alexandresantosbr em yahoo.com.br
Sábado Novembro 19 11:21:51 BRST 2011


Boa dia pessoal,

       Então fiz as recomendações que o Prof. Paulo me recomendou, porém
quando utilizo a função overlay() ou over(), para sobrescrever um novo
grid (objeto sel.grid), somente com as parcelas do grid contidas no
limite da área, obtenho o seguinte erro: Erro em grid[!is.na(clip), ] :
(subscript) subscrito lógico muito longo, já verifiquei todos os objetos
espaciais envolvidos e me parece estar tudo Ok não sei o que pode estar
dando errado, segue o script:

require(splancs)
require(sp)
set.seed(12)
#Geração dos pontos aleatórios
x<- runif(n=500,min=0, max=20)
y<- runif(n=500,min=0, max=20)
xy<-cbind(x,y)
plot(x=x,y=y,axes=F, xlab="", ylab="",
      xlim=c(-1,20),ylim=c(0,21))##Plota os pontos
##Divide em parcelas
segments(x0=rep(0,20),y0=0:20,
          x1=rep(20,20),y1=0:20, col="gray", lty=2)
segments(x0=0:20,y0=rep(0,20),
          x1=0:20,y1=rep(20,20),col="gray", lty=2)
pt0<- c(0.5,0.5)##Define o centro da primeira parcela
N_S=seq(pt0[1], by=1, length.out=20)##Define o centro das parcelas
L_O=seq(pt0[2],by=1, length.out=20)
grid0<- expand.grid(N_S=seq(pt0[1], by=1, length.out=20),
L_O=seq(pt0[2],by=1, length.out=20))
##Cria o limite da área
limx<-c(2.5,2.5,18,18,2.5)
limy<-c(2.5,18,18,2.5,2.5)
lim=cbind(limx,limy)
lim<-as.matrix(lim)
##Passando para objetos da classe Spatial
#Pontos
pontos<- SpatialPoints(cbind(x,y))
pontos<- SpatialPoints(list(x,y))
pontos<- SpatialPoints(data.frame(x,y))
#Grid
grid0= GridTopology(c(0.5,0.5), c(1,1), c(20,20))
grid<-SpatialGrid(grid = grid0)
##Limite da área
limite=SpatialPolygons(list(Polygons(list(Polygon(lim)),"lim")))
##Plotando
plot(limite)#Limite
points(pontos,col='red')#Pontos
points(grid,col='blue')#Malha
clip<-overlay(grid,limite)##Jogando o limite sobre a malha
sel.grid<-grid[!is.na(clip),]##Retirando os NA's que correspondem a
parte do grid fora do limite


Obrigado,

-- 
Alexandre DOS SANTOS
Engenheiro Florestal, Msc.
Laboratório de Entomologia Florestal
Departamento de Entomologia
Universidade Federal de Lavras
Caixa Postal 3037
37200-000 - Lavras - Minas Gerais - Brasil
Tel: +55 35 92230304






Em 16-11-2011 15:25, Paulo Justiniano escreveu:
>  Alexandre
>
>  sem fornecer codigo especifico aqui vao algums ideias de por ojnde eu
>  comecaria
>
>  algumas alternativas caso nao queira programar isto:
>
>  1. represetnar os dados no formato sp. Um como SpatialPoints
>  -- 
>  Alexandre DOS SANTOS
>  Engenheiro Florestal, Msc.
>  Laboratório de Entomologia Florestal
>  Departamento de Entomologia
>  Universidade Federal de Lavras
>  Caixa Postal 3037
>  37200-000 - Lavras - Minas Gerais - Brasil
>  Tel: +55 35 92230304
>  e outro como SpatialGrid
>  Depois a operaçõa de overlay (over() ) com tabloe vai te fornecer as
>  contagens
>
>  2.
>  este problema é o mesmo do chamado "quadrat counts"
>  que é tratado em pacotes como spatstat (oficial)
>  ou Rcitrus (nao oficial)
>
>  aqui vai um exemplinho usando o 1o
>
>  require(spatstat)
>  ## Carregando um conjunto de dados
>  data(swedishpines)
>  X<- swedishpines
>  plot(X)
>  summary(X)
>  ## Contagem de Quadrats
>  Q<- quadratcount(X, nx = 4, ny = 3)
>  Q
>  plot(X)
>  plot(Q, add = TRUE, cex = 2)
>
>
>

-- 
Alexandre DOS SANTOS
Engenheiro Florestal, Msc.
Laboratório de Entomologia Florestal
Departamento de Entomologia
Universidade Federal de Lavras
Caixa Postal 3037
37200-000 - Lavras - Minas Gerais - Brasil
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