[R-br] Atualização do R no Ubuntu 11.04

[Paulo Justiniano]

Beleti

acho 	que as coisas precisam ficar mais claras aqui

Voce pode instalar o R de 2 formas:

1. usando os binários para sua distribuicao

2. Compilando das fontes

Para 1 voce tem que acessar a pagina que o Benilton indicou e incluir um 
repositorio  do R no seu Ubuntu, uma vez que a versao do
do R nos repositorios padrao do Ubuntu nao eh a ultima

Para 2 voce tem que baixar o tar.gz do R ou via snv

Se quiser aqui vai um script em bash para isto.
Basta rodar (como root ou sudo) com a opcao --install

Rpatch.sh
-------------------------------------------------------
TEMPROOTR=`pwd`
Rver=2-13

echo =============================================
echo =============================================
echo    ARQUIVOS FONTE R - VERSAO  $Rver
echo =============================================
echo =============================================

# checando argumentos
for i in "$@"; do
         case $i in
         --h|--help)
             printf "Opces:\n"
             printf " --deps\n"
             printf " --no-download\n"
             printf " --install\n"
             printf " --compile\n"
             exit 0;;
         --deps|--no-download|--install|--no-compile) ;;
         *) printf "Argumento invlido: $i\nTente --help para possveis 
argumentos\n"
            exit 1;
         esac
done


echo =============================================
echo =============================================
echo    ARQUIVOS FONTES R -  VERSAO  $Rver
echo =============================================
echo =============================================


# instalando dependencias e conveni<EA>ncias:
if echo $@|grep -e --deps 1>/dev/null
then
     aptitude install subversion rsync automake autoconf gawk bison byacc 
texlive-latex-base texlive-latex-extra texlive-latex-recommended gfortran 
liblapack-dev libblas-dev bzip2 gcc g++ libreadline-dev libjpeg-dev 
texinfo build-essential gobjc++ xorg-dev libicu-dev libpng-dev 
libpango1.0-dev libpango1.0 libcairo libcairo-dev guile-cairo-dev tcl-dev 
tk-dev libjava3d-jni libsetools-jni javacc valgrind xmkmf javahelper 
libjarjar-java libtiff4-dev libtiff-tools libtiff4 libfreeimage-dev 
libgeotiff-dev java-compiler sun-java6-jdk sun-java6-bin sun-java6-jre 
libjsr107cache-java libjogl-jni libsetools-jni libglu1-mesa-dev 
libxml2-dev
else
         printf "Nao instalando dependencias, o R ou alguns pacotes podem 
nao compilar dependendo do que voce tem instalado no seu sistema.\n Para 
instalar dependencias automaticamente utilize opcao --deps\nVeja opcoes 
com --help \n"
fi


echo =============================================
echo =============================================
echo     ARQUIVOS FONTE  R-VERSAO  $Rver
echo =============================================
echo =============================================

cd
mkdir -p R

if echo $@|grep -e --no-download 1>/dev/null
then
         printf "N<C3>O atualizando do repositorio subversion\n"
else
         svn checkout https://svn.r-project.org/R/branches/R-$Rver-branch/ 
R
         cd R
         ./tools/rsync-recommended
         ./tools/link-recommended
         cd ..
fi

if echo $@|grep -e --no-compile 1>/dev/null
then
         printf "N<E3>o compilando o R\n"
else
         rm -rf RT
         mkdir RT
         cd RT
#../R-$Rver/configure --with-gnome --with-tcltk --enable-R-shlib
         ../R/configure --with-tcltk --enable-R-shlib 
--with-recommended-packages --with-valgrind-instrumentation 
--enable-memory-profiling --with-system-bzlib --with-rgl

         make
         make vignettes
         make dvi
         make pdf
         make info
#\rm -rf /usr/local/lib/R
fi

echo =============================================
echo =============================================
echo     ARQUIVOS FONTE R - VERSAO  $Rver
echo =============================================
echo =============================================

if echo $@|grep -e --install 1>/dev/null
then
         make install
         make install-dvi
         make install-pdf
         make install-info
         cd ..
         rm -rf RT
else
         printf "Nao instalando, apenas compilando\n"
         cd ..
fi

#\rm /usr/bin/R
#ln -s /usr/local/R/bin/R /usr/bin/R

#cd
#R CMD BATCH bin/minipkg.R
#R CMD BATCH bin/instala.pacotes.R

echo =============================================
echo =============================================
echo    ARQUIVOS FONTE R - VERSAO  $Rver
echo =============================================
echo =============================================

#echo =============================================
#echo PJ: n<E3>o esqueca de mudar o Rd.sty !!!
#echo newcommand{\Link} para providecommand{\Link}
#echo =============================================

cd $TEMPROOTR


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On Wed, 4 May 2011, Junior Beleti wrote:

> Olá, estou utilizando o Ubunto 11.04 e gostaria de atualizar a versão do R, pois quero instalar o pacote "threads" e ele é dependente
> da versão 2.13.0.
> 
> Através do arquivo INSTALL da versão 2.13.0 tentei o que está lá:
> 
>     ./configure
>     make
> 
> mas recebi a seguinte mensagem:
>     make: *** Nenhum alvo indicado e nenhum arquivo make encontrado.  Pare.
> 
> Também tentei através dos comandos:
> 
>     sudo apt-get update
>     sudo apt-get upgrade
> 
> e não obtive sucesso.
> 
> Já procurei nas discussões anteriores e não encontrei tópico com exatamente esse problema.
> Nos tópicos encontrei que pode-se ter problemas na atualização quanto a pacotes.
> 
> Gostaria de saber como proceder para não ter problemas.
> 
> Peço desculpas se for algo óbvio, pois estou iniciando minhas pesquisas com R.
> 
> Obrigado.
> 
> --
> Carlos Roberto Beleti Junior Mestrado em Ciência da Computação
> Departamento de Informática
> Universidade Estadual de Maringá
> 
> 
>