[R-br] RES: Cluster + ANOVA

Sexta Julho 29 21:50:29 BRT 2011

Pois bem Éder,

Que foi feito, que eu relatei, foi: diante de dos métodos de clusterização
(de n existentes) se obteviram dos mesmos tratamentos n grupamentos, aé aí
acho que todos entenderam.

Vale destacar que no MEU caso a rsposta não era efetivamente multivariada no
sentido estrito da palavra. Era uma análise da interação genótipo x
ambiente. Os mesmos genetipos avaliados e vários ambientes. Geramos
grupamentos desses genotipos que "classificam" esses genótipos em estáveis,
responsivos, não responśivos, etc...

A Anova nesse caso pode ser aplicada p/ as médias desses genótipos nos
vários ambientes. No delineamento one-way. A interpretação foi feita como
disse no outro e-mail!

Reiterando o que disse, essa foi uma sugestão "old school". Não sei se isso
etá certo ou errado. Acho que não há qualquer sofismo, mas sou completamente
aberto a críticas...

PS: Se tiver oportunidade mande um alô pro Gabardo!

abraço,
FH

2011/7/29 Eder David Borges da Silva <eder em leg.ufpr.br>

> Pessoal,
> Venho acompanhando o tópico e me gerou algumas duvidas, por exemplo:
> ### Exemplo do Kmeans
> set.seed(123)
> x <- rbind(matrix(rnorm(100, sd = 0.3), ncol = 4),
>            matrix(rnorm(100, mean = 1, sd = 0.3), ncol = 4))
> colnames(x) <- letters[1:4]
> head(x)
> cl <- kmeans(x, 3)
> plot(x, col = cl$cluster)
> points(cl$centers, col = 1:2, pch = 8, cex=2)
> m1 <- manova(x~as.factor(cl$cluster))
> summary(m1)
>
> ### Hierarchical Clustering
> hc <- hclust(dist(USArrests)^2, "cen")
> memb <- cutree(hc, k = 10)
> m2 <- manova(as.matrix(USArrests)~as.factor(memb))
> summary(m2)
>
> Nestes dois exemplos a MANOVA verificada sob H0 que os centroides dos
> grupos são iguais, certo?
>  isso poderia ser um meio de validação que realmente os grupos são
> diferentes entre si. Meu conhecimento vai até ai, Agora quanto a resposta do
> Fernando não consegui entender como a ANOVA poderia ser utilizada. No livro
> de multivariada do Furtado ele cita a MANOVA como validação dos grupos, pena
> que não faz um exemplo para esclarecer melhor.
> Outra duvida que surgiu foi a seguinte: A MANOVA quando tenho dois grupos
> OK, mas quando são n grupos como poderemos por exemplo de 9 grupos formados
> se 8 forem iguais e apenas um for diferente a MANOVA será significativa, as
> entre os 8 grupos não é.
>
> O tópico é bem interessante...
> Att
>
>
>
> Em 29 de julho de 2011 19:09, Fernando Henrique Toledo <
> fernandohtoledo em gmail.com> escreveu:
>
> Vinicius, boa noite!
>>
>> Estou acompanhando aqui esse tópico!
>>
>> Uma vez fiz uma coisa um pouco parecida com o que você viu. O que fiz foi
>> a partir de duas formas de agrupar (clusterizar) um conjunto de tratamentos
>> realizei um ANOVA one-way.
>>
>> Essa abordagem foi proposta por mei orientador (que é da old school). A
>> princípio achei um pouco simples "demais". Mas depois fui compreendendo a
>> idéia...
>>
>> A SQ do erro da ANOVA one-way é a média das variâncias dentro de cada
>> tratamento. Nesse caso os tratamentos eram os tratamentos, propriamente
>> ditos, dentro dos clusteres. O resultado dessa ANOVA permitiu ver qual era o
>> método de agrupamento que "melhor" agrupava os tratamentos... gerando a
>> menor SQ. Permitiu ver tb, Parametrizando como Efeitos de grupo e tratamento
>> dentro de grupo, os grupos com maiores variâncias dentro (indicativo de um
>> agrupamento "fraco").
>>
>> Não sou teórico o suficiente p/ me delongar, nem sei se o que falei ou fiz
>> esta de todo certo ou foi pura masturbação de dados ou ainda se existe uma
>> forma "melhor" de se fazer isso! Mas EU não vejo porque isso possa estar
>> errado... Fiquem a vontade p/ me corrigir.
>>
>> att,
>> FH
>>
>>
>> 2011/7/29 Vinicius Brito Rocha <viniciusbritor em gmail.com>
>>
>>> Senhores,
>>>
>>> vejão bem, eu sei o que cada técnica siginifica. O que perguntei foi:
>>>
>>> Alguém já utilizou avaliação de clusters via ANOVA.
>>>
>>>
>>> Guilherme não é MANOVA. é ANOVA utilizando as somas de quadrados, de
>>> resíduos e totais.
>>>
>>> Abs
>>>
>>>
>>>
>>>
>>> Em 29 de julho de 2011 15:03, Hugo Zeni <hzeni82 em gmail.com> escreveu:
>>>
>>>   Vinicius,****
>>>>
>>>> ** **
>>>>
>>>> Pelo o que eu sei você realiza um agrupamento (seja hierárquico ou não)
>>>> pelas medidas de similaridade ou dissimilaridade.****
>>>>
>>>> ** **
>>>>
>>>> O fato de usar uma MANOVA como o Guilherme citou acredito que seja para
>>>> validação desse agrupamento.****
>>>>
>>>> ** **
>>>>
>>>> Caso esteja falando muita besteira me corrijam, pois também fiquei na
>>>> dúvida, se não acredito que seja por aí!****
>>>>
>>>> ** **
>>>>
>>>> Abraços****
>>>>
>>>> Zeni****
>>>>
>>>> ** **
>>>>
>>>> *De:* r-br-bounces em listas.c3sl.ufpr.br [mailto:
>>>> r-br-bounces em listas.c3sl.ufpr.br] *Em nome de *Vinicius Brito Rocha
>>>> *Enviada em:* Friday, July 29, 2011 2:25 PM
>>>> *Para:* r-br em listas.c3sl.ufpr.br
>>>> *Assunto:* Re: [R-br] Cluster + ANOVA****
>>>>
>>>> ** **
>>>>
>>>> Bom, no livro esta ANOVA.****
>>>>
>>>> De qualquer forma se vc tiver um material de como fazer via MANOVA estou
>>>> aceitando.****
>>>>
>>>>  ****
>>>>
>>>> Att.****
>>>>
>>>> Em 29 de julho de 2011 14:10, Guilherme Moraes Ferraudo <
>>>> guiferraudo em gmail.com> escreveu:****
>>>>
>>>> Vinicius não seria via MANOVA???
>>>>
>>>> Em 29 de julho de 2011 11:48, Vinicius Brito Rocha
>>>> <viniciusbritor em gmail.com> escreveu:****
>>>>
>>>> > Srs.
>>>> >
>>>> > Estou lendo um livro de multivariada onde existe uma avaliação dos
>>>> cluster
>>>> > produzidos pelo K-means através de ANOVA.
>>>> >
>>>> > Não entendi muito bem o que estava sendo feito. Num primeito momento
>>>> me
>>>> > pareceu que para cada variável realizava-se uma ANOVA, e amarzenava-se
>>>> as
>>>> > somas de quadrados individualmente.
>>>> >
>>>> > Alguém já viu isso? Ou melhor. Alguem já avaliou cluster via ANOVA?
>>>> >
>>>> > Att.
>>>> >
>>>> > --
>>>> > Vinicius Brito Rocha.
>>>> > Estatístico e Atuário,
>>>> > Mestre em Pesquisa Operacional
>>>> >
>>>> > www.aplicademic.blogspot.com
>>>> > http://twitter.com/viniciusbritor
>>>> >
>>>> > "Não se preocupe muito com as suas dificuldades em Matemática, posso
>>>> > assegurar-lhe que as minhas são ainda maiores." - Albert Einstein.
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>>>> > Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça
>>>> código
>>>> > mínimo reproduzível.
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