Sobre lista de pacotes para formatação
Bom dia, Eu recomendaria fazer um backup da pasta de instalação do R, a menos que você creia haver alguma corrupção em seus arquivos. Depois de reinstalado é só substituir as pastas originais pelas do backup e você não teria que fazer nem lista nem baixar tudo novamente. Att. -----Mensagem original----- De: R-br [mailto:r-br-bounces@listas.c3sl.ufpr.br] Em nome de r-br-request@listas.c3sl.ufpr.br Enviada em: sábado, 29 de agosto de 2015 12:00 Para: r-br@listas.c3sl.ufpr.br Assunto: Digest R-br, volume 56, assunto 28 Enviar submissões para a lista de discussão R-br para r-br@listas.c3sl.ufpr.br Para se cadastrar ou descadastrar via WWW, visite o endereço https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br ou, via email, envie uma mensagem com a palavra 'help' no assunto ou corpo da mensagem para r-br-request@listas.c3sl.ufpr.br Você poderá entrar em contato com a pessoa que gerencia a lista pelo endereço r-br-owner@listas.c3sl.ufpr.br Quando responder, por favor edite sua linha Assunto assim ela será mais específica que "Re: Contents of R-br digest..." Tópicos de Hoje: 1. Salvar lista de pacotes instalados para utilizar após a formatação (Fernando Antonio de souza) 2. conversão caracter para formato hora (Heloíse Pavanato) 3. Re: Salvar lista de pacotes instalados para utilizar após a formatação (Marcus Nunes) 4. Re: Salvar lista de pacotes instalados para utilizar após a formatação (Fernando Antonio de souza) 5. Re: duvida em if else (Cesar Rabak) 6. Re: Salvar lista de pacotes instalados para utilizar após a formatação (Walmes Zeviani) 7. Re: ANOVA via bootstrap não-paramétrico (Cesar Rabak) 8. Re: Salvar lista de pacotes instalados para utilizar após a formatação (Cesar Rabak) 9. Re: Salvar lista de pacotes instalados para utilizar após a formatação (Paulo Justiniano) 10. Re: ANOVA via bootstrap não-paramétrico (Euriann Yamamoto) 11. Re: Salvar lista de pacotes instalados para utilizar após a formatação (Fernando Mayer) ---------------------------------------------------------------------- Message: 1 Date: Fri, 28 Aug 2015 12:20:55 -0300 From: Fernando Antonio de souza <nandodesouza@gmail.com> To: "r-br@listas.c3sl.ufpr.br" <r-br@listas.c3sl.ufpr.br> Subject: [R-br] Salvar lista de pacotes instalados para utilizar após a formatação Message-ID: <CAFrWFs=RG9p2Td_CdSeSBQpFmYA7v9agrKuBiHVRJPKCf6OM0w@mail.gmail.com> Content-Type: text/plain; charset="utf-8" Caros colegas. Preciso formatar meu computador. Eu utilizo Ubuntu 14.04, eu gostaria de salvar uma lista com os pacotes instalados para que eu possa repor após a formatação de forma automática. Há uma forma de fazer isso, ou terei de fazer de maneira automática? Qual a melhor forma de resolver Att -- ======================================================================= Fernando Souza Zootecnista, DSc. Produção Animal e-mail:nandodesouza@gmail.com https://producaoanimalcomr.wordpress.com/ ======================================================================== -------------- Próxima Parte ---------- Um anexo em HTML foi limpo... URL: <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20150828/8d87cffe/attachment-0001.html> ------------------------------ Message: 2 Date: Fri, 28 Aug 2015 12:45:58 -0300 From: Heloíse Pavanato <helopavanato@gmail.com> To: r-br@listas.c3sl.ufpr.br Subject: [R-br] conversão caracter para formato hora Message-ID: <CAPw23dGUaUO3xfH8nK7KnWAT27-_jDLUWaSAO-wVR0O3mfPNog@mail.gmail.com> Content-Type: text/plain; charset="utf-8" Cara lista, Tenho uma dúvida quanto a conversão de um vetor (importado por read.table) com caracteres em formato de hora (H:M:S). Por exemplo, este vetor: hora <- c('10:57:41', '11:04:41', '11:04:41', '11:05:56') Agradeço qualquer ajuda. Heloise -------------- Próxima Parte ---------- Um anexo em HTML foi limpo... URL: <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20150828/07f01429/attachment-0001.html> ------------------------------ Message: 3 Date: Fri, 28 Aug 2015 13:24:37 -0300 From: Marcus Nunes <marcus.nunes@gmail.com> To: r-br@listas.c3sl.ufpr.br Subject: Re: [R-br] Salvar lista de pacotes instalados para utilizar após a formatação Message-ID: <CA+QGQvtj7ho3=DC2g3rvQdrSzMbuM_EGYJR2fLg7gFaqWdzZxw@mail.gmail.com> Content-Type: text/plain; charset="utf-8" Não sei se é a melhor forma de resolver, mas o que eu faço nestes casos é o seguinte: 1- Entre no R e digite .libPaths() [1] "/usr/lib64/R/library" "/usr/share/R/library" Estes são os locais onde teus pacotes estão instalados 2- No terminal, rode ls /usr/lib64/R/library > pacotes.txt Com isto, um arquivo chamado pacotes.txt vai ser criado, com todos os pacotes instalados na tua versão do R. Verifique se não falta nada. 3- Formate o computador e instale o R 4- Entre no R da nova instalação do Ubuntu, leia o arquivo pacotes.txt nele e instale os pacotes contidos nele: pacotes <- read.table(file="pacotes.txt") install.packages(pacotes) 5- Se houverem pacotes do Bioconductor, será necessário instalá-los também 2015-08-28 12:20 GMT-03:00 Fernando Antonio de souza <nandodesouza@gmail.com
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Caros colegas.
Preciso formatar meu computador. Eu utilizo Ubuntu 14.04, eu gostaria de salvar uma lista com os pacotes instalados para que eu possa repor após a formatação de forma automática. Há uma forma de fazer isso, ou terei de fazer de maneira automática? Qual a melhor forma de resolver
Att
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-- Marcus Nunes http://marcusnunes.me/ -------------- Próxima Parte ---------- Um anexo em HTML foi limpo... URL: <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20150828/36979554/attachment-0001.html> ------------------------------ Message: 4 Date: Fri, 28 Aug 2015 14:12:36 -0300 From: Fernando Antonio de souza <nandodesouza@gmail.com> To: "r-br@listas.c3sl.ufpr.br" <r-br@listas.c3sl.ufpr.br> Subject: Re: [R-br] Salvar lista de pacotes instalados para utilizar após a formatação Message-ID: <CAFrWFsmD8HCd+UJT+Tf9i-F2y_yZ9+otgmtg1SfTFN9yWdeF9A@mail.gmail.com> Content-Type: text/plain; charset="utf-8" Obrigado Marcus! Em 28 de agosto de 2015 13:24, Marcus Nunes <marcus.nunes@gmail.com> escreveu:
Não sei se é a melhor forma de resolver, mas o que eu faço nestes casos é o seguinte:
1- Entre no R e digite
.libPaths() [1] "/usr/lib64/R/library" "/usr/share/R/library"
Estes são os locais onde teus pacotes estão instalados
2- No terminal, rode
ls /usr/lib64/R/library > pacotes.txt
Com isto, um arquivo chamado pacotes.txt vai ser criado, com todos os pacotes instalados na tua versão do R. Verifique se não falta nada.
3- Formate o computador e instale o R
4- Entre no R da nova instalação do Ubuntu, leia o arquivo pacotes.txt nele e instale os pacotes contidos nele:
pacotes <- read.table(file="pacotes.txt") install.packages(pacotes)
5- Se houverem pacotes do Bioconductor, será necessário instalá-los também
2015-08-28 12:20 GMT-03:00 Fernando Antonio de souza < nandodesouza@gmail.com>:
Caros colegas.
Preciso formatar meu computador. Eu utilizo Ubuntu 14.04, eu gostaria de salvar uma lista com os pacotes instalados para que eu possa repor após a formatação de forma automática. Há uma forma de fazer isso, ou terei de fazer de maneira automática? Qual a melhor forma de resolver
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1:10 + 0.07 [1] 1,07 2,07 3,07 4,07 5,07 6,07 7,07 8,07 9,07 10,07
Se você quiser pensar de maneira procedural você *poderia* (mas IMNSHO *não deve*) fazer:
for (i in 1:10) print(i + 0.07) [1] 1,07 [1] 2,07 [1] 3,07 [1] 4,07 [1] 5,07 [1] 6,07 [1] 7,07 [1] 8,07 [1] 9,07 [1] 10,07
Então vejamos: Seu teste if(x < 4) retorna o vetor
x < 4 [1] TRUE TRUE TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE
Mas você está tentando resolver um teste encima de um objeto com dez elementos e faz um único teste. . . Veja que no seu caso seu depoimento "porem isso nao esta funcionando." não está correto de todo, pois o R lhe indica com clareza qual é o problema:
if(x < 4) {print ("a")} else {print ("b")} [1] "a" Mensagens de aviso perdidas: In if (1:10 < 4) {: a condição tem comprimento > 1 e somente o primeiro elemento será usado
Aliás, o seu código no exemplo acima do "if" tem erro de sintaxe, que talvez esteja mascarando a mensagem de erro:
if(x < 4) {print ("a")} else {"print ("b)} Erro: símbolo inesperado in "if(x < 4) {print ("a")} else {"print ("b"
Portanto, entenda que para um programador do R a forma mais clara no script é a natural da linguagem, como mostrou a Fátima. Como curiosidade, veja como mesmo o ifelse poderia ser removido, se você quisesse fazer algo mais "críptico" (que aí eu considero exagero no malabarismo do uso dos recursos da linguagem, mas vez por outra eu me deparo em código escrito até pelos mantenedores do corpo de pacotes do R):
c("a","b")[(x < 4) + 1] [1] "b" "b" "b" "a" "a" "a" "a" "a" "a" "a"
HTH -- Cesar Rabak 2015-08-23 23:27 GMT-03:00 Leonardo Monteiro <monteiroleonardo6@gmail.com>:
Prezados, eu sei que existem outras maneiras (funcoes, tipo ifelse) de se fazer isso, porem eu gostaria de fazer pelo if else , pq fica mais claro no meu script.
bom.. eu venho tentando aplicar a condicao em um vetor, por exemplo
x<- 1:10 if(x < 4) {print ("a")} else {"print ("b)}
porem isso nao esta funcionando.
Há algum outra maneira de aplicar a funcao if else para teste e/ou avaliacao dos dados de um vetor?
obrigado,
Leonardo.
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-------------- Próxima Parte ---------- Um anexo em HTML foi limpo... URL: <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20150828/d07f7b76/attachment-0001.html> ------------------------------ Message: 6 Date: Fri, 28 Aug 2015 14:31:12 -0300 From: Walmes Zeviani <walmeszeviani@gmail.com> To: "r-br@listas.c3sl.ufpr.br" <r-br@listas.c3sl.ufpr.br> Subject: Re: [R-br] Salvar lista de pacotes instalados para utilizar após a formatação Message-ID: <CAFU=EkZb1AGJRm1AemWQ3Lp_XnOchcx8LDmBvd+9NSH9wdRDpQ@mail.gmail.com> Content-Type: text/plain; charset="utf-8" Eu nunca fiz mas segundo o que eu ouvi, você pode pegar o conteúdo dos diretórios retornados por .libPath(), salvar num pendrive, formatar e instalar o novo sistema, instalar o R, e devolver no lugar que tudo vai funcionar. Para o futuro, você pode instalar o Ubuntu numa partição e deixar a sua /home em outra, para poder formatar sem perder os dados. Na sua /home você cria um diretório no qual a partir de então vai instalar os pacotes do R (install.packages("pacote", lib="/home/eu/pacotesdoR")). Dessa forma, ao formatar, todos os pacotes serão mantidos. À disposição. Walmes. ? -------------- Próxima Parte ---------- Um anexo em HTML foi limpo... URL: <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20150828/f9045ca7/attachment-0001.html> ------------------------------ Message: 7 Date: Fri, 28 Aug 2015 14:36:54 -0300 From: Cesar Rabak <cesar.rabak@gmail.com> To: r-br@listas.c3sl.ufpr.br Subject: Re: [R-br] ANOVA via bootstrap não-paramétrico Message-ID: <CAKrF98=9HEL1H4e=dxRCUtTTTa5Yovfea3ptC4wkxMFrGEKCuw@mail.gmail.com> Content-Type: text/plain; charset="utf-8" Euriann, Bem vinda à lista R-Br! Embora eu saiba que em Estatística a gente acaba com nomes que parecem, á primeira vista, tão malucos como "bicicleta de uma roda só", achei interessante essa descrição "Análise de Variância via bootstrap não paramétrico". . .?. Uma primeira indicação é que você vá a https://cran.r-project.org/web/views/ e procure dentro das "tasks" aquelas que possuam os métodos que você necessita. Outra opção de busca é o site http://rseek.org/ que lhe permitirá buscar diretamente esse tipo de análise. HTH -- Cesar Rabak 2015-08-27 10:14 GMT-03:00 Euriann Yamamoto <euriann@outlook.com>:
Bom dia. Meu nome é Euriann e uso a versão 0.98.1028 do RStudio.
Estamos trabalhando com adaptabilidade e estabilidade utilizando um índice de seleção de distância para o ideótipo. Entretanto preciso gerar uma análise de variância via bootstrap não-paramétrico. Comecei a trabalhar com o R tem pouco tempo. Alguém poderia me ajudar a como fazer essa análise pelo R? Ou sugerir algum material para estudo?
Obrigada
*Euriann Yamamoto* *Doutoranda em Agronomia* *Universidade Federal da Grande Dourados*
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Eu nunca fiz mas segundo o que eu ouvi, você pode pegar o conteúdo dos diretórios retornados por .libPath(), salvar num pendrive, formatar e instalar o novo sistema, instalar o R, e devolver no lugar que tudo vai funcionar. Para o futuro, você pode instalar o Ubuntu numa partição e deixar a sua /home em outra, para poder formatar sem perder os dados. Na sua /home você cria um diretório no qual a partir de então vai instalar os pacotes do R (install.packages("pacote", lib="/home/eu/pacotesdoR")). Dessa forma, ao formatar, todos os pacotes serão mantidos.
À disposição. Walmes. ?
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Caros colegas.
Preciso formatar meu computador. Eu utilizo Ubuntu 14.04, eu gostaria de salvar uma lista com os pacotes instalados para que eu possa repor após a formatação de forma automática. Há uma forma de fazer isso, ou terei de fazer de maneira automática? Qual a melhor forma de resolver
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------------------------------ Message: 10 Date: Fri, 28 Aug 2015 18:41:27 +0000 From: Euriann Yamamoto <euriann@outlook.com> To: Dúvidas R <r-br@listas.c3sl.ufpr.br> Subject: Re: [R-br] ANOVA via bootstrap não-paramétrico Message-ID: <COL128-W34295A7F42963CC461585BB66E0@phx.gbl> Content-Type: text/plain; charset="utf-8" Obrigada. Vou conferir! Euriann YamamotoDoutoranda em AgronomiaUniversidade Federal da Grande Dourados(67) 9910-6787 Date: Fri, 28 Aug 2015 14:36:54 -0300 From: cesar.rabak@gmail.com To: r-br@listas.c3sl.ufpr.br Subject: Re: [R-br] ANOVA via bootstrap não-paramétrico Euriann, Bem vinda à lista R-Br! Embora eu saiba que em Estatística a gente acaba com nomes que parecem, á primeira vista, tão malucos como "bicicleta de uma roda só", achei interessante essa descrição "Análise de Variância via bootstrap não paramétrico". . .?. Uma primeira indicação é que você vá a https://cran.r-project.org/web/views/ e procure dentro das "tasks" aquelas que possuam os métodos que você necessita. Outra opção de busca é o site http://rseek.org/ que lhe permitirá buscar diretamente esse tipo de análise. HTH--Cesar Rabak 2015-08-27 10:14 GMT-03:00 Euriann Yamamoto <euriann@outlook.com>: Bom dia. Meu nome é Euriann e uso a versão 0.98.1028 do RStudio. Estamos trabalhando com adaptabilidade e estabilidade utilizando um índice de seleção de distância para o ideótipo. Entretanto preciso gerar uma análise de variância via bootstrap não-paramétrico. Comecei a trabalhar com o R tem pouco tempo. Alguém poderia me ajudar a como fazer essa análise pelo R? Ou sugerir algum material para estudo? Obrigada Euriann YamamotoDoutoranda em AgronomiaUniversidade Federal da Grande Dourados _______________________________________________ R-br mailing list R-br@listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível. _______________________________________________ R-br mailing list R-br@listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forne?a c?digo m?nimo reproduz?vel. -------------- Próxima Parte ---------- Um anexo em HTML foi limpo... URL: <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20150828/0d3e972e/attachment-0001.html> ------------------------------ Message: 11 Date: Fri, 28 Aug 2015 22:42:56 -0300 From: Fernando Mayer <fernandomayer@gmail.com> To: r-br@listas.c3sl.ufpr.br Subject: Re: [R-br] Salvar lista de pacotes instalados para utilizar após a formatação Message-ID: <CAO4bAdOu9RMX90es0YkeaXWvEzhXDBQF9hKp2h-UFvDcoiXFJg@mail.gmail.com> Content-Type: text/plain; charset="utf-8" Para uma solução mais permanente, crie um diretório onde vc tem permissão de escrita, por exemplo em /home/fernando/R/library Ainda no seu HOME, crie um arquivo .Renviron (/home/fernando/.Renviron) com a seguinte variável de ambiente: R_LIBS=~/R/library Salve esse arquivo e reinicie uma sessão do R. Agora seu .libPaths() deve ser algo como .libPaths() [1] "/home/fernando/R/library" "/usr/local/lib64/R/library" O importante é que sua biblioteca particular é a primeira dessa lista. Agora qualquer pacote que vc instalar, tanto com install.packages() ou devtools::install_git() por exemplo, será instalado nessa biblioteca por padrão. Quando vc for formatar seu computador basta salvar esse diretório, e na nova instalação colocar ele no mesmo lugar e não esquecer de criar o ~/.Rprofile. Dessa forma tudo funcionará como antes. Esse procedimento também é válido para quando vc atualizar a versão do R. Se o seu .Rprofile estiver presente, a nova versão já ira carregar os pacotes desse local, sem a necessidade de fazer qualquer configuração adicional, e sem ter que reinstalar tudo novamente. Para mais detalhes de instalação e gerenciamento de pacotes no R, veja: http://git.leg.ufpr.br/fernandomayer/R-pacotes-rautu/blob/master/R_gerenciam... --- Fernando de Pol Mayer Laboratório de Estatística e Geoinformação - LEG Departamento de Estatística - DEST Universidade Federal do Paraná - UFPR URL: http://www.leg.ufpr.br/~fernandomayer e-mail: fernando.mayer [@] {gmail.com, ufpr.br} 2015-08-28 15:36 GMT-03:00 Paulo Justiniano <paulojus@leg.ufpr.br>:
pac <- packageStatus() names(pac)
terá uma dista com istalados e dispobíveis
exporte em um arquivo e depois leir e passe o vetor dos instalados para o install.packages()
On Fri, 28 Aug 2015, Fernando Antonio de souza wrote:
Caros colegas.
Preciso formatar meu computador. Eu utilizo Ubuntu 14.04, eu gostaria de salvar uma lista com os pacotes instalados para que eu possa repor após a formatação de forma automática. Há uma forma de fazer isso, ou terei de fazer de maneira automática? Qual a melhor forma de resolver
Att
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De verdade, não faça dessa prática um hábito. Existe uma razão (muito bem justificada) para reinstalar os pacotes do zero (baixando tudo de novo e instalando todos). benilton On Mon, Aug 31, 2015 at 7:20 AM Franklin Januario da Silva < Franklin.Silva@cerradinho.com.br> wrote:
Bom dia,
Eu recomendaria fazer um backup da pasta de instalação do R, a menos que você creia haver alguma corrupção em seus arquivos. Depois de reinstalado é só substituir as pastas originais pelas do backup e você não teria que fazer nem lista nem baixar tudo novamente.
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1. Salvar lista de pacotes instalados para utilizar após a formatação (Fernando Antonio de souza) 2. conversão caracter para formato hora (Heloíse Pavanato) 3. Re: Salvar lista de pacotes instalados para utilizar após a formatação (Marcus Nunes) 4. Re: Salvar lista de pacotes instalados para utilizar após a formatação (Fernando Antonio de souza) 5. Re: duvida em if else (Cesar Rabak) 6. Re: Salvar lista de pacotes instalados para utilizar após a formatação (Walmes Zeviani) 7. Re: ANOVA via bootstrap não-paramétrico (Cesar Rabak) 8. Re: Salvar lista de pacotes instalados para utilizar após a formatação (Cesar Rabak) 9. Re: Salvar lista de pacotes instalados para utilizar após a formatação (Paulo Justiniano) 10. Re: ANOVA via bootstrap não-paramétrico (Euriann Yamamoto) 11. Re: Salvar lista de pacotes instalados para utilizar após a formatação (Fernando Mayer)
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Message: 1 Date: Fri, 28 Aug 2015 12:20:55 -0300 From: Fernando Antonio de souza <nandodesouza@gmail.com> To: "r-br@listas.c3sl.ufpr.br" <r-br@listas.c3sl.ufpr.br> Subject: [R-br] Salvar lista de pacotes instalados para utilizar após a formatação Message-ID: <CAFrWFs= RG9p2Td_CdSeSBQpFmYA7v9agrKuBiHVRJPKCf6OM0w@mail.gmail.com> Content-Type: text/plain; charset="utf-8"
Caros colegas.
Preciso formatar meu computador. Eu utilizo Ubuntu 14.04, eu gostaria de salvar uma lista com os pacotes instalados para que eu possa repor após a formatação de forma automática. Há uma forma de fazer isso, ou terei de fazer de maneira automática? Qual a melhor forma de resolver
Att
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Message: 2 Date: Fri, 28 Aug 2015 12:45:58 -0300 From: Heloíse Pavanato <helopavanato@gmail.com> To: r-br@listas.c3sl.ufpr.br Subject: [R-br] conversão caracter para formato hora Message-ID: < CAPw23dGUaUO3xfH8nK7KnWAT27-_jDLUWaSAO-wVR0O3mfPNog@mail.gmail.com> Content-Type: text/plain; charset="utf-8"
Cara lista,
Tenho uma dúvida quanto a conversão de um vetor (importado por read.table) com caracteres em formato de hora (H:M:S).
Por exemplo, este vetor:
hora <- c('10:57:41', '11:04:41', '11:04:41', '11:05:56')
Agradeço qualquer ajuda.
Heloise -------------- Próxima Parte ---------- Um anexo em HTML foi limpo... URL: < http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20150828/07f01429/attac...
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Message: 3 Date: Fri, 28 Aug 2015 13:24:37 -0300 From: Marcus Nunes <marcus.nunes@gmail.com> To: r-br@listas.c3sl.ufpr.br Subject: Re: [R-br] Salvar lista de pacotes instalados para utilizar após a formatação Message-ID: <CA+QGQvtj7ho3= DC2g3rvQdrSzMbuM_EGYJR2fLg7gFaqWdzZxw@mail.gmail.com> Content-Type: text/plain; charset="utf-8"
Não sei se é a melhor forma de resolver, mas o que eu faço nestes casos é o seguinte:
1- Entre no R e digite
.libPaths() [1] "/usr/lib64/R/library" "/usr/share/R/library"
Estes são os locais onde teus pacotes estão instalados
2- No terminal, rode
ls /usr/lib64/R/library > pacotes.txt
Com isto, um arquivo chamado pacotes.txt vai ser criado, com todos os pacotes instalados na tua versão do R. Verifique se não falta nada.
3- Formate o computador e instale o R
4- Entre no R da nova instalação do Ubuntu, leia o arquivo pacotes.txt nele e instale os pacotes contidos nele:
pacotes <- read.table(file="pacotes.txt") install.packages(pacotes)
5- Se houverem pacotes do Bioconductor, será necessário instalá-los também
2015-08-28 12:20 GMT-03:00 Fernando Antonio de souza < nandodesouza@gmail.com
:
Caros colegas.
Preciso formatar meu computador. Eu utilizo Ubuntu 14.04, eu gostaria de salvar uma lista com os pacotes instalados para que eu possa repor após a formatação de forma automática. Há uma forma de fazer isso, ou terei de fazer de maneira automática? Qual a melhor forma de resolver
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-- Marcus Nunes http://marcusnunes.me/ -------------- Próxima Parte ---------- Um anexo em HTML foi limpo... URL: < http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20150828/36979554/attac...
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Message: 4 Date: Fri, 28 Aug 2015 14:12:36 -0300 From: Fernando Antonio de souza <nandodesouza@gmail.com> To: "r-br@listas.c3sl.ufpr.br" <r-br@listas.c3sl.ufpr.br> Subject: Re: [R-br] Salvar lista de pacotes instalados para utilizar após a formatação Message-ID: < CAFrWFsmD8HCd+UJT+Tf9i-F2y_yZ9+otgmtg1SfTFN9yWdeF9A@mail.gmail.com> Content-Type: text/plain; charset="utf-8"
Obrigado Marcus!
Em 28 de agosto de 2015 13:24, Marcus Nunes <marcus.nunes@gmail.com> escreveu:
Não sei se é a melhor forma de resolver, mas o que eu faço nestes casos é o seguinte:
1- Entre no R e digite
.libPaths() [1] "/usr/lib64/R/library" "/usr/share/R/library"
Estes são os locais onde teus pacotes estão instalados
2- No terminal, rode
ls /usr/lib64/R/library > pacotes.txt
Com isto, um arquivo chamado pacotes.txt vai ser criado, com todos os pacotes instalados na tua versão do R. Verifique se não falta nada.
3- Formate o computador e instale o R
4- Entre no R da nova instalação do Ubuntu, leia o arquivo pacotes.txt nele e instale os pacotes contidos nele:
pacotes <- read.table(file="pacotes.txt") install.packages(pacotes)
5- Se houverem pacotes do Bioconductor, será necessário instalá-los também
2015-08-28 12:20 GMT-03:00 Fernando Antonio de souza < nandodesouza@gmail.com>:
Caros colegas.
Preciso formatar meu computador. Eu utilizo Ubuntu 14.04, eu gostaria de salvar uma lista com os pacotes instalados para que eu possa repor após a formatação de forma automática. Há uma forma de fazer isso, ou terei de fazer de maneira automática? Qual a melhor forma de resolver
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Message: 5 Date: Fri, 28 Aug 2015 14:25:09 -0300 From: Cesar Rabak <cesar.rabak@gmail.com> To: r-br@listas.c3sl.ufpr.br Subject: Re: [R-br] duvida em if else Message-ID: < CAKrF98k-vUkiYkntY20hjR05LrRnL9zPGLwrsTEhYoet_fumWA@mail.gmail.com> Content-Type: text/plain; charset="utf-8"
Leonardo,
Eu já toquei nesse assunto em resposta a outra questão parecida com essa sua, por isso serei mais breve.
A linguagem R é por excelência uma linguagem voltada para o tratamento de dados em grupos que *grosso modo* podemos denominar de "matriciais".
Por a maioria das "coisas" que se pode fazer em R são "automagicamente" feitas em vetores ou matrizes de dados.
Como um exemplo "bobinho" veja:
1:10 + 0.07 [1] 1,07 2,07 3,07 4,07 5,07 6,07 7,07 8,07 9,07 10,07
Se você quiser pensar de maneira procedural você *poderia* (mas IMNSHO *não deve*) fazer:
for (i in 1:10) print(i + 0.07) [1] 1,07 [1] 2,07 [1] 3,07 [1] 4,07 [1] 5,07 [1] 6,07 [1] 7,07 [1] 8,07 [1] 9,07 [1] 10,07
Então vejamos:
Seu teste if(x < 4) retorna o vetor
x < 4 [1] TRUE TRUE TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE
Mas você está tentando resolver um teste encima de um objeto com dez elementos e faz um único teste. . .
Veja que no seu caso seu depoimento "porem isso nao esta funcionando." não está correto de todo, pois o R lhe indica com clareza qual é o problema:
if(x < 4) {print ("a")} else {print ("b")} [1] "a" Mensagens de aviso perdidas: In if (1:10 < 4) {: a condição tem comprimento > 1 e somente o primeiro elemento será usado
Aliás, o seu código no exemplo acima do "if" tem erro de sintaxe, que talvez esteja mascarando a mensagem de erro:
if(x < 4) {print ("a")} else {"print ("b)} Erro: símbolo inesperado in "if(x < 4) {print ("a")} else {"print ("b"
Portanto, entenda que para um programador do R a forma mais clara no script é a natural da linguagem, como mostrou a Fátima.
Como curiosidade, veja como mesmo o ifelse poderia ser removido, se você quisesse fazer algo mais "críptico" (que aí eu considero exagero no malabarismo do uso dos recursos da linguagem, mas vez por outra eu me deparo em código escrito até pelos mantenedores do corpo de pacotes do R):
c("a","b")[(x < 4) + 1] [1] "b" "b" "b" "a" "a" "a" "a" "a" "a" "a"
HTH -- Cesar Rabak
2015-08-23 23:27 GMT-03:00 Leonardo Monteiro <monteiroleonardo6@gmail.com
:
Prezados, eu sei que existem outras maneiras (funcoes, tipo ifelse) de se fazer isso, porem eu gostaria de fazer pelo if else , pq fica mais claro no meu script.
bom.. eu venho tentando aplicar a condicao em um vetor, por exemplo
x<- 1:10 if(x < 4) {print ("a")} else {"print ("b)}
porem isso nao esta funcionando.
Há algum outra maneira de aplicar a funcao if else para teste e/ou avaliacao dos dados de um vetor?
obrigado,
Leonardo.
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Message: 6 Date: Fri, 28 Aug 2015 14:31:12 -0300 From: Walmes Zeviani <walmeszeviani@gmail.com> To: "r-br@listas.c3sl.ufpr.br" <r-br@listas.c3sl.ufpr.br> Subject: Re: [R-br] Salvar lista de pacotes instalados para utilizar após a formatação Message-ID: <CAFU= EkZb1AGJRm1AemWQ3Lp_XnOchcx8LDmBvd+9NSH9wdRDpQ@mail.gmail.com> Content-Type: text/plain; charset="utf-8"
Eu nunca fiz mas segundo o que eu ouvi, você pode pegar o conteúdo dos diretórios retornados por .libPath(), salvar num pendrive, formatar e instalar o novo sistema, instalar o R, e devolver no lugar que tudo vai funcionar. Para o futuro, você pode instalar o Ubuntu numa partição e deixar a sua /home em outra, para poder formatar sem perder os dados. Na sua /home você cria um diretório no qual a partir de então vai instalar os pacotes do R (install.packages("pacote", lib="/home/eu/pacotesdoR")). Dessa forma, ao formatar, todos os pacotes serão mantidos.
À disposição. Walmes. ? -------------- Próxima Parte ---------- Um anexo em HTML foi limpo... URL: < http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20150828/f9045ca7/attac...
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Message: 7 Date: Fri, 28 Aug 2015 14:36:54 -0300 From: Cesar Rabak <cesar.rabak@gmail.com> To: r-br@listas.c3sl.ufpr.br Subject: Re: [R-br] ANOVA via bootstrap não-paramétrico Message-ID: <CAKrF98=9HEL1H4e= dxRCUtTTTa5Yovfea3ptC4wkxMFrGEKCuw@mail.gmail.com> Content-Type: text/plain; charset="utf-8"
Euriann,
Bem vinda à lista R-Br!
Embora eu saiba que em Estatística a gente acaba com nomes que parecem, á primeira vista, tão malucos como "bicicleta de uma roda só", achei interessante essa descrição "Análise de Variância via bootstrap não paramétrico". . .?.
Uma primeira indicação é que você vá a https://cran.r-project.org/web/views/ e procure dentro das "tasks" aquelas que possuam os métodos que você necessita.
Outra opção de busca é o site http://rseek.org/ que lhe permitirá buscar diretamente esse tipo de análise.
HTH -- Cesar Rabak
2015-08-27 10:14 GMT-03:00 Euriann Yamamoto <euriann@outlook.com>:
Bom dia. Meu nome é Euriann e uso a versão 0.98.1028 do RStudio.
Estamos trabalhando com adaptabilidade e estabilidade utilizando um índice de seleção de distância para o ideótipo. Entretanto preciso gerar uma análise de variância via bootstrap não-paramétrico. Comecei a trabalhar com o R tem pouco tempo. Alguém poderia me ajudar a como fazer essa análise pelo R? Ou sugerir algum material para estudo?
Obrigada
*Euriann Yamamoto* *Doutoranda em Agronomia* *Universidade Federal da Grande Dourados*
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Message: 8 Date: Fri, 28 Aug 2015 14:45:40 -0300 From: Cesar Rabak <cesar.rabak@gmail.com> To: r-br@listas.c3sl.ufpr.br Subject: Re: [R-br] Salvar lista de pacotes instalados para utilizar após a formatação Message-ID: <CAKrF98kjAnCoSqw6C1ts8n8d4bjf9NwV3sFeuKJ= Lgh0SjmCVQ@mail.gmail.com> Content-Type: text/plain; charset="utf-8"
Apenas como sugestão adicional, vejam este blog do Tal Galili, que parece ficou tão fissurado com esse tema de (re-)instalação de pacotes no R que até criou um para facilitar esse trabalho (o installr [mas não me lembro se a versão atual já funciona em "sabores" do Linux]) http://www.r-bloggers.com/automated-re-install-of-packages-for-r-3-0/
A lição mais importante, IMHO, é que existe um comando especialmente para saber quais são os pacotes instalados! Como se isso surpreenderia alguém que usa o R ?
HTH -- Cesar Rabak
2015-08-28 14:31 GMT-03:00 Walmes Zeviani <walmeszeviani@gmail.com>:
Eu nunca fiz mas segundo o que eu ouvi, você pode pegar o conteúdo dos diretórios retornados por .libPath(), salvar num pendrive, formatar e instalar o novo sistema, instalar o R, e devolver no lugar que tudo vai funcionar. Para o futuro, você pode instalar o Ubuntu numa partição e deixar a sua /home em outra, para poder formatar sem perder os dados. Na sua /home você cria um diretório no qual a partir de então vai instalar os pacotes do R (install.packages("pacote", lib="/home/eu/pacotesdoR")). Dessa forma, ao formatar, todos os pacotes serão mantidos.
À disposição. Walmes. ?
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Message: 9 Date: Fri, 28 Aug 2015 15:36:55 -0300 (BRT) From: Paulo Justiniano <paulojus@leg.ufpr.br> To: "r-br@listas.c3sl.ufpr.br" <r-br@listas.c3sl.ufpr.br> Subject: Re: [R-br] Salvar lista de pacotes instalados para utilizar após a formatação Message-ID: <alpine.DEB.2.00.1508281535350.14896@pataxo.est.ufpr.br> Content-Type: text/plain; charset="utf-8"; Format="flowed"
pac <- packageStatus() names(pac)
terá uma dista com istalados e dispobíveis
exporte em um arquivo e depois leir e passe o vetor dos instalados para o install.packages()
On Fri, 28 Aug 2015, Fernando Antonio de souza wrote:
Caros colegas.
Preciso formatar meu computador. Eu utilizo Ubuntu 14.04, eu gostaria de salvar uma lista com os pacotes instalados para que eu possa repor após a formatação de forma automática. Há uma forma de fazer isso, ou terei de fazer de maneira automática? Qual a melhor forma de resolver
Att
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Message: 10 Date: Fri, 28 Aug 2015 18:41:27 +0000 From: Euriann Yamamoto <euriann@outlook.com> To: Dúvidas R <r-br@listas.c3sl.ufpr.br> Subject: Re: [R-br] ANOVA via bootstrap não-paramétrico Message-ID: <COL128-W34295A7F42963CC461585BB66E0@phx.gbl> Content-Type: text/plain; charset="utf-8"
Obrigada. Vou conferir!
Euriann YamamotoDoutoranda em AgronomiaUniversidade Federal da Grande Dourados(67) 9910-6787
Date: Fri, 28 Aug 2015 14:36:54 -0300 From: cesar.rabak@gmail.com To: r-br@listas.c3sl.ufpr.br Subject: Re: [R-br] ANOVA via bootstrap não-paramétrico
Euriann, Bem vinda à lista R-Br! Embora eu saiba que em Estatística a gente acaba com nomes que parecem, á primeira vista, tão malucos como "bicicleta de uma roda só", achei interessante essa descrição "Análise de Variância via bootstrap não paramétrico". . .?. Uma primeira indicação é que você vá a https://cran.r-project.org/web/views/ e procure dentro das "tasks" aquelas que possuam os métodos que você necessita. Outra opção de busca é o site http://rseek.org/ que lhe permitirá buscar diretamente esse tipo de análise. HTH--Cesar Rabak
2015-08-27 10:14 GMT-03:00 Euriann Yamamoto <euriann@outlook.com>:
Bom dia. Meu nome é Euriann e uso a versão 0.98.1028 do RStudio. Estamos trabalhando com adaptabilidade e estabilidade utilizando um índice de seleção de distância para o ideótipo. Entretanto preciso gerar uma análise de variância via bootstrap não-paramétrico. Comecei a trabalhar com o R tem pouco tempo. Alguém poderia me ajudar a como fazer essa análise pelo R? Ou sugerir algum material para estudo? Obrigada
Euriann YamamotoDoutoranda em AgronomiaUniversidade Federal da Grande Dourados
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Message: 11 Date: Fri, 28 Aug 2015 22:42:56 -0300 From: Fernando Mayer <fernandomayer@gmail.com> To: r-br@listas.c3sl.ufpr.br Subject: Re: [R-br] Salvar lista de pacotes instalados para utilizar após a formatação Message-ID: < CAO4bAdOu9RMX90es0YkeaXWvEzhXDBQF9hKp2h-UFvDcoiXFJg@mail.gmail.com> Content-Type: text/plain; charset="utf-8"
Para uma solução mais permanente, crie um diretório onde vc tem permissão de escrita, por exemplo em /home/fernando/R/library
Ainda no seu HOME, crie um arquivo .Renviron (/home/fernando/.Renviron) com a seguinte variável de ambiente:
R_LIBS=~/R/library
Salve esse arquivo e reinicie uma sessão do R. Agora seu .libPaths() deve ser algo como
.libPaths() [1] "/home/fernando/R/library" "/usr/local/lib64/R/library"
O importante é que sua biblioteca particular é a primeira dessa lista. Agora qualquer pacote que vc instalar, tanto com install.packages() ou devtools::install_git() por exemplo, será instalado nessa biblioteca por padrão.
Quando vc for formatar seu computador basta salvar esse diretório, e na nova instalação colocar ele no mesmo lugar e não esquecer de criar o ~/.Rprofile. Dessa forma tudo funcionará como antes.
Esse procedimento também é válido para quando vc atualizar a versão do R. Se o seu .Rprofile estiver presente, a nova versão já ira carregar os pacotes desse local, sem a necessidade de fazer qualquer configuração adicional, e sem ter que reinstalar tudo novamente.
Para mais detalhes de instalação e gerenciamento de pacotes no R, veja:
http://git.leg.ufpr.br/fernandomayer/R-pacotes-rautu/blob/master/R_gerenciam...
--- Fernando de Pol Mayer Laboratório de Estatística e Geoinformação - LEG Departamento de Estatística - DEST Universidade Federal do Paraná - UFPR URL: http://www.leg.ufpr.br/~fernandomayer e-mail: fernando.mayer [@] {gmail.com, ufpr.br}
2015-08-28 15:36 GMT-03:00 Paulo Justiniano <paulojus@leg.ufpr.br>:
pac <- packageStatus() names(pac)
terá uma dista com istalados e dispobíveis
exporte em um arquivo e depois leir e passe o vetor dos instalados para o install.packages()
On Fri, 28 Aug 2015, Fernando Antonio de souza wrote:
Caros colegas.
Preciso formatar meu computador. Eu utilizo Ubuntu 14.04, eu gostaria de salvar uma lista com os pacotes instalados para que eu possa repor após a
formatação
de forma automática. Há uma forma de fazer isso, ou terei de fazer de maneira automática? Qual a melhor forma de resolver
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Subject: Legenda do Digest
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Fim da Digest R-br, volume 56, assunto 28 *****************************************
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