
Boa noite pessoal! Sou iniciante no programa R e estou utilizando o pacote Bipartite para minhas análises. Eu estou tentando rodar um modelo com 1.000 amostras de redes de interação que são criadas aleatoriamente a partir de um banco de dados. E agora durante a análise, começou a aparecer o seguinte erro: Error in file(file, ifelse(append, "a", "w")) : cannot open the connection In addition: Warning message: In file(file, ifelse(append, "a", "w")) : cannot open file 'web-1-1.pairs': Permission denied Aparentemente, durante a análise é gerado um arquivo que neste caso é o 'web-1-1.pairs', e o mesmo tem acesso negado, não finalizando a análise para as 1.000 redes de interação. Pelo que andei pesquisando, este erro pode acontecer quando: Tem um arquivo aberto em outro programa, como o Excel, enquanto tenta gravá-lo..ou se o diretório de trabalho não tenha acesso para gravação a esse diretório.. mas acredito que isso não seja o meu caso. Alguém conhece ou já teve esse erro, e poderia compartilhar como solucioná-lo ? Muito obrigada Elvira D'Bastiani Mestranda em Ecologia e Conservação Laboratório de Ecologia e Evolução de Interações (Leei) Universidade Federal do Paraná - UFPR Curitiba, Paraná, Brasil (41) 9 9653-2860

Você está usando windows ou linux? Se for o windows, eu acho que os arquivos estão sendo gerados dentro da pasta do R, que fica na pasta onde ficam os programas, e la é protegido, as vezes erros parecidos acontecem quando a gente tenta usar algo que modifica arquivos, como o Rprofile automaticamente. Mas você precisa dar mais informações, como qual função ta usando, um script mínimo reproduzível para outras pessoas verem o mesmo erro etc, não da para ajudar muito somente com a informação que vc ta dando Em 26 de março de 2017 18:58, Elvira De Bastiani via R-br < r-br@listas.c3sl.ufpr.br> escreveu:
Boa noite pessoal!
Sou iniciante no programa R e estou utilizando o pacote Bipartite para minhas análises.
Eu estou tentando rodar um modelo com 1.000 amostras de redes de interação que são criadas aleatoriamente a partir de um banco de dados.
E agora durante a análise, começou a aparecer o seguinte erro:
Error in file(file, ifelse(append, "a", "w")) : cannot open the connection In addition: Warning
message: In file(file, ifelse(append, "a", "w")) : cannot open file 'web-1-1.pairs': Permission denied
Aparentemente, durante a análise é gerado um arquivo que neste caso é o 'web-1-1.pairs', e o mesmo tem acesso negado, não finalizando a análise para as 1.000 redes de interação.
Pelo que andei pesquisando, este erro pode acontecer quando:
Tem um arquivo aberto em outro programa, como o Excel, enquanto tenta gravá-lo..ou se o diretório de trabalho não tenha acesso para gravação a esse diretório.. mas acredito que isso não seja o meu caso.
Alguém conhece ou já teve esse erro, e poderia compartilhar como solucioná-lo ?
Muito obrigada
Elvira D'Bastiani Mestranda em Ecologia e Conservação Laboratório de Ecologia e Evolução de Interações (Leei) Universidade Federal do Paraná - UFPR Curitiba, Paraná, Brasil (41) 9 9653-2860
_______________________________________________ R-br mailing list R-br@listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível.
-- Grato Augusto C. A. Ribas Site Pessoal: http://recologia.com.br/ <http://augustoribas.heliohost.org> Github: https://github.com/Squiercg Lattes: http://lattes.cnpq.br/7355685961127056

Bom dia pessoal! Estou utilizando o windows. Segue o script: library(bipartite) namostras=1000 exemplo=matrix(1/100,10,10) exemplo<-mgen(exemplo, n = 10, rep.cell=F) for (n in 1:namostras){ NODF=nested(exemplo,method="NODF2",rescale=F) NODFarr=round(NODF,digits=3) Modular=computeModules(exemplo) Modularidade=slot(Modular,"likelihood") } ERRO: Error in file(file, ifelse(append, "a", "w")) : cannot open the connection In addition: Warning message: In file(file, ifelse(append, "a", "w")) : cannot open file 'web-1-1.pairs': Permission denied Muito obrigada! Elvira D'Bastiani Mestranda em Ecologia e Conservação Laboratório de Ecologia e Evolução de Interações (Leei) Universidade Federal do Paraná - UFPR Curitiba, Paraná, Brasil Em 28 de março de 2017 15:40, Augusto Ribas <ribas.aca@gmail.com> escreveu:
Você está usando windows ou linux? Se for o windows, eu acho que os arquivos estão sendo gerados dentro da pasta do R, que fica na pasta onde ficam os programas, e la é protegido, as vezes erros parecidos acontecem quando a gente tenta usar algo que modifica arquivos, como o Rprofile automaticamente.
Mas você precisa dar mais informações, como qual função ta usando, um script mínimo reproduzível para outras pessoas verem o mesmo erro etc, não da para ajudar muito somente com a informação que vc ta dando
Em 26 de março de 2017 18:58, Elvira De Bastiani via R-br < r-br@listas.c3sl.ufpr.br> escreveu:
Boa noite pessoal!
Sou iniciante no programa R e estou utilizando o pacote Bipartite para minhas análises.
Eu estou tentando rodar um modelo com 1.000 amostras de redes de interação que são criadas aleatoriamente a partir de um banco de dados.
E agora durante a análise, começou a aparecer o seguinte erro:
Error in file(file, ifelse(append, "a", "w")) : cannot open the connection In addition: Warning
message: In file(file, ifelse(append, "a", "w")) : cannot open file 'web-1-1.pairs': Permission denied
Aparentemente, durante a análise é gerado um arquivo que neste caso é o 'web-1-1.pairs', e o mesmo tem acesso negado, não finalizando a análise para as 1.000 redes de interação.
Pelo que andei pesquisando, este erro pode acontecer quando:
Tem um arquivo aberto em outro programa, como o Excel, enquanto tenta gravá-lo..ou se o diretório de trabalho não tenha acesso para gravação a esse diretório.. mas acredito que isso não seja o meu caso.
Alguém conhece ou já teve esse erro, e poderia compartilhar como solucioná-lo ?
Muito obrigada
Elvira D'Bastiani Mestranda em Ecologia e Conservação Laboratório de Ecologia e Evolução de Interações (Leei) Universidade Federal do Paraná - UFPR Curitiba, Paraná, Brasil
_______________________________________________ R-br mailing list R-br@listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível.
-- Grato Augusto C. A. Ribas
Site Pessoal: http://recologia.com.br/ <http://augustoribas.heliohost.org> Github: https://github.com/Squiercg Lattes: http://lattes.cnpq.br/7355685961127056
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