Não carrega o biblioteca - lmer4
boa noite,de uma hora para outra não consigo carregar a biblioteca lme4.Alguém tem alguma sugestão de ajuda? (estou usando win10) require(lmer4)Carregando pacotes exigidos: lmer4Warning message:In library(package, lib.loc = lib.loc, character.only = TRUE, logical.return = TRUE, : there is no package called ‘lmer4’ att., André
boa noite reinstale o package. o erro diz: "aqui não há um pacote chamado lmer4" att. Jersiton Sent from my Samsung Galaxy smartphone. -------- Original message -------- From: "Andre Oliveira por (R-br)" <r-br@listas.c3sl.ufpr.br> Date: 9/1/19 20:34 (GMT-03:00) To: "a lista Brasileira oficial de discussão do programa R." <r-br@listas.c3sl.ufpr.br> Cc: Andre Oliveira <andreolsouza@yahoo.com.br> Subject: [R-br] Não carrega o biblioteca - lmer4 boa noite, de uma hora para outra não consigo carregar a biblioteca lme4. Alguém tem alguma sugestão de ajuda? (estou usando win10) require(lmer4) Carregando pacotes exigidos: lmer4 Warning message: In library(package, lib.loc = lib.loc, character.only = TRUE, logical.return = TRUE, : there is no package called ‘lmer4’ att., André
Boa noite, obrigado pela reposta! Já havia instalado o R e a lme4.Resolvi assim:rm(list=ls(all=TRUE)) rm(list=ls()) gc(reset = TRUE) att,.André Em domingo, 1 de setembro de 2019 20:50:54 GMT-3, Jersiton Tiago Pereira Matos por (R-br) <r-br@listas.c3sl.ufpr.br> escreveu: boa noite reinstale o package. o erro diz: "aqui não há um pacote chamado lmer4" att.Jersiton Sent from my Samsung Galaxy smartphone. -------- Original message --------From: "Andre Oliveira por (R-br)" <r-br@listas.c3sl.ufpr.br> Date: 9/1/19 20:34 (GMT-03:00) To: "a lista Brasileira oficial de discussão do programa R." <r-br@listas.c3sl.ufpr.br>Cc: Andre Oliveira <andreolsouza@yahoo.com.br> Subject: [R-br] Não carrega o biblioteca - lmer4 boa noite,de uma hora para outra não consigo carregar a biblioteca lme4.Alguém tem alguma sugestão de ajuda? (estou usando win10) require(lmer4)Carregando pacotes exigidos: lmer4Warning message:In library(package, lib.loc = lib.loc, character.only = TRUE, logical.return = TRUE, : there is no package called ‘lmer4’ att., André _______________________________________________ R-br mailing list R-br@listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível.
Eu não entendi duas coisas: 1. Por que utilizar "repeatedcv" como method se a ideia é fazer apenas a validação cruzada simples? Basta usar "cv" se a validação cruzada não for repetida. 2. Particularmente, nunca vi ninguém fazer validação cruzada com mais de 10 folds. No teu caso, tu está usando 683. Desconfio que, ao rodar o algoritmo e fazer as reamostragens para criar os conjuntos de treinamento e validação intermediários, acabem faltando observações justamente para estas etapas de validação intermediárias. Estude um pouco mais sobre validação cruzada e utilize number = 5 que o teu algoritmo deve rodar satisfatoriamente. On Thu, Sep 12, 2019, 06:17 Juliana DS por (R-br) <r-br@listas.c3sl.ufpr.br> wrote:
Olá pessoal, bom dia!
Preciso rodar um código, mas estou com um erro. Poderiam me ajudar,por favor?
library(MASS) library(class) library(caret) library(e1071)
biopsyX = na.omit(biopsy[,-c(1)]) # Removi a coluna ID is.na(biopsyX$V6) biopsyX <- na.omit(biopsyX) # Omitir os valores NA str(biopsyX)
set.seed(1984)
ctrl <- trainControl(method="repeatedcv", number=683) nn_grid <- expand.grid(k=c(1:12)) best_knn <- train(class ~ ., data=biopsyX, method="knn", trControl=ctrl, preProcess = c("center", "scale"), tuneGrid=nn_grid) print(best_knn)
O meu código trava na linha de treinar o modelo, e me retorna o seguinte erro: "Warning message: In nominalTrainWorkflow(x = x, y = y, wts = weights, info = trainInfo, : There were missing values in resampled performance measures."
Eu não tenho valores NA na minha base... não estou entendendo o erro.
Outra dúvida: Está correto o ordem do código? O seed deveria ficar após a linha do ctrl?
Obrigada Juliana
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De fato, usar 683 é não usual. Por outro lado, fiquei intrigado e vi que esse é o tamanho da amostra. Então creio que você esteja buscando fazer o LOOCV (leave one out cross validation), só que de uma forma subótima. É melhor que você passe o argumento "LOOCV" para o parâmetro `method`. Dessa forma eu não observei mensagens de erro nem aviso. Mais um detalhe, usar número par de vizinhos é não aconselhável porque gera empates no classificador binário (um vizinho positivo e outro negativo) o que acredito ser desempatado por chance. Então use apenas números ímpares no grid de busca. ctrl <- trainControl(method = "LOOCV") nn_grid <- expand.grid(k = seq(1, by = 2, length.out = 7)) best_knn <- train(class ~ ., data = biopsyX, method = "knn", trControl = ctrl, preProcess = c("center", "scale"), tuneGrid = nn_grid) print(best_knn) plot(best_knn) ----------------------------------------------------- k-Nearest Neighbors 683 samples 9 predictors 2 classes: 'benign', 'malignant' Pre-processing: centered (9), scaled (9) Resampling: Leave-One-Out Cross-Validation Summary of sample sizes: 682, 682, 682, 682, 682, 682, ... Resampling results across tuning parameters: k Accuracy Kappa 1 0.9531479 0.8962164 3 0.9619327 0.9163274 5 0.9677892 0.9293366 7 0.9707174 0.9356365 9 0.9677892 0.9292001 11 0.9692533 0.9323530 13 0.9707174 0.9356365 Accuracy was used to select the optimal model using the largest value. The final value used for the model was k = 13. À disposição. Walmes.
participantes (5)
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Andre Oliveira -
Jersiton Tiago Pereira Matos -
Juliana DS -
Marcus Nunes -
Walmes Zeviani