Atualizar R 2.14 para 2.15
Boa tarde pessoal, Consegui instalar rgdal no R 3.0.0 por sugestões de colegas da lista, mas começaram a aparecer outros pacotes que estão dando problema com o R 3.0.0, como não pretendo entrar em contato com cada um dos desenvolvedores de pacotes que uso, voltei para o R 2.14.1, mas para funcionar alguns pacotes preciso do R 2.15.1. Então pergunto se tem alguma forma de atualizar do R 2.14 para R 2.15 no Ubuntu 12.04, sem passar pelo: sudo apt-get install r-base Que vai me instalar novamente ao R 3.0.0. Tentei baixar o r-base-core_2.15.1-1precise2_amd64.deb e instalar via central de programas do Ubuntu, mas deu conflito com r-base-core, teria alguma solução para o que eu estou tentando fazer? Obrigado, Alexandre
Compile o fonte. Estou curioso p saber quais pacotes não funcionam no 2.15.x Se você reinstalar todos os pacotes, tudo deveria funcionar normalmente. Se você tentar dar uma de esperto e reaproveitar os pacotes da instalação velha, então não tem mesmo pq funcionar. b On 12 Jun 2013 15:56, "Alexandre Santos" <alexandresantosbr@yahoo.com.br> wrote:
Boa tarde pessoal,
Consegui instalar rgdal no R 3.0.0 por sugestões de colegas da lista, mas começaram a aparecer outros pacotes que estão dando problema com o R 3.0.0, como não pretendo entrar em contato com cada um dos desenvolvedores de pacotes que uso, voltei para o R 2.14.1, mas para funcionar alguns pacotes preciso do R 2.15.1. Então pergunto se tem alguma forma de atualizar do R 2.14 para R 2.15 no Ubuntu 12.04, sem passar pelo:
sudo apt-get install r-base
Que vai me instalar novamente ao R 3.0.0. Tentei baixar o r-base-core_2.15.1-1precise2_amd64.deb <http://cran.us.r-project.org/bin/linux/ubuntu/precise/r-base-core_2.15.1-1precise2_amd64.deb> e instalar via central de programas do Ubuntu, mas deu conflito com r-base-core, teria alguma solução para o que eu estou tentando fazer? Obrigado,
Alexandre
_______________________________________________ R-br mailing list R-br@listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível.
Não Benilton, Foi sem golpe sujo, não tentei reaproveitar não, e não deu certo para o pacote landsat por exemplo, sendo: R version 2.15.0 (2012-03-30) Copyright (C) 2012 The R Foundation for Statistical Computing ISBN 3-900051-07-0 Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit) R é um software livre e vem sem GARANTIA ALGUMA. Você pode redistribuí-lo sob certas circunstâncias. Digite 'license()' ou 'licence()' para detalhes de distribuição. R é um projeto colaborativo com muitos contribuidores. Digite 'contributors()' para obter mais informações e 'citation()' para saber como citar o R ou pacotes do R em publicações. Digite 'demo()' para demonstrações, 'help()' para o sistema on-line de ajuda, ou 'help.start()' para abrir o sistema de ajuda em HTML no seu navegador. Digite 'q()' para sair do R. [Área de trabalho anterior carregada]
install.packages("landsat") Installing package(s) into ‘/home/asantos/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/2.15’ (as ‘lib’ is unspecified) --- Please select a CRAN mirror for use in this session --- Carregando a interface Tcl/Tk ... pronto tentando a URL 'http://cran-r.c3sl.ufpr.br/src/contrib/landsat_1.0.8.tar.gz' Content type 'application/x-gzip' length 995030 bytes (971 Kb) URL aberta ================================================== downloaded 971 Kb
* installing *source* package ‘landsat’ ... ** package ‘landsat’ successfully unpacked and MD5 sums checked ** R ** data ** inst ** preparing package for lazy loading Error : .onLoad failed in loadNamespace() for 'Matrix', details: call: assignInNamespace(".M.classEnv", .M.classEnv, ns = "base") error: locked binding of ‘.M.classEnv’ cannot be changed ERROR: lazy loading failed for package ‘landsat’ * removing ‘/home/asantos/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/2.15/landsat’ The downloaded source packages are in ‘/tmp/RtmpLwK1yq/downloaded_packages’ Mensagens de aviso perdidas: In install.packages("landsat") : installation of package ‘landsat’ had non-zero exit status ________________________________ De: Benilton Carvalho <beniltoncarvalho@gmail.com> Para: r-br <r-br@listas.c3sl.ufpr.br> Enviadas: Quarta-feira, 12 de Junho de 2013 15:00 Assunto: Re: [R-br] Atualizar R 2.14 para 2.15 Compile o fonte. Estou curioso p saber quais pacotes não funcionam no 2.15.x Se você reinstalar todos os pacotes, tudo deveria funcionar normalmente. Se você tentar dar uma de esperto e reaproveitar os pacotes da instalação velha, então não tem mesmo pq funcionar. b On 12 Jun 2013 15:56, "Alexandre Santos" <alexandresantosbr@yahoo.com.br> wrote:
Boa tarde pessoal,
Consegui instalar rgdal no R 3.0.0 por sugestões de colegas da lista, mas começaram a aparecer outros pacotes que estão dando problema com o R 3.0.0, como não pretendo entrar em contato com cada um dos desenvolvedores de pacotes que uso, voltei para o R 2.14.1, mas para funcionar alguns pacotes preciso do R 2.15.1. Então pergunto se tem alguma forma de atualizar do R 2.14 para R 2.15 no Ubuntu 12.04, sem passar pelo:
sudo apt-get install r-base
Que vai me instalar novamente ao R 3.0.0. Tentei baixar o r-base-core_2.15.1-1precise2_amd64.deb e instalar via central de programas do Ubuntu, mas deu conflito com r-base-core, teria alguma solução para o que eu estou tentando fazer? Obrigado,
Alexandre
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Como eu nao tenho as dependencias necessarias nao posso testar. Entretanto, deixo a dica de, primeiro, instalar a ultima versao do R (3.0.1) e tentar a partir dali... Pode ser que o problema ja' tenha sido resolvido. b Em 12 de junho de 2013 16:43, Alexandre Santos < alexandresantosbr@yahoo.com.br> escreveu:
Não Benilton,
Foi sem golpe sujo, não tentei reaproveitar não, e não deu certo para o pacote landsat por exemplo, sendo:
R version 2.15.0 (2012-03-30) Copyright (C) 2012 The R Foundation for Statistical Computing ISBN 3-900051-07-0 Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)
R é um software livre e vem sem GARANTIA ALGUMA.
Você pode redistribuí-lo sob certas circunstâncias. Digite 'license()' ou 'licence()' para detalhes de distribuição.
R é um projeto colaborativo com muitos contribuidores. Digite 'contributors()' para obter mais informações e
'citation()' para saber como citar o R ou pacotes do R em publicações.
Digite 'demo()' para demonstrações, 'help()' para o sistema on-line de ajuda, ou 'help.start()' para abrir o sistema de ajuda em HTML no seu navegador. Digite 'q()' para sair do R.
[Área de trabalho anterior carregada]
install.packages("landsat")
Installing package(s) into ‘/home/asantos/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/2.15’ (as ‘lib’ is unspecified) --- Please select a CRAN mirror for use in this session --- Carregando a interface Tcl/Tk ... pronto tentando a URL 'http://cran-r.c3sl.ufpr.br/src/contrib/landsat_1.0.8.tar.gz'
Content type 'application/x-gzip' length 995030 bytes (971 Kb) URL aberta ================================================== downloaded 971 Kb
* installing *source* package ‘landsat’ ... ** package ‘landsat’ successfully unpacked and MD5 sums checked
** R ** data ** inst ** preparing package for lazy loading Error : .onLoad failed in loadNamespace() for 'Matrix', details: call: assignInNamespace(".M.classEnv", .M.classEnv, ns = "base") error: locked binding of ‘.M.classEnv’ cannot be changed ERROR: lazy loading failed for package ‘landsat’ * removing ‘/home/asantos/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/2.15/landsat’
The downloaded source packages are in ‘/tmp/RtmpLwK1yq/downloaded_packages’ Mensagens de aviso perdidas: In install.packages("landsat") : installation of package ‘landsat’ had non-zero exit status
------------------------------ *De:* Benilton Carvalho <beniltoncarvalho@gmail.com> *Para:* r-br <r-br@listas.c3sl.ufpr.br> *Enviadas:* Quarta-feira, 12 de Junho de 2013 15:00 *Assunto:* Re: [R-br] Atualizar R 2.14 para 2.15
Compile o fonte. Estou curioso p saber quais pacotes não funcionam no 2.15.x Se você reinstalar todos os pacotes, tudo deveria funcionar normalmente. Se você tentar dar uma de esperto e reaproveitar os pacotes da instalação velha, então não tem mesmo pq funcionar. b On 12 Jun 2013 15:56, "Alexandre Santos" <alexandresantosbr@yahoo.com.br> wrote:
Boa tarde pessoal,
Consegui instalar rgdal no R 3.0.0 por sugestões de colegas da lista, mas começaram a aparecer outros pacotes que estão dando problema com o R 3.0.0, como não pretendo entrar em contato com cada um dos desenvolvedores de pacotes que uso, voltei para o R 2.14.1, mas para funcionar alguns pacotes preciso do R 2.15.1. Então pergunto se tem alguma forma de atualizar do R 2.14 para R 2.15 no Ubuntu 12.04, sem passar pelo:
sudo apt-get install r-base
Que vai me instalar novamente ao R 3.0.0. Tentei baixar o r-base-core_2.15.1-1precise2_amd64.deb <http://cran.us.r-project.org/bin/linux/ubuntu/precise/r-base-core_2.15.1-1precise2_amd64.deb> e instalar via central de
programas do Ubuntu, mas deu conflito com r-base-core, teria alguma solução para o que eu estou tentando fazer? Obrigado,
Alexandre
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Se você usa o Ubuntu e quer atualizar o seu R mantendo os pacotes, eu recomendo que você leia o post do Michael Rutter (http://www.personal.psu.edu/mar36/blogs/the_ubuntu_r_blog/2013/03/moving-to-...), adicione o novo repositório dele (https://launchpad.net/~marutter/+archive/rrutter) para atualizar o R (tendo o cuidade de remover o repositório anterior para evitar conflitos). Uma vez que o R estiver atualizado, recomendo principalmente atualizar os pacotes da forma apropriada: update.packages(checkBuilt=TRUE) Esse comando manterá seus pacotes existentes, mas recompilará o que for necessário para rodar no R v.3 (que por sinal já é 3.0.1). Saudações, -- Thiago V. dos Santos PhD student Land and Atmospheric Science University of Minnesota http://www.laas.umn.edu/CurrentStudents/MeettheStudents/ThiagodosSantos/inde... Phone: (612) 323 9898 ________________________________ From: Alexandre Santos <alexandresantosbr@yahoo.com.br> To: r-br@listas.c3sl.ufpr.br Sent: Wednesday, June 12, 2013 1:56 PM Subject: [R-br] Atualizar R 2.14 para 2.15 Boa tarde pessoal, Consegui instalar rgdal no R 3.0.0 por sugestões de colegas da lista, mas começaram a aparecer outros pacotes que estão dando problema com o R 3.0.0, como não pretendo entrar em contato com cada um dos desenvolvedores de pacotes que uso, voltei para o R 2.14.1, mas para funcionar alguns pacotes preciso do R 2.15.1. Então pergunto se tem alguma forma de atualizar do R 2.14 para R 2.15 no Ubuntu 12.04, sem passar pelo: sudo apt-get install r-base Que vai me instalar novamente ao R 3.0.0. Tentei baixar o r-base-core_2.15.1-1precise2_amd64.deb e instalar via central de programas do Ubuntu, mas deu conflito com r-base-core, teria alguma solução para o que eu estou tentando fazer? Obrigado, Alexandre _______________________________________________ R-br mailing list R-br@listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível.
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