Bom dia, alguém está com mesmo problema na instalação da lme4? compilation terminated. make: ** [external.o] Erro 1 ERROR: compilation failed for package ‘lme4’ * removing ‘/usr/local/lib/R/site-library/lme4’ The downloaded source packages are in ‘/tmp/RtmpRFLqvs/downloaded_packages’ Warning message: In install.packages("lme4") : installation of package ‘lme4’ had non-zero exit status
library(lme4) Error in library(lme4) : there is no package called ‘lme4’
Grato André Oliveira Souza. Graduação em Matemática, mestrado em estatística aplicada.Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia do Espirito Santo. IFES
Oi, André. É só com este pacote que dá o erro? Você testou instalar algum outro? Onde está executando o R (terminal, RStudio, Emacs etc.)? Qual o seu sistema operacional? On Wed, Jul 5, 2017 at 1:56 AM Andre Oliveira via R-br < r-br@listas.c3sl.ufpr.br> wrote:
Bom dia, alguém está com mesmo problema na instalação da lme4?
compilation terminated. make: ** [external.o] Erro 1 ERROR: compilation failed for package ‘lme4’ * removing ‘/usr/local/lib/R/site-library/lme4’
The downloaded source packages are in ‘/tmp/RtmpRFLqvs/downloaded_packages’ Warning message: In install.packages("lme4") : installation of package ‘lme4’ had non-zero exit status
library(lme4) Error in library(lme4) : there is no package called ‘lme4’
Grato
André Oliveira Souza. Graduação em Matemática, mestrado em estatística aplicada.Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia do Espirito Santo. IFES _______________________________________________ R-br mailing list R-br@listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível.
André, Já tive problemas similares com o lme4 usando o openSUSE. No meu caso, havia dependências não atendidas. Existe mais informação antes do output que você postou? Abs, Vinícius On 07/05/2017 01:51 AM, Andre Oliveira via R-br wrote:
Bom dia, alguém está com mesmo problema na instalação da lme4?
compilation terminated. make: ** [external.o] Erro 1 ERROR: compilation failed for package ‘lme4’ * removing ‘/usr/local/lib/R/site-library/lme4’
The downloaded source packages are in ‘/tmp/RtmpRFLqvs/downloaded_packages’ Warning message: In install.packages("lme4") : installation of package ‘lme4’ had non-zero exit status
library(lme4) Error in library(lme4) : there is no package called ‘lme4’
Grato
André Oliveira Souza. Graduação em Matemática, mestrado em estatística aplicada.Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia do Espirito Santo. IFES
_______________________________________________ R-br mailing list R-br@listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forne�a c�digo m�nimo reproduz�vel.
-- Best regards, Vinícius Lionel Mateus, PhD (http://lattes.cnpq.br/6501001637020665) Atmospheric Chemistry Laboratory - Dep. Chemistry PUC-Rio - Pontifical Catholic University of Rio de Janeiro Marquês de São Vicente, 225, Gávea - Rio de Janeiro, RJ - Brazil CEP: 22451-900 Phone: (+55) (21) 982 - 889 - 221 Skype: vinicius.lionel http://www.qui.puc-rio.br/index.html
Boa noite, estou usando o terminal Karina.Vinícius os avisos são estes!
install.packages("lme4") Installing package into ‘/usr/local/lib/R/site-library’ (as ‘lib’ is unspecified) tentando a URL 'https://cran.cnr.berkeley.edu/src/contrib/lme4_1.1-13.tar.gz' Content type 'application/x-gzip' length 3624472 bytes (3.5 MB) ================================================== downloaded 3.5 MB
* installing *source* package ‘lme4’ ... ** package ‘lme4’ successfully unpacked and MD5 sums checked ** libs g++ -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I"/usr/local/lib/R/site-library/Rcpp/include" -I"/usr/local/lib/R/site-library/RcppEigen/include" -DNDEBUG -DEIGEN_DONT_VECTORIZE -fpic -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -c external.cpp -o external.o In file included from external.cpp:8:0: predModule.h:12:23: fatal error: RcppEigen.h: Arquivo ou diretório não encontrado #include <RcppEigen.h> ^ compilation terminated. make: ** [external.o] Erro 1 ERROR: compilation failed for package ‘lme4’ * removing ‘/usr/local/lib/R/site-library/lme4’ Warning in install.packages : installation of package ‘lme4’ had non-zero exit status The downloaded source packages are in ‘/tmp/RtmpNtJzRo/downloaded_packages’ André Oliveira Souza. Graduação em Matemática, mestrado em estatística aplicada.Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia do Espirito Santo. IFES Em Quarta-feira, 5 de Julho de 2017 17:48, Vinícius Lionel Mateus via R-br <r-br@listas.c3sl.ufpr.br> escreveu: André, Já tive problemas similares com o lme4 usando o openSUSE. No meu caso, havia dependências não atendidas. Existe mais informação antes do output que você postou? Abs, Vinícius On 07/05/2017 01:51 AM, Andre Oliveira via R-br wrote: Bom dia, alguém está com mesmo problema na instalação da lme4? compilation terminated. make: ** [external.o] Erro 1 ERROR: compilation failed for package ‘lme4’ * removing ‘/usr/local/lib/R/site-library/lme4’ The downloaded source packages are in ‘/tmp/RtmpRFLqvs/downloaded_packages’ Warning message: In install.packages("lme4") : installation of package ‘lme4’ had non-zero exit status
library(lme4) Error in library(lme4) : there is no package called ‘lme4’
Grato André Oliveira Souza. Graduação em Matemática, mestrado em estatística aplicada.Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia do Espirito Santo. IFES _______________________________________________ R-br mailing list R-br@listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forne�a c�digo m�nimo reproduz�vel. -- Best regards, Vinícius Lionel Mateus, PhD (http://lattes.cnpq.br/6501001637020665) Atmospheric Chemistry Laboratory - Dep. Chemistry PUC-Rio - Pontifical Catholic University of Rio de Janeiro Marquês de São Vicente, 225, Gávea - Rio de Janeiro, RJ - Brazil CEP: 22451-900 Phone: (+55) (21) 982 - 889 - 221 Skype: vinicius.lionel http://www.qui.puc-rio.br/index.html _______________________________________________ R-br mailing list R-br@listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forne�a c�digo m�nimo reproduz�vel.
Não sei sua distribuição qual é, mas se for alguma baseada em Debian (com aptitude), instale pelo terminal o pacote *.deb ao invés do pacote CRAN, ou seja: $ sudo apt-get install r-cran-lme4 Pela mensagem de erro, o que te falta é a dependência do RcppEigen. HTH FH 2017-07-05 17:45 GMT-05:00 Andre Oliveira via R-br <r-br@listas.c3sl.ufpr.br
:
Boa noite, estou usando o terminal Karina.Vinícius os avisos são estes!
install.packages("lme4") Installing package into ‘/usr/local/lib/R/site-library’ (as ‘lib’ is unspecified) tentando a URL 'https://cran.cnr.berkeley.edu/src/contrib/lme4_1.1-13. tar.gz' Content type 'application/x-gzip' length 3624472 bytes (3.5 MB) ================================================== downloaded 3.5 MB
* installing *source* package ‘lme4’ ... ** package ‘lme4’ successfully unpacked and MD5 sums checked ** libs g++ -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I"/usr/local/lib/R/site-library/Rcpp/include" -I"/usr/local/lib/R/site-library/RcppEigen/include" -DNDEBUG -DEIGEN_DONT_VECTORIZE -fpic -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -c external.cpp -o external.o In file included from external.cpp:8:0: predModule.h:12:23: fatal error: RcppEigen.h: Arquivo ou diretório não encontrado #include <RcppEigen.h> ^ compilation terminated. make: ** [external.o] Erro 1 ERROR: compilation failed for package ‘lme4’ * removing ‘/usr/local/lib/R/site-library/lme4’ Warning in install.packages : installation of package ‘lme4’ had non-zero exit status
The downloaded source packages are in ‘/tmp/RtmpNtJzRo/downloaded_packages’
André Oliveira Souza. Graduação em Matemática, mestrado em estatística aplicada.Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia do Espirito Santo. IFES
Em Quarta-feira, 5 de Julho de 2017 17:48, Vinícius Lionel Mateus via R-br <r-br@listas.c3sl.ufpr.br> escreveu:
André,
Já tive problemas similares com o lme4 usando o openSUSE. No meu caso, havia dependências não atendidas.
Existe mais informação antes do output que você postou?
Abs, Vinícius
On 07/05/2017 01:51 AM, Andre Oliveira via R-br wrote:
Bom dia, alguém está com mesmo problema na instalação da lme4?
compilation terminated. make: ** [external.o] Erro 1 ERROR: compilation failed for package ‘lme4’ * removing ‘/usr/local/lib/R/site-library/lme4’
The downloaded source packages are in ‘/tmp/RtmpRFLqvs/downloaded_packages’ Warning message: In install.packages("lme4") : installation of package ‘lme4’ had non-zero exit status
library(lme4) Error in library(lme4) : there is no package called ‘lme4’
Grato
André Oliveira Souza. Graduação em Matemática, mestrado em estatística aplicada.Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia do Espirito Santo. IFES
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Vinícius Lionel Mateus, PhD (http://lattes.cnpq.br/6501001637020665) Atmospheric Chemistry Laboratory - Dep. Chemistry PUC-Rio - Pontifical Catholic University of Rio de Janeiro Marquês de São Vicente, 225, Gávea - Rio de Janeiro, RJ - Brazil CEP: 22451-900 Phone: (+55) (21) 982 - 889 - 221 Skype: vinicius.lionelhttp://www.qui.puc-rio.br/index.html
_______________________________________________ R-br mailing list R-br@listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forne�a c�digo m�nimo reproduz�vel.
_______________________________________________ R-br mailing list R-br@listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível.
Andre, É como o FH respondeu. Parece que há problemas com o RccpEigen. O repositório da distro é uma opção que resolve, mas os pacotes podem estar desatualizados. Att, Vinícius Best regards, Vinícius Lionel Mateus, PhD (http://lattes.cnpq.br/6501001637020665) Atmospheric Chemistry Laboratory - Dep. Chemistry PUC-Rio - Pontifical Catholic University of Rio de Janeiro Marquês de São Vicente, 225, Gávea - Rio de Janeiro, RJ - Brazil CEP: 22451-900 Phone: (+55) (21) 982 - 889 - 221 Skype: vinicius.lionel http://www.qui.puc-rio.br/index.html 2017-07-05 19:45 GMT-03:00 Andre Oliveira <andreolsouza@yahoo.com.br>:
Boa noite, estou usando o terminal Karina.Vinícius os avisos são estes!
install.packages("lme4") Installing package into ‘/usr/local/lib/R/site-library’ (as ‘lib’ is unspecified) tentando a URL 'https://cran.cnr.berkeley.edu/src/contrib/lme4_1.1-13. tar.gz' Content type 'application/x-gzip' length 3624472 bytes (3.5 MB) ================================================== downloaded 3.5 MB
* installing *source* package ‘lme4’ ... ** package ‘lme4’ successfully unpacked and MD5 sums checked ** libs g++ -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I"/usr/local/lib/R/site-library/Rcpp/include" -I"/usr/local/lib/R/site-library/RcppEigen/include" -DNDEBUG -DEIGEN_DONT_VECTORIZE -fpic -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -c external.cpp -o external.o In file included from external.cpp:8:0: predModule.h:12:23: fatal error: RcppEigen.h: Arquivo ou diretório não encontrado #include <RcppEigen.h> ^ compilation terminated. make: ** [external.o] Erro 1 ERROR: compilation failed for package ‘lme4’ * removing ‘/usr/local/lib/R/site-library/lme4’ Warning in install.packages : installation of package ‘lme4’ had non-zero exit status
The downloaded source packages are in ‘/tmp/RtmpNtJzRo/downloaded_packages’
André Oliveira Souza. Graduação em Matemática, mestrado em estatística aplicada.Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia do Espirito Santo. IFES
Em Quarta-feira, 5 de Julho de 2017 17:48, Vinícius Lionel Mateus via R-br <r-br@listas.c3sl.ufpr.br> escreveu:
André,
Já tive problemas similares com o lme4 usando o openSUSE. No meu caso, havia dependências não atendidas.
Existe mais informação antes do output que você postou?
Abs, Vinícius
On 07/05/2017 01:51 AM, Andre Oliveira via R-br wrote:
Bom dia, alguém está com mesmo problema na instalação da lme4?
compilation terminated. make: ** [external.o] Erro 1 ERROR: compilation failed for package ‘lme4’ * removing ‘/usr/local/lib/R/site-library/lme4’
The downloaded source packages are in ‘/tmp/RtmpRFLqvs/downloaded_packages’ Warning message: In install.packages("lme4") : installation of package ‘lme4’ had non-zero exit status
library(lme4) Error in library(lme4) : there is no package called ‘lme4’
Grato
André Oliveira Souza. Graduação em Matemática, mestrado em estatística aplicada.Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia do Espirito Santo. IFES
_______________________________________________ R-br mailing listR-br@listas.c3sl.ufpr.brhttps://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forne�a c�digo m�nimo reproduz�vel.
-- Best regards,
Vinícius Lionel Mateus, PhD (http://lattes.cnpq.br/6501001637020665) Atmospheric Chemistry Laboratory - Dep. Chemistry PUC-Rio - Pontifical Catholic University of Rio de Janeiro Marquês de São Vicente, 225, Gávea - Rio de Janeiro, RJ - Brazil CEP: 22451-900 Phone: (+55) (21) 982 - 889 - 221 Skype: vinicius.lionelhttp://www.qui.puc-rio.br/index.html
_______________________________________________ R-br mailing list R-br@listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forne�a c�digo m�nimo reproduz�vel.
Resolvido. Obrigado! André Oliveira Souza. Graduação em Matemática, mestrado em estatística aplicada.Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia do Espirito Santo. IFES Em Quinta-feira, 6 de Julho de 2017 20:20, Vinícius Lionel Mateus <vinynegrelli@gmail.com> escreveu: Andre, É como o FH respondeu. Parece que há problemas com o RccpEigen. O repositório da distro é uma opção que resolve, mas os pacotes podem estar desatualizados. Att, Vinícius Best regards, Vinícius Lionel Mateus, PhD (http://lattes.cnpq.br/6501001637020665) Atmospheric Chemistry Laboratory - Dep. Chemistry PUC-Rio - Pontifical Catholic University of Rio de Janeiro Marquês de São Vicente, 225, Gávea - Rio de Janeiro, RJ - Brazil CEP: 22451-900 Phone: (+55) (21) 982 - 889 - 221 Skype: vinicius.lionel http://www.qui.puc-rio.br/index.html 2017-07-05 19:45 GMT-03:00 Andre Oliveira <andreolsouza@yahoo.com.br>: Boa noite, estou usando o terminal Karina.Vinícius os avisos são estes!
install.packages("lme4") Installing package into ‘/usr/local/lib/R/site- library’ (as ‘lib’ is unspecified) tentando a URL 'https://cran.cnr.berkeley. edu/src/contrib/lme4_1.1-13. tar.gz' Content type 'application/x-gzip' length 3624472 bytes (3.5 MB) ============================== ==================== downloaded 3.5 MB
* installing *source* package ‘lme4’ ... ** package ‘lme4’ successfully unpacked and MD5 sums checked ** libs g++ -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I"/usr/local/lib/R/site- library/Rcpp/include" -I"/usr/local/lib/R/site- library/RcppEigen/include" -DNDEBUG -DEIGEN_DONT_VECTORIZE -fpic -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -c external.cpp -o external.o In file included from external.cpp:8:0: predModule.h:12:23: fatal error: RcppEigen.h: Arquivo ou diretório não encontrado #include <RcppEigen.h> ^ compilation terminated. make: ** [external.o] Erro 1 ERROR: compilation failed for package ‘lme4’ * removing ‘/usr/local/lib/R/site- library/lme4’ Warning in install.packages : installation of package ‘lme4’ had non-zero exit status The downloaded source packages are in ‘/tmp/RtmpNtJzRo/downloaded_ packages’ André Oliveira Souza. Graduação em Matemática, mestrado em estatística aplicada.Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia do Espirito Santo. IFES Em Quarta-feira, 5 de Julho de 2017 17:48, Vinícius Lionel Mateus via R-br <r-br@listas.c3sl.ufpr.br> escreveu: André, Já tive problemas similares com o lme4 usando o openSUSE. No meu caso, havia dependências não atendidas. Existe mais informação antes do output que você postou? Abs, Vinícius On 07/05/2017 01:51 AM, Andre Oliveira via R-br wrote: Bom dia, alguém está com mesmo problema na instalação da lme4? compilation terminated. make: ** [external.o] Erro 1 ERROR: compilation failed for package ‘lme4’ * removing ‘/usr/local/lib/R/site- library/lme4’ The downloaded source packages are in ‘/tmp/RtmpRFLqvs/downloaded_ packages’ Warning message: In install.packages("lme4") : installation of package ‘lme4’ had non-zero exit status
library(lme4) Error in library(lme4) : there is no package called ‘lme4’
Grato André Oliveira Souza. Graduação em Matemática, mestrado em estatística aplicada.Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia do Espirito Santo. IFES ______________________________ _________________ R-br mailing list R-br@listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/ cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br- guia) e forne�a c�digo m�nimo reproduz�vel. -- Best regards, Vinícius Lionel Mateus, PhD (http://lattes.cnpq.br/ 6501001637020665) Atmospheric Chemistry Laboratory - Dep. Chemistry PUC-Rio - Pontifical Catholic University of Rio de Janeiro Marquês de São Vicente, 225, Gávea - Rio de Janeiro, RJ - Brazil CEP: 22451-900 Phone: (+55) (21) 982 - 889 - 221 Skype: vinicius.lionel http://www.qui.puc-rio.br/ index.html ______________________________ _________________ R-br mailing list R-br@listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/ cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br- guia) e forne�a c�digo m�nimo reproduz�vel.
participantes (4)
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Andre Oliveira -
FHRB Toledo -
Karina Rebuli -
Vinícius Lionel Mateus