metodologia para validação de tratamentos

Caros amigos, Estou analisando dados que comparam diferentes metodologias. Os dados referem a medidas de áreas de olho de lombo e estou comparando 4 metodologias utilizadas para medila (controle, A, B, C). Eu realizei a anova e utilizei o teste de dunnet para fazer as comparações dos tratamento com o grupo controle. Gostaria de saber quais avaliações estatísticas a mais eu posso fazer para melhorar esta análise? Quais análises de resíduos eu posso utilizar? abçs -- ======================================================================= Fernando Souza Zootecnista, DSc. Produção Animal celular: (+55) 82 8113-8781 e-mail:nandodesouza@gmail.com https://producaoanimalcomr.wordpress.com/ ========================================================================

Para validar a ANOVA, análise de resíduos: Considerando um delineamento inteiramente casualizado. #### HOMOCEDASTICIDADE boxplot(modelo$res ~ d$trat, ylab='Residuals') ### Gráfico de dispersão dos resíduos vs tratamento plot.default(d$trat, mod1$res, ylab='Residuals', xlab='Tratamento',col='darkblue',cex=.75,pch=16) #### Testando Homocedasticidade # H0: As variâncias são comuns # H1: As variâncias não são comuns bartlett.test(modelo1$res, d$trat) #### NORMALIDADE DOS RESÍDUOS hist(modelo$res,prob=T,main='',ylab='',xlab='',bg='white',border='seagreen',breaks='FD',axes=F) axis(1) rug(modelo$res,col='seagreen') lines(density(modelo$res),col='red') stem(modelo$res) qqnorm(modelo$res,ylab='Residuals',col='darkblue',pch=16) qqline(modelo$res,col='red') ## Teste de Normalidade # H0:Os resíduos seguem distribuição Normal # H1:Os resíduos NÃO seguem distribuição Normal shapiro.test(modelo$res) ###### INDEPENDÊNCIA DOS RESÍDUOS par(mfrow=c(1,2)) plot(modelo$fit, modelo$res, ylab='Residuals', xlab='Fitted Values',col='darkblue',cex=.75,pch=16) title('Residual vs Fitted Values') plot(modelo$fit, order(modelo$res), ylab='Residuals', xlab='Fitted Values',col='darkblue',cex=.75,pch=16) title('Residual vs Fitted Values') ####### VERIFICAÇÃO DE OUTLIERS par(mfrow=c(2,2)) plot(modelo) names(anova(modelo)) var <- anova(modelo)$Mean[2] var res <- modelo$res resd <- (res/sqrt(var)) boxplot(resd,col='darkblue',pch=16) plot.default(d$trat,resd,xlab='Tratamento',pch=16,type='p',col='red') title('Standard Residuals') On 18-03-2015 16:36, Fernando Antonio de souza wrote:
Caros amigos,
Estou analisando dados que comparam diferentes metodologias. Os dados referem a medidas de áreas de olho de lombo e estou comparando 4 metodologias utilizadas para medila (controle, A, B, C). Eu realizei a anova e utilizei o teste de dunnet para fazer as comparações dos tratamento com o grupo controle.
Gostaria de saber quais avaliações estatísticas a mais eu posso fazer para melhorar esta análise? Quais análises de resíduos eu posso utilizar?
abçs
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Olá Felipe, obrigadopor me responder Mas não é exatamente isso que eu tinha em mente quando levantei a questão. O que você me enviou foi a análise de resíduos básica de uma análise de variância. A minha questão não é essa. Eu quero validar os dados de uma nova metologolia (C) em relação as outras 3 metodologias existentes (controle, A e B). Eu fiz a analise de variância e comparação de médias com o controle pelo teste de Dunnet Eu quero saber se para validar há alguma outra estatístistica a mais ou somente essa comparação basta. O meu objetivo é mostrar que a metodologia C fornece resultados iguais ou melhores que os métodos existentes abçs Em 19 de março de 2015 13:17, Felipe <felipe.e.barletta@gmail.com> escreveu:
Para validar a ANOVA, análise de resíduos: Considerando um delineamento inteiramente casualizado.
#### HOMOCEDASTICIDADE
boxplot(modelo$res ~ d$trat, ylab='Residuals') ### Gráfico de dispersão dos resíduos vs tratamento plot.default(d$trat, mod1$res, ylab='Residuals', xlab='Tratamento',col='darkblue',cex=.75,pch=16) #### Testando Homocedasticidade # H0: As variâncias são comuns # H1: As variâncias não são comuns bartlett.test(modelo1$res, d$trat)
#### NORMALIDADE DOS RESÍDUOS
hist(modelo$res,prob=T,main='',ylab='',xlab='',bg='white',border='seagreen',breaks='FD',axes=F) axis(1) rug(modelo$res,col='seagreen') lines(density(modelo$res),col='red')
stem(modelo$res)
qqnorm(modelo$res,ylab='Residuals',col='darkblue',pch=16) qqline(modelo$res,col='red') ## Teste de Normalidade # H0:Os resíduos seguem distribuição Normal # H1:Os resíduos NÃO seguem distribuição Normal shapiro.test(modelo$res)
###### INDEPENDÊNCIA DOS RESÍDUOS par(mfrow=c(1,2)) plot(modelo$fit, modelo$res, ylab='Residuals', xlab='Fitted Values',col='darkblue',cex=.75,pch=16) title('Residual vs Fitted Values')
plot(modelo$fit, order(modelo$res), ylab='Residuals', xlab='Fitted Values',col='darkblue',cex=.75,pch=16) title('Residual vs Fitted Values')
####### VERIFICAÇÃO DE OUTLIERS par(mfrow=c(2,2)) plot(modelo)
names(anova(modelo)) var <- anova(modelo)$Mean[2] var res <- modelo$res resd <- (res/sqrt(var)) boxplot(resd,col='darkblue',pch=16) plot.default(d$trat,resd,xlab='Tratamento',pch=16,type='p',col='red') title('Standard Residuals')
On 18-03-2015 16:36, Fernando Antonio de souza wrote:
Caros amigos,
Estou analisando dados que comparam diferentes metodologias. Os dados referem a medidas de áreas de olho de lombo e estou comparando 4 metodologias utilizadas para medila (controle, A, B, C). Eu realizei a anova e utilizei o teste de dunnet para fazer as comparações dos tratamento com o grupo controle.
Gostaria de saber quais avaliações estatísticas a mais eu posso fazer para melhorar esta análise? Quais análises de resíduos eu posso utilizar?
abçs
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Talvez o pacote multcomp possa te ajudar: http://cran.r-project.org/web/packages/multcomp/multcomp.pdf Exemplo: library(multcomp) Contr=c(123,179,121,185,183,191,182,187) A=c(96,79,91,85,83,91,82,87) B=c(77,76,74,73,78,71,80) C=c(66,73,69,66,77,73,71,70,74) resp=c(Contr,A,B,C) Metodo=c(rep(1,length(Contr)), rep(2,length(A)), rep(3,length(B)), rep(4,length(C))) Metodo=factor(Metodo) anova=aov(resp~Metodo) summary(anova) test.dunnett=glht(anova,linfct=mcp(Metodo="Dunnett")) confint(test.dunnett) plot(test.dunnett)

Embora chegando um pouco tarde nesta conversa, acho que se a ideia é conferir metodologias de medida de um mesmo fenômeno, a técnica mais apropriada seria a desenvolvida por Tukey, o gráfico de diferenças de médias (também denominado de gráfico de Bland-Altman) para comparação de medidas. HTH 2015-03-18 16:36 GMT-03:00 Fernando Antonio de souza <nandodesouza@gmail.com
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Caros amigos,
Estou analisando dados que comparam diferentes metodologias. Os dados referem a medidas de áreas de olho de lombo e estou comparando 4 metodologias utilizadas para medila (controle, A, B, C). Eu realizei a anova e utilizei o teste de dunnet para fazer as comparações dos tratamento com o grupo controle.
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abçs
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