Ajuda em modelo misto

Ajustei o seguinte modelo misto: ga=interaction(genótipo,ambiente) modelo=lmer(resposta~bloco/ambiente+ambiente+(1|genótipo)+(1|ga)) É um modelo de avaliação de genótipos em vários ambientes. Neste modelo tenho as seguintes variâncias: ga genótipo residual Gostaria que alguém me ajuda-se a ajustar o modelo acima para obter as seguintes variâncias, supondo 3 ambientes: ga genótipo residual (ambiente 1) residual(ambiente 2) residual (ambiente 3)

Emmanuel, A variância residual para cada ambiente, vc terá somente se realizar uma análise para cada ambiente separadamente. No seu caso, o usual a se fazer é: Realizar uma análise para cada ambiente, depois realizar a análise conjunta dos ambientes. Desta forma forma vc tem a variância ambiental total e a variância de cada ambiente. Tem outra coisa, o seu modelo esta errado. O certo seria: Ambiente/Bloco = Bloco dentro de Ambiente. (Wilkinson & Rogers, 1973) A notação Bloco/Ambiente, é utilizada pelo Satanic Analysis System. Vc está dizendo ao R que realize a análise de Ambientes dentro de blocos, o que não tem sentido. Valeu!!! Fábio Mathias Corrêa Universidade Estadual de Santa Cruz Departamento de Ciências Exatas e da Terra - DCET Campus Soane Nazaré de Andrade, km 16 Rodovia Ilhéus-Itabuna CEP 45662-900. Ilhéus-Bahia Tel.: 73-3680-5076 ________________________________ De: Emmanuel Arnhold <emmanuelarnhold@yahoo.com.br> Para: R-br <r-br@listas.c3sl.ufpr.br> Enviadas: Sábado, 28 de Maio de 2011 9:28 Assunto: [R-br] Ajuda em modelo misto Ajustei o seguinte modelo misto: ga=interaction(genótipo,ambiente) modelo=lmer(resposta~bloco/ambiente+ambiente+(1|genótipo)+(1|ga)) É um modelo de avaliação de genótipos em vários ambientes. Neste modelo tenho as seguintes variâncias: ga genótipo residual Gostaria que alguém me ajuda-se a ajustar o modelo acima para obter as seguintes variâncias, supondo 3 ambientes: ga genótipo residual (ambiente 1) residual(ambiente 2) residual (ambiente 3) _______________________________________________ R-br mailing list R-br@listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br

Uma alternativa seria realizar a análise com ambiente/bloco... e depois colocar da mesma forma ambientes/genótipos e desdobrar a interação, saindo uma entre locais e a dentro de genótipos dentro de cada local! Mas acho que essa minha parametrização só funciona com o aov...! não lme não sei! abraço, FH 2011/5/28 Fabio Mathias Corrêa <fabio.ufla@yahoo.com.br>
Emmanuel,
A variância residual para cada ambiente, vc terá somente se realizar uma análise para cada ambiente separadamente.
No seu caso, o usual a se fazer é:
Realizar uma análise para cada ambiente, depois realizar a análise conjunta dos ambientes.
Desta forma forma vc tem a variância ambiental total e a variância de cada ambiente.
Tem outra coisa, o seu modelo esta errado.
O certo seria:
Ambiente/Bloco = Bloco dentro de Ambiente. (Wilkinson & Rogers, 1973)
A notação Bloco/Ambiente, é utilizada pelo Satanic Analysis System.
Vc está dizendo ao R que realize a análise de Ambientes dentro de blocos, o que não tem sentido.
Valeu!!!
Fábio Mathias Corrêa
Universidade Estadual de Santa Cruz Departamento de Ciências Exatas e da Terra - DCET
Campus Soane Nazaré de Andrade, km 16 Rodovia Ilhéus-Itabuna CEP 45662-900. Ilhéus-Bahia
Tel.: 73-3680-5076 ------------------------------ *De:* Emmanuel Arnhold <emmanuelarnhold@yahoo.com.br> *Para:* R-br <r-br@listas.c3sl.ufpr.br> *Enviadas:* Sábado, 28 de Maio de 2011 9:28 *Assunto:* [R-br] Ajuda em modelo misto
Ajustei o seguinte modelo misto:
ga=interaction(genótipo,ambiente)
modelo=lmer(resposta~bloco/ambiente+ambiente+(1|genótipo)+(1|ga))
É um modelo de avaliação de genótipos em vários ambientes. Neste modelo tenho as seguintes variâncias: ga genótipo residual
Gostaria que alguém me ajuda-se a ajustar o modelo acima para obter as seguintes variâncias, supondo 3 ambientes: ga genótipo residual (ambiente 1) residual(ambiente 2) residual (ambiente 3)
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Acho que não é bem isso. Mas vou dar uma olhada. Obrigado. --- Em sáb, 28/5/11, Fernando Henrique Toledo <fernandohtoledo@gmail.com> escreveu: De: Fernando Henrique Toledo <fernandohtoledo@gmail.com> Assunto: Re: [R-br] Ajuda em modelo misto Para: r-br@listas.c3sl.ufpr.br, "Fabio Mathias Corrêa" <fabio.ufla@yahoo.com.br> Data: Sábado, 28 de Maio de 2011, 13:01 Uma alternativa seria realizar a análise com ambiente/bloco... e depois colocar da mesma forma ambientes/genótipos e desdobrar a interação, saindo uma entre locais e a dentro de genótipos dentro de cada local! Mas acho que essa minha parametrização só funciona com o aov...! não lme não sei! abraço, FH 2011/5/28 Fabio Mathias Corrêa <fabio.ufla@yahoo.com.br> Emmanuel, A variância residual para cada ambiente, vc terá somente se realizar uma análise para cada ambiente separadamente. No seu caso, o usual a se fazer é: Realizar uma análise para cada ambiente, depois realizar a análise conjunta dos ambientes. Desta forma forma vc tem a variância ambiental total e a variância de cada ambiente. Tem outra coisa, o seu modelo esta errado. O certo seria: Ambiente/Bloco = Bloco dentro de Ambiente. (Wilkinson & Rogers, 1973) A notação Bloco/Ambiente, é utilizada pelo Satanic Analysis System. Vc está dizendo ao R que realize a análise de Ambientes dentro de blocos, o que não tem sentido. Valeu!!! Fábio Mathias Corrêa Universidade Estadual de Santa Cruz Departamento de Ciências Exatas e da Terra - DCET Campus Soane Nazaré de Andrade, km 16 Rodovia Ilhéus-Itabuna CEP 45662-900. Ilhéus-Bahia Tel.: 73-3680-5076 De: Emmanuel Arnhold <emmanuelarnhold@yahoo.com.br> Para: R-br <r-br@listas.c3sl.ufpr.br> Enviadas: Sábado, 28 de Maio de 2011 9:28 Assunto: [R-br] Ajuda em modelo misto Ajustei o seguinte modelo misto: ga=interaction(genótipo,ambiente) modelo=lmer(resposta~bloco/ambiente+ambiente+(1|genótipo)+(1|ga)) É um modelo de avaliação de genótipos em vários ambientes. Neste modelo tenho as seguintes variâncias: ga genótipo residual Gostaria que alguém me ajuda-se a ajustar o modelo acima para obter as seguintes variâncias, supondo 3 ambientes: ga genótipo residual (ambiente 1) residual(ambiente 2) residual (ambiente 3) _______________________________________________ R-br mailing list R-br@listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br _______________________________________________ R-br mailing list R-br@listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br -----Anexo incorporado----- _______________________________________________ R-br mailing list R-br@listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br

Vc poderia explicar melhor o seu experimento? Valeu!!! Fábio Mathias Corrêa Universidade Estadual de Santa Cruz Departamento de Ciências Exatas e da Terra - DCET Campus Soane Nazaré de Andrade, km 16 Rodovia Ilhéus-Itabuna CEP 45662-900. Ilhéus-Bahia Tel.: 73-3680-5076 ________________________________ De: Emmanuel Arnhold <emmanuelarnhold@yahoo.com.br> Para: r-br@listas.c3sl.ufpr.br Enviadas: Sábado, 28 de Maio de 2011 12:49 Assunto: Re: [R-br] Ajuda em modelo misto Acho que não é bem isso. Mas vou dar uma olhada. Obrigado. --- Em sáb, 28/5/11, Fernando Henrique Toledo <fernandohtoledo@gmail.com> escreveu:
De: Fernando Henrique Toledo <fernandohtoledo@gmail.com> Assunto: Re: [R-br] Ajuda em modelo misto Para: r-br@listas.c3sl.ufpr.br, "Fabio Mathias Corrêa" <fabio.ufla@yahoo.com.br> Data: Sábado, 28 de Maio de 2011, 13:01
Uma alternativa seria realizar a análise com ambiente/bloco... e depois colocar da mesma forma ambientes/genótipos e desdobrar a interação, saindo uma entre locais e a dentro de genótipos dentro de cada local!
Mas acho que essa minha parametrização só funciona com o aov...! não lme não sei!
abraço, FH
2011/5/28 Fabio Mathias Corrêa <fabio.ufla@yahoo.com.br>
Emmanuel,
A variância residual para cada ambiente, vc terá somente se realizar uma análise para cada ambiente separadamente.
No seu caso, o usual a se fazer é:
Realizar uma análise para cada ambiente, depois realizar a análise conjunta dos ambientes.
Desta forma forma vc tem a variância ambiental total e a variância de cada ambiente.
Tem outra coisa, o seu modelo esta errado.
O certo seria:
Ambiente/Bloco = Bloco dentro de Ambiente. (Wilkinson & Rogers, 1973)
A notação Bloco/Ambiente, é utilizada pelo Satanic Analysis System.
Vc está dizendo ao R que realize a análise de Ambientes dentro de blocos, o que não tem sentido.
Valeu!!!
Fábio Mathias Corrêa
Universidade Estadual de Santa Cruz Departamento de Ciências Exatas e da Terra - DCET
Campus Soane Nazaré de Andrade, km 16 Rodovia Ilhéus-Itabuna CEP 45662-900. Ilhéus-Bahia
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Ajustei o seguinte modelo misto: ga=interaction(genótipo,ambiente)
modelo=lmer(resposta~bloco/ambiente+ambiente+(1|genótipo)+(1|ga)) É um modelo de avaliação de genótipos em vários ambientes. Neste modelo tenho as seguintes variâncias: ga genótipo residual Gostaria que alguém me ajuda-se a ajustar o modelo acima
para obter as seguintes variâncias, supondo 3 ambientes:
ga genótipo residual (ambiente 1) residual(ambiente 2) residual (ambiente 3) _______________________________________________ R-br mailing list R-br@listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br
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Certo Fábio, o correto é Ambiente dentro de bloco, é que geralmente uso a notação bloco:ambiente que equivale a ambiente/bloco. Troquei as bolas na hora de apresentar o exemplo na lista. Mas a questão é: O modelo que eu quero é realmente o que eu coloquei pra vcs. Se for possível é claro parametrizar de tal forma a obter os parâmetros que eu estou querendo. Valeu Fábio. --- Em sáb, 28/5/11, Fabio Mathias Corrêa <fabio.ufla@yahoo.com.br> escreveu: De: Fabio Mathias Corrêa <fabio.ufla@yahoo.com.br> Assunto: Re: [R-br] Ajuda em modelo misto Para: "r-br@listas.c3sl.ufpr.br" <r-br@listas.c3sl.ufpr.br> Data: Sábado, 28 de Maio de 2011, 12:53 Emmanuel, A variância residual para cada ambiente, vc terá somente se realizar uma análise para cada ambiente separadamente. No seu caso, o usual a se fazer é: Realizar uma análise para cada ambiente, depois realizar a análise conjunta dos ambientes. Desta forma forma vc tem a variância ambiental total e a variância de cada ambiente. Tem outra coisa, o seu modelo esta errado. O certo seria: Ambiente/Bloco = Bloco dentro de Ambiente. (Wilkinson & Rogers, 1973) A notação Bloco/Ambiente, é utilizada pelo Satanic Analysis System. Vc está dizendo ao R que realize a análise de Ambientes dentro de blocos, o que não tem sentido. Valeu!!! Fábio Mathias Corrêa Universidade Estadual de Santa Cruz Departamento de Ciências Exatas e da Terra - DCET Campus Soane Nazaré de Andrade, km 16 Rodovia Ilhéus-Itabuna CEP 45662-900. Ilhéus-Bahia Tel.: 73-3680-5076 De: Emmanuel Arnhold <emmanuelarnhold@yahoo.com.br> Para: R-br <r-br@listas.c3sl.ufpr.br> Enviadas: Sábado, 28 de Maio de 2011 9:28 Assunto: [R-br] Ajuda em modelo misto Ajustei o seguinte modelo misto: ga=interaction(genótipo,ambiente) modelo=lmer(resposta~bloco/ambiente+ambiente+(1|genótipo)+(1|ga)) É um modelo de avaliação de genótipos em vários ambientes. Neste modelo tenho as seguintes variâncias: ga genótipo residual Gostaria que alguém me ajuda-se a ajustar o modelo acima para obter as seguintes variâncias, supondo 3 ambientes: ga genótipo residual (ambiente 1) residual(ambiente 2) residual (ambiente 3) _______________________________________________ R-br mailing list R-br@listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br -----Anexo incorporado----- _______________________________________________ R-br mailing list R-br@listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br
participantes (3)
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Emmanuel Arnhold
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Fabio Mathias Corrêa
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Fernando Henrique Toledo