ANOVA com medidas repetidas no tempo

Olá pessoal, Sou relativamento nova no e R e estou trabalhando em análises com medidas repetidas, porém estou insegura com o código que estou utilizando. Nós trabalhamos com avaliação de desempenho animal em diferentes períodos, sendo que nossas repetições são os animais que são aleatorizados nos tratamento e coletadas as informações em diferentes períodos. Para montar o código utilizei o pacote lme4 considerei como fixos: trat e período , aleatório: animais, ficando desse forma: a1 = lme(desempenho ~ trat * per, random = ~1|animal, method="REML",data=desempenho). Estou no caminho certo? Alguém tem alguma sugestão ? Outra duvida é: como eu indico que esses meus animais é dentro do tratamento? Montei o código para indicar essa questão da seguinte forma: a2= lme(desempenho ~ trat * per, random = ~1|animal/trat, method="REML",data=desempenho). Está certo ou estou seguindo um raciocínio errado? Além disso, como descubro qual a matriz de covariância melhor para os meus dados e onde indico no codigo? No SAS sempre realizamos essa analise para posteriormente fazer a analise de variância. Agradeço desde já, Att, Amanda Martini Mestranda em Produção Animal – Forragicultura Laboratório Pastos e Suplementos
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Amanda Martini