Simbolos pré-definidos em função das linhas de uma tabela
Possuo um conjunto de dados composto por 21 linhas e 3 colunas. Ao importar os dados eu utilizo o comando row.names e atribuo nome as linhas para facilitar a visualização das espécies na pca (no caso utilizo o pacote vegan e uso o comando rda(dados,scale=TRUE) nesse conjunto de dados da linha 1 a 7 são plantas da mesma espécie, de 8 a 14 outra e de 16 a 21 a outra. Como eu faço p atribuir um símbolo único para cada espécie (ex: quadrado, circulo e triângulo) ao plotar um biplot? Muito obrigado. Marcelo Claro de Souza Biólogo, Doutorando em Biologia Vegetal, Depto. de botânica, IBRC- UNESP.16 - 91914780 http://lattes.cnpq.br/5691388412841376
Marcelo, O controle dos símbolos é com o argumento pch= {p}oint {ch}aracter dentro das funções gráficas. Em gráficos de dispersão, basta passar um vetor com os índices que identificam os símbolos. Para conhecer os símbolos faça plot(1:30, pch=1:30) Espero que no biplot() seja assim também. Caso não dê certo, forneça um exemplo reproduzível e destaque o erro para que possamos ajudar. À disposição. Walmes. ========================================================================== Walmes Marques Zeviani LEG (Laboratório de Estatística e Geoinformação, 25.450418 S, 49.231759 W) Departamento de Estatística - Universidade Federal do Paraná fone: (+55) 41 3361 3573 VoIP: (3361 3600) 1053 1173 e-mail: walmes@ufpr.br twitter: @walmeszeviani homepage: http://www.leg.ufpr.br/~walmes linux user number: 531218 ========================================================================== Em 7 de abril de 2011 13:44, Marcelo Claro de Souza < marcelo_claro@yahoo.com.br> escreveu:
Possuo um conjunto de dados composto por 21 linhas e 3 colunas. Ao importar os dados eu utilizo o comando row.names e atribuo nome as linhas para facilitar a visualização das espécies na pca (no caso utilizo o pacote vegan e uso o comando rda(dados,scale=TRUE) nesse conjunto de dados da linha 1 a 7 são plantas da mesma espécie, de 8 a 14 outra e de 16 a 21 a outra. Como eu faço p atribuir um símbolo único para cada espécie (ex: quadrado, circulo e triângulo) ao plotar um biplot? Muito obrigado.
Marcelo Claro de Souza Biólogo, Doutorando em Biologia Vegetal, Depto. de botânica, IBRC- UNESP. 16 - 91914780 http://lattes.cnpq.br/5691388412841376
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Walmes, Eu sou bem novato em R e não entendi direito. No caso eu devo usar da seguinte forma por exemplo: biplot(dados.pca,xlab="pc1",ylab="pc2", pch(1:7,8:14,15:21)) é mais ou menos isso que tenho de fazer? Muito obrigado. Marcelo Claro de Souza Biólogo, Doutorando em Biologia Vegetal, Depto. de botânica, IBRC- UNESP.16 - 91914780 http://lattes.cnpq.br/5691388412841376 --- Em qui, 7/4/11, Walmes Zeviani <walmeszeviani@gmail.com> escreveu: De: Walmes Zeviani <walmeszeviani@gmail.com> Assunto: Re: [R-br] Simbolos pré-definidos em função das linhas de uma tabela Para: r-br@listas.c3sl.ufpr.br Data: Quinta-feira, 7 de Abril de 2011, 14:51 Marcelo, O controle dos símbolos é com o argumento pch= {p}oint {ch}aracter dentro das funções gráficas. Em gráficos de dispersão, basta passar um vetor com os índices que identificam os símbolos. Para conhecer os símbolos faça plot(1:30, pch=1:30) Espero que no biplot() seja assim também. Caso não dê certo, forneça um exemplo reproduzível e destaque o erro para que possamos ajudar. À disposição. Walmes. ========================================================================== Walmes Marques Zeviani LEG (Laboratório de Estatística e Geoinformação, 25.450418 S, 49.231759 W) Departamento de Estatística - Universidade Federal do Paraná fone: (+55) 41 3361 3573 VoIP: (3361 3600) 1053 1173 e-mail: walmes@ufpr.br twitter: @walmeszeviani homepage: http://www.leg.ufpr.br/~walmes linux user number: 531218 ========================================================================== Em 7 de abril de 2011 13:44, Marcelo Claro de Souza <marcelo_claro@yahoo.com.br> escreveu: Possuo um conjunto de dados composto por 21 linhas e 3 colunas. Ao importar os dados eu utilizo o comando row.names e atribuo nome as linhas para facilitar a visualização das espécies na pca (no caso utilizo o pacote vegan e uso o comando rda(dados,scale=TRUE) nesse conjunto de dados da linha 1 a 7 são plantas da mesma espécie, de 8 a 14 outra e de 16 a 21 a outra. Como eu faço p atribuir um símbolo único para cada espécie (ex: quadrado, circulo e triângulo) ao plotar um biplot? Muito obrigado. Marcelo Claro de Souza Biólogo, Doutorando em Biologia Vegetal, Depto. de botânica, IBRC- UNESP. 16 - 91914780 http://lattes.cnpq.br/5691388412841376 _______________________________________________ R-br mailing list R-br@listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br -----Anexo incorporado----- _______________________________________________ R-br mailing list R-br@listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br
Tipo, um numero corresponde um simbulo. Por exemplo 19 é bolinha preta fechada 1 é bolinha com contorno preto e interior branco. digita ?pch ou ?points que vai ter uma parte que fala qual numero faz cada simbulo. então segundo seu exemplo vc deveria fazer algo como: biplot(dados.pca,xlab="pc1",ylab="pc2", pch(rep(19,6),rep(1,6),rep(2,6)) ai no caso repete o valor 19 que é bolinha preta 6 vez que é sua primeira especies e assim vai. a segunda especie vai ser bolinha aberta, que é o numero 1. O vertor tem que ter o mesmo tamanho do numero de pontos que vai ter no grafico, numero de linhas no caso. Acho que é mais ou menos isso :) Em 7 de abril de 2011 22:01, Marcelo Claro de Souza < marcelo_claro@yahoo.com.br> escreveu:
Walmes, Eu sou bem novato em R e não entendi direito. No caso eu devo usar da seguinte forma por exemplo: biplot(dados.pca,xlab="pc1",ylab="pc2", pch(1:7,8:14,15:21)) é mais ou menos isso que tenho de fazer?
Muito obrigado.
Marcelo Claro de Souza Biólogo, Doutorando em Biologia Vegetal, Depto. de botânica, IBRC- UNESP. 16 - 91914780 http://lattes.cnpq.br/5691388412841376
--- Em *qui, 7/4/11, Walmes Zeviani <walmeszeviani@gmail.com>* escreveu:
De: Walmes Zeviani <walmeszeviani@gmail.com> Assunto: Re: [R-br] Simbolos pré-definidos em função das linhas de uma tabela Para: r-br@listas.c3sl.ufpr.br Data: Quinta-feira, 7 de Abril de 2011, 14:51
Marcelo,
O controle dos símbolos é com o argumento pch= {p}oint {ch}aracter dentro das funções gráficas. Em gráficos de dispersão, basta passar um vetor com os índices que identificam os símbolos. Para conhecer os símbolos faça
plot(1:30, pch=1:30)
Espero que no biplot() seja assim também. Caso não dê certo, forneça um exemplo reproduzível e destaque o erro para que possamos ajudar.
À disposição. Walmes.
========================================================================== Walmes Marques Zeviani LEG (Laboratório de Estatística e Geoinformação, 25.450418 S, 49.231759 W) Departamento de Estatística - Universidade Federal do Paraná fone: (+55) 41 3361 3573 VoIP: (3361 3600) 1053 1173 e-mail: walmes@ufpr.br <http://mc/compose?to=walmes@ufpr.br> twitter: @walmeszeviani homepage: http://www.leg.ufpr.br/~walmes linux user number: 531218 ==========================================================================
Em 7 de abril de 2011 13:44, Marcelo Claro de Souza < marcelo_claro@yahoo.com.br<http://mc/compose?to=marcelo_claro@yahoo.com.br>
escreveu:
Possuo um conjunto de dados composto por 21 linhas e 3 colunas. Ao importar os dados eu utilizo o comando row.names e atribuo nome as linhas para facilitar a visualização das espécies na pca (no caso utilizo o pacote vegan e uso o comando rda(dados,scale=TRUE) nesse conjunto de dados da linha 1 a 7 são plantas da mesma espécie, de 8 a 14 outra e de 16 a 21 a outra. Como eu faço p atribuir um símbolo único para cada espécie (ex: quadrado, circulo e triângulo) ao plotar um biplot? Muito obrigado.
Marcelo Claro de Souza Biólogo, Doutorando em Biologia Vegetal, Depto. de botânica, IBRC- UNESP. 16 - 91914780 http://lattes.cnpq.br/5691388412841376
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-- Grato Augusto C. A. Ribas Site Pessoal: http://augustoribas.heliohost.org Lattes: http://lattes.cnpq.br/7355685961127056
Marcelo, Seria isso biplot(dados.pca, xlab="pc1", ylab="pc2", pch=rep(c(19,1,2), each=6)) Espero que dê certo. À disposição. Walmes. ========================================================================== Walmes Marques Zeviani LEG (Laboratório de Estatística e Geoinformação, 25.450418 S, 49.231759 W) Departamento de Estatística - Universidade Federal do Paraná fone: (+55) 41 3361 3573 VoIP: (3361 3600) 1053 1173 e-mail: walmes@ufpr.br twitter: @walmeszeviani homepage: http://www.leg.ufpr.br/~walmes linux user number: 531218 ========================================================================== Em 7 de abril de 2011 23:12, Augusto Ribas <ribas.aca@gmail.com> escreveu:
Tipo, um numero corresponde um simbulo. Por exemplo 19 é bolinha preta fechada 1 é bolinha com contorno preto e interior branco.
digita ?pch ou ?points que vai ter uma parte que fala qual numero faz cada simbulo. então segundo seu exemplo vc deveria fazer algo como:
biplot(dados.pca,xlab="pc1",ylab="pc2", pch(rep(19,6),rep(1,6),rep(2,6))
ai no caso repete o valor 19 que é bolinha preta 6 vez que é sua primeira especies e assim vai. a segunda especie vai ser bolinha aberta, que é o numero 1. O vertor tem que ter o mesmo tamanho do numero de pontos que vai ter no grafico, numero de linhas no caso. Acho que é mais ou menos isso :)
Em 7 de abril de 2011 22:01, Marcelo Claro de Souza < marcelo_claro@yahoo.com.br> escreveu:
Walmes,
Eu sou bem novato em R e não entendi direito. No caso eu devo usar da seguinte forma por exemplo: biplot(dados.pca,xlab="pc1",ylab="pc2", pch(1:7,8:14,15:21)) é mais ou menos isso que tenho de fazer?
Muito obrigado.
Marcelo Claro de Souza Biólogo, Doutorando em Biologia Vegetal, Depto. de botânica, IBRC- UNESP. 16 - 91914780 http://lattes.cnpq.br/5691388412841376
--- Em *qui, 7/4/11, Walmes Zeviani <walmeszeviani@gmail.com>* escreveu:
De: Walmes Zeviani <walmeszeviani@gmail.com> Assunto: Re: [R-br] Simbolos pré-definidos em função das linhas de uma tabela Para: r-br@listas.c3sl.ufpr.br Data: Quinta-feira, 7 de Abril de 2011, 14:51
Marcelo,
O controle dos símbolos é com o argumento pch= {p}oint {ch}aracter dentro das funções gráficas. Em gráficos de dispersão, basta passar um vetor com os índices que identificam os símbolos. Para conhecer os símbolos faça
plot(1:30, pch=1:30)
Espero que no biplot() seja assim também. Caso não dê certo, forneça um exemplo reproduzível e destaque o erro para que possamos ajudar.
À disposição. Walmes.
========================================================================== Walmes Marques Zeviani LEG (Laboratório de Estatística e Geoinformação, 25.450418 S, 49.231759 W) Departamento de Estatística - Universidade Federal do Paraná fone: (+55) 41 3361 3573 VoIP: (3361 3600) 1053 1173 e-mail: walmes@ufpr.br <http://mc/compose?to=walmes@ufpr.br> twitter: @walmeszeviani homepage: http://www.leg.ufpr.br/~walmes linux user number: 531218 ==========================================================================
Em 7 de abril de 2011 13:44, Marcelo Claro de Souza < marcelo_claro@yahoo.com.br<http://mc/compose?to=marcelo_claro@yahoo.com.br>
escreveu:
Possuo um conjunto de dados composto por 21 linhas e 3 colunas. Ao importar os dados eu utilizo o comando row.names e atribuo nome as linhas para facilitar a visualização das espécies na pca (no caso utilizo o pacote vegan e uso o comando rda(dados,scale=TRUE) nesse conjunto de dados da linha 1 a 7 são plantas da mesma espécie, de 8 a 14 outra e de 16 a 21 a outra. Como eu faço p atribuir um símbolo único para cada espécie (ex: quadrado, circulo e triângulo) ao plotar um biplot? Muito obrigado.
Marcelo Claro de Souza Biólogo, Doutorando em Biologia Vegetal, Depto. de botânica, IBRC- UNESP. 16 - 91914780 http://lattes.cnpq.br/5691388412841376
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-- Grato Augusto C. A. Ribas
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