não-convergência glm poisson
Caros, Gostaria de alguma sugestão sobre o que fazer quando um glm (Poisson) não converge. Erros: Mensagens de aviso: 1: glm.fit: algoritmo não convergiu 2: glm.fit: taxas ajustadas numericamente 0 ocorreu Obrigada. Heloise --- Oceanógrafa Heloise Pavanato Julião Pós-graduação em Oceanogra Biológica Instituto de Oceanografia Universidade Federal do Rio Grande
sugiro comecar por uma boa analise descriticva dos seus dados que devem conter um excessivo no de zeros On Wed, 12 Sep 2012, Heloíse Pavanato wrote:
Caros,
Gostaria de alguma sugestão sobre o que fazer quando um glm (Poisson) não converge.
Erros: Mensagens de aviso: 1: glm.fit: algoritmo não convergiu 2: glm.fit: taxas ajustadas numericamente 0 ocorreu
Obrigada.
Heloise
--- Oceanógrafa Heloise Pavanato Julião Pós-graduação em Oceanogra Biológica Instituto de Oceanografia Universidade Federal do Rio Grande
Sim, muitos zeros. Vou começar do começo mesmo.. Obrigada. --- Oceanógrafa Heloise Pavanato Julião Pós-graduação em Oceanografia Instituto de Oceanografia Universidade Federal do Rio Grande Em 12 de setembro de 2012 14:12, Paulo Justiniano <paulojus@leg.ufpr.br>escreveu:
sugiro comecar por uma boa analise descriticva dos seus dados que devem conter um excessivo no de zeros
On Wed, 12 Sep 2012, Heloíse Pavanato wrote:
Caros,
Gostaria de alguma sugestão sobre o que fazer quando um glm (Poisson) não converge.
Erros: Mensagens de aviso: 1: glm.fit: algoritmo não convergiu 2: glm.fit: taxas ajustadas numericamente 0 ocorreu
Obrigada.
Heloise
--- Oceanógrafa Heloise Pavanato Julião Pós-graduação em Oceanogra Biológica Instituto de Oceanografia Universidade Federal do Rio Grande
_______________________________________________ R-br mailing list R-br@listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível.
On 09/12/2012 03:36 PM, Heloíse Pavanato wrote:
Sim, muitos zeros. Vou começar do começo mesmo..
Obrigada.
--- Oceanógrafa Heloise Pavanato Julião Pós-graduação em Oceanografia Instituto de Oceanografia Universidade Federal do Rio Grande
Heloise sem tem muitos zeros não vai convergir... Apesar de muita gente não gostar soma .1 em todos os desfechos e veja o que acontece... []s Tura
Heloise, nesse caso seria bem interessante voce aplicar os modelos com zero inflacionado como por exemplo os zero inflated e o delta log normal. esses dois eu uso bastante para a padronizacao de series de cpue quando a quantidade de zero é elevada. Qual o percentual de zeros em tua amostra? um abraço, ------------------------------------------------ Humberto Hazin Dr. em ciencias do mar Departamento de ciencias animais UFERSA Enviado via iPad Em 13/09/2012, às 17:40, "Bernardo Rangel Tura" <tura@centroin.com.br> escreveu:
On 09/12/2012 03:36 PM, Heloíse Pavanato wrote:
Sim, muitos zeros. Vou começar do começo mesmo..
Obrigada.
--- Oceanógrafa Heloise Pavanato Julião Pós-graduação em Oceanografia Instituto de Oceanografia Universidade Federal do Rio Grande
Heloise sem tem muitos zeros não vai convergir... Apesar de muita gente não gostar soma .1 em todos os desfechos e veja o que acontece...
[]s Tura
_______________________________________________ R-br mailing list R-br@listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível.
Olá, Desculpe a demora em agradecer e responder. Na verdade é um trabalho de uma colega, que estávamos tentando aplicar um glm. A quantidade de zeros é enorme mesmo...corresponde a 95% dos dados. Obrigada Humberto e Tura pelas sugestões. Abc, Heloise Em 13 de setembro de 2012 18:10, Humberto Hazin <hghazin@hotmail.com>escreveu:
Heloise,
nesse caso seria bem interessante voce aplicar os modelos com zero inflacionado como por exemplo os zero inflated e o delta log normal. esses dois eu uso bastante para a padronizacao de series de cpue quando a quantidade de zero é elevada. Qual o percentual de zeros em tua amostra?
um abraço,
------------------------------------------------ Humberto Hazin Dr. em ciencias do mar Departamento de ciencias animais UFERSA
Enviado via iPad
Em 13/09/2012, às 17:40, "Bernardo Rangel Tura" <tura@centroin.com.br> escreveu:
On 09/12/2012 03:36 PM, Heloíse Pavanato wrote:
Sim, muitos zeros. Vou começar do começo mesmo..
Obrigada.
--- Oceanógrafa Heloise Pavanato Julião Pós-graduação em Oceanografia Instituto de Oceanografia Universidade Federal do Rio Grande
Heloise sem tem muitos zeros não vai convergir... Apesar de muita gente não gostar soma .1 em todos os desfechos e veja o que acontece...
[]s Tura
_______________________________________________ R-br mailing list R-br@listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível.
R-br mailing list R-br@listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível.
ola heloise, mesmo com essa quantidade de zeros os modelos de zero inflacionados como o ZINB, ZIP, DELTA LOGNORMAL.... funcionam, contudo deve-se tomar os cuidados tradicionais. peça para essa sua amiga fazer o teste. a library que uso é a pscl, porém existem outras que vc pode usar. existe um livro muito bom com aplicações dos zero inflated com o R que é Zero Inflated Models and Generalized Linear Mixed Models with R. Zuur, Saveliev, Ieno. (2012) um abraço ----------------------------------------------------------------------------------------------------- Dr. Humberto Hazin Laboratório de manejo e conservação de recursos pesqueiros e Inovações tecnológicas sustentáveis (LACITES) Departamento de Ciências Animais/UFERSA ----------------------------------------------------------------------------------------------------- Em 15/09/2012, às 09:56, "Heloíse Pavanato" <helopavanato@gmail.com> escreveu:
Olá,
Desculpe a demora em agradecer e responder.
Na verdade é um trabalho de uma colega, que estávamos tentando aplicar um glm. A quantidade de zeros é enorme mesmo...corresponde a 95% dos dados.
Obrigada Humberto e Tura pelas sugestões.
Abc, Heloise
Em 13 de setembro de 2012 18:10, Humberto Hazin <hghazin@hotmail.com> escreveu: Heloise,
nesse caso seria bem interessante voce aplicar os modelos com zero inflacionado como por exemplo os zero inflated e o delta log normal. esses dois eu uso bastante para a padronizacao de series de cpue quando a quantidade de zero é elevada. Qual o percentual de zeros em tua amostra?
um abraço,
------------------------------------------------ Humberto Hazin Dr. em ciencias do mar Departamento de ciencias animais UFERSA
Enviado via iPad
Em 13/09/2012, às 17:40, "Bernardo Rangel Tura" <tura@centroin.com.br> escreveu:
On 09/12/2012 03:36 PM, Heloíse Pavanato wrote:
Sim, muitos zeros. Vou começar do começo mesmo..
Obrigada.
--- Oceanógrafa Heloise Pavanato Julião Pós-graduação em Oceanografia Instituto de Oceanografia Universidade Federal do Rio Grande
Heloise sem tem muitos zeros não vai convergir... Apesar de muita gente não gostar soma .1 em todos os desfechos e veja o que acontece...
[]s Tura
_______________________________________________ R-br mailing list R-br@listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível.
R-br mailing list R-br@listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível.
_______________________________________________ R-br mailing list R-br@listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível.
_______________________________________________ R-br mailing list R-br@listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível.
Humberto, muito obrigada. Vou repassar todas as sugestões. Um abraço, Heloise Em 15 de setembro de 2012 10:06, Humberto Hazin <hghazin@hotmail.com>escreveu:
ola heloise,
mesmo com essa quantidade de zeros os modelos de zero inflacionados como o ZINB, ZIP, DELTA LOGNORMAL.... funcionam, contudo deve-se tomar os cuidados tradicionais. peça para essa sua amiga fazer o teste. a library que uso é a pscl, porém existem outras que vc pode usar.
existe um livro muito bom com aplicações dos zero inflated com o R que é Zero Inflated Models and Generalized Linear Mixed Models with R. Zuur, Saveliev, Ieno. (2012)
um abraço
----------------------------------------------------------------------------------------------------- Dr. Humberto Hazin Laboratório de manejo e conservação de recursos pesqueiros e Inovações tecnológicas sustentáveis (LACITES) Departamento de Ciências Animais/UFERSA
-----------------------------------------------------------------------------------------------------
Em 15/09/2012, às 09:56, "Heloíse Pavanato" <helopavanato@gmail.com> escreveu:
Olá,
Desculpe a demora em agradecer e responder.
Na verdade é um trabalho de uma colega, que estávamos tentando aplicar um glm. A quantidade de zeros é enorme mesmo...corresponde a 95% dos dados.
Obrigada Humberto e Tura pelas sugestões.
Abc, Heloise
Em 13 de setembro de 2012 18:10, Humberto Hazin <hghazin@hotmail.com>escreveu:
Heloise,
nesse caso seria bem interessante voce aplicar os modelos com zero inflacionado como por exemplo os zero inflated e o delta log normal. esses dois eu uso bastante para a padronizacao de series de cpue quando a quantidade de zero é elevada. Qual o percentual de zeros em tua amostra?
um abraço,
------------------------------------------------ Humberto Hazin Dr. em ciencias do mar Departamento de ciencias animais UFERSA
Enviado via iPad
Em 13/09/2012, às 17:40, "Bernardo Rangel Tura" <tura@centroin.com.br> escreveu:
On 09/12/2012 03:36 PM, Heloíse Pavanato wrote:
Sim, muitos zeros. Vou começar do começo mesmo..
Obrigada.
--- Oceanógrafa Heloise Pavanato Julião Pós-graduação em Oceanografia Instituto de Oceanografia Universidade Federal do Rio Grande
Heloise sem tem muitos zeros não vai convergir... Apesar de muita gente não gostar soma .1 em todos os desfechos e veja o que acontece...
[]s Tura
_______________________________________________ R-br mailing list R-br@listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível.
R-br mailing list R-br@listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível.
_______________________________________________ R-br mailing list R-br@listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível.
_______________________________________________ R-br mailing list R-br@listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível.
participantes (4)
-
Bernardo Rangel Tura -
Heloíse Pavanato -
Humberto Hazin -
Paulo Justiniano