Erro ao fazer a leitura de arquivos shapefiles.
Boa tarde a todos! Estou tentando realizar a leitura de arquivos shapefiles usando o maptools. O código que estou usando é: Loading required package: sp
require(maptools) Carregando pacotes exigidos: maptools Checking rgeos availability: TRUE library("sp", lib="/home/est/paulojus/R-lib/") library("maptools", lib="/home/est/paulojus/R-lib/") rs <- readShapePoly("43MUE250GC_SIR") Shapefile type: PolygonM (25), # of Shapes: 498
____________________ A mensagem de erro é: Erro em read.shape(filen = fn, verbose = verbose, repair = repair) : Shapefile type not (yet) handled by this function Alguém pode ajudar! Abraço e muito obrigado. -- Prof. Dr. Rudiney Soares Pereira UFSM - CCR - DER RS 509 KM 9 - Campus Universitário 97.105-900 Santa Maria RS Brasil site: http://www.ufsm.br/geosere skype: rudiney.s.pereira msn: rudiney.s.pereira@hotmail.com gtalk: rudiney.s.pereira@gmail.com fone: 55 3220-9468 55 9118-4142
Prezado Rudiney, boa tarde! O erro se deve à incompatibilidade do pacote maptools() com shapefiles do tipo "M". O artigo do Wikipedia disponível em < http://en.wikipedia.org/wiki/Shapefile> fala mais sobre tipos de shapefile. O problema é relatado no link < http://r-sig-geo.2731867.n2.nabble.com/Shapefile-Compatibility-td6616948.html#none> e uma sugestão é usar rgdal::readOGR() pra ler o shape. No link tem exemplo de código. Usando o rgdal vão aparecer mensagens de erro, pois parte do conteúdo será perdido, preservando apenas as informações planimétricas (2D). Éder Comunello <c <comunello.eder@gmail.com>omunello.eder@gmail.com> Dourados, MS - [22 16.5'S, 54 49'W] Em 20 de novembro de 2013 13:28, Rudiney S Pereira < rudiney.s.pereira@gmail.com> escreveu:
Boa tarde a todos!
Estou tentando realizar a leitura de arquivos shapefiles usando o maptools. O código que estou usando é:
Loading required package: sp
require(maptools) Carregando pacotes exigidos: maptools Checking rgeos availability: TRUE library("sp", lib="/home/est/paulojus/R-lib/") library("maptools", lib="/home/est/paulojus/R-lib/") rs <- readShapePoly("43MUE250GC_SIR") Shapefile type: PolygonM (25), # of Shapes: 498
____________________ A mensagem de erro é:
Erro em read.shape(filen = fn, verbose = verbose, repair = repair) : Shapefile type not (yet) handled by this function
Alguém pode ajudar! Abraço e muito obrigado. -- Prof. Dr. Rudiney Soares Pereira UFSM - CCR - DER RS 509 KM 9 - Campus Universitário 97.105-900 Santa Maria RS Brasil site: http://www.ufsm.br/geosere skype: rudiney.s.pereira msn: rudiney.s.pereira@hotmail.com gtalk: rudiney.s.pereira@gmail.com fone: 55 3220-9468 55 9118-4142
_______________________________________________ R-br mailing list R-br@listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível.
Complementando... Outras mensagens com o mesmo problema na R-br: < http://r-br.2285057.n4.nabble.com/template/NamlServlet.jtp?macro=search_page...
Éder Comunello <c <comunello.eder@gmail.com>omunello.eder@gmail.com> Dourados, MS - [22 16.5'S, 54 49'W]
Estou tentando instalar o pacote "rgdal" mas estou com as seguintes mensagens, alguma ajuda? Obrigado desde já.
update.packages(ask=FALSE, checkBuilt=TRUE) Aviso: package 'colorspace' in library '/usr/lib/R/site-library' will not be updated Aviso: package 'gam' in library '/usr/lib/R/site-library' will not be updated Aviso: package 'ggplot2' in library '/usr/lib/R/site-library' will not be updated Aviso: package 'maps' in library '/usr/lib/R/site-library' will not be updated Aviso: package 'maptools' in library '/usr/lib/R/site-library' will not be updated Aviso: package 'MNP' in library '/usr/lib/R/site-library' will not be updated Aviso: package 'msm' in library '/usr/lib/R/site-library' will not be updated Aviso: package 'multcomp' in library '/usr/lib/R/site-library' will not be updated Aviso: package 'plotrix' in library '/usr/lib/R/site-library' will not be updated Aviso: package 'RcppEigen' in library '/usr/lib/R/site-library' will not be updated Aviso: package 'RSQLite' in library '/usr/lib/R/site-library' will not be updated Aviso: package 'scatterplot3d' in library '/usr/lib/R/site-library' will not be updated Aviso: package 'sp' in library '/usr/lib/R/site-library' will not be updated Aviso: package 'vcd' in library '/usr/lib/R/site-library' will not be updated Aviso: package 'nlme' in library '/usr/lib/R/library' will not be updated tentando a URL 'http://cran-r.c3sl.ufpr.br/src/contrib/polyclip_1.2-0.tar.gz ' Content type 'application/x-gzip' length 66542 bytes (64 Kb) URL aberta ================================================== downloaded 64 Kb
* installing *source* package ‘polyclip’ ... ** package ‘polyclip’ successfully unpacked and MD5 sums checked checking whether the C++ compiler works... yes checking for C++ compiler default output file name... a.out checking for suffix of executables... checking whether we are cross compiling... no checking for suffix of object files... o checking whether we are using the GNU C++ compiler... yes checking whether g++ accepts -g... yes checking for int64_t... yes In src/clipper.h, signed 64-bit integers (long64) will be declared as 'int64_t' checking for uint64_t... yes In src/clipper.h, unsigned 64-bit integers (ulong64) will be declared as 'uint64_t' configure: creating ./config.status config.status: creating src/Makevars ** libs g++ -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -DPOLYCLIP_LONG64="int64_t" -DPOLYCLIP_ULONG64="uint64_t" -fpic -O3 -pipe -g -c clipper.cpp -o clipper.o g++ -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -DPOLYCLIP_LONG64="int64_t" -DPOLYCLIP_ULONG64="uint64_t" -fpic -O3 -pipe -g -c interface.cpp -o interface.o g++ -shared -o polyclip.so clipper.o interface.o -L/usr/lib/R/lib -lR installing to /home/rudiney/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.0/polyclip/libs ** R ** byte-compile and prepare package for lazy loading ** help *** installing help indices ** building package indices ** testing if installed package can be loaded * DONE (polyclip) The downloaded source packages are in ‘/tmp/RtmpCLMqbZ/downloaded_packages’
install.packages("rgdal",dependencies=TRUE) Installing package into ‘/home/rudiney/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.0’ (as ‘lib’ is unspecified) tentando a URL 'http://cran-r.c3sl.ufpr.br/src/contrib/rgdal_0.8-12.tar.gz' Content type 'application/x-gzip' length 1579918 bytes (1.5 Mb) URL aberta ================================================== downloaded 1.5 Mb
* installing *source* package ‘rgdal’ ... ** package ‘rgdal’ successfully unpacked and MD5 sums checked configure: CC: gcc -std=gnu99 configure: CXX: g++ configure: rgdal: 0.8-10 checking for /usr/bin/svnversion... no configure: svn revision: 492 configure: gdal-config: gdal-config checking gdal-config usability... yes configure: GDAL: 1.9.0 checking GDAL version >= 1.6.3... yes checking for gcc... gcc -std=gnu99 checking for C compiler default output file name... a.out checking whether the C compiler works... yes checking whether we are cross compiling... no checking for suffix of executables... checking for suffix of object files... o checking whether we are using the GNU C compiler... yes checking whether gcc -std=gnu99 accepts -g... yes checking for gcc -std=gnu99 option to accept ANSI C... none needed checking how to run the C preprocessor... gcc -std=gnu99 -E checking for egrep... grep -E checking for ANSI C header files... yes checking for sys/types.h... yes checking for sys/stat.h... yes checking for stdlib.h... yes checking for string.h... yes checking for memory.h... yes checking for strings.h... yes checking for inttypes.h... yes checking for stdint.h... yes checking for unistd.h... yes checking gdal.h usability... yes checking gdal.h presence... yes checking for gdal.h... yes checking gdal: linking with --libs only... yes checking GDAL: /usr/share/gdal/1.9/pcs.csv readable... yes checking proj_api.h usability... no checking proj_api.h presence... no checking for proj_api.h... no configure: error: proj_api.h not found in standard or given locations. ERROR: configuration failed for package ‘rgdal’ * removing ‘/home/rudiney/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.0/rgdal’ The downloaded source packages are in ‘/tmp/RtmpCLMqbZ/downloaded_packages’ Mensagens de aviso perdidas: In install.packages("rgdal", dependencies = TRUE) : installation of package ‘rgdal’ had non-zero exit status
Atenciosamente, Em 20 de novembro de 2013 17:30, Éder Comunello <comunello.eder@gmail.com>escreveu:
Prezado Rudiney, boa tarde!
O erro se deve à incompatibilidade do pacote maptools() com shapefiles do tipo "M". O artigo do Wikipedia disponível em < http://en.wikipedia.org/wiki/Shapefile> fala mais sobre tipos de shapefile.
O problema é relatado no link < http://r-sig-geo.2731867.n2.nabble.com/Shapefile-Compatibility-td6616948.html#none> e uma sugestão é usar rgdal::readOGR() pra ler o shape. No link tem exemplo de código.
Usando o rgdal vão aparecer mensagens de erro, pois parte do conteúdo será perdido, preservando apenas as informações planimétricas (2D).
Éder Comunello <c <comunello.eder@gmail.com>omunello.eder@gmail.com> Dourados, MS - [22 16.5'S, 54 49'W]
Em 20 de novembro de 2013 13:28, Rudiney S Pereira < rudiney.s.pereira@gmail.com> escreveu:
Boa tarde a todos!
Estou tentando realizar a leitura de arquivos shapefiles usando o maptools. O código que estou usando é:
Loading required package: sp
require(maptools) Carregando pacotes exigidos: maptools Checking rgeos availability: TRUE library("sp", lib="/home/est/paulojus/R-lib/") library("maptools", lib="/home/est/paulojus/R-lib/") rs <- readShapePoly("43MUE250GC_SIR") Shapefile type: PolygonM (25), # of Shapes: 498
____________________ A mensagem de erro é:
Erro em read.shape(filen = fn, verbose = verbose, repair = repair) : Shapefile type not (yet) handled by this function
Alguém pode ajudar! Abraço e muito obrigado. -- Prof. Dr. Rudiney Soares Pereira UFSM - CCR - DER RS 509 KM 9 - Campus Universitário 97.105-900 Santa Maria RS Brasil site: http://www.ufsm.br/geosere skype: rudiney.s.pereira msn: rudiney.s.pereira@hotmail.com gtalk: rudiney.s.pereira@gmail.com fone: 55 3220-9468 55 9118-4142
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_______________________________________________ R-br mailing list R-br@listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível.
-- Prof. Dr. Rudiney Soares Pereira UFSM - CCR - DER RS 509 KM 9 - Campus Universitário 97.105-900 Santa Maria RS Brasil site: http://www.ufsm.br/geosere skype: rudiney.s.pereira msn: rudiney.s.pereira@hotmail.com gtalk: rudiney.s.pereira@gmail.com fone: 55 3220-9468 55 9118-4142
On Thu, Nov 21, 2013 at 09:38:03AM -0200, Rudiney S Pereira wrote:
Estou tentando instalar o pacote "rgdal" mas estou com as seguintes mensagens, alguma ajuda? Obrigado desde já.
update.packages(ask=FALSE, checkBuilt=TRUE)
[...]
checking for proj_api.h... no configure: error: proj_api.h not found in standard or given locations. ERROR: configuration failed for package ‘rgdal’ * removing ‘/home/rudiney/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.0/rgdal’
A mensagem acima diz que o arquivo proj_api.h não foi encontrado. A solução genérica para problemas desse tipo encontrados pelo script "configure" (no caso, executado pelo R) é instalar o software que inclua o arquivo em questão. No caso do Debian/Ubuntu ou distribuição Linux derivada de uma dessas duas, o seguinte procedimento deve resolver o problema: 1. Acessar o site: http://packages.debian.org ou http://packages.ubuntu.com 2. Procurar a seção "Search the contents of packages". 3. Digitar na caixa de pesquisa o nome do arquivo procurado. Neste caso: proj_api.h O resultado será: File Packages /usr/include/proj_api.h libproj-dev 4. Instalar o pacote que inclui o arquivo. Neste caso: sudo apt-get install libproj-dev -- Jakson Alves de Aquino Universidade Federal do Ceará Departamento de Ciências Sociais www.lepem.ufc.br/aquino.php
Resolvido o problema de carga/instalação da rgdal. Muito obrigado Jakson! Abraço! Em 21 de novembro de 2013 14:30, Jakson Alves de Aquino <jalvesaq@gmail.com>escreveu:
On Thu, Nov 21, 2013 at 09:38:03AM -0200, Rudiney S Pereira wrote:
Estou tentando instalar o pacote "rgdal" mas estou com as seguintes mensagens, alguma ajuda? Obrigado desde já.
update.packages(ask=FALSE, checkBuilt=TRUE)
[...]
checking for proj_api.h... no configure: error: proj_api.h not found in standard or given locations. ERROR: configuration failed for package ‘rgdal’ * removing ‘/home/rudiney/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.0/rgdal’
A mensagem acima diz que o arquivo proj_api.h não foi encontrado. A solução genérica para problemas desse tipo encontrados pelo script "configure" (no caso, executado pelo R) é instalar o software que inclua o arquivo em questão. No caso do Debian/Ubuntu ou distribuição Linux derivada de uma dessas duas, o seguinte procedimento deve resolver o problema:
1. Acessar o site: http://packages.debian.org ou http://packages.ubuntu.com
2. Procurar a seção "Search the contents of packages".
3. Digitar na caixa de pesquisa o nome do arquivo procurado. Neste caso: proj_api.h
O resultado será:
File Packages /usr/include/proj_api.h libproj-dev
4. Instalar o pacote que inclui o arquivo. Neste caso:
sudo apt-get install libproj-dev
-- Jakson Alves de Aquino Universidade Federal do Ceará Departamento de Ciências Sociais www.lepem.ufc.br/aquino.php _______________________________________________ R-br mailing list R-br@listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível.
-- Prof. Dr. Rudiney Soares Pereira UFSM - CCR - DER RS 509 KM 9 - Campus Universitário 97.105-900 Santa Maria RS Brasil site: http://www.ufsm.br/geosere skype: rudiney.s.pereira msn: rudiney.s.pereira@hotmail.com gtalk: rudiney.s.pereira@gmail.com fone: 55 3220-9468 55 9118-4142
pessoal esto com uma duvida esto querendo plotar dois círculos usando o comando a baixo porem o comando não funciona para esse tipo de plot. pacote {rgl} open3d() plot3d(x1, box=F)par(new=T) ### não funciona!!!!plot3d(x2, box=F) sendo x1 e x2 são matrizes de mesmas dimensões. quero apenas apenas fazer na mesma janela plotar dois ou mais círculos. Carlos Pereira da Silva Bacharel em Estatística – UEPB Mestrando em Estatística e Experimentação Agropecuária - UFLA Lavras - MG Cel: 035 - 9119 - 2245 Email: ccpsilva81@hotmail.com __________________________________________ Tenha Um Dia Abençoado Por DEUS!!! Sl – 34, 8
Boa Tarde Carlos! Não entendi muito bem... Você quer no mesmo gráfico que aparecam x1 e x2, "Sobrepostos"? Se sim, teste: pacote {rgl} open3d() plot3d(x1, box=F) points3d(x2, box=F) 2013/11/22 Carlos Pereira <ccpsilva81@hotmail.com>
pessoal esto com uma duvida esto querendo plotar dois círculos usando o comando a baixo porem o comando não funciona para esse tipo de plot.
pacote {rgl}
open3d()
plot3d(x1, box=F) par(new=T) ### não funciona!!!! plot3d(x2, box=F)
sendo x1 e x2 são matrizes de mesmas dimensões. quero apenas apenas fazer na mesma janela plotar dois ou mais círculos.
Carlos Pereira da Silva Bacharel em Estatística – UEPB
Mestrando em Estatística e Experimentação Agropecuária - UFLA Lavras - MG Cel: 035 - 9119 - 2245 Email: ccpsilva81@hotmail.com __________________________________________
*Tenha Um Dia Abençoado Por DEUS!!!* * Sl – 34, 8*
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-- Atenciosamente, Deisy Morselli Gysi Bacharel em Biotecnologia Bacharel em Estatística
Obrigado por sua ajuda e desculpa por não ter sido mais claro na realidade estou tentando sobrepor 5 conjunto de dados para uma analise, mais não estou conseguindo ver uma forma de fazer isso como em gráficos em plot(X,Y) que pode-se fazer a junção. Carlos Pereira da Silva Bacharel em Estatística – UEPB Mestrando em Estatística e Experimentação Agropecuária - UFLA Lavras - MG Cel: 035 - 9119 - 2245 Email: ccpsilva81@hotmail.com __________________________________________ Tenha Um Dia Abençoado Por DEUS!!! Sl – 34, 8 From: deisygysi@gmail.com Date: Fri, 22 Nov 2013 16:52:10 -0200 To: r-br@listas.c3sl.ufpr.br Subject: Re: [R-br] Plot 3d Boa Tarde Carlos! Não entendi muito bem... Você quer no mesmo gráfico que aparecam x1 e x2, "Sobrepostos"? Se sim, teste: pacote {rgl} open3d() plot3d(x1, box=F)points3d(x2, box=F) 2013/11/22 Carlos Pereira <ccpsilva81@hotmail.com> pessoal esto com uma duvida esto querendo plotar dois círculos usando o comando a baixo porem o comando não funciona para esse tipo de plot. pacote {rgl} open3d() plot3d(x1, box=F)par(new=T) ### não funciona!!!!plot3d(x2, box=F) sendo x1 e x2 são matrizes de mesmas dimensões. quero apenas apenas fazer na mesma janela plotar dois ou mais círculos. Carlos Pereira da Silva Bacharel em Estatística – UEPB Mestrando em Estatística e Experimentação Agropecuária - UFLA Lavras - MG Cel: 035 - 9119 - 2245 Email: ccpsilva81@hotmail.com __________________________________________ Tenha Um Dia Abençoado Por DEUS!!! Sl – 34, 8 _______________________________________________ R-br mailing list R-br@listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível. -- Atenciosamente, Deisy Morselli Gysi Bacharel em Biotecnologia Bacharel em Estatística _______________________________________________ R-br mailing list R-br@listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forne�a c�digo m�nimo reproduz�vel.
participantes (5)
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Jakson Alves de Aquino -
Rudiney S Pereira -
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