Leitura de range de aba de arquivo xlsx Excell no R
Bom dia Pessoal, Estou tentando ler dados de uma planilha Excel com muitas abas, trabalhando com RStudio no Mac. Dei os seguintes comandos:
install.packages("XLConnect") trying URL ' https://cran.rstudio.com/bin/macosx/mavericks/contrib/3.3/XLConnect_0.2-12.t... ' Content type 'application/x-gzip' length 5546911 bytes (5.3 MB) ================================================== downloaded 5.3 MB
tar: Failed to set default locale The downloaded binary packages are in /var/folders/_4/f5_n3z0x24nc08f5whq81nl80000gn/T//RtmpxbUYbW/downloaded_packages
library(XLConnect) Loading required package: XLConnectJars JavaVM: requested Java version ((null)) not available. Using Java at "" instead. JavaVM: Failed to load JVM: /bundle/Libraries/libserver.dylib JavaVM FATAL: Failed to load the jvm library. Error : .onLoad failed in loadNamespace() for 'XLConnectJars', details: call: .jinit() error: JNI_GetCreatedJavaVMs returned -1
Error: package 'XLConnectJars' could not be loaded Ou seja o XLConnect instala mas a library dá problema. Alguém teria alguma orientação? Obrigado, Maurício
Maurício, sugiro testar a função excel_sheets() do pacote readxl que não tem dependências externas. Para ler arquivos xls ou xlsx read_excel(). Att. On Tue, Aug 30, 2016 at 9:45 PM, Maurício Cunha via R-br < r-br@listas.c3sl.ufpr.br> wrote:
Bom dia Pessoal,
Estou tentando ler dados de uma planilha Excel com muitas abas, trabalhando com RStudio no Mac.
Dei os seguintes comandos:
install.packages("XLConnect") trying URL 'https://cran.rstudio.com/bin/macosx/mavericks/contrib/3.3/ XLConnect_0.2-12.tgz' Content type 'application/x-gzip' length 5546911 bytes (5.3 MB) ================================================== downloaded 5.3 MB
tar: Failed to set default locale The downloaded binary packages are in /var/folders/_4/f5_n3z0x24nc08f5whq81nl80000gn/T//RtmpxbUYbW/downloaded_ packages
library(XLConnect) Loading required package: XLConnectJars JavaVM: requested Java version ((null)) not available. Using Java at "" instead. JavaVM: Failed to load JVM: /bundle/Libraries/libserver.dylib JavaVM FATAL: Failed to load the jvm library. Error : .onLoad failed in loadNamespace() for 'XLConnectJars', details: call: .jinit() error: JNI_GetCreatedJavaVMs returned -1
Error: package 'XLConnectJars' could not be loaded
Ou seja o XLConnect instala mas a library dá problema. Alguém teria alguma orientação?
Obrigado,
Maurício
_______________________________________________ R-br mailing list R-br@listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível.
-- ############################################################### ## Jônatan Dupont Tatsch ## Professor do Departamento de Física ## Centro de Ciências Exatas e Naturais (CCNE) ## Universidade Federal de Santa Maria - UFSM ## Faixa de Camobi, Prédio 13 - Campus UFSM - Santa Maria, RS, Brasil - 97105-900 ## Telefone: +55(55)33012083 ## www.ufsm.br/meteorologia ###############################################################
Mauricio, Eu também enfrento esse problema sempre que atualizo a VM do Java no meu Mac. O problema parece acontecer porque o RStudio não consegue encontrar a biblioteca do Java aonde ela deveria estar no OS X El Capitan. O que funciona pra mim nesse caso é criar um link simbólico, digitando o seguinte comando no terminal: sudo ln -s $(/usr/libexec/java_home)/jre/lib/server/libjvm.dylib /usr/local/lib Em seguida, vale a pena reconfigurar o java no R (também em linha de comando): sudo R CMD javareconf -n Finalmente, eu recomendo que você remova o pacote XLConnectJars e reinstale-o usando o código fonte: install.packages("XLConnectJars", type='source') Deve funcionar. Greetings, -- Thiago V. dos Santos PhD student Land and Atmospheric Science University of Minnesota On Tuesday, August 30, 2016 10:48 PM, Jônatan via R-br <r-br@listas.c3sl.ufpr.br> wrote: Maurício, sugiro testar a função excel_sheets() do pacote readxl que não tem dependências externas. Para ler arquivos xls ou xlsx read_excel(). Att. On Tue, Aug 30, 2016 at 9:45 PM, Maurício Cunha via R-br <r-br@listas.c3sl.ufpr.br> wrote: Bom dia Pessoal,
Estou tentando ler dados de uma planilha Excel com muitas abas, trabalhando com RStudio no Mac.
Dei os seguintes comandos:
install.packages("XLConnect") trying URL 'https://cran.rstudio.com/bin/ macosx/mavericks/contrib/3.3/ XLConnect_0.2-12.tgz' Content type 'application/x-gzip' length 5546911 bytes (5.3 MB) ============================== ==================== downloaded 5.3 MB
tar: Failed to set default locale The downloaded binary packages are in /var/folders/_4/f5_ n3z0x24nc08f5whq81nl80000gn/T/ /RtmpxbUYbW/downloaded_ packages
library(XLConnect) Loading required package: XLConnectJars JavaVM: requested Java version ((null)) not available. Using Java at "" instead. JavaVM: Failed to load JVM: /bundle/Libraries/libserver. dylib JavaVM FATAL: Failed to load the jvm library. Error : .onLoad failed in loadNamespace() for 'XLConnectJars', details: call: .jinit() error: JNI_GetCreatedJavaVMs returned -1
Error: package 'XLConnectJars' could not be loaded
Ou seja o XLConnect instala mas a library dá problema.Alguém teria alguma orientação?
Obrigado,
Maurício ______________________________ _________________ R-br mailing list R-br@listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/ cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br- guia) e forneça código mínimo reproduzível.
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Tem um detalhe referente a Java, odbc e similares no Windows. Se seu R for x64, estes também devem ser. Em 31 de ago de 2016 11:03, "Thiago V. dos Santos via R-br" < r-br@listas.c3sl.ufpr.br> escreveu:
Mauricio,
Eu também enfrento esse problema sempre que atualizo a VM do Java no meu Mac. O problema parece acontecer porque o RStudio não consegue encontrar a biblioteca do Java aonde ela deveria estar no OS X El Capitan. O que funciona pra mim nesse caso é criar um link simbólico, digitando o seguinte comando no terminal:
sudo ln -s $(/usr/libexec/java_home)/jre/lib/server/libjvm.dylib /usr/local/lib
Em seguida, vale a pena reconfigurar o java no R (também em linha de comando):
sudo R CMD javareconf -n
Finalmente, eu recomendo que você remova o pacote XLConnectJars e reinstale-o usando o código fonte:
install.packages("XLConnectJars", type='source')
Deve funcionar. Greetings, -- Thiago V. dos Santos
PhD student Land and Atmospheric Science University of Minnesota
On Tuesday, August 30, 2016 10:48 PM, Jônatan via R-br < r-br@listas.c3sl.ufpr.br> wrote:
Maurício, sugiro testar a função excel_sheets() do pacote readxl que não tem dependências externas. Para ler arquivos xls ou xlsx read_excel(). Att.
On Tue, Aug 30, 2016 at 9:45 PM, Maurício Cunha via R-br < r-br@listas.c3sl.ufpr.br> wrote:
Bom dia Pessoal,
Estou tentando ler dados de uma planilha Excel com muitas abas,
trabalhando com RStudio no Mac.
Dei os seguintes comandos:
install.packages("XLConnect") trying URL 'https://cran.rstudio.com/bin/ macosx/mavericks/contrib/3.3/
XLConnect_0.2-12.tgz'
Content type 'application/x-gzip' length 5546911 bytes (5.3 MB) ============================== ==================== downloaded 5.3 MB
tar: Failed to set default locale The downloaded binary packages are in /var/folders/_4/f5_ n3z0x24nc08f5whq81nl80000gn/T/ /RtmpxbUYbW/downloaded_ packages
library(XLConnect) Loading required package: XLConnectJars JavaVM: requested Java version ((null)) not available. Using Java at "" instead. JavaVM: Failed to load JVM: /bundle/Libraries/libserver. dylib JavaVM FATAL: Failed to load the jvm library. Error : .onLoad failed in loadNamespace() for 'XLConnectJars', details: call: .jinit() error: JNI_GetCreatedJavaVMs returned -1
Error: package 'XLConnectJars' could not be loaded
Ou seja o XLConnect instala mas a library dá problema.Alguém teria alguma orientação?
Obrigado,
Maurício ______________________________ _________________ R-br mailing list R-br@listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/ cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br- guia) e forneça código mínimo reproduzível.
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## Telefone: +55(55)33012083
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participantes (4)
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Jônatan -
Leonard Assis -
Maurício Cunha -
Thiago V. dos Santos