
Bom dia a todos. A algum tempo venho tentando instalar o pacote 'smida' [um pacote com as técnicas e os dados descritos no livro Statistics for Microarrays]. Porém, quando vou instalá-lo, a seguinte mensagem de erro aparece: ERROR: dependencies ‘mva’, ‘modreg’ are not available for package ‘smida’ Esses dois pacotes não existem mais, a partir do R1.9 do pacote 'stats' substitui ambos [informação contida no site do livro]. Alguém teria alguma ideia de como conseguir instalar esse pacote? Pois achei que o R iria reconhecer essas duas dependências faltantes como o pacote 'stats'. Desde já agradeço. Atenciosamente, Rafael Cunha -- YNWA

os autores, aparentemente, ja' resolveram isso: http://www.math.rug.nl/~ernst/book/smida.html entretanto, ele (o pacote) nao e' parte da pratica comum para analise de microarranjos... o que exatamente vc precisa fazer? b 2011/4/7 Rafael Garcia Cunha <rafareds@gmail.com>:
Bom dia a todos. A algum tempo venho tentando instalar o pacote 'smida' [um pacote com as técnicas e os dados descritos no livro Statistics for Microarrays]. Porém, quando vou instalá-lo, a seguinte mensagem de erro aparece: ERROR: dependencies ‘mva’, ‘modreg’ are not available for package ‘smida’ Esses dois pacotes não existem mais, a partir do R1.9 do pacote 'stats' substitui ambos [informação contida no site do livro]. Alguém teria alguma ideia de como conseguir instalar esse pacote? Pois achei que o R iria reconhecer essas duas dependências faltantes como o pacote 'stats'. Desde já agradeço. Atenciosamente, Rafael Cunha
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olhando o historico... tudo indica q vc vai ter problemas tbm com a versao "atualizada".... imagino que a melhor solucao seja usar os pacotes que mantemos no BioConductor... se vc precisar de uma analise basica de arranjos de 2 cores, comece a ler o manual do limma. b 2011/4/7 Benilton Carvalho <beniltoncarvalho@gmail.com>:
os autores, aparentemente, ja' resolveram isso:
http://www.math.rug.nl/~ernst/book/smida.html
entretanto, ele (o pacote) nao e' parte da pratica comum para analise de microarranjos... o que exatamente vc precisa fazer?
b
2011/4/7 Rafael Garcia Cunha <rafareds@gmail.com>:
Bom dia a todos. A algum tempo venho tentando instalar o pacote 'smida' [um pacote com as técnicas e os dados descritos no livro Statistics for Microarrays]. Porém, quando vou instalá-lo, a seguinte mensagem de erro aparece: ERROR: dependencies ‘mva’, ‘modreg’ are not available for package ‘smida’ Esses dois pacotes não existem mais, a partir do R1.9 do pacote 'stats' substitui ambos [informação contida no site do livro]. Alguém teria alguma ideia de como conseguir instalar esse pacote? Pois achei que o R iria reconhecer essas duas dependências faltantes como o pacote 'stats'. Desde já agradeço. Atenciosamente, Rafael Cunha
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A instalação seria para visualizar o que os autores estão realizando no texto do livro. Estou começando a estudar e mexer com microarranjos. Obrigado pela dica do pacote 'limma'. -- YNWA

nesse caso, instale uma versao arcaica do R.... =/ 2011/4/7 Rafael Garcia Cunha <rafareds@gmail.com>:
A instalação seria para visualizar o que os autores estão realizando no texto do livro. Estou começando a estudar e mexer com microarranjos. Obrigado pela dica do pacote 'limma'.
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